BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-069E12
Chromosome16 (Build37)
Map Location 89,707,868 - 89,875,149
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTiam1
Upstream gene2310061N02Rik, Krtap13-1, Krtap13, 2310034C09Rik, 2310057N15Rik, EG546672, EG433047, 4930553J12Rik, Krtap14, Krtap15, Krtap16-9, Krtap16-1, Krtap16-5, Krtap16-4, Krtap8-2, LOC100040191, AY026312, Krtap16-10, EG621595, LOC100040167, 1110032D16Rik, LOC100040201, Krtap6-1, LOC100040214, Krtap16-8, 1110025L11Rik, LOC100040249, LOC100040267, EG622794, LOC100040281, ENSMUSG00000044227, EG665661, LOC100040288, EG622935, EG622981, EG622998, EG623011, EG623026, LOC100040346, EG623049, LOC100040415, EG640636, LOC640652, LOC640654, LOC100040425, LOC100040374, LOC640656, LOC100040445, LOC100040456, Krtap21-1, Krtap6-2, 5430433J05Rik
Downstream geneLOC100040496, LOC640694, LOC100040440, Sod1, Sfrs15, LOC545175, Hunk, 2610039C10Rik, Mrap, 4921511H13Rik, 4931408A02Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-069E12.bB6Ng01-069E12.g
ACCDH887636DH887637
length1,0081,099
definitionDH887636|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-069E12, 5' end.DH887637|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-069E12, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(89,874,193 - 89,875,149)(89,707,868 - 89,708,974)
sequence
gaattcccactaaaaggacctgcgtggccataaaattgctagccgagtct
acccagtaagtcacattgtacaaaatgctttctgaggcaacacaagaccg
tgtttatagaaacctcggacttcttttaatgggggacttttatcccactt
atgtgggataaaggacaaagtgaaccttttcagaggaaattactgttgtt
tgggatccgtgacggcattttctgccatccacttattgtaatccacatag
ctccagaggggctcgatttgaaagaaacctgtgtgtgcccgggtgaggtt
acagcgagggagatcagctgtgattatggaaataatttgtaggttatttc
agccccagggctcaattcactgcacagtttcctgagcctgtgtgctgctg
attcgtccctgttgcccagagacccacacactcaccctggaaaagagatt
cgtgtaacccacagaagtagaaaaaggggttttgtgtgaagagtgggggc
gggaatgagggagtgtgctggagtagctgatacagaggaagttttatgct
gcctgcagagtgtggctgtatctccttctcccctgaactattttaattag
agctctttcctccgacttgatgtcagaggcagcacctaccacttacacgg
tccagtttcctccctggcttgcatccgttcattcctagaggatgccgcag
ttcctgacagctcagccccttgcaggaacatcccaacgtgtgttttgcat
tcctgtgccaaatgcctggggaacttagctaccagacaggacaagagaga
tagacacctgactgagtagaaaatgtgtgtggttgcgttatagaggggta
agaaacgaggggctttagcaaagtgcctcacctttgtctcactttgtttc
tctgtcacttagagaccattttactaggccacttcctggatgttaaaaac
tctaaaagaatgtactttgtgtatagaagagacttgaaagactgcatctg
tcatttct
gaattcctaagcgaggtaactcagagaccgctggggtcagcacttcctct
acagagagatttcaaaataaaggattctgtacttctggcagtcatattca
gttcctctattgctggaaggagccagccattctgtgaaatatgataatga
ctccagtttacaaaagagaggacaaactaagaaatgaagagagggctgga
gagacagctcagctgctaaacgttctactttactagaacaagaacctagg
ttcaacaagcagttaggtgtggtggcatgggcttgaaatcctgggggtca
gggggaagcagagatgggcagagccggagggatcactctccagtacagcc
tggttggtgagttagaactggtaagagacctaaaaaagttgggttatgcc
tgaggagctgtaccctgggttttcttctggcctccatatgaatgtgtgcc
atacacatatgtgtacaagcacacacagacacatagacacatccatacac
acacatacacacagagacacccacatacaaacacacacacatacaggcac
acacatacccacatgtgtacatgaatgagtgtgccatacacatatgtgta
ctaacatacacagacacatgcgtgcacatgcacatatatacacatgagta
cacacacagacacacttgtgtacacacacagataccttcatagaaacaca
tacacagagacacatacacatgaacacacacaaacatacacacatgtgta
catgaatgagtgtgccatacacatatgtgtactaacacagacacatagac
acatccatacacacacaaacacatatacacacatgtatacatatagacac
ccacattcaaacacacatacatgcacacacatacacacatatgtacatga
atgagtgtgccatacacatatgtttactaacacacagagacatatgcatg
cactttgatatacacatacacacacatgtacaccacagaccactacatga
accacatacacggacacatacccttgcacacataccaacatacaccatga
ttacatgattgatgtgccatacacatatgtgtagtacacaaggcacatc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_89874193_89875149
seq2: B6Ng01-069E12.b_46_994 (reverse)

seq1  TTTTATAACATCCAGGAAGTGGCCTAGTAAAAATGGTCTTCTAAGTGACA  50
       ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
seq2  -TTTTTAACATCCAGGAAGTGGCCTAGT-AAAATGGTC-TCTAAGTGACA  47

seq1  GAGAAACAAAGGTGAGACAAAGGTGAGGCACTTCTGCTAAAGCCCCTCGT  100
      |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  GAGAAACAAA-GTGAGACAAAGGTGAGGCACTT-TGCTAAAGCCCCTCGT  95

seq1  TTCTTACCCCTCTATATACGCAACCACACACATTTTCTACTCAGTCAGGT  150
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTACCCCTCTATA-ACGCAACCACACACATTTTCTACTCAGTCAGGT  144

seq1  GTCTATCTCTCTTGTCCTGTCTGGTAGCTAAGTTCCCCAGGCATTTGGCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTATCTCTCTTGTCCTGTCTGGTAGCTAAGTTCCCCAGGCATTTGGCA  194

seq1  CAGGAATGCAAAACACACGTTGGGATGTTTCCTGCAAGGGGCTGAGCTGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAATGCAAAACACACGTTGGGATG-TTCCTGCAAGGGGCTGAGCTGT  243

seq1  CAGGAACTGCGGCATCCTCTAGGAATGAACGGATGCAAGCCAGGGAGGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAACTGCGGCATCCTCTAGGAATGAACGGATGCAAGCCAGGGAGGAA  293

seq1  ACTGGACCGTGTAAGTGGTAGGTGCTGCCTCTGACATCAAGTCGGAGGAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGACCGTGTAAGTGGTAGGTGCTGCCTCTGACATCAAGTCGGAGGAA  343

seq1  AGAGCTCTAATTAAAATAGTTCAGGGGAGAAGGAGATACAGCCACACTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCTCTAATTAAAATAGTTCAGGGGAGAAGGAGATACAGCCACACTCT  393

seq1  GCAGGCAGCATAAAACTTCCTCTGTATCAGCTACTCCAGCACACTCCCTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGCAGCATAAAACTTCCTCTGTATCAGCTACTCCAGCACACTCCCTC  443

seq1  ATTCCCGCCCCCACTCTTCACACAAAACCCCTTTTTCTACTTCTGTGGGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCCGCCCCCACTCTTCACACAAAACCCCTTTTTCTACTTCTGTGGGT  493

seq1  TACACGAATCTCTTTTCCAGGGTGAGTGTGTGGGTCTCTGGGCAACAGGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACGAATCTCTTTTCCAGGGTGAGTGTGTGGGTCTCTGGGCAACAGGG  543

seq1  ACGAATCAGCAGCACACAGGCTCAGGAAACTGTGCAGTGAATTGAGCCCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGAATCAGCAGCACACAGGCTCAGGAAACTGTGCAGTGAATTGAGCCCT  593

seq1  GGGGCTGAAATAACCTACAAATTATTTCCATAATCACAGCTGATCTCCCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGCTGAAATAACCTACAAATTATTTCCATAATCACAGCTGATCTCCCT  643

seq1  CGCTGTAACCTCACCCGGGCACACACAGGTTTCTTTCAAATCGAGCCCCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCTGTAACCTCACCCGGGCACACACAGGTTTCTTTCAAATCGAGCCCCT  693

seq1  CTGGGAGCTATGTGGATTACAATAAGTGGATGGCAGAAAATGCCGTCACG  750
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CT-GGAGCTATGTGGATTACAATAAGTGGATGGCAGAAAATGCCGTCACG  742

seq1  GATCCCAAACAACAGTAATTTCCTCTGAAAAGGTTCACTTTGTCCTTTAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCCCAAACAACAGTAATTTCCTCTGAAAAGGTTCACTTTGTCCTTTAT  792

seq1  CCCACATAAGTGGGATAAAAGTCCCCCATTAAAAGAAGTCCGAGGTTTCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACATAAGTGGGATAAAAGTCCCCCATTAAAAGAAGTCCGAGGTTTCT  842

seq1  ATAAACACGGTCTTGTGTTGCCTCAGAAAGCATTTTGTACAATGTGACTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAACACGGTCTTGTGTTGCCTCAGAAAGCATTTTGTACAATGTGACTT  892

seq1  ACTGGGTAGACTCGGCTAGCAATTTTATGGCCACGCAGGTCCTTTTAGTG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGGTAGACTCGGCTAGCAATTTTATGGCCACGCAGGTCCTTTTAGTG  942

seq1  GGAATTC  957
      |||||||
seq2  GGAATTC  949

seq1: chr16_89707868_89708974
seq2: B6Ng01-069E12.g_68_1166

seq1  GAATTCCTAAGCGAGGTAACTCAGAGACCGCTGGGGTCAGCACTTCCTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTAAGCGAGGTAACTCAGAGACCGCTGGGGTCAGCACTTCCTCT  50

seq1  ACAGAGAGATTTCAAAATAAAGGATTCTGTACTTCTGGCAGTCATATTCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAGAGATTTCAAAATAAAGGATTCTGTACTTCTGGCAGTCATATTCA  100

seq1  GTTCCTCTATTGCTGGAAGGAGCCAGCCATTCTGTGAAATATGATAATGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCCTCTATTGCTGGAAGGAGCCAGCCATTCTGTGAAATATGATAATGA  150

seq1  CTCCAGTTTACAAAAGAGAGGACAAACTAAGAAATGAAGAGAGGGCTGGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCAGTTTACAAAAGAGAGGACAAACTAAGAAATGAAGAGAGGGCTGGA  200

seq1  GAGACAGCTCAGCTGCTAAACGTTCTACTTTACTAGAACAAGAACCTAGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACAGCTCAGCTGCTAAACGTTCTACTTTACTAGAACAAGAACCTAGG  250

seq1  TTCAACAAGCAGTTAGGTGTGGTGGCATGGGCTTGAAATCCTGGGGGTCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAACAAGCAGTTAGGTGTGGTGGCATGGGCTTGAAATCCTGGGGGTCA  300

seq1  GGGGGAAGCAGAGATGGGCAGAGCCGGAGGGATCACTCTCCAGTACAGCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGAAGCAGAGATGGGCAGAGCCGGAGGGATCACTCTCCAGTACAGCC  350

seq1  TGGTTGGTGAGTTAGAACTGGTAAGAGACCTAAAAAAGTTGGGTTATGCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTGGTGAGTTAGAACTGGTAAGAGACCTAAAAAAGTTGGGTTATGCC  400

seq1  TGAGGAGCTGTACCCTGGGTTTTCTTCTGGCCTCCATATGAATGTGTGCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGAGCTGTACCCTGGGTTTTCTTCTGGCCTCCATATGAATGTGTGCC  450

seq1  ATACACATATGTGTACAAGCACACACAGACACATAGACACATCCATACAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACACATATGTGTACAAGCACACACAGACACATAGACACATCCATACAC  500

seq1  ACACATACACACAGAGACACCCACATACAAACACACACACATACAGGCAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACATACACACAGAGACACCCACATACAAACACACACACATACAGGCAC  550

seq1  ACACATACCCACATGTGTACATGAATGAGTGTGCCATACACATATGTGTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACATACCCACATGTGTACATGAATGAGTGTGCCATACACATATGTGTA  600

seq1  CTAACATACACAGACACATGCGTGCACATGCACATATATACACATGAGTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACATACACAGACACATGCGTGCACATGCACATATATACACATGAGTA  650

seq1  CACACACAGACACACTTGTGTACACACACAGATACCTTCATAGAAACACA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACAGACACACTTGTGTACACACACAGATACCTTCATAGAAACACA  700

seq1  TACACAGAGACACATACACATGAACACACACAAACATACACACATGTGTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACAGAGACACATACACATGAACACACACAAACATACACACATGTGTA  750

seq1  CATGAATGAGTGTGCCATACACATATGTGTACTAACACAGACACATAGAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAATGAGTGTGCCATACACATATGTGTACTAACACAGACACATAGAC  800

seq1  ACATCCATACACACACAAACACATATACACACATGTATACATATAGACAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCCATACACACACAAACACATATACACACATGTATACATATAGACAC  850

seq1  CCACATTCAAACACACATACATGCACACACATACACACATATGTACATGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACATTCAAACACACATACATGCACACACATACACACATATGTACATGA  900

seq1  ATGAGTGTGCCATACACATATGTTTACTAACACACAGAGACATATGCATG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGTGTGCCATACACATATGTTTACTAACACACAGAGACATATGCATG  950

seq1  CACTTGAATATACACATACACACACATGTACACACACAGACACCTACATT  1000
      |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |
seq2  CACTTTGATATACACATACACACACATGTACAC-CACAGACCACTACA-T  998

seq1  GAAACACACATACACAGACACATACACATGCACACATACACACATACACA  1050
      |||   ||||||||| ||||||||| | |||||||||||  |||||||| 
seq2  GAA--CCACATACACGGACACATACCCTTGCACACATACCAACATACAC-  1045

seq1  CATGTATACATGAATGAGTGTGCCATACACATATGTGTAGTAACACACAG  1100
      ||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||
seq2  CATGATTACATGATTGA-TGTGCCATACACATATGTGTAGT-ACACA-AG  1092

seq1  GCACATC  1107
      |||||||
seq2  GCACATC  1099