BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-434M21.T7 (MSMg01no434_m21.b1) | MSMg01-434M21.TJ (MSMg01no434_m21.g1) |
ACC | AG526259 | AG526260 |
length | 730 | 767 |
length of high quality (start - end) | 547 (66 - 612) | 465 (69 - 533) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no434_m21.b1 PHD_FILE: MSMg01no434_m21.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:59:19 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no434_m21.g1 PHD_FILE: MSMg01no434_m21.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:59:19 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTCTTT
CAGGCTTTTCTGATTTTGCATAGATTTATTTTTTTTCACATTTTAAAGTC
TTTAATGGGTTGTGGTCTTGCTTATATTTCTTAATAGTTACAACTCTAAA
CTAGTTCAAGCACATTTACTTGTCAAGCATCACCCTTTTTATATTTTTTT
GCTCTCTCTTACTGTAGACTGGAATGAGCCACACCCATGACAGAGATTGA
ATGCTATACTGTCTTGAAATTTTCTCCATCAAAATTTCATCCATTACTTT
TGAATTACAGCTCATGCTATTTCCCAAGACATGGGGGAAATAAAGTTGGA
TTCTTTGCCAGAATGTAGCAAGATTTGTCTCTTAGCATTTGAAGCGGATA
GCTCTGGGCTCTTCTGGCTTTTACAATTTCTATTGAGAAACTAGCTGTTA
TTCTGATGGGTTTCCCTTTATATATGATGTGTTTTTCTATATTTTTCTTG
CTGCTTTCACTACCTTCTCTTTGNTTTGAATATTTAGTGTTTTAACTTTA
ATGTTTCCTGGGGAGTTTCTTTTCTGGCCTCCTCTATTTGGAGTTCTCTG
TGCTTCTTGGATTTGTATGAGTCTGCCCTCTACTTCATTTCTCCATAAAA
CCCATCCTGTCCCCAATCTCAGTACCCACAATCATCACTATGCGTACACA
GCACATAATGCATCATGGGACATTTTTGTT
| AXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXATCTTCTGGGGACCAACCACAGGAGAGACTCA
TCAGCTCCTGCATTTGCAGATGGCTACTCATGATGGACACTCAAGGTTGG
CTTGCTGCCTTTTCTTTCTAAGTGAGGAACATGTAATATACTGAAGTCTG
ATCACAGTTGTCAGTGCCTAGTTCACAAGATGGGATGACCATGGTAATGT
GGGTACACTGTGAAATTCACAAACCTTATATGAAACATAAATAGCATAAG
TAGAAGTTAGAGACATGGGGAATTAACGTAGGGAGGAGAAAGATGGGTCA
CTCAGAAACTTCTGTTCTCTCAGAAATGTTAGGAAAAGTGCTCTTTTTTA
TTGGTTATTTTATTTATTTACATTTCAAATGTTATCCCCCTTCCTAGTTT
CCCCTCCTCAAATTCCCTATTCCCTCCCCCTTACCACCTGTTTCTATGAG
AGTGCTCCCCCTCCCACCCATCCATTCCTGCCTCATTTGCCCTCGCNATT
CCCTGTACGAGGGCATCCAGCCTTCCCAGGATCAAGGGGCCTCCCCTCTC
TTTGATGCCCAACAAGGGAATCAATCCTCTGCTTTCTATTGGACTGGAGA
AAGGGGCCTTTCCTGGCTAACCCTTTGGGGGGAAGTTAATACCTTGGGAG
GCCTCGAAGGGTCAAATGGTTGAAAATGGCCTTTTCTAGGGTTGGAAAAC
CCCTTCTCTCTTTATAT
|
quality values | Open.Hide.28 32 32 32 32 28 28 22 23 19 17 17 24 37 40 41 43 28 28 28 25 23 21 23 9 9 9 9 10 9 7 9 9 9 10 11 13 13 12 22 18 32 32 33 33 44 44 59 33 33
31 21 17 9 9 9 8 7 8 8 7 7 15 17 22 22 26 24 29 28 37 37 39 48 48 57 53 53 53 53 53 59 59 59 47 47 42 42 42 47 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 43 57 57 54 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57
57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 39 39 35 47 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59
59 57 57 57 57 57 53 50 50 59 59 59 59 59 30 25 12 11 11 11 13 21 24 28 18 30 30 43 44 53 57 57 57 59 59 57 57 53 53 53 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68
68 68 68 57 57 48 43 39 39 37 37 37 59 47 36 36 28 28 40 44 57 68 57 57 57 57 59 59 59 68 68 59 59 59 59 48 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 50 50 54 50 59 57 57 59 59 57 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 59 59
59 59 57 57 57 57 57 57 44 43 43 44 59 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 48 48 39 39 32 39 39 47 57 48 48 54 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 59 59 57 48
48 48 57 59 57 50 50 50 47 47 50 59 50 50 59 50 50 47 47 44 27 27 3 0 3 27 27 59 59 47 47 47 48 39 34 28 28 28 30 37 37 39 39 34 34 39 39 41 47 59
32 32 30 30 30 30 30 39 37 37 28 28 28 37 37 48 48 48 46 47 47 47 44 41 41 31 31 35 37 37 31 31 43 40 39 39 42 37 39 32 32 18 16 16 22 28 33 36 43 28
28 25 28 28 30 30 27 19 14 14 17 18 19 26 14 12 12 12 12 11 16 22 13 12 9 9 12 15 20 20 20 17 17 14 17 12 12 12 26 26 15 14 14 19 19 20 17 15 9 12
12 14 10 10 10 10 8 12 8 8 8 11 16 11 12 11 12 13 10 8 8 8 12 11 11 11 12 15 12 11 11 16 12 21 19 11 11 11 9 7 8 8 6 6 8 10 10 13 12 12
12 11 12 12 12 10 10 10 10 10 8 8 8 8 10 10 8 9 8 8 8 8 8 8 8 10 10 13 12 12 | Open.Hide. 6 6 6 8 6 6 8 19 21 39 39 39 44 44 39 39 44 37 37 41 37 37 43 27 23 9 9 12 14 11 10 10 13 13 25 19 34 34 43 48 37 36 33 33 33 38 36 53 50 50
50 50 59 37 19 21 8 8 8 10 10 15 10 22 21 24 31 28 33 36 36 57 57 57 57 57 57 53 57 43 43 43 50 48 50 53 53 68 47 51 51 68 68 51 68 68 68 68 50 50
50 51 51 51 53 59 59 68 68 68 68 68 68 68 51 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59
59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62
68 68 68 62 62 62 68 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 44 43 19 19 38 43 57 52 43 57 38 44 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68
68 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 59 43 43 43 59 59 68 68 59 59 57 57 57 57 57 59 43 43 43 46 46
57 59 59 59 59 59 57 57 48 47 43 43 43 43 57 57 57 57 48 48 48 48 48 48 48 48 47 47 47 41 39 37 30 26 26 32 33 37 37 31 25 25 39 37 37 37 25 25 12 11
11 12 12 15 16 23 32 32 43 59 22 19 16 16 17 17 25 32 37 41 41 31 34 37 31 31 31 22 28 20 18 18 27 15 11 11 11 11 14 14 15 11 21 12 8 3 0 3 7 7
9 9 9 10 12 13 18 13 8 8 8 8 8 10 11 14 16 9 9 9 11 10 11 11 10 9 9 9 10 16 10 12 9 10 11 11 10 8 9 9 10 10 10 14 19 10 10 13 13 11
14 13 14 16 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 11 10 10 9 9 12 9 9 10 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 8 8
9 9 9 8 8 13 9 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 9 12 12 18 12 8 6 6 6 6 7 8 9 8 8 8 8 8 8 8 7 7 7 7 8 8 8 10 10 10 9 9
9 9 8 8 8 8 8 8 8 9 10 11 11 10 8 10 8 8 8 10 11 10 11 14 8 8 8 8 6 8 6 6 11 10 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 10 10 10 13 14 18
9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 |