MoG+ -Mouse Genome database with high added value-

BAC Information

BAC name
Region	Chromosome -
Gene	search by nearby gene name.
Format	rows / page	Page	1

BAC

Clone Name	B6Ng01-081H13
Chromosome	16 (Build37)
Map Location	87,331,439 - 87,332,473
singlet/doublet	singlet
Overlap gene	none
Upstream gene	none
Downstream gene	N6amt1, Zfp294, ORF5, LOC100040088, Usp16, Cct8, B130034C11Rik, LOC435486, ORF63, Bach1, LOC100039901, Grik1
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BAC End Information

BAC end	BAC-end 1	BAC-end 2
end name	B6Ng01-081H13.b	B6Ng01-081H13.g
ACC	DH896314	DH896315
length	1,033	1,263
definition	DH896314\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-081H13, 5' end.	DH896315\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-081H13, 3' end.
singlet/doublet	singlet	---
BLAST hit	unique	no hit data
sequence	gaattctgtttagctctgtaaccaattttttgattgggttatttgatttt agttattggtgtctttagttattcttgagtttataaattttggatattag ccctctaacagatgtagggttgctgaaaagtcctttcctaatcggaaggc tgctgttttgtcctattttctgtatcctttgccttatagaagctttttag tttcacgaggtcccatttatcaattgttgatcttagagcccgagccactg gtgttctgttcaggaagttgtctcctgtactaaagagttcaaggttactc cccactttctgttgtattagatttagtgtatctggttttatgttgaggcc tttgatctgcttggacatgagttctgtgcagggtgatagatatggatcta ttcacattttctacatgcagacacccagttagaccgggatcatttgttcc aattcaagcttcttttgatggattttgttttccaaaagactttctccatg cttctacgtcttaattttatgagtcagtttcaaaatatggatagacttat tcttgttcccacattagctgggatgtgggactcaggattctacaaagata cattgagcacgagtagttggagcaacaataacatactagtaaaagtaata gaaatggaaaactaccagataatgttttattacttcctttccacccaggt aagcccctcatttcattaacaactgcacacccaggagaagaaatccaggc ttggagtgacaaagcagcgtgctgaaattgcatacagtgccagggatgag aacaggaagcaagaagccatttcttcaaagttcagcacaaatggcaaggg gagccatctgggtattattttgttctgtttatcagagggggcatttctca ttctcatttaatgtcccactgttattttatattataatgctttgcttcca tgtatgtcggcgctccttttgcatgactgtggggaaccaaaaaggggtca gaacccctgtgctggctgcctgttagccccaag	gaattcaacacaccactttcaccaatggacagatcatggaaacagaaact aaacagggacacactgaaactaacagaagtgatgaaacaaatggatctga cagatatctacagaacattttatcctaaaacaaaaggatataccttcttc tcagcacctcatggtaccttctccaaaattgaccacataataggtcacaa aacaggcctcaacagattcaaaaatattgaaattgtcccatgtatcccat cagatcaccatgcactaaggctgatcttcaataacaaaaaaaataacaga aagcctacactcacgtggaaactgaacaacactcttctcaatgatacctt ggtcaaggaaggaataaagaaagaaattaaagactttttagagtttaatg aaaatgaagccacaacgtacccaaacctttgggacacaatgaaagcattt ctaagagggaaactcatagctctgagtgcctccatgaagaaacgggagag agcacatactagtagcttgacaacacatctaaaagctctagaaaaaaagg aagcaaattcacccaagaggagtagacggcaggaaataatcaaactcagg ggtgaaatcaaccaagtggaaacaagaagaactattcaaagaattaacca aacgaggagttggttctttgagaaaatcaacaagatagataaacccttag ctagactcactagagggcacagagacaaaatcctaattaacaaaatcaga actgaaagggagacataacaacagatcctgaagaaatccaaaacaccatc agatccttctacaaaaggctatactcaacaaaactggaaaacctggacga aatggacaaatttctggacagataccaggtaccaaagttgatcaggatca agttgaccttctaacagtcccatatccctaaagaatagaagcaattataa tagtctcccagccaaaaaagcccaggaccagacgggtttagtgcagagtt ctatcagacttcaaggagatctattccagttctgcacaaactttttcaaa tagaagtagaagtactcctacccactccttttatgaggccctttactttg aaccttaaaccacagaagaatcaacaagaatgaggacttcgaacaatttc tcttaggaatgcaggcaaaatcctcaataaattcccgtacggattccaga ccgtagcaactttatctctctgacaatggtttatcgatgacgggaggcta tatacgaaatgtc
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Alignment Information

BAC End 1	BAC End 2
seq1: chr16_87331439_87332473 seq2: B6Ng01-081H13.b_48_1080 (reverse) seq1 CTTGGTGGCTAACAAGCAGCCAGCACAGGGTGTCTGACCCCTTCTTTGGT 50 \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| seq2 CTTGG-GGCTAACAGGCAGCCAGCACAGGGGTTCTGACCCCTT-TTTGGT 48 seq1 TCCCCACAGTCATGCAAAAGGAGCGCCGACATACATGGAAGCAAAGCATT 100 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TCCCCACAGTCATGCAAAAGGAGCGCCGACATACATGGAAGCAAAGCATT 98 seq1 ATAATAATAAAATAACAGTGGGACATTAAATGAGAATGAGAAATGCCCCC 150 \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATAAT-ATAAAATAACAGTGGGACATTAAATGAGAATGAGAAATGCCCCC 147 seq1 TCTGATAAACAGAACAAAATAATACCCAGATGGCTCCCCTTGCCATTTGT 200 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TCTGATAAACAGAACAAAATAATACCCAGATGGCTCCCCTTGCCATTTGT 197 seq1 GCTGAACTTTGAAGAAATGGCTTCTTGCTTCCTGTTCTCATCCCTGGCAC 250 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GCTGAACTTTGAAGAAATGGCTTCTTGCTTCCTGTTCTCATCCCTGGCAC 247 seq1 TGTATGCAATTTCAGCACGCTGCTTTGTCACTCCAAGCCTGGATTTCTTC 300 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGTATGCAATTTCAGCACGCTGCTTTGTCACTCCAAGCCTGGATTTCTTC 297 seq1 TCCTGGGTGTGCAGTTGTTAATGAATTGAGGGGCTTACCTGGGTGGAAAG 350 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TCCTGGGTGTGCAGTTGTTAATGAAATGAGGGGCTTACCTGGGTGGAAAG 347 seq1 GAAGTAAT-AAACATTATCTGGTAGTTTTCCATTTCTATTACTTTTACTA 399 \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GAAGTAATAAAACATTATCTGGTAGTTTTCCATTTCTATTACTTTTACTA 397 seq1 GTATGTTATTGTTGCTCCAACTACTCGTGCTCAATGTATCTTTGTAGAAT 449 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GTATGTTATTGTTGCTCCAACTACTCGTGCTCAATGTATCTTTGTAGAAT 447 seq1 CCTGAGTCCCACATCCCAGCTAATGTGGGAACAAGAATAAGTCTATCCAT 499 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CCTGAGTCCCACATCCCAGCTAATGTGGGAACAAGAATAAGTCTATCCAT 497 seq1 ATTTTGAAACTGACTCATAAAATTAAGACGTAGAAGCATGGAGAAAGTCT 549 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATTTTGAAACTGACTCATAAAATTAAGACGTAGAAGCATGGAGAAAGTCT 547 seq1 TTTGGAAAACAAAATCCATCAAAAGAAGCTTGAATTGGAACAAATGATCC 599 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TTTGGAAAACAAAATCCATCAAAAGAAGCTTGAATTGGAACAAATGATCC 597 seq1 CGGTCTAACTGGGTGTCTGCATGTAGAAAATGTGAATAGATCCATATCTA 649 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CGGTCTAACTGGGTGTCTGCATGTAGAAAATGTGAATAGATCCATATCTA 647 seq1 TCACCCTGCACAGAACTCATGTCCAAGCAGATCAAAGGCCTCAACATAAA 699 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TCACCCTGCACAGAACTCATGTCCAAGCAGATCAAAGGCCTCAACATAAA 697 seq1 ACCAGATACACTAAATCTAATACAACAGAAAGTGGGGAGTAACCTTGAAC 749 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ACCAGATACACTAAATCTAATACAACAGAAAGTGGGGAGTAACCTTGAAC 747 seq1 TCTTTAGTACAGGAGACAACTTCCTGAACAGAACACCAGTGGCTCGGGCT 799 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TCTTTAGTACAGGAGACAACTTCCTGAACAGAACACCAGTGGCTCGGGCT 797 seq1 CTAAGATCAACAATTGATAAATGGGACCTCGTGAAACTAAAAAGCTTCTA 849 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CTAAGATCAACAATTGATAAATGGGACCTCGTGAAACTAAAAAGCTTCTA 847 seq1 TAAGGCAAAGGATACAGAAAATAGGACAAAACAGCAGCCTTCCGATTAGG 899 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TAAGGCAAAGGATACAGAAAATAGGACAAAACAGCAGCCTTCCGATTAGG 897 seq1 AAAGGACTTTTCAGCAACCCTACATCTGTTAGAGGGCTAATATCCAAAAT 949 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AAAGGACTTTTCAGCAACCCTACATCTGTTAGAGGGCTAATATCCAAAAT 947 seq1 TTATAAACTCAAGAATAACTAAAGACACCAATAACTAAAATCAAATAACC 999 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TTATAAACTCAAGAATAACTAAAGACACCAATAACTAAAATCAAATAACC 997 seq1 CAATCAAAAAATTGGTTACAGAGCTAAACAGAATTC 1035 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CAATCAAAAAATTGGTTACAGAGCTAAACAGAATTC 1033

BAC End 1

BAC End 2

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      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
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      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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