BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-313L17.T7 (MSMg01no313_l17.b1) | MSMg01-313L17.TJ (MSMg01no313_l17.g1) |
ACC | AG435578 | AG435579 |
length | 1,270 | 1,262 |
length of high quality (start - end) | 763 (129 - 891) | 332 (502 - 833) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_l17.b1 PHD_FILE: MSMg01no313_l17.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:55:46 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_l17.g1 PHD_FILE: MSMg01no313_l17.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:55:46 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CCGAAATTNNNNNNNNATCATTGGGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXCGCGGAATTCTCACCTGAGGAATACCCTTTGACAGACAAGCACCTGA
AAAAATGTTCAACATCCTTCTTTATCAAGGAAATGCAAATCAAAACAACC
CTGAGATTCCACCTCACACCAGTCAGAATGGCTAAGATCAAACATTCAGG
TGACAGCAGATGCCCGCATGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATT
GTTGGTGGGATTGCAGGCTTGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCGG
TTCCTCAGAAAATTGGACATAGTACTACCGGAGGATCCAGCAATACCTCT
CCTAGGCATATATCCAGAAGATGCCCCAACTGGTAAGAAGGACACATGCT
CCACTATGTTCTTAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTGGAAAGAA
CCCAGATGCCCCTCATCAGAGGAATGGATACAGAAAATGTGGTACATCTA
CACAATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTACGAAATTCC
TAGCCAAATGGATGGACCTGGAGGGCATCATCCTGAGTGAGGTAACACAT
TCACAAAGGAACTCACACAATATGTACTCACTGATAAGTGGATATTAGCC
CAAAACCTAGGATACCCAAGATATAAGATACAATTTCCTAAACACATGAA
ACTCAAGAAAAATGAAGACTGAAGTGTGGACACTATGCCCCTCCTTAGAA
GTGGGAACAAAACACCCTTGGAAGGAGTTACAGAGACAAAGTTTGGAGCT
GAGATGAAAGGATGGACCATGTAGAGACTGCCATATCCAGGGATCCACCC
CATAATCAGCATCCAAACGCTGACACCATTGCATACACTAGCAAGATTTT
ATCCGAAGGACCCAGATGTAGCTGTCTCTTGTGAGACTATGCCGGGGCCT
AGCAAAAACAGAAGTGGATGCTCACAGTCAGCTAATGAATGGATCACAGG
GCTCCCAATGGAGGAACTAGAAAAAGTACCCAGGGAGCTAAAGGGAACTG
CAACCCTTAAGGGGGAACACCTTTTGGAACTATCAGAACCCCGAAGACCT
TGATCTTACTGGCAAAGGATCAAAAAAGGCCCAATTTGCCTCCCTGGAAA
AAAAGCCCTTGGAATTTCAACCTTTATTGCCCCCAAAGGGAAAAAAAGCC
CCCAAAGAGAAGGTGGGGGTTGTAATTTTTCCTTCTTTCCTCTCCTTCCT
CTTCTTTTTCTCTCTCTCCA
| NNNCCGCATGATGGAGCCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCACACATGACAGTACAACCCAAAGGTGGA
AAAGGTAGAAGAATATTAGACAGCCGCCATTTTTTGCAGACATTGGAGGA
ATCAGCCATCAGTCAAAGGTCAAGATTNCCTCCACACAGGAGAGAACTCC
TCTTTTCTTGTGCCTAATCACCCCACACTGAATTCCACAATGAGGACTCC
AGCCCTTGTCTGCCTTGTACCTGCACTGGTTACAGAAACCAAAGCCCAGT
AGCAATACCAGTAACTTGAGTCATGAACAACTATTACAGCTACATTCAAG
TGTAACTAGTGTTCTTAGCACTGCAACAAATTACATATCTGAGCCTGTTT
TATAAAGGGGAAGACAAGGGAATATCTAATTTCTTCAGCTTTTATGGTGT
TTTTTTTATACCCACCCACCAAGTTTGCTATTTCCCGCAAAAAAAAGGGA
CTGTCATTGTTCATTTAGAAAGGAGAAATGTAAGTAGCTGAATTCCTCAT
ACTGCATAGCAAGAAACTGTGGCCACAAACTAAGGTAGTGTTTACTATAT
AGTTGCATCATAGTTACCAAAAGTAGGTAAACTGTTGGAGCAGATGCTAT
AGAGAAATGAGAAAGCTGGTTTGACTTAGACACAGAAGTTTTGAGAGCTC
ACCATACAGAATGTGAGTTCAAAGCAGTGTCTCCTGACACCGTTTTAGCA
CTTTAGAGTTACGCTGCTATCAATGTGATTTTTACACACCTCAATGCGGT
ACCCATAAGCATATTTATCAAACAATGTCAAGTAAACCTTATATATTAAG
TGGTTTCTTCATACTGGTTTGTGATGGATGATAAACCATCCAATGAGTAG
CAAAACCAGTTGTGACTGATACAAGTTCTCAAATGAGTAAGAGTAGCCCA
CCCTCCATATGTGCATTATGCGTAAAATTTTTTTAACTTTAAATTTCCCC
GGAACACAATCCCATAAAACCCAGTCCCCTTTGGGGTTTGAAGAACCCCT
TGGTTTCAGGTAACCCCACTTTAAAAAAAAAGAGTTTGGGAAAAAAGGGC
CCCCCAAAAAGGTTTTTAAAAGGTTGGAAGGGAGGTACTTTTATTTTTTT
GGGGGTAATTCCCCCTCCCCTTTGGGGGAGGAAAAAACCCCCCTCTTATT
CGGTGGAAAAGGCTTCCACCCTATTAAACCATATTTCCCCTCACCCCACA
ATAAATTTGTAA
|
quality values | Open.Hide.15 15 9 9 11 12 9 3 0 0 0 0 0 0 0 0 3 7 6 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 11 15 19 28 20 14 19 14 20 22
29 37 37 40 37 30 30 25 26 21 22 32 33 33 33 33 33 26 28 29 28 28 30 28 25 23 23 19 8 8 8 9 8 9 9 9 8 10 8 8 10 8 19 30 33 33 33 33 33 36
36 50 59 59 53 53 50 50 36 36 50 41 39 41 37 26 25 17 10 10 11 10 10 10 9 9 11 11 11 19 22 39 43 39 37 30 28 28 28 43 39 42 43 46 43 43 46 46 42 42
48 42 42 30 33 33 42 42 48 48 42 48 48 50 50 48 48 48 48 34 34 34 37 43 47 57 48 50 53 50 48 48 48 48 48 40 46 46 34 22 13 8 8 8 11 17 28 30 36 36
39 43 43 43 43 39 39 43 39 39 39 37 43 43 43 39 59 47 57 48 57 57 57 57 54 54 54 59 57 46 48 48 54 54 57 57 57 59 57 57 57 57 48 54 46 46 40 46 44 57
36 36 19 24 17 24 24 31 31 25 36 36 44 42 44 44 43 43 39 48 48 43 43 43 57 57 50 50 43 43 47 44 44 43 43 46 46 47 50 52 57 57 68 68 44 59 41 41 41 41
41 38 38 38 38 38 38 57 57 68 68 68 68 68 57 57 54 57 57 57 57 57 57 43 57 57 57 57 57 52 52 45 57 57 57 57 52 52 52 52 52 52 52 52 52 57 57 57 59 59
68 68 68 57 57 57 52 52 52 59 59 57 57 59 57 57 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 52 43 43 43 43 35 43 59 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 43 38 23 17 13 13 13 13 39 39 43 43 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 45 45 45 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 44 39 12 8 8 8 8 12 39 43 35 43 43 43 39 39 39 43 43 43 43 52 62 62 62 52 62 52 43 43 39 62 62 62 62 62 62 62 62
62 52 43 43 43 43 35 43 43 43 52 52 62 62 68 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 43 35 35 43 62 43 52 62 62 62 57 59 59 59 57 57 45 45 57 57 57 57 57 59 59
57 52 52 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 52 52 52 57 57 57 52 52 52 52 52 52 59 59 43 43 43 57 59 57 57 57 52 52 52 57 57 57 52 52 52 52 52 57 59 59 59
59 57 52 52 52 57 57 57 57 68 57 57 57 54 54 59 57 48 48 48 50 50 59 59 59 47 57 57 44 44 48 57 57 57 57 57 48 48 48 57 57 57 57 57 57 59 57 44 44 43
43 48 47 47 57 57 57 48 43 43 43 46 44 57 57 57 43 57 48 54 54 68 68 68 68 68 68 54 54 50 57 48 53 48 48 57 57 57 59 59 59 59 48 48 47 46 46 46 46 48
46 47 37 37 30 30 37 33 39 39 41 41 41 39 39 37 37 30 37 37 43 43 46 41 43 41 41 32 36 39 39 44 47 47 50 59 59 48 48 48 37 37 30 30 18 27 20 28 22 25
30 27 26 31 27 25 27 32 31 31 41 43 43 39 31 31 36 34 34 31 27 27 25 32 37 33 30 26 29 39 41 37 39 39 41 41 41 32 37 41 41 37 39 41 31 31 41 37 37 30
30 12 12 11 19 17 23 22 28 23 31 28 37 17 16 18 14 20 28 31 23 30 28 28 12 22 21 30 30 29 27 29 35 43 59 47 47 46 46 46 43 37 37 30 25 18 22 20 25 34
39 39 39 31 36 28 28 20 31 21 21 21 20 18 28 29 31 37 37 39 37 37 37 30 30 30 37 37 35 31 35 30 39 39 40 23 25 11 12 9 23 11 16 17 30 14 11 11 16 9
12 9 9 8 9 17 22 22 17 18 11 11 9 16 16 11 19 11 10 10 10 10 13 13 18 28 28 34 30 27 19 21 21 16 16 12 22 21 25 28 30 21 22 18 22 23 14 13 13 15
11 9 9 9 11 8 8 9 9 10 15 18 19 12 10 8 9 10 12 12 19 19 15 15 14 15 23 15 10 9 9 9 9 16 12 18 9 9 9 13 9 12 14 14 11 14 11 18 8 8
8 8 8 8 10 8 8 10 10 6 9 9 10 9 9 8 8 8 10 10 11 11 11 17 12 11 11 11 10 13 10 10 10 7 9 9 6 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 12
21 14 12 9 9 8 8 8 8 11 17 15 12 12 13 15 9 11 11 11 11 12 9 14 9 9 9 13 11 10 10 9 10 16 11 10 10 10 10 9 7 6 6 6 6 6 6 6 8 10
10 12 9 9 9 9 9 9 9 9 6 6 6 6 8 10 12 12 11 13 13 17 19 15 15 10 8 8 8 9 9 9 9 10 9 9 9 9 9 9 10 10 12 15 16 12 14 18 27 25
37 13 10 8 8 8 11 12 14 16 12 12 12 12 10 10 10 10 10 10 11 11 11 15 9 6 6 6 6 6 12 8 9 8 8 8 9 9 18 15 15 17 16 12 12 9 9 12 12 12
15 11 11 11 13 10 6 6 6 8 10 11 11 11 12 13 13 8 8 10 8 8 8 8 8 11 9 9 9 10 8 10 10 8 8 10 9 10 10 10 13 24 21 10 10 14 16 15 10 10
8 8 8 6 7 8 8 8 8 6 7 10 10 10 8 13 8 8 6 6 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 7 7 7 10 9 8 7 8 6 8 8 8 12 13 9 8 9 8 15 9 15 15 22 8 9 13 23 23 33 32 35 31 33 34 35 34 37 37 37
37 37 42 43 48 48 48 50 50 68 54 57 57 68 57 50 48 46 46 42 42 41 42 48 41 48 48 50 50 50 48 48 48 48 51 50 68 68 57 44 42 28 28 36 38 50 50 48 48 57
57 57 59 59 59 57 42 31 27 20 20 24 36 38 57 57 57 57 38 38 36 36 25 32 15 15 15 32 32 54 57 57 68 68 59 59 57 54 54 59 57 54 68 68 68 50 50 57 59 59
59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 42 42 41 39 27 27 3 0 3 8 6 6 6 8 16 25 32 40 34 34 19 19 17 19 19 28 28 39 39 57
57 59 59 57 57 59 59 57 57 48 57 57 54 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 54 54 54 54 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 54 54 54 57 59 68 68 68 57 57 57
68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57
57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 68 68 59 59 59
59 59 57 57 57 57 57 57 54 54 54 59 59 59 59 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 50 50 41 41 30 25 23 14 12 10 10
10 10 10 22 23 59 59 59 59 50 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 29 29 11 11 9
9 9 9 15 19 19 9 8 8 8 7 7 6 6 6 7 6 8 8 10 21 27 59 41 34 32 26 28 21 18 15 15 13 12 13 11 11 11 12 12 12 14 11 11 9 9 10 11 12 12
11 15 11 25 25 59 59 59 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 53 53 53 53 53 53 54 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 59
59 59 59 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 57 57 59 59 59 68 68 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 59 59 59 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 50 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 57 57 57 57 57 57 59 59
59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 57 59 57 43 43 30 30 30 34 34 48 48 48 48 48 48 57 57 59 59 59 48 48 48 48 48 48 48
48 48 41 41 59 59 41 41 41 37 37 41 39 39 41 46 46 46 48 48 48 48 59 59 59 59 47 39 39 39 30 32 28 32 32 30 30 40 39 37 39 39 37 37 43 43 37 39 36 39
39 41 34 28 19 19 17 19 18 31 36 37 37 39 40 39 46 41 41 37 32 27 29 32 37 37 39 40 40 40 48 43 39 39 35 28 28 33 30 30 30 32 30 27 32 28 31 28 31 30
32 36 36 37 44 28 27 13 13 13 30 28 47 47 59 37 30 24 15 15 20 24 37 37 30 37 30 23 25 20 20 24 17 12 9 10 12 16 18 22 10 10 10 15 15 25 23 18 18 16
11 11 14 13 11 12 18 15 23 21 30 30 37 37 31 22 24 26 26 30 28 28 28 22 22 17 19 14 16 13 12 12 12 14 14 25 17 19 18 18 20 25 30 20 17 21 11 11 11 25
23 34 34 37 35 31 20 23 20 11 10 8 8 8 15 14 21 17 12 10 10 12 9 10 12 20 18 28 22 22 15 13 13 10 9 8 8 7 7 7 7 9 7 7 7 7 8 11 8 9
9 13 11 12 9 10 9 9 9 9 9 10 10 10 9 9 9 10 19 10 9 8 8 8 10 10 10 11 11 19 19 28 23 14 11 10 10 16 10 9 9 8 8 8 8 8 10 9 9 9
10 11 10 10 10 13 10 9 9 9 9 11 10 11 10 11 11 12 11 10 13 9 10 10 10 11 17 23 16 12 11 11 10 9 11 13 10 9 9 10 9 9 9 9 9 10 15 10 12 14
10 10 18 12 8 8 8 8 7 7 7 11 10 10 11 11 8 8 8 8 12 13 15 22 17 15 15 17 13 9 9 8 6 6 6 8 6 7 7 9 18 22 19 7 8 6 8 8 12 8
8 10 10 8 8 8 11 11 18 15 9 12 13 10 10 11 12 15 12 13 9 9 9 15 15 19 14 18 11 11 11 12 10 10 10 13 10 10 9 9 9 9 12 10 10 13 16 11 11 11
18 12 12 12 12 12 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 11 12 12 18 13 18 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 17 24 11 11 8 8 8 8 12 8 10 8 8 6 6 6 6 8
8 8 6 6 8 6 6 12 12 14 15 15 12 11 11 12 12 12 11 8 10 8 8 7 8 9 9 10 10 10 8 8 8 8 8 8 15 10 15 15 8 7 7 8 8 13 13 13 8 8
8 8 8 8 9 8 10 3 3 3 6 6 |