BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-050B03
Chromosome16 (Build37)
Map Location 86,641,606 - 86,758,429
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC622000, Adamts1, Adamts5, LOC100040025, LOC100039780
Downstream geneN6amt1, Zfp294, ORF5, LOC100040088, Usp16, Cct8, B130034C11Rik, LOC435486, ORF63, Bach1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-050B03.bB6Ng01-050B03.g
ACCDH874130DH874131
length1,081792
definitionDH874130|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-050B03, 5' end.DH874131|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-050B03, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(86,641,606 - 86,642,704)(86,757,638 - 86,758,429)
sequence
tgaaaaacaaaaaaagaaaactcccacaaggaatggcatgccttcatgac
tgacaccttcttctagaccacttgaaattaaaacatacatacaaacataa
acacagacacatactacatacacacatgcatgtagaatcacaacacacgc
acacacacacacatgcacacttgaaaagagaaaaacatcaaatagcttat
ttatcattggtaatatcaaacaagcactacagacatgattttgaataaag
cagtagtctgataataaacaatgagattgtatagttggaacattcacatt
tgaaatcaagctgggctctctctaacaatcaaaatcggccttatattctt
tatgtcccaatctcagtcacatgaatcctttttacaatcatcaaaaattc
aagtatgtgcatttgataaaaaataattctatgaaatgtatgaccaatgt
ggtaattataaacaagtttataaaataatgtagtaaatttaataagttat
aaaaaacattagatatgtttaggacttgtaaggtgtctttcaaatgaggg
ctcaacaccctcctgaactgaggaaatattagtgttctaccagactccat
acttcaaacaagtccttgtgccaacctgtatgctacacagtaagcttctt
tctacctgccaacctgcagtatgccatgtcttcatgaattattaaatagt
cttgatgtgttcaacttgttttctagactgtaatctcaaggttacttctt
atattggtgttttaaaattattaaatcataaaaattcaatattcagaaaa
gtagaaccaaacttgattattccaaaatcaattacttaagtatagtagtg
ctgtgtttggaaaaaatacctttccctttgtaacttgactttagaaacct
ttttgatgtagcaaaggtgtataaagatgggaaattatgatttcattatc
agaaattatgagcagtgcatgtgtgtgtgtgtatgtatgtgtgtgttctt
ccctagcgtgttagttgctattttgtaggtggagccttatgaacttcctt
cccttattgtagcatgctataagtgctagca
gaattctcaaatgtgggtagaagtgaaaatcctttcatgaaagatgccga
cttttctagccatcttatggtccttcacctttattgttgataggtaaaag
atttgggtattatgagaaagatgaaacataaggacactactagagtgtag
ggcacaaagaggagctttttcctctgaaccaaactgtacctgctcacagt
tcatacattgagaatattgaatatattttcatatattaatattcataaat
ttgctttagtgtgatttcatttgggaatgaggctttaaggaggtggtgaa
ggaggagtgagagtggtggctggcttccattttgctaggagagttaccta
acaaaaatgaaagcataacattctccatcatactgagttagccattcata
atccaagaagagactccacatcaggactgggtaaggatgacccttgatca
tgggcttctaacatttaggatgttgagtaaatacatttctgtgttctgag
ccacccaactgatgctacttattatggatgactgcaaccacaagtccgtt
tttaatagtgttaatgtgctgtagatcatgacatgaaagagaatcaaaga
tagattgtgtgacactcataagaattgaggttgttggcatctgaaatagt
gtctgggttggtggttggttatgcgatggattccccagtgggggcagatt
ctgggatggtcatgccttgagtctctgctctgaactttgtcttgtaactc
ctttccatgggtattttgttccctcttctaagagggatcgaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_86641606_86642704
seq2: B6Ng01-050B03.b_49_1129

seq1  TGAAAAACAAAAAAAGAAAACTCCCACAAGGAATGGCATGCCTTCATGAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAAACAAAAAAAGAAAACTCCCACAAGGAATGGCATGCCTTCATGAC  50

seq1  TGACACCTTCTTCTAGACCACTTGAAATTAAAACATACATACAAACATAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACACCTTCTTCTAGACCACTTGAAATTAAAACATACATACAAACATAA  100

seq1  ACACAGACACATACTACATACACACATGCATGTAGAATCACAACACACGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAGACACATACTACATACACACATGCATGTAGAATCACAACACACGC  150

seq1  ACACACACACACATGCACACTTGAAAAGAGAAAAACATCAAATAGCTTAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACATGCACACTTGAAAAGAGAAAAACATCAAATAGCTTAT  200

seq1  TTATCATTGGTAATATCAAACAAGCACTACAGACATGATTTTGAATAAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCATTGGTAATATCAAACAAGCACTACAGACATGATTTTGAATAAAG  250

seq1  CAGTAGTCTGATAATAAACAATGAGATTGTATAGTTGGAACATTCACATT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTAGTCTGATAATAAACAATGAGATTGTATAGTTGGAACATTCACATT  300

seq1  TGAAATCAAGCTGGGCTCTCTCTAACAATCAAAATCGGCCTTATATTCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAATCAAGCTGGGCTCTCTCTAACAATCAAAATCGGCCTTATATTCTT  350

seq1  TATGTCCCAATCTCAGTCACATGAATCCTTTTTACAATCATCAAAAATTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTCCCAATCTCAGTCACATGAATCCTTTTTACAATCATCAAAAATTC  400

seq1  AAGTATGTGCATTTGATAAAAAATAATTCTATGAAATGTATGACCAATGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTATGTGCATTTGATAAAAAATAATTCTATGAAATGTATGACCAATGT  450

seq1  GGTAATTATAAACAAGTTTATAAAATAATGTAGTAAATTTAATAAGTTAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAATTATAAACAAGTTTATAAAATAATGTAGTAAATTTAATAAGTTAT  500

seq1  AAAAAACATTAGATATGTTTAGGACTTGTAAGGTGTCTTTCAAATGAGGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAACATTAGATATGTTTAGGACTTGTAAGGTGTCTTTCAAATGAGGG  550

seq1  CTCAACACCCTCCTGAACTGAGGAAATATTAGTGTTCTACCAGACTCCAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAACACCCTCCTGAACTGAGGAAATATTAGTGTTCTACCAGACTCCAT  600

seq1  ACTTCAAACAAGTCCTTGTGCCAACCTGTATGCTACACAGTAAGCTTCTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCAAACAAGTCCTTGTGCCAACCTGTATGCTACACAGTAAGCTTCTT  650

seq1  TCTACCTGCCAACCTGCAGTATGCCATGTCTTCATGAATTATTAAATAGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTACCTGCCAACCTGCAGTATGCCATGTCTTCATGAATTATTAAATAGT  700

seq1  CTTGATGTGTTCAACTTGTTTTCTAGACTGTAATCTCAAGGTTACTTCTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGATGTGTTCAACTTGTTTTCTAGACTGTAATCTCAAGGTTACTTCTT  750

seq1  ATATTGGTGTTTTAAAATTATTAAATCATAAAAATTCAATATTCAGAAAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTGGTGTTTTAAAATTATTAAATCATAAAAATTCAATATTCAGAAAA  800

seq1  GTAGAACCAAACTTGATTATTCCAAAATCAATTACTTAAGTATAGTAGTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGAACCAAACTTGATTATTCCAAAATCAATTACTTAAGTATAGTAGTG  850

seq1  CTGTGTTTGGAAAAAAATACCTTTCCCTTTGTAACTTGACTTTAGAAAAC  900
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
seq2  CTGTGTTTGG-AAAAAATACCTTTCCCTTTGTAACTTGACTTTAGAAA--  897

seq1  CTTTTTTGATGTAAGCAAAGGTTGTATAAAGATGGGAAATTATGATTTCA  950
      | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTTTGATGT-AGCAAAGG-TGTATAAAGATGGGAAATTATGATTTCA  945

seq1  TTATCCAGAAAATTATGAGCAGTGCATGTGTGTGTGTGTATGTATGTGTG  1000
      |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAT-CAG-AAATTATGAGCAGTGCATGTGTGTGTGTGTATGTATGTGTG  993

seq1  TGTTTCTTCACTTAGCGTGTTTAGTTGTCTATTTTTGTAGAGTGAAGCCT  1050
      || |||||| | ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||| |||||
seq2  TG-TTCTTC-CCTAGCGTG-TTAGTTG-CTA-TTTTGTAG-GTGGAGCCT  1037

seq1  TATGAGCTTCCCTCTCCTTATGTTAGCATGCTTATTAGTGTTGCTAGCA  1099
      ||||| ||||| || ||||||  |||||||| ||| ||   ||||||||
seq2  TATGAACTTCCTTC-CCTTATTGTAGCATGC-TATAAG---TGCTAGCA  1081

seq1: chr16_86757638_86758429
seq2: B6Ng01-050B03.g_68_859 (reverse)

seq1  TTCGATCCCTCTTAGAAGAGGGAACAAAATACCCATGG-AAGGAGTTACA  49
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  TTCGATCCCTCTTAGAAGAGGGAACAAAATACCCATGGAAAGGAGTTACA  50

seq1  GAGACAAAGTTCAGAGCAGAGACTCAAGGCATGACCAT-CCAGAATCTG-  97
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| 
seq2  -AGACAAAGTTCAGAGCAGAGACTCAAGGCATGACCATCCCAGAATCTGC  99

seq1  CCCCACTGGGGGAATCCATCGCATAAACAACCACCAAACCCAGACACTAT  147
      ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
seq2  CCCCACT-GGGGAATCCATCGCATAACCAACCACC-AACCCAGACACTAT  147

seq1  TTCAGATGCCAACAACCTCAATTCTTATGAGTGTCACACAATCTATCTTT  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGATGCCAACAACCTCAATTCTTATGAGTGTCACACAATCTATCTTT  197

seq1  GATTCTCTTTCATGTCATGATCTACAGCACATTAACACTATTAAAAACGG  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCTCTTTCATGTCATGATCTACAGCACATTAACACTATTAAAAACGG  247

seq1  ACTTGTGGTTGCAGTCATCCATAATAAGTAGCATCAGTTGGGTGGCTCAG  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGTGGTTGCAGTCATCCATAATAAGTAGCATCAGTTGGGTGGCTCAG  297

seq1  AACACAGAAATGTATTTACTCAACATCCTAAATGTTAGAAGCCCATGATC  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACAGAAATGTATTTACTCAACATCCTAAATGTTAGAAGCCCATGATC  347

seq1  AAGGGTCATCCTTACCCAGTCCTGATGTGGAGTCTCTTCTTGGATTATGA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGTCATCCTTACCCAGTCCTGATGTGGAGTCTCTTCTTGGATTATGA  397

seq1  ATGGCTAACTCAGTATGATGGAGAATGTTATGCTTTCATTTTTGTTAGGT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCTAACTCAGTATGATGGAGAATGTTATGCTTTCATTTTTGTTAGGT  447

seq1  AACTCTCCTAGCAAAATGGAAGCCAGCCACCACTCTCACTCCTCCTTCAC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCTCCTAGCAAAATGGAAGCCAGCCACCACTCTCACTCCTCCTTCAC  497

seq1  CACCTCCTTAAAGCCTCATTCCCAAATGAAATCACACTAAAGCAAATTTA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTCCTTAAAGCCTCATTCCCAAATGAAATCACACTAAAGCAAATTTA  547

seq1  TGAATATTAATATATGAAAATATATTCAATATTCTCAATGTATGAACTGT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATATTAATATATGAAAATATATTCAATATTCTCAATGTATGAACTGT  597

seq1  GAGCAGGTACAGTTTGGTTCAGAGGAAAAAGCTCCTCTTTGTGCCCTACA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAGGTACAGTTTGGTTCAGAGGAAAAAGCTCCTCTTTGTGCCCTACA  647

seq1  CTCTAGTAGTGTCCTTATGTTTCATCTTTCTCATAATACCCAAATCTTTT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTAGTAGTGTCCTTATGTTTCATCTTTCTCATAATACCCAAATCTTTT  697

seq1  ACCTATCAACAATAAAGGTGAAGGACCATAAGATGGCTAGAAAAGTCGGC  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTATCAACAATAAAGGTGAAGGACCATAAGATGGCTAGAAAAGTCGGC  747

seq1  ATCTTTCATGAAAGGATTTTCACTTCTACCCACATTTGAGAATTC  792
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTTCATGAAAGGATTTTCACTTCTACCCACATTTGAGAATTC  792