BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-119I23
Chromosome16 (Build37)
Map Location 14,024,337 - 14,203,625
singlet/doubletdoublet
Overlap gene2900011O08Rik, 4921513D23Rik, Nde1, Myh11
Upstream geneErcc4, Gt4-1, Mkl2, Parn, LOC100043196, 3110001I22Rik, Pla2g10, A930007A09Rik, LOC622757, Rrn3, Ntan1, Pdxdc1, Mpv17l, Ifitm7
Downstream gene0610037P05Rik, Abcc1, Gm1758, Snai2, Efcab1, LOC100042737
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-119I23.bB6Ng01-119I23.g
ACCDH923742DH923743
length1,1851,062
definitionDH923742|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-119I23, 5' end.DH923743|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-119I23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(14,202,445 - 14,203,625)(14,024,337 - 14,025,398)
sequence
gaattctatcatgtcctgaagccaccacggaaaggatccacttattaagc
cagagcctcagaatctagtcatttaccagagccgatcagttgataactga
gcccccagtgcatgagcttgtgagggacatttcccattcaaaccatgata
caggtgaccgtgggtgactctggtctcccttgagcttgttttcccagtta
gagaatgagggccacctgagacaacacctttctagggagagaggcttaag
actggggaaggcccatgggtccccaaagcagcttcattccctctaggaat
acactgcaggatgagaagcgccgcctggaggcaaggatcgcccaactaga
ggaggagctggaggaagagcagggcaacatggaggccatgagtgatagag
tacgcaaggccacactgcaggtaggacatactgaggttagagtgagggga
gagggagggaacacctactcaagccatttaagttaacacagagggctcag
gaaggagcctgaccctacctaaccttttagctctgggtagttgcttctgc
cctgtgcaggacacctgtattgggcacttagccactggactcaaaataag
cacctgagggctatggtgaggcaagacctcttggccatccatattctcca
actggaagggcagagtgccttgggtttcctgaaacagaatctaggtgtag
cccagcactggctaagtagcatgcaccacaggtatgctttgtgttagttc
cagagattgaggagaaagagaggagacccaaaaataaggcacagggtcct
tcttcctccatgtctctgtgtgtcgtgcttgtttctgactgtggtttaga
agactaaacggaccccacagggtcttctgttagccagcatcatcttgttt
atactccaccatatgggccatggtgaatggcactggtgtttttcctcact
gcttttgcccagtcccagagtccttggtgccactgtggagtggaaagctc
ttcagcatctctggatgggtgcaaggggcaatctggtaggcccctcaggg
tctgggctaggtagcatggcagaacagaaacaggtttcctggctcagtct
agtgtgcaccatggaagccttcttgagttgagtctcggaattgacacgaa
tggttagaaatggaagagaaccagtgctctggcct
gaattctttgtttagctctgtaccccatttttaatggggttatttgactt
tctggagtccatcttcttgagttctttatatatattggattttagtcccc
tatctgatttaggattgataaagatcttttcccaatttgttggtggcctt
tttgtcttattggcagtgtcttttgccttacagaagctttgcaaatttat
gaggtcccatttgtcaattcttgatcttacagcacaagccattgctgttc
tgttcaggaatttttctcctgtgaccatatcttcgaggtttttccccact
ttctcctctataagtttcagtgtctctggtttaatgtggagttccttgat
ccacttagacttgagctttgtacaaggagataagaatggatcaatttgca
ttcttctacatgataaccaccagttgggcctgcaccatttgggaaccaaa
gagtttattgtgaggggttatttacaggggaacgggtgaccccaaagcag
gttgaccatcaaaaagtctcatccagcatggatgacaactgccccatagg
tgcactgacaccatactaacttcagctaaacttcaagcctctgtacactc
cagcacctcccaagatgataatgaggctgcaggcacttattgcataatta
cacacagctggctgagaggtgctggctggggtggctagaatcttaagtga
gaggccagtggacccccccccccctcacgcacacacacacacactctttc
ctataaaggagcatccacagggccaattttgaggatcttttgcaaattag
ttacagctgttcttatgatttttatactgaaagagagtgttacaatagca
ggagagagaatatggaggtaggtgctgagtttgcctcttatcttaagact
tggctaattttcccagcctgaactggtgctatgatagagagaaaggaagc
agctggtgatagaggatctgattggtcagattctgtgtcaccctcatcct
taaaggaatggatgcagggagaggtgaaagaaatagatagtctctgggct
ggggagctgcat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_14202445_14203625
seq2: B6Ng01-119I23.b_50_1234 (reverse)

seq1  AGGCCAGAGCACCTGCTTCCTCTCTCATTTTCTACCCATTCGTTGTCATC  50
      ||||||||||| ||| || |||| ||  |||||| ||||||| |||||  
seq2  AGGCCAGAGCA-CTGGTT-CTCT-TCCATTTCTAACCATTCG-TGTCAAT  46

seq1  TCC-AGACTCAACTC-AGAAGCCT--CCTGTGTCAC-CTAGACTGAGCCA  95
      ||| ||||||||||| ||||| ||  | ||   ||| |||||||||||||
seq2  TCCGAGACTCAACTCAAGAAGGCTTCCATGGTGCACACTAGACTGAGCCA  96

seq1  -GAAACCTG-TTCTGTTCTGCCCATGCTCCCTAGCCCAGACCCTGAGGGG  143
       |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  GGAAACCTGTTTCTGTTCTG-CCATGCTACCTAGCCCAGACCCTGAGGGG  145

seq1  -CTA-CAGATGGCCCCTTGCACCCATCCAGAGATGCTGAAGAAGCTTCCA  191
       ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||
seq2  CCTACCAGATTGCCCCTTGCACCCATCCAGAGATGCTGAAGAGCTTTCCA  195

seq1  CTCCACAGTGGCACCAAGGACTCTTGGGACTGGGCAAAAAGCAGTGAGGA  241
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
seq2  CTCCACAGTGGCACCAAGGACTC-TGGGACTGGGC-AAAAGCAGTGAGGA  243

seq1  AAAACACCAGTGCCATTCACCATGG-CCATATGGTGGAGTATAAACAAGA  290
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACACCAGTGCCATTCACCATGGCCCATATGGTGGAGTATAAACAAGA  293

seq1  TGATGCTGGCTAACAGAAGACCCTGT-GGGTCCGTTTAGTCTTCTAAACC  339
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGCTGGCTAACAGAAGACCCTGTGGGGTCCGTTTAGTCTTCTAAACC  343

seq1  ACAGTCAGAAACAAGCACGACACACAGAGACATGGAGGAAGAAGGACCCT  389
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTCAGAAACAAGCACGACACACAGAGACATGGAGGAAGAAGGACCCT  393

seq1  GTGCCTTATTTTTGGGTCTCCTCTCTTTCTCCTCAATCTCTGGAACTAAC  439
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCTTATTTTTGGGTCTCCTCTCTTTCTCCTCAATCTCTGGAACTAAC  443

seq1  ACAAAGCATACCTGTGGTGCATGCTACTTAGCCAGTGCTGGGCTACACCT  489
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAGCATACCTGTGGTGCATGCTACTTAGCCAGTGCTGGGCTACACCT  493

seq1  AGATTCTGTTTCAGGAAACCCAAGGCACTCTGCCCTTCCAGTTGGAGAAT  539
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTCTGTTTCAGGAAACCCAAGGCACTCTGCCCTTCCAGTTGGAGAAT  543

seq1  ATGGATGGCCAAGAGGTCTTGCCTCACCATAGCCCTCAGGTGCTTATTTT  589
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGATGGCCAAGAGGTCTTGCCTCACCATAGCCCTCAGGTGCTTATTTT  593

seq1  GAGTCCAGTGGCTAAGTGCCCAATACAGGTGTCCTGCACAGGGCAGAAGC  639
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCCAGTGGCTAAGTGCCCAATACAGGTGTCCTGCACAGGGCAGAAGC  643

seq1  AACTACCCAGAGCTAAAAGGTTAGGTAGGGTCAGGCTCCTTCCTGAGCCC  689
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTACCCAGAGCTAAAAGGTTAGGTAGGGTCAGGCTCCTTCCTGAGCCC  693

seq1  TCTGTGTTAACTTAAATGGCTTGAGTAGGTGTTCCCTCCCTCTCCCCTCA  739
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTGTTAACTTAAATGGCTTGAGTAGGTGTTCCCTCCCTCTCCCCTCA  743

seq1  CTCTAACCTCAGTATGTCCTACCTGCAGTGTGGCCTTGCGTACTCTATCA  789
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTAACCTCAGTATGTCCTACCTGCAGTGTGGCCTTGCGTACTCTATCA  793

seq1  CTCATGGCCTCCATGTTGCCCTGCTCTTCCTCCAGCTCCTCCTCTAGTTG  839
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATGGCCTCCATGTTGCCCTGCTCTTCCTCCAGCTCCTCCTCTAGTTG  843

seq1  GGCGATCCTTGCCTCCAGGCGGCGCTTCTCATCCTGCAGTGTATTCCTAG  889
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCGATCCTTGCCTCCAGGCGGCGCTTCTCATCCTGCAGTGTATTCCTAG  893

seq1  AGGGAATGAAGCTGCTTTGGGGACCCATGGGCCTTCCCCAGTCTTAAGCC  939
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAATGAAGCTGCTTTGGGGACCCATGGGCCTTCCCCAGTCTTAAGCC  943

seq1  TCTCTCCCTAGAAAGGTGTTGTCTCAGGTGGCCCTCATTCTCTAACTGGG  989
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCCCTAGAAAGGTGTTGTCTCAGGTGGCCCTCATTCTCTAACTGGG  993

seq1  AAAACAAGCTCAAGGGAGACCAGAGTCACCCACGGTCACCTGTATCATGG  1039
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACAAGCTCAAGGGAGACCAGAGTCACCCACGGTCACCTGTATCATGG  1043

seq1  TTTGAATGGGAAATGTCCCTCACAAGCTCATGCACTGGGGGCTCAGTTAT  1089
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAATGGGAAATGTCCCTCACAAGCTCATGCACTGGGGGCTCAGTTAT  1093

seq1  CAACTGATCGGCTCTGGTAAATGACTAGATTCTGAGGCTCTGGCTTAATA  1139
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTGATCGGCTCTGGTAAATGACTAGATTCTGAGGCTCTGGCTTAATA  1143

seq1  AGTGGATCCATTCCGTGGTGGCTTCAGGACATGATAGAATTC  1181
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGATCCTTTCCGTGGTGGCTTCAGGACATGATAGAATTC  1185

seq1: chr16_14024337_14025398
seq2: B6Ng01-119I23.g_68_1128

seq1  GAATTCTTTGTTTAGCTCTGTACCCCATTTTTAATGGGGTTATTTGACTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTGTTTAGCTCTGTACCCCATTTTTAATGGGGTTATTTGACTT  50

seq1  TCTGGAGTCCATCTTCTTGAGTTCTTTATATATATTGGATTTTAGTCCCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGAGTCCATCTTCTTGAGTTCTTTATATATATTGGATTTTAGTCCCC  100

seq1  TATCTGATTTAGGATTGATAAAGATCTTTTCCCAATTTGTTGGTGGCCTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTGATTTAGGATTGATAAAGATCTTTTCCCAATTTGTTGGTGGCCTT  150

seq1  TTTGTCTTATTGGCAGTGTCTTTTGCCTTACAGAAGCTTTGCAAATTTAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTCTTATTGGCAGTGTCTTTTGCCTTACAGAAGCTTTGCAAATTTAT  200

seq1  GAGGTCCCATTTGTCAATTCTTGATCTTACAGCACAAGCCATTGCTGTTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTCCCATTTGTCAATTCTTGATCTTACAGCACAAGCCATTGCTGTTC  250

seq1  TGTTCAGGAATTTTTCTCCTGTGACCATATCTTCGAGGTTTTTCCCCACT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCAGGAATTTTTCTCCTGTGACCATATCTTCGAGGTTTTTCCCCACT  300

seq1  TTCTCCTCTATAAGTTTCAGTGTCTCTGGTTTAATGTGGAGTTCCTTGAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCCTCTATAAGTTTCAGTGTCTCTGGTTTAATGTGGAGTTCCTTGAT  350

seq1  CCACTTAGACTTGAGCTTTGTACAAGGAGATAAGAATGGATCAATTTGCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTTAGACTTGAGCTTTGTACAAGGAGATAAGAATGGATCAATTTGCA  400

seq1  TTCTTCTACATGATAACCACCAGTTGGGCCTGCACCATTTGGGAACCAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTCTACATGATAACCACCAGTTGGGCCTGCACCATTTGGGAACCAAA  450

seq1  GAGTTTATTGTGAGGGGTTATTTACAGGGGAACGGGTGACCCCAAAGCAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTTATTGTGAGGGGTTATTTACAGGGGAACGGGTGACCCCAAAGCAG  500

seq1  GTTGACCATCAAAAAGTCTCATCCAGCATGGATGACAACTGCCCCATAGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGACCATCAAAAAGTCTCATCCAGCATGGATGACAACTGCCCCATAGG  550

seq1  TGCACTGACACCATACTAACTTCAGCTAAACTTCAAGCCTCTGTACACTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACTGACACCATACTAACTTCAGCTAAACTTCAAGCCTCTGTACACTC  600

seq1  CAGCACCTCCCAAGATGATAATGAGGCTGCAGGCACTTATTGCATAATTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCACCTCCCAAGATGATAATGAGGCTGCAGGCACTTATTGCATAATTA  650

seq1  CACACAGCTGGCTGAGAGGTGCTGGCTGGGGTGGCTAGAATCTTAAGTGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACAGCTGGCTGAGAGGTGCTGGCTGGGGTGGCTAGAATCTTAAGTGA  700

seq1  GAGGCCAGTGGACCCCCCCCCCCCTCACGCACACACACACACACTCTTTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCCAGTGGACCCCCCCCCCCCTCACGCACACACACACACACTCTTTC  750

seq1  CTATAAAGGAGCATCCACAGGGCCAATTTTGAGGATCTTTTGCAAATTAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATAAAGGAGCATCCACAGGGCCAATTTTGAGGATCTTTTGCAAATTAG  800

seq1  TTACAGCTGTTCTTATGATTTTTATACTGAAGGAGAGTGTTACAATAGCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TTACAGCTGTTCTTATGATTTTTATACTGAAAGAGAGTGTTACAATAGCA  850

seq1  GGAGAGAG-ATATGGAGGTAGGTGCTGAGTTTGCCTCTTATCTT-AGACT  898
      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  GGAGAGAGAATATGGAGGTAGGTGCTGAGTTTGCCTCTTATCTTAAGACT  900

seq1  TGGCTAATTTTCCCAGCCTGAACTGGTGCTATGATAGAGAGAAAGGAAGC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTAATTTTCCCAGCCTGAACTGGTGCTATGATAGAGAGAAAGGAAGC  950

seq1  AGCTGGTGATAGAGGATTCTGATTGGTCAGATTCTGTGTCACCTCTCATT  998
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |
seq2  AGCTGGTGATAGAGGA-TCTGATTGGTCAGATTCTGTGTCACC-CTCA-T  997

seq1  CCTTAAAGGAAATGGATGCAGGGAGAGGTGAGAG-AATAGATAGTCTCTG  1047
      ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
seq2  CCTTAAAGG-AATGGATGCAGGGAGAGGTGAAAGAAATAGATAGTCTCTG  1046

seq1  GGCTGGGGAGCTGCA  1062
      |||||||||||||||
seq2  GGCTGGGGAGCTGCA  1061