| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-529P17.T7 (MSMg01no529_p17.b1) | MSMg01-529P17.TJ (MSMg01no529_p17.g1) |
|---|
| ACC | AG598730 | AG598731 |
|---|
| length | 788 | 1,433 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 488 (32 - 519) | --- |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no529_p17.b1 PHD_FILE: MSMg01no529_p17.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 21:06:09 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no529_p17.g1 PHD_FILE: MSMg01no529_p17.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 21:06:09 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | CXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTTCAGGATCCGCGGAAT
TCTCAAGGCTGTCTATTCACACCTGTCAATCCACTGGCAGCCTTGAGACC
CAAGACAGTGAGTGACACAGGTTCCGTCTGAATCCTGTCCCGCAAAAATC
TAAAGGAGTGGACAGAGATGATGAACTCCAAAGCAAGTTTGCTGGGAGGA
TCTGTTCTTGCTCAGCAAGGCTTGTATCTTCACACTTTTCAGACTGGATG
AGGTGGAATCAAATTACACAGAGAGCAGTTTTACTAAAAAGCATGCACAT
GTTTAATTTTGTTGACACCGTTTTCATCATTATATTTAGTATATTTTCAT
TAAAAGGTATTAATTTTAAGTGATTTTTGAGACAGTTGAGTGTAATGTAT
TAAATTGGTTAATTTTTATATATGAAACCATCCTTGTATTGCAGGAATAA
GTTCCAGCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG
TGTGTGTATATATATATATATATATTTTCTAATTCTCTCACACAACGACA
GATTCAGTTACACACACTCTCTCAGAGAGGTATTTCTTTCACCAAAGACC
TCAGTTGTTTTTGTCTTTTTGTATAAAAAAATTTTTTGCTCATTACTTCT
TTAATCCCTATAATTTATCTGGTACATTACTCTGCCCCTTGTGTAAGAAG
GAAAATTTAAATTGGGTGAACCTGCGCACCCTTTTTACATACATGACGAC
CCGCGCGATGGAATTTAAACAAGACTCGTTTGTTGAAG
| CTTTCATCTAGCCTCTCATAACATCGTATTGTCGCTCGCTTCGTTCTTCT
CCTCCGAGTGGGGGTTGTTTGATCGCCGCGCGCGTGATAGGATCCCACCA
GAAGTATATGAGTCATACAGATTATATGACGCGTGCAGATGATGTAGCGA
GACCGTATATAGGTCTAGCGGAGAAGGAGCGAAGTGTCGCAGACGCGCGG
ACTATTATGTCTTACTACGATCTGTGATAGCACCCGCACTACGATTACGA
GGATATCGTATGACACGACAATGATATTAGAGAACGTTGAAGTGAGTATA
TGTTTACCGAGTTAGTAACTATAATCATCCACGTCTGCCGCCGCGGATTT
CCGCAGCTGTTTGAGTCGNGCGTCGACAGAATTAGTAAGCACATTCTAAC
TCCTGATATAGATATGCGCACAGTTATATTATGTATAGATATGGGTAAGA
ACTACGATAGGTGCCGACACGTACATAGGAGGATGTATATATTGTCATTA
CTCTCCACAAGTAATTGATGAGTTTTATGGATGGACACGCCGACACGAGT
CCTGTTTATACCAATCGTATCATGAGCCGCAGCGAGACGATAAGACANTA
TTTGCTATCAGTCGTTATCGTGGANAACATGACGTATTTCCCATCGCTAT
TATAATCATGTGTTTAGATAAATGAACACGATTTANCACGATCACGGCTG
CTGTCGTTGCATCGCATGATAACGCGATACGTTGANTTATATACACGCAC
TGTAGTTCCCACCGTCAGTCTGTGTGTGTAGACAAATACGAAGTACGATA
TATAAGACGGTATACGCGATGGTACGATCTGCGGATGAAGTACAAGAAGG
ACTATACCGAACATGCAGCATGATATATGAACATTCTATATGTAACTAGT
TTATCTAGCGCCGTCAGATGGAGTTGATGCTGACGATTGTAGAGATGTGG
ATTTACATACTGTCGTCGCCTGTGATAGGTAAGTCGGCCGCCACGCACGA
TCGCGGAACTGGCGCGCCGAGTTACGGACATTGTTGTATCGAGCGTATAT
ATCTAGCTCGACGTATATATAACGTGTGGCGTGTAGAGTCTGTACTATTC
GATTTTCTTACTATATAATTGCACGCAGGAGTGTAATGTAACATATTACG
GCACCTCCGCGACGCCCTGTATCGTTATAGCGTAAGATGCAGAATTTGTG
TGATGCGACGCATTTANTGCCATATGAGCTTATCATATCGAGTATTGTTC
TTACTGTATCCGGGACGACTTCATTAGTCTTGNGTCGCGACTATATTAGA
CTCTAGAAGTGCTGGTCTGATCATACGCATGCGCGATGTGTTGTGTTATA
CNCACGATTGATTGATATGAGCGTACTAATGATCAAGGATGAGTCGTGTC
AATACTGCGACGACTATGTCGTACAAAGTCTTN
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 6 6 8 10 13 10 10 10 11 11 11 11 16 15 13 13 21 18 21 17 29 29 30 28 26 26 24 25 22 15 8 8 8 8 9 11 8 8 19 23 31 31 31 43 41 41 21 19 19 22
29 29 33 33 33 30 25 28 28 26 28 15 12 12 12 21 23 22 31 31 31 31 34 43 43 42 42 42 47 43 43 37 41 41 42 43 48 48 48 48 54 46 46 42 42 30 42 42 43 43
47 44 41 39 39 39 39 37 44 44 48 48 54 47 57 47 47 47 42 42 35 42 42 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 48 52 38 38 32 37 37
37 52 52 52 52 52 38 37 37 50 50 50 51 42 42 24 24 24 36 36 50 50 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 59 57 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 52 45 45 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 52 52 43 44 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 44 44 43 43 35 47 44 47 47 47 62 62
62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 41 41 43 43 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 57 57 57 57 59 59 57 52 52 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 47 35 35 35 43 35 35 35 42 43 52 57 57 57 57 52 57
57 59 59 59 57 57 54 59 59 52 52 52 59 59 59 59 57 57 57 54 54 54 57 57 59 59 59 59 54 54 54 57 57 57 52 52 52 50 57 59 59 59 43 43 43 44 44 43 43 35
35 35 59 48 57 57 57 57 57 48 48 59 48 48 57 57 57 59 48 47 47 44 44 43 47 47 57 46 44 43 43 44 46 57 54 54 54 47 47 43 43 43 47 43 46 46 48 48 48 48
54 48 48 40 40 30 30 30 40 33 43 43 43 37 37 28 24 20 20 20 16 24 10 10 10 12 10 9 8 8 10 10 8 8 8 6 6 6 8 8 10 15 12 9 8 8 8 8 10 12
12 12 12 12 12 12 10 10 10 12 12 12 15 13 9 9 8 10 8 9 8 8 9 9 9 9 9 9 8 8 10 10 10 13 8 8 8 8 10 10 10 10 10 11 17 12 12 11 10 10
10 10 10 10 11 13 11 11 11 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 9 9 9 9 11 11 12 16 21 16 8 8 10 10 10 9 9 9 8 8 10 8 9 9 11
11 9 8 8 10 8 8 8 10 10 8 8 8 10 11 10 8 10 8 8 8 8 10 10 10 10 12 12 11 11 14 10 8 6 6 6 6 10 15 10 10 10 13 9 9 9 9 9 9 15
11 10 8 8 8 10 10 10 10 10 10 13 12 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 7 8 8 9 9 9 8 11 15 18 18 17 15 9 9 9 16 12 11 10 11 10 8 8 6 6 8
8 15 9 7 6 8 8 8 8 11 10 10 10 13 17 11 8 8 8 9 9 10 10 10 12 10 10 9 9 10 9 11 13 10 9 9 9 9 | Open.Hide. 8 8 8 8 10 11 11 11 10 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 12 8 6 10 7 7 6 6 8 8 8 8 8 10 6 6 6 6
6 6 7 7 10 10 9 10 10 10 10 8 9 8 9 8 8 8 8 7 6 7 8 10 8 8 6 6 8 8 8 6 8 8 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 10 7
8 7 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 6 6 6 6 10 12 10 10 8 10 10 10 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 8 10 8 8 9 8 10 6 7 7 7
8 8 8 8 8 12 18 12 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 6 6 6 8 6 6 8 8 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 10 6 6 6 6 6 6 10 8
8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 7 7 9 6 6 7 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 10 8 8 8 8 8 10 8 8 9 9 10 8 8 8 8 8 8 10 9 10 8
8 6 6 6 8 6 9 9 9 9 9 10 8 8 8 10 8 8 7 6 6 6 6 7 7 10 9 8 10 10 12 9 9 12 8 8 8 8 8 11 14 19 15 12 12 11 10 10 9 9
9 10 10 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 11 10 10 10 9 9 8 8 8 8 8 10 9 9 9 11 11 11 10 8 8 8 8 8 8 10 10 13 13 8 10 6 6 6 10 9
9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 10 8 6 6 6 6 6 3 0 3 9 9 9 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 7 10 10 8 8 8
8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 8 8 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 11 10 12 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8
8 6 8 8 7 8 8 6 6 6 7 11 8 8 10 11 8 10 9 9 8 8 6 6 8 8 7 7 7 6 10 6 6 8 6 6 7 10 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 10 15 15 8 8 8 10 8 9 9 9 8 6 6 6 6 6 8 8 10 8 8 9 12 10 10 13 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 10 6 7 7 7 10 10 17
8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 7 7 8 8 8 8 6 6 8 6 6 6 6 6 8 6 8 6 6 8 10 6 6 6 6 6 6 8 10 10 3 0 3 6
6 8 6 6 6 6 15 11 8 8 8 8 11 12 8 8 8 6 6 6 8 8 8 3 0 3 6 8 8 8 8 12 10 10 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 6 8 10 13 13 6 6 6 8 8 8 3 0 3 8 6 6 6 6 6 6 8 8 10 12 10 8
8 8 7 6 8 8 8 8 10 10 10 8 11 10 8 10 9 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 10 7 6 6 3 0 3 10 10 8 9 9 8 10 10 8 8 8 6 6
6 6 6 6 6 6 6 7 8 6 6 6 7 7 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 10 8 8 6 10 8 8 6 6 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 15 10 10 10 12 11 13 10 10 8 10 8 6 9 9 9 9 9 13 13 16 13 10 10 8 10 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 11 11 11 8 6 8 6 6 10 10 8 8 8 8 8 8 8 9 7 7 8 8 7 7 8 6 6 6 6 6 6 8 8 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 6
6 6 8 8 8 7 6 6 8 8 8 8 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 10 10 11 9 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10
10 10 7 10 8 7 8 8 8 8 7 7 8 8 8 11 9 9 9 13 10 8 8 6 6 8 8 12 10 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8
8 8 10 8 8 8 8 10 10 12 10 10 9 8 8 8 8 8 10 6 6 6 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 10 12 10 10 9 9 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 10 10 10 12 11 11 10 10 8 8 8 8 8 10 8 6 7 10 6 8 8 11 8 9 8 10 12 10 10 8 9 6
8 6 7 7 6 10 10 12 11 10 8 8 8 8 8 11 10 10 9 8 10 7 7 9 9 7 8 8 8 6 6 6 6 8 9 8 10 10 10 9 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8
6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 7 6 8 8 7 7 9 9 9 10 10 8 8 8 8 11 11 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 10 8 10 10 15 11 6 8
6 6 8 6 8 9 9 11 10 10 9 6 8 8 9 3 0 3 9 9 9 10 13 15 8 8 8 6 6 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 6 6
9 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 6 8 6 6 6 6 9 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 10 3 0 3 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 13 10 8 6 8 6
8 6 6 6 6 6 6 8 8 10 6 6 6 8 8 8 8 8 9 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 15 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 10 10 11
3 0 3 6 6 6 6 8 6 6 8 8 8 10 8 8 11 10 10 10 8 8 6 6 10 8 8 8 12 12 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 9 9 9
8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 11 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 3 0 |
|---|
