BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-051B19
Chromosome16 (Build37)
Map Location 26,215,479 - 26,292,206
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream gene5430420C16Rik, Trp63, LOC100043571, Leprel1
Downstream geneCldn1, Cldn16, LOC100043057, Il1rap, Gm606
LinkOpen Mouse BAC browser

no map image available.



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-051B19.bB6Ng01-051B19.g
ACCDH874852DH874853
length1,121778
definitionDH874852|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-051B19, 5' end.DH874853|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-051B19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(26,291,071 - 26,292,206)(26,215,479 - 26,216,258)
sequence
gaattctcaaaggaaattacaaccctggacacagcaagtgattattcaga
agcttataaatctgaaacttaaaaaggaaacttataaatcctcactaaca
atagtaacagcacatctaattaatgtgtttgctcattccttagcacaaga
ttttatgcagctgcctggaatttggcagaaagcatgcatgatcatgccaa
gaacacaggagaagtagaccttaacccagctcactccaattttaactgtt
caacacaactttctgagcgttaagaggcagagacaggaggtgagggaagt
gattgatgaacggatactctgtcataacaaacactcaactatattgatat
gattcagatgttactttctgtgaattttggtgatgagtgaagaaacagac
tagctagtataaaagggagaaaagtattattgccttcctccattgctgag
ctcctggtgggacacccatattagaagactgcttaagagagaaaagcatc
catcacttaacacgagttctatgtgacatgagggtctatgagtcaaagag
acaggaaagtttgccatgattaggggtgagccccagaacacgtaggcaac
caatagctttgagcatatgtggagtgcatgttcaccctgaggctgaagac
agaacccatacccaggtttgttccaagacttgaagtttgtcctaaaagag
aacataaaggttcgtccactggcagtccagagacacacatgtgatagtca
cccaggtcatatgcgttcacaggaaacaaggacttcatatgctcttctat
tctaaagatggacactctctcggagagctcagttctacttcttcatagtg
ttaccatgtgttcctgagttttagaaaacttatgacaaccaaatgtattt
tatacttctctttctattaattaattaactaattattaattaattaatta
acttactttgaatctttatcatagcttcccagtgctctctctcccagtcc
tttcttctcactctctcctcatcattttctttcagagtagaaggagcttt
ccccagatatcaacagctttggcatatcaagtgcagtatgactgggtgca
tctttactgagctgagcagtt
gaattccacatatatcttctccctttccaaatatgggtgctgtcaatgtg
actgcattaatgagcatggcatttgggtggtgaagaaggcaagatatctg
atctgctcttagcaggaggcatttacatcatacatacaacatcatacata
caatgttcagctagttagcttacttgatgttttctgttatgcagcaagga
ggctctcccccaacacaaatcacagtgcctgggtcttagaatcttcagcc
ccagaactctaaacaataaatttaatttctttttaaattaccacatctca
ggtgttctgctatatctgcacaagcagcctaagctaggatgtcagtcata
ccttcagatccagtcaaactctcaacagtcaaagcaggttttgcacacaa
aaattcaagaattaccagtgtccaaaattgtgttgtgaaagcacaaatta
tgtcattgggtcactgtaatcatgatagtatgtgaattaaaacaggcttt
ttatttttattttgttttctaggtctattcagtttaactcttgggaatgt
gactctgtacattgatctttttgttcagagaatatatatatatatatata
tatatatatatatatatatatatatatatatatatcttcctgggagaaaa
ttcttttaatccagcagcatataagtccacaatcagtgttctacatggga
aactaaataggcaattccatcttctgccaggctagatgcttccctgtggg
gcaatttatggaaaagatggatatattc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_26291071_26292206
seq2: B6Ng01-051B19.b_44_1164 (reverse)

seq1  AACTGCCTTCAGCCTCAGTAAAAGATGCACCCAGTCATACTGCAACTTGA  50
      ||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  AACTGC--TCAG-CTCAGT-AAAGATGCACCCAGTCATACTGC-ACTTGA  45

seq1  TATGCCAAAGCTGGTTGATATCTGTGGGAAGCTTCCTCTACTCTGAAAAG  100
      |||||||||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| ||||
seq2  TATGCCAAAGCT-GTTGATATCTGGGGAAAGCTCCTTCTACTCTG-AAAG  93

seq1  AAAATGATGGAGGGAGAGGAGGTGAGAAGAAAGGACTGGGAGGAGAGGAG  150
      |||||||||  | ||||    |||||||||||||||||||| |||| |||
seq2  AAAATGATGAGGAGAGA----GTGAGAAGAAAGGACTGGGA-GAGA-GAG  137

seq1  CACTGGGAAGCTATGATAAAGATTCAAAGTAAGTTAATTAATTAATTAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  CACTGGGAAGCTATGATAAAGATTCAAAGTAAGTTAATTAATTAATTAA-  186

seq1  TAATTAGTTAATTAATTAATAAGAAAGAGAAGTATAAAATACATTTGGTT  250
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTAGTTAATTAATTAAT-AGAAAGAGAAGTATAAAATACATTTGGTT  235

seq1  GTCATAAGTTTTCTAAAACTCAGGAACACATGGTAACACTATGAAGAAGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATAAGTTTTCTAAAACTCAGGAACACATGGTAACACTATGAAGAAGT  285

seq1  AGAACTGAGCTCTCCGAGAGAGTGTCCATCTTTAGAATAGAAGAGCATAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACTGAGCTCTCCGAGAGAGTGTCCATCTTTAGAATAGAAGAGCATAT  335

seq1  GAAGTCCTTGTTTCCTGTGAACGCATATGACCTGGGTGACTATCACATGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTCCTTGTTTCCTGTGAACGCATATGACCTGGGTGACTATCACATGT  385

seq1  GTGTCTCTGGACTGCCAGTGGACGAACCTTTATGTTCTCTTTTAGGACAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCTCTGGACTGCCAGTGGACGAACCTTTATGTTCTCTTTTAGGACAA  435

seq1  ACTTCAAGTCTTGGAACAAACCTGGGTATGGGTTCTGTCTTCAGCCTCAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCAAGTCTTGGAACAAACCTGGGTATGGGTTCTGTCTTCAGCCTCAG  485

seq1  GGTGAACATGCACTCCACATATGCTCAAAGCTATTGGTTGCCTACGTGTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGAACATGCACTCCACATATGCTCAAAGCTATTGGTTGCCTACGTGTT  535

seq1  CTGGGGCTCACCCCTAATCATGGCAAACTTTCCTGTCTCTTTGACTCATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGGCTCACCCCTAATCATGGCAAACTTTCCTGTCTCTTTGACTCATA  585

seq1  GACCCTCATGTCACATAGAACTCGTGTTAAGTGATGGATGCTTTTCTCTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCCTCATGTCACATAGAACTCGTGTTAAGTGATGGATGCTTTTCTCTC  635

seq1  TTAAGCAGTCTTCTAATATGGGTGTCCCACCAGGAGCTCAGCAATGGAGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGCAGTCTTCTAATATGGGTGTCCCACCAGGAGCTCAGCAATGGAGG  685

seq1  AAGGCAATAATACTTTTCTCCCTTTTATACTAGCTAGTCTGTTTCTTCAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCAATAATACTTTTCTCCCTTTTATACTAGCTAGTCTGTTTCTTCAC  735

seq1  TCATCACCAAAATTCACAGAAAGTAACATCTGAATCATATCAATATAGTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCACCAAAATTCACAGAAAGTAACATCTGAATCATATCAATATAGTT  785

seq1  GAGTGTTTGTTATGACAGAGTATCCGTTCATCAATCACTTCCCTCACCTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGTTTGTTATGACAGAGTATCCGTTCATCAATCACTTCCCTCACCTC  835

seq1  CTGTCTCTGCCTCTTAACGCTCAGAAAGTTGTGTTGAACAGTTAAAATTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCTCTGCCTCTTAACGCTCAGAAAGTTGTGTTGAACAGTTAAAATTG  885

seq1  GAGTGAGCTGGGTTAAGGTCTACTTCTCCTGTGTTCTTGGCATGATCATG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGAGCTGGGTTAAGGTCTACTTCTCCTGTGTTCTTGGCATGATCATG  935

seq1  CATGCTTTCTGCCAAATTCCAGGCAGCTGCATAAAATCTTGTGCTAAGGA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCTTTCTGCCAAATTCCAGGCAGCTGCATAAAATCTTGTGCTAAGGA  985

seq1  ATGAGCAAACACATTAATTAGATGTGCTGTTACTATTGTTAGTGAGGATT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGCAAACACATTAATTAGATGTGCTGTTACTATTGTTAGTGAGGATT  1035

seq1  TATAAGTTTCCTTTTTAAGTTTCAGATTTATAAGCTTCTGAATAATCACT  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAGTTTCCTTTTTAAGTTTCAGATTTATAAGCTTCTGAATAATCACT  1085

seq1  TGCTGTGTCCAGGGTTGTAATTTCCTTTGAGAATTC  1136
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGTGTCCAGGGTTGTAATTTCCTTTGAGAATTC  1121

seq1: chr16_26215479_26216258
seq2: B6Ng01-051B19.g_66_843

seq1  GAATTCCACATATATCTTCTCCCTTTCCAAATATGGGTGCTGTCAATGTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCACATATATCTTCTCCCTTTCCAAATATGGGTGCTGTCAATGTG  50

seq1  ACTGCATTAATGAGCATGGCATTTGGGTGGTGAAGAAGGCAAGATATCTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCATTAATGAGCATGGCATTTGGGTGGTGAAGAAGGCAAGATATCTG  100

seq1  ATCTGCTCTTAGCAGGAGGCATTTACATCATACATACAACATCATACATA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGCTCTTAGCAGGAGGCATTTACATCATACATACAACATCATACATA  150

seq1  CAATGTTCAGCTAGTTAGCTTACTTGATGTTTTCTGTTATGCAGCAAGGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGTTCAGCTAGTTAGCTTACTTGATGTTTTCTGTTATGCAGCAAGGA  200

seq1  GGCTCTCCCCCAACACAAATCACAGTGCCTGGGTCTTAGAATCTTCAGCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCTCCCCCAACACAAATCACAGTGCCTGGGTCTTAGAATCTTCAGCC  250

seq1  CCAGAACTCTAAACAATAAATTTAATTTCTTTTTAAATTACCACATCTCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAACTCTAAACAATAAATTTAATTTCTTTTTAAATTACCACATCTCA  300

seq1  GGTGTTCTGCTATATCTGCACAAGCAGCCTAAGCTAGGATGTCAGTCATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTTCTGCTATATCTGCACAAGCAGCCTAAGCTAGGATGTCAGTCATA  350

seq1  CCTTCAGATCCAGTCAAACTCTCAACAGTCAAAGCAGGTTTTGCACACAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCAGATCCAGTCAAACTCTCAACAGTCAAAGCAGGTTTTGCACACAA  400

seq1  AAATTCAAGAATTACCAGTGTCCAAAATTGTGTTGTGAAAGCACAAATTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTCAAGAATTACCAGTGTCCAAAATTGTGTTGTGAAAGCACAAATTA  450

seq1  TGTCATTGGGTCACTGTAATCATGATAGTATGTGAATTAAAACAGGCTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCATTGGGTCACTGTAATCATGATAGTATGTGAATTAAAACAGGCTTT  500

seq1  TTATTTTTATTTTGTTTTCTAGGTCTATTCAGTTTAACTCTTGGGAATGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTTTATTTTGTTTTCTAGGTCTATTCAGTTTAACTCTTGGGAATGT  550

seq1  GACTCTGTACATTGATCTTTTTGTTCAGAGAATATATATATATATATATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTCTGTACATTGATCTTTTTGTTCAGAGAATATATATATATATATATA  600

seq1  TATATATATATATATATATATATATATATATATATAAAACATCCTGGGAG  650
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||||||
seq2  TATATATATATATATATATATATATATATATATAT----CTTCCTGGGAG  646

seq1  AAAATTC-TTTAATCCAGCAGCATATAAGTCCACAATCAGTGTTCTACAT  699
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATTCTTTTAATCCAGCAGCATATAAGTCCACAATCAGTGTTCTACAT  696

seq1  -GGAAACTTAATAGGCTATTCCATCATTCTGCCAGGCTAGATGCTTCCCT  748
       ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAAACTAAATAGGCAATTCCATC-TTCTGCCAGGCTAGATGCTTCCCT  745

seq1  GTGGTGCAATTTATGG-AAAGATGGATAGATTC  780
      |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||
seq2  GTGGGGCAATTTATGGAAAAGATGGATATATTC  778