BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-074A14
Chromosome16 (Build37)
Map Location 86,717,330 - 86,849,928
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneAdamts1, Adamts5, LOC100040025, LOC100039780
Downstream geneN6amt1, Zfp294, ORF5, LOC100040088, Usp16, Cct8, B130034C11Rik, LOC435486, ORF63, Bach1, LOC100039901
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-074A14.bB6Ng01-074A14.g
ACCDH890997DH890998
length1,169722
definitionDH890997|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-074A14, 5' end.DH890998|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-074A14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(86,717,330 - 86,718,500)(86,849,215 - 86,849,928)
sequence
gaattcactctgtgtataaggattccagagctggaaaggtagggatatct
atgtcctttagagcccagaagatcacaaccccagatattagacactggcc
tagttacaagtacaattgtgtaaaacaacagtagtgggttataccttaga
gttgatggccttctgagaatgataagcttctctaatcagggttacatcag
cagacataaaattcccttctgtgaaacagacttcaaatccagtcacagag
gatcccttactcagtcataccactatggccctactagatacattttaggt
ggcaggtccatactgcatcatgcaaggtccaactctgggtaaaacttttg
ctttctttcctcctccagcagcctgcacgctatcttctgggtggcagctt
tatgtcactttgtagaaatcttgcatcaccaaggagtggtaactatagtc
tttgttgtacaaaggagacgttgaatctgagggacgttactgccttaccc
tcaactaaaccaccactgagaacacagcatgagactaagatgtttgttca
tagcatactagctccaaagaacttattaaatgtttcttaagctcctcttt
tttaaaccatggtatttaaaggaggtgaatcctacctaccttttgtatct
ctaataaatttaatttacagtcagaataaagtgatgaaatggttcttaaa
aactaaaattccaacaccgctacttaaatcataacaccaaaagttttgga
gttaaaaatgtgatgaattgcagactgtcaactgcaattgtgtgcagact
gttaattgtggaagggcaatcatggtactttatagtggactcttgaataa
tgactttaagagtggtgcagagacaaagagacgcgtgtgatcatcacccc
agtttgctttagtgaattgttaaaaagtaccagagataagatgtcttatt
tggttcccaaatttatggtgtatttcctttgcggagctgttttgtataac
atggttaacaggaacctctggaataagatgcgcctgagtatcagtgagta
gagaaaggcacgggtttctggtaccaacaattcatatcagctatgatggg
agcccttttgtggaaaatatatttatttagaaagacattctcaatactaa
gtcatgggattatcactat
gaattccaagtttcacagttgttgaagtaaaaggcagactatgtctgtaa
ggcaaaacaaacaccaccttggaatcacaaactgtctggtattcttaact
ctcccagaaagcacattggaatattaaaaacatctaatctggtatcaatt
attctgtttgaaatggctccaattcaatattgataaaaatggtgattcag
tacctaagcagtaagccctggagagactcatttacatgtcaattaatcct
gttgagtgtgccatttaatatgataatggttaacacagagactggcccat
agtaaaccatcaaaaatgttagctattgtagcattgttactaagacctgc
cccttataacaagctttaggaaaaaatagatgggagataatcacacaatt
ttgcatgctaacaaagtttacagatttcttacttcacacagcagaaagtt
tgaagtacaaatgaaggctttgagaatcagttcaaaagcataaaaattta
atgttatatatgctctattgatagtcaaactgtactgtattttgttaaag
ttatttgaattaaatagttgagataaattaagggaatagatagaaatata
tatgtatatatatatatatatatatatatatatatatatacatatataca
tatgtatctataggtacacatgtgaacacatatatatgtatattaatgtt
atgtgtgtatctatatatatat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_86717330_86718500
seq2: B6Ng01-074A14.b_45_1213

seq1  GAATTCACTCTGTGTATAAGGATTCCAGAGCTGGAAAGGTAGGGATATCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTCTGTGTATAAGGATTCCAGAGCTGGAAAGGTAGGGATATCT  50

seq1  ATGTCCTTTAGAGCCCAGAAGATCACAACCCCAGATATTAGACACTGGCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCCTTTAGAGCCCAGAAGATCACAACCCCAGATATTAGACACTGGCC  100

seq1  TAGTTACAAGTACAATTGTGTAAAACAACAGTAGTGGGTTATACCTTAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTACAAGTACAATTGTGTAAAACAACAGTAGTGGGTTATACCTTAGA  150

seq1  GTTGATGGCCTTCTGAGAATGATAAGCTTCTCTAATCAGGGTTACATCAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGATGGCCTTCTGAGAATGATAAGCTTCTCTAATCAGGGTTACATCAG  200

seq1  CAGACATAAAATTCCCTTCTGTGAAACAGACTTCAAATCCAGTCACAGAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACATAAAATTCCCTTCTGTGAAACAGACTTCAAATCCAGTCACAGAG  250

seq1  GATCCCTTACTCAGTCATACCACTATGGCCCTACTAGATACATTTTAGGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCCCTTACTCAGTCATACCACTATGGCCCTACTAGATACATTTTAGGT  300

seq1  GGCAGGTCCATACTGCATCATGCAAGGTCCAACTCTGGGTAAAACTTTTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGGTCCATACTGCATCATGCAAGGTCCAACTCTGGGTAAAACTTTTG  350

seq1  CTTTCTTTCCTCCTCCAGCAGCCTGCACGCTATCTTCTGGGTGGCAGCTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTTTCCTCCTCCAGCAGCCTGCACGCTATCTTCTGGGTGGCAGCTT  400

seq1  TATGTCACTTTGTAGAAATCTTGCATCACCAAGGAGTGGTAACTATAGTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTCACTTTGTAGAAATCTTGCATCACCAAGGAGTGGTAACTATAGTC  450

seq1  TTTGTTGTACAAAGGAGACGTTGAATCTGAGGGACGTTACTGCCTTACCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTTGTACAAAGGAGACGTTGAATCTGAGGGACGTTACTGCCTTACCC  500

seq1  TCAACTAAACCACCACTGAGAACACAGCATGAGACTAAGATGTTTGTTCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACTAAACCACCACTGAGAACACAGCATGAGACTAAGATGTTTGTTCA  550

seq1  TAGCATACTAGCTCCAAAGAACTTATTAAATGTTTCTTAAGCTCCTCTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCATACTAGCTCCAAAGAACTTATTAAATGTTTCTTAAGCTCCTCTTT  600

seq1  TTTAAACCATGGTATTTAAAGGAGGTGAATCCTACCTACCTTTTGTATCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAACCATGGTATTTAAAGGAGGTGAATCCTACCTACCTTTTGTATCT  650

seq1  CTAATAAATTTAATTTACAGTCAGAATAAAGTGATGAAATGGTTCTTAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATAAATTTAATTTACAGTCAGAATAAAGTGATGAAATGGTTCTTAAA  700

seq1  AACTAAAATTCCAACACCGCTACTTAAATCATAACACCAAAAGTTTTGGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTAAAATTCCAACACCGCTACTTAAATCATAACACCAAAAGTTTTGGA  750

seq1  GTTAAAAATGTGATGAATTGCAGACTGTCAACTGCAATTGTGTGCAGACT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAAAAATGTGATGAATTGCAGACTGTCAACTGCAATTGTGTGCAGACT  800

seq1  GTTAATTGTGGAAGGGCAATCATGGTACTTTATAGTGGACTCTTGAATAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAATTGTGGAAGGGCAATCATGGTACTTTATAGTGGACTCTTGAATAA  850

seq1  TGACTTTAAGAGTGGTGCAGAGACAAAGAGACGCGTGTGATCATCACCCC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTTTAAGAGTGGTGCAGAGACAAAGAGACGCGTGTGATCATCACCCC  900

seq1  AGTTTGCTTTAGTGAATTGTTAAAAAGTACCAGAGATAAGATGTCTTATT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTGCTTTAGTGAATTGTTAAAAAGTACCAGAGATAAGATGTCTTATT  950

seq1  TGGTTCCCAAATTTATGGTGTATTTCCTTTGCGGAGCTGTTTTGTATAAC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTCCCAAATTTATGGTGTATTTCCTTTGCGGAGCTGTTTTGTATAAC  1000

seq1  ATGGTTAACAGGAACCTCTGGAAATAAGATGCGCCTGAGTATCAGTGAGT  1050
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTTAACAGGAACCTCTGG-AATAAGATGCGCCTGAGTATCAGTGAGT  1049

seq1  AGAGAAAGGGCAC-GGTTTCTGGTACCAAACAATTCATATCAGCTATGAT  1099
      ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAAA-GGCACGGGTTTCTGGTACC-AACAATTCATATCAGCTATGAT  1097

seq1  GGGAG-CCTTTTGT-GAAAATATA-TTATTTAGAAAGACATTCTCCAATA  1146
      ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||
seq2  GGGAGCCCTTTTGTGGAAAATATATTTATTTAGAAAGACATTCT-CAATA  1146

seq1  CTAAAGTCATTGGATATATCACTAT  1171
      || ||||||| |||| |||||||||
seq2  CT-AAGTCATGGGAT-TATCACTAT  1169

seq1: chr16_86849215_86849928
seq2: B6Ng01-074A14.g_68_789 (reverse)

seq1  --ATATATATATAT------ATAACATTAATATACATATATATGTGTTCA  42
        ||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATATATAGATACACACATAACATTAATATACATATATATGTGTTCA  50

seq1  CATGTGTACCTATAGATACATATGTATATGTGTGTATATTTATATATATA  92
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||
seq2  CATGTGTACCTATAGATACATATGTATATATGTATATATATATATATATA  100

seq1  TATATATATATATATATACATATATATTTCTATCTATTCCCTTAATTTAT  142
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATATATATATATATACATATATATTTCTATCTATTCCCTTAATTTAT  150

seq1  CTCAACTATTTAATTCAAATAACTTTAACAAAATACAGTACAGTTTGACT  192
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAACTATTTAATTCAAATAACTTTAACAAAATACAGTACAGTTTGACT  200

seq1  ATCAATAGAGCATATATAACATTAAATTTTTATGCTTTTGAACTGATTCT  242
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAATAGAGCATATATAACATTAAATTTTTATGCTTTTGAACTGATTCT  250

seq1  CAAAGCCTTCATTTGTACTTCAAACTTTCTGCTGTGTGAAGTAAGAAATC  292
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGCCTTCATTTGTACTTCAAACTTTCTGCTGTGTGAAGTAAGAAATC  300

seq1  TGTAAACTTTGTTAGCATGCAAAATTGTGTGATTATCTCCCATCTATTTT  342
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAACTTTGTTAGCATGCAAAATTGTGTGATTATCTCCCATCTATTTT  350

seq1  TTCCTAAAGCTTGTTATAAGGGGCAGGTCTTAGTAACAATGCTACAATAG  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTAAAGCTTGTTATAAGGGGCAGGTCTTAGTAACAATGCTACAATAG  400

seq1  CTAACATTTTTGATGGTTTACTATGGGCCAGTCTCTGTGTTAACCATTAT  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACATTTTTGATGGTTTACTATGGGCCAGTCTCTGTGTTAACCATTAT  450

seq1  CATATTAAATGGCACACTCAACAGGATTAATTGACATGTAAATGAGTCTC  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATTAAATGGCACACTCAACAGGATTAATTGACATGTAAATGAGTCTC  500

seq1  TCCAGGGCTTACTGCTTAGGTACTGAATCACCATTTTTATCAATATTGAA  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGGGCTTACTGCTTAGGTACTGAATCACCATTTTTATCAATATTGAA  550

seq1  TTGGAGCCATTTCAAACAGAATAATTGATACCAGATTAGATGTTTTTAAT  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGAGCCATTTCAAACAGAATAATTGATACCAGATTAGATGTTTTTAAT  600

seq1  ATTCCAATGTGCTTTCTGGGAGAGTTAAGAATACCAGACAGTTTGTGATT  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCAATGTGCTTTCTGGGAGAGTTAAGAATACCAGACAGTTTGTGATT  650

seq1  CCAAGGTGGTGTTTGTTTTGCCTTACAGACATAGTCTGCCTTTTACTTCA  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGGTGGTGTTTGTTTTGCCTTACAGACATAGTCTGCCTTTTACTTCA  700

seq1  ACAACTGTGAAACTTGGAATTC  714
      ||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACTGTGAAACTTGGAATTC  722