BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-090G22
Chromosome16 (Build37)
Map Location 53,381,741 - 53,570,383
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneAlcam, LOC100043430, LOC667895
Downstream geneLOC433027, LOC100043442
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-090G22.bB6Ng01-090G22.g
ACCDH902732DH902733
length1,1191,106
definitionDH902732|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-090G22, 5' end.DH902733|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-090G22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(53,569,265 - 53,570,383)(53,381,741 - 53,382,864)
sequence
gaattcctggtgagaaaagaacaaaagaaccttttaattccctagtacag
gacttaacaaccaaagccagtgtttattaatctcacaataagcaagaata
tattttagatattttagaagctagtagttttagctttcagcatagttaga
gagtttaaaggttagagattatcagtgttctgccctatgttaaatgctgt
gttccacttaaactaattccaagctgggcaggctcctggcaaactttaac
agatttacatatgaattactagaggaatatcagatttcacaaaacaggag
taaaagaagtgagtagaaatgactgccctacaagcctatcatcacatttg
ataaatcagggctttattcagtagaacccaatttcaccataaatctccag
tttgatgcaagcttttatggtaaactacaaaattttgccaaatattttgt
aaacatgaataaaaatgttttatttctttttcagtagagtgaaatagaat
tttataattaacataatagttagattacctgctttatagaaatctgacca
agctattcatcttatatataagatcttatacaaacacaaaattttttcat
aaggacattaatttattatggccaaaatctgttagttgaaaagtccttca
gtgaatgaatctatgaacagagatgtttgctgttttagtttggttcttca
tagtcctatttctgactagtaccaagcttgaccatggcagcatcaactgc
tatgggactgtttgtttagtttaagattagactaaaatgtgttattatat
tgcatattatagtcagcatctacagatattcaaaattcttctttgacaat
tctctttccataaaaagtttgaagttttgacttctataactaatataacc
agatctttatggtaaaactaaactcttgtttatttttacagattgtctgt
gtgtctctctgtgtgtgtatgtatgtgactttgtgggactgggtgtatgt
ggagtgatagtggtatataatgaatgttcatcggggggacttgatggccc
tctcaggtagaagccaaaatataccatggagtcattacttcccttcacct
ttcctggattcccagtgaa
gaattcccaaaagatgatagaatacatctctgaaattgatcatgaagaca
tatgaggacacttgctaaatgacaccatagctgagacagataaggaactg
gtaaggaagggttcctggcaaagcatagacctcagaggaaggtatgaatg
atttatgttgctcagggggattacagtgaaacagtataatggagaggaaa
agcttgcatcttaaaggagatagtgggtaattgatgcatatgctcattta
aaatgaatctagtgctgggaacttttaacaggtaaaataatactctatct
gtatattcttcttcattaatgtcagattgtattatttggatagaaaattt
catttaaaatggtgaaagaatggggaaatattttaaatatctagatctga
tattttaatgaaaatagtagtgttaaaaagttattgagtgaagatttgtg
gaagcaaggacccagaagatcactgaagcccctgtatccaggatgggact
ggaacattagccaatgtagtggtggattgactaagagactgagactcaga
aactttttatgtattggaaagcttcattttcttaaaaacaacaagaatta
caatctaatgtgcaatgaattacagatcaatatttccaaacccctctttt
ctggattcaaatatattaagtgtatagagcacaggtaaatatggcattga
ctatacaactgacaatctaacatagcaatttagttaaggatttattcatt
acccttcaatattcaaataagtgtttttatgccatgattcattcttttat
attgcaccatattgcaaaggtatagaaacagtacaatgcatatggcatag
caggtgtaatgtccaggatatgaacattctcttatcatatcactcatcac
aggagacttaaggaacgagatgatatctaaatttgtacagctatatatgt
cctttacatagtaaaagaactcttattttgaagatttacttttaacatta
tattttaatatatgtcctagaaagagcttcaaaactttcagtgctgactt
ctcaataaccttcagaatgacaacgttcgcttctaatgaagctgtacatg
agcaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_53569265_53570383
seq2: B6Ng01-090G22.b_43_1161 (reverse)

seq1  TTCACT-GGAACGCAGGAAAGGGTGGAAGGGATGAAATGACTCCATAGAT  49
      |||||| ||||  |||||||||   ||||||| | ||||||||||| |  
seq2  TTCACTGGGAATCCAGGAAAGG--TGAAGGGAAGTAATGACTCCATGGTA  48

seq1  TATTTTTGGCTTCTACCCTGAGGTGGCATTCATGTCACCACAAATAAACA  99
      || |||||||||||| ||||||  |||  ||| ||| || |  || ||||
seq2  TA-TTTTGGCTTCTA-CCTGAGAGGGCCATCAAGTC-CCCCCGATGAACA  95

seq1  -TCA-TATATA-CACAATCACT-CACATACACCCAGTCCCACAAAGTCAC  145
       ||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATTATATACCACTATCACTCCACATACACCCAGTCCCACAAAGTCAC  145

seq1  ATACATACACACACAGAGAGACACACAGACAATCTGTAAAAATAAACAAG  195
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATACACACACAGAGAGACACACAGACAATCTGTAAAAATAAACAAG  195

seq1  AGTTTAGTTTTACCATAAAGATCTGGTTATATTAGTTATAGAAGTCAAAA  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTAGTTTTACCATAAAGATCTGGTTATATTAGTTATAGAAGTCAAAA  245

seq1  CTTCAAACTTTTTATGGAAAGAGAATTGTCAAAGAAGAATTTTGAATATC  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAAACTTTTTATGGAAAGAGAATTGTCAAAGAAGAATTTTGAATATC  295

seq1  TGTAGATGCTGACTATAATATGCAATATAATAACACATTTTAGTCTAATC  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGATGCTGACTATAATATGCAATATAATAACACATTTTAGTCTAATC  345

seq1  TTAAACTAAACAAACAGTCCCATAGCAGTTGATGCTGCCATGGTCAAGCT  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAACTAAACAAACAGTCCCATAGCAGTTGATGCTGCCATGGTCAAGCT  395

seq1  TGGTACTAGTCAGAAATAGGACTATGAAGAACCAAACTAAAACAGCAAAC  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTACTAGTCAGAAATAGGACTATGAAGAACCAAACTAAAACAGCAAAC  445

seq1  ATCTCTGTTCATAGATTCATTCACTGAAGGACTTTTCAACTAACAGATTT  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCTGTTCATAGATTCATTCACTGAAGGACTTTTCAACTAACAGATTT  495

seq1  TGGCCATAATAAATTAATGTCCTTATGAAAAAATTTTGTGTTTGTATAAG  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCATAATAAATTAATGTCCTTATGAAAAAATTTTGTGTTTGTATAAG  545

seq1  ATCTTATATATAAGATGAATAGCTTGGTCAGATTTCTATAAAGCAGGTAA  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTATATATAAGATGAATAGCTTGGTCAGATTTCTATAAAGCAGGTAA  595

seq1  TCTAACTATTATGTTAATTATAAAATTCTATTTCACTCTACTGAAAAAGA  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAACTATTATGTTAATTATAAAATTCTATTTCACTCTACTGAAAAAGA  645

seq1  AATAAAACATTTTTATTCATGTTTACAAAATATTTGGCAAAATTTTGTAG  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAAACATTTTTATTCATGTTTACAAAATATTTGGCAAAATTTTGTAG  695

seq1  TTTACCATAAAAGCTTGCATCAAACTGGAGATTTATGGTGAAATTGGGTT  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACCATAAAAGCTTGCATCAAACTGGAGATTTATGGTGAAATTGGGTT  745

seq1  CTACTGAATAAAGCCCTGATTTATCAAATGTGATGATAGGCTTGTAGGGC  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACTGAATAAAGCCCTGATTTATCAAATGTGATGATAGGCTTGTAGGGC  795

seq1  AGTCATTTCTACTCACTTCTTTTACTCCTGTTTTGTGAAATCTGATATTC  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCATTTCTACTCACTTCTTTTACTCCTGTTTTGTGAAATCTGATATTC  845

seq1  CTCTAGTAATTCATATGTAAATCTGTTAAAGTTTGCCAGGAGCCTGCCCA  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTAGTAATTCATATGTAAATCTGTTAAAGTTTGCCAGGAGCCTGCCCA  895

seq1  GCTTGGAATTAGTTTAAGTGGAACACAGCATTTAACATAGGGCAGAACAC  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGGAATTAGTTTAAGTGGAACACAGCATTTAACATAGGGCAGAACAC  945

seq1  TGATAATCTCTAACCTTTAAACTCTCTAACTATGCTGAAAGCTAAAACTA  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAATCTCTAACCTTTAAACTCTCTAACTATGCTGAAAGCTAAAACTA  995

seq1  CTAGCTTCTAAAATATCTAAAATATATTCTTGCTTATTGTGAGATTAATA  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGCTTCTAAAATATCTAAAATATATTCTTGCTTATTGTGAGATTAATA  1045

seq1  AACACTGGCTTTGGTTGTTAAGTCCTGTACTAGGGAATTAAAAGGTTCTT  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACTGGCTTTGGTTGTTAAGTCCTGTACTAGGGAATTAAAAGGTTCTT  1095

seq1  TTGTTCTTTTCTCACCAGGAATTC  1119
      ||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTCTTTTCTCACCAGGAATTC  1119

seq1: chr16_53381741_53382864
seq2: B6Ng01-090G22.g_68_1173

seq1  GAATTCCCAAAAGATGATAGAATACATCTCTGAAATTGATCATGAAGACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCAAAAGATGATAGAATACATCTCTGAAATTGATCATGAAGACA  50

seq1  TATGAGGACACTTGCTAAATGACACCATAGCTGAGACAGATAAGGAACTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGAGGACACTTGCTAAATGACACCATAGCTGAGACAGATAAGGAACTG  100

seq1  GTAAGGAAGGGTTCCTGGCAAAGCATAGACCTCAGAGGAAGGTATGAATG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAGGAAGGGTTCCTGGCAAAGCATAGACCTCAGAGGAAGGTATGAATG  150

seq1  ATTTATGTTGCTCAGGGGGATTACAGTGAAACAGTATAATGGAGAGGAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTATGTTGCTCAGGGGGATTACAGTGAAACAGTATAATGGAGAGGAAA  200

seq1  AGCTTGCATCTTAAAGGAGATAGTGGGTAATTGATGCATATGCTCATTTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTGCATCTTAAAGGAGATAGTGGGTAATTGATGCATATGCTCATTTA  250

seq1  AAATGAATCTAGTGCTGGGAACTTTTAACAGGTAAAATAATACTCTATCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGAATCTAGTGCTGGGAACTTTTAACAGGTAAAATAATACTCTATCT  300

seq1  GTATATTCTTCTTCATTAATGTCAGATTGTATTATTTGGATAGAAAATTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATATTCTTCTTCATTAATGTCAGATTGTATTATTTGGATAGAAAATTT  350

seq1  CATTTAAAATGGTGAAAGAATGGGGAAATATTTTAAATATCTAGATCTGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTAAAATGGTGAAAGAATGGGGAAATATTTTAAATATCTAGATCTGA  400

seq1  TATTTTAATGAAAATAGTAGTGTTAAAAAGTTATTGAGTGAAGATTTGTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTAATGAAAATAGTAGTGTTAAAAAGTTATTGAGTGAAGATTTGTG  450

seq1  GAAGCAAGGACCCAGAAGATCACTGAAGCCCCTGTATCCAGGATGGGACT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCAAGGACCCAGAAGATCACTGAAGCCCCTGTATCCAGGATGGGACT  500

seq1  GGAACATTAGCCAATGTAGTGGTGGATTGACTAAGAGACTGAGACTCAGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACATTAGCCAATGTAGTGGTGGATTGACTAAGAGACTGAGACTCAGA  550

seq1  AACTTTTTATGTATTGGAAAGCTTCATTTTCTTAAAAACAACAAGAATTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTTTTATGTATTGGAAAGCTTCATTTTCTTAAAAACAACAAGAATTA  600

seq1  CAATCTAATGTGCAATGAATTACAGATCAATATTTCCAAACCCCTCTTTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATCTAATGTGCAATGAATTACAGATCAATATTTCCAAACCCCTCTTTT  650

seq1  CTGGATTCAAATATATTAAGTGTATAGAGCACAGGTAAATATGGCATTGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGATTCAAATATATTAAGTGTATAGAGCACAGGTAAATATGGCATTGA  700

seq1  CTATACAACTGACAATCTAACATAGCAATTTAGTTAAGGATTTATTCATT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATACAACTGACAATCTAACATAGCAATTTAGTTAAGGATTTATTCATT  750

seq1  ACCCTTCAATATTCAAATAAGTGTTTTTATGCCATGATTCATTCTTTTAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTTCAATATTCAAATAAGTGTTTTTATGCCATGATTCATTCTTTTAT  800

seq1  ATTGCACCATATTGCAAAGGTATAGAAACAGTACAATGCATATGGCATAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCACCATATTGCAAAGGTATAGAAACAGTACAATGCATATGGCATAG  850

seq1  CAGGTGTAATGTCCAGGATATGAACATTCTCTTATCATATCACTCATCAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTGTAATGTCCAGGATATGAACATTCTCTTATCATATCACTCATCAC  900

seq1  AGGAGACTTAAGGAACGAGATGATAATCTAAATATTGTACAAGCTATATA  950
      |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||
seq2  AGGAGACTTAAGGAACGAGATGAT-ATCTAAAT-TTGTAC-AGCTATATA  947

seq1  TGTCCTTTACAATAGTAAAAGAACTCTTATTTTGAAGAATTTACTTTTAA  1000
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
seq2  TGTCCTTTAC-ATAGTAAAAGAACTCTTATTTTGAAG-ATTTACTTTT-A  994

seq1  ACATTATATCTAATTATATGTCCTAGAAAGAGGCTTCCAAATACTTTCAA  1050
      ||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||  || |||||| |
seq2  ACATTATATTTTAATATATGTCCTAGAAAGA-GCTTC--AAAACTTTC-A  1040

seq1  GTGGCTGACTTCTCCAAATACACCTTTCAGAAATGACAAAACGTTCGC-T  1099
      || |||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||  ||||||||| |
seq2  GT-GCTGACTTCTC--AATA-ACC-TTCAG-AATGAC--AACGTTCGCTT  1082

seq1  CTCATGAGGCTGTACATGAGGCAGA  1124
      || |||| ||||||||||| |||||
seq2  CTAATGAAGCTGTACATGA-GCAGA  1106