BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-031E19
Chromosome16 (Build37)
Map Location 70,572,163 - 70,716,838
singlet/doubletdoublet
Overlap geneD16Ertd519e
Upstream geneSpeer2, EG664930, Gbe1
Downstream geneLOC100039231
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-031E19.bB6Ng01-031E19.g
ACCDH860959DH860960
length595875
definitionDH860959|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-031E19, 5' end.DH860960|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-031E19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(70,716,247 - 70,716,838)(70,572,163 - 70,573,035)
sequence
gaattctttgtgatgtaattttcttagtaacttttctgttactcaaataa
aagactatatccaaggaaacttggaagagagatgtttaatttatggctta
caatttcaggtaaacggagcccacgtaagacaggaaaggcatggtgacag
agctgagagcttacatgttgattcacaattggagacaaagagagaaagct
aactgggtggggtggggtggtatagatagcataatctcccaaataaacta
tattttgaaagcagaaaaactggaagataggatctttttagctacaggag
gaagaggcgtataggttgcttgttttgtttcaatgtttcattttcttctt
cccttaaatagctacagtatagtttttcagttccatcaacaaagacactt
aaaacattagaaaaatgaatcattcatttattgctagtaggaatgcaaaa
tagtgcagtgtctctggaacacttgtacattaggttcttctgaaactaag
catccacttcccacacaagagcagcagctcttggggaagccatcccacaa
taatgacagctttatgtccacgcccaatgtgtataccaaatattt
gaattcaccagggatgatagtatgatgtgcaatgatgacatcccctggag
ggctatcaaaatcattacagttgtcttggttgtctataaggagagatggc
tctttgcatcaggaatggtatgtgtgtgcctctgcatgtgcatgcgcaca
catcccagtgtggatgcacatccatgtgtatggatgcaaaggctagaata
catcctgggatatatttcatcagaagacaccctttacaggatctgtcaca
gcttagcacaccactaagtaggctagacaggttgaccagtaaacccccag
agacttatgtgtctctgccttcctaaagcataagccaccacacccataaa
ttccagggactgaaaccaagtaaaccctcctgcaactgagtcctatctgc
agaccttgggtttgcagggcgtgttatttgttttcgtttggtttgctttt
tttatccattgataatttttctctctttttttttccttttattggatatt
ttctttatttacatttcaagtgttatcccctttccaggtttcccctcccc
tccagaaactctctatgctatccccccttccttgcctctaagaggatgct
cacccacccaccccccaccttcctgccctggtaatctcctaccctggggc
attgaaccctcacaggaccaagggttgctcctccccctgatgtttcaaca
aggtcatccggagccctgggtcccttcatgtgtacactttgattggtggt
ccagtccctgggagctctggggggggggtctggctggttgacacttttgc
ttcccctcatggggctgcaaatttttaacacaagaaataacttaccaata
aaaacctgtcctttcacaatgagtt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_70716247_70716838
seq2: B6Ng01-031E19.b_41_635 (reverse)

seq1  AAATATTT-GTATACACATTGTGCGTGGACAT-AAGCTGTCATTATTGTG  48
      |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||
seq2  AAATATTTGGTATACACATTGGGCGTGGACATAAAGCTGTCATTATTGTG  50

seq1  GGATGGCTT-CCCAAGAGCTGCTGCTCTTGTGTGGGAAGTGGATGCTTAG  97
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGGCTTCCCCAAGAGCTGCTGCTCTTGTGTGGGAAGTGGATGCTTAG  100

seq1  TTTCAGAAGAACCTAATGTACAAGTGTTCCAGAGACACTGCACTATTTTG  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAGAAGAACCTAATGTACAAGTGTTCCAGAGACACTGCACTATTTTG  150

seq1  CATTCCTACTAGCAATAAATGAATGATTCATTTTTCTAATGTTTTAAGTG  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCCTACTAGCAATAAATGAATGATTCATTTTTCTAATGTTTTAAGTG  200

seq1  TCTTTGTTGATGGAACTGAAAAACTATACTGTAGCTATTTAAGGGAAGAA  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTGTTGATGGAACTGAAAAACTATACTGTAGCTATTTAAGGGAAGAA  250

seq1  GAAAATGAAACATTGAAACAAAACAAGCAACCTATACGCCTCTTCCTCCT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAATGAAACATTGAAACAAAACAAGCAACCTATACGCCTCTTCCTCCT  300

seq1  GTAGCTAAAAAGATCCTATCTTCCAGTTTTTCTGCTTTCAAAATATAGTT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCTAAAAAGATCCTATCTTCCAGTTTTTCTGCTTTCAAAATATAGTT  350

seq1  TATTTGGGAGATTATGCTATCTATACCACCCCACCCCACCCAGTTAGCTT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTGGGAGATTATGCTATCTATACCACCCCACCCCACCCAGTTAGCTT  400

seq1  TCTCTCTTTGTCTCCAATTGTGAATCAACATGTAAGCTCTCAGCTCTGTC  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCTTTGTCTCCAATTGTGAATCAACATGTAAGCTCTCAGCTCTGTC  450

seq1  ACCATGCCTTTCCTGTCTTACGTGGGCTCCGTTTACCTGAAATTGTAAGC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATGCCTTTCCTGTCTTACGTGGGCTCCGTTTACCTGAAATTGTAAGC  500

seq1  CATAAATTAAACATCTCTCTTCCAAGTTTCCTTGGATATAGTCTTTTATT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAATTAAACATCTCTCTTCCAAGTTTCCTTGGATATAGTCTTTTATT  550

seq1  TGAGTAACAGAAAAGTTACTAAGAAAATTACATCACAAAGAATTC  592
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTAACAGAAAAGTTACTAAGAAAATTACATCACAAAGAATTC  595

seq1: chr16_70572163_70573035
seq2: B6Ng01-031E19.g_67_941

seq1  GAATTCACCAGGGATGATAGTATGATGTGCAATGATGACATCCCCTGGAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACCAGGGATGATAGTATGATGTGCAATGATGACATCCCCTGGAG  50

seq1  GGCTATCAAAATCATTACAGTTGTCTTGGTTGTCTATAAGGAGAGATGGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTATCAAAATCATTACAGTTGTCTTGGTTGTCTATAAGGAGAGATGGC  100

seq1  TCTTTGCATCAGGAATGGTATGTGTGTGCCTCTGCATGTGCATGCGCACA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTGCATCAGGAATGGTATGTGTGTGCCTCTGCATGTGCATGCGCACA  150

seq1  CATCCCAGTGTGGATGCACATCCATGTGTATGGATGCAAAGGCTAGAATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCCAGTGTGGATGCACATCCATGTGTATGGATGCAAAGGCTAGAATA  200

seq1  CATCCTGGGATATATTTCATCAGAAGACACCCTTTACAGGATCTGTCACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCTGGGATATATTTCATCAGAAGACACCCTTTACAGGATCTGTCACA  250

seq1  GCTTAGCACACCACTAAGTAGGCTAGACAGGTTGACCAGTAAACCCCCAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTAGCACACCACTAAGTAGGCTAGACAGGTTGACCAGTAAACCCCCAG  300

seq1  AGACTTATGTGTCTCTGCCTTCCTAAAGCATAAGCCACCACACCCATAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTTATGTGTCTCTGCCTTCCTAAAGCATAAGCCACCACACCCATAAA  350

seq1  TTCCAGGGACTGAAACCAAGTAAACCCTCCTGCAACTGAGTCCTATCTGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGGGACTGAAACCAAGTAAACCCTCCTGCAACTGAGTCCTATCTGC  400

seq1  AGACCTTGGGTTTGCAGGGCGTGTTATTTGTTTTCGTTTGGTTTGCTTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCTTGGGTTTGCAGGGCGTGTTATTTGTTTTCGTTTGGTTTGCTTTT  450

seq1  TTTATCCATTGATAATTTTTCTCTCTTTTTTTTTCCTTTTATTGGATATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATCCATTGATAATTTTTCTCTCTTTTTTTTTCCTTTTATTGGATATT  500

seq1  TTCTTTATTTACATTTCAAGTGTTATCCCCTTTCCAGGTTTCCCCTCCCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTATTTACATTTCAAGTGTTATCCCCTTTCCAGGTTTCCCCTCCCC  550

seq1  TCCAGAAACTCTCTATGCTATCCCCCCTTCCTTGCCTCTAAGAGGATGCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGAAACTCTCTATGCTATCCCCCCTTCCTTGCCTCTAAGAGGATGCT  600

seq1  CACCCACCCA-CCCCCACCTTCCTGCCCTGGTAATCTCCTACCCTGGGGC  649
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCACCCACCCCCCACCTTCCTGCCCTGGTAATCTCCTACCCTGGGGC  650

seq1  ATTGAACCCTCACAGGACCAAGGGTTGCTCCTCCCCCTGATG-TTCAACA  698
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  ATTGAACCCTCACAGGACCAAGGGTTGCTCCTCCCCCTGATGTTTCAACA  700

seq1  AGGTCATCCGGAGCCCTGGGTCCCTTCATGTGTACACTTTGATTGGTGGT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCATCCGGAGCCCTGGGTCCCTTCATGTGTACACTTTGATTGGTGGT  750

seq1  CCAGTCCCTGGGAGCTCTGGGGGGGGGGGTCTGGCTGGTTGACACTTTTG  798
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTCCCTGGGAGCTCT-GGGGGGGGGGTCTGGCTGGTTGACACTTTTG  799

seq1  C-TCCCCCCATGGGGCTGCAAATTTTTAACACAAGAAATTACTTACCATT  847
      | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
seq2  CTTCCCCTCATGGGGCTGCAAATTTTTAACACAAGAAATAACTTACCAAT  849

seq1  AAAACCCTGTTCTTTCACCATGAGTT  873
      |||| ||||| ||||||| |||||||
seq2  AAAAACCTGTCCTTTCACAATGAGTT  875