BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-138B07
Chromosome16 (Build37)
Map Location 70,067,956 - 70,181,735
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneSpeer2
Downstream geneEG664930, Gbe1, D16Ertd519e, LOC100039231
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-138B07.bB6Ng01-138B07.g
ACCDH937434DH937435
length668832
definitionDH937434|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-138B07, 5' end.DH937435|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-138B07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(70,181,072 - 70,181,735)(70,067,956 - 70,068,786)
sequence
gctcctggacatgaccttataaaaggagaggaagttttaaccggctccca
gctacttgacctcctctgaggaggcaaaggtggggagcatgggcctatgt
agtcaggaagtgtaagaccagaccagaaaacagaggcgatggtagccagg
aagtgcaagatccaggcaggctagggaaaatgggaagtggggggctgtag
ggtgtggaggaggaattccactcttgatgatctcaggaggatatatttcc
agggtttgatcataccctgacactactattgctctaaacctgcctctcct
ggtcctatgggtccctggccccacaattaactttgacaaaggtcacataa
gcagtacagcagtcaccagctcagctggtgtgggtcccgggtctctactc
taggtggactattgtggaatgatggtttttcactcaggagaagctaacaa
gttttggtcctaatggctggaaatagattacagttgctgtctactttata
tattttaattggtgaagataattagcctttgtctgaatgagtaatctttg
ccctatttagcatgttttgttaactacaagtataataaaatcatagcagt
gagtgtgaagttgctatttctgtgtccctaaaaaatcaaatcatagcatt
ttaattatttttaatttc
gaattcatttctaaactaaaactgacttgagagataaacagggagttatg
aatattgtcaggaatgcatcaatttttaaccaaggagagagagtactgag
cctacatgtggtggaaacatgaaagtctggaagttaacatttagaagacc
tttccccatcactatacaatgctgaaaaaatgtggacggtgaattacatg
atcctcataggcatgtacaatatttaaaaaatcttccacactcaagttgc
tataatttatagaccactaaatgtgtggaactaacggttatgtgactctg
atcaaggcatttttctgtgttgaattgatgggccaacatatatacaaagc
ccccttccctttcaataaattctgaaagttgacagttaggaaagttaaat
tttatcttaactgtaaataaatatgtaaaaaatagaggaggtggccttat
tgagtaataccacctttgagaggataatgagatcctgtaatagaaaaaaa
ttaatacgaattattctagtgtcatatagaatgagtcattaatgtgagtc
ttaaaacaaagacattaaaagttcatattttggtttgaatatcatacacc
tgaccaactcatgtgttggaatgtttggtcaccagttggtggcactatta
gaggagatcacagaacattttggaactgttttctagctagcaggaatgaa
ttgctgtttatctttaagatgtattattagtgtgtgtgtgtgtgtgtgcg
tgtgcgtgtgcgtgtgcgtgtgcgtgtgcgtgtgcgtgtgcgcgtgcgcg
tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagtgtgtgtgta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_70181072_70181735
seq2: B6Ng01-138B07.b_58_725 (reverse)

seq1  GAACTTAAAAATAATT-AAATGCTATGATTTGATTTTTTA-GGACACAGA  48
      ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  GAAATTAAAAATAATTAAAATGCTATGATTTGATTTTTTAGGGACACAGA  50

seq1  AATAGCAACTTCACACTCACTGCTATGA-TTTATTATACTTGTAGTTAAC  97
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  AATAGCAACTTCACACTCACTGCTATGATTTTATTATACTTGTAGTTAAC  100

seq1  AAAACATGCT-AATAGGGCAAAGATTACTCATTCAGACAAAGGCTAATTA  146
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACATGCTAAATAGGGCAAAGATTACTCATTCAGACAAAGGCTAATTA  150

seq1  TCTTCACCAATTAAAATATATAAAGTAGACAGCAACTGTAATCTATTTCC  196
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCACCAATTAAAATATATAAAGTAGACAGCAACTGTAATCTATTTCC  200

seq1  AGCCATTAGGACCAAAACTTGTTAGCTTCTCCTGAGTGAAAAACCATCAT  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCATTAGGACCAAAACTTGTTAGCTTCTCCTGAGTGAAAAACCATCAT  250

seq1  TCCACAATAGTCCACCTAGAGTAGAGACCCGGGACCCACACCAGCTGAGC  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACAATAGTCCACCTAGAGTAGAGACCCGGGACCCACACCAGCTGAGC  300

seq1  TGGTGACTGCTGTACTGCTTATGTGACCTTTGTCAAAGTTAATTGTGGGG  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGACTGCTGTACTGCTTATGTGACCTTTGTCAAAGTTAATTGTGGGG  350

seq1  CCAGGGACCCATAGGACCAGGAGAGGCAGGTTTAGAGCAATAGTAGTGTC  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGGACCCATAGGACCAGGAGAGGCAGGTTTAGAGCAATAGTAGTGTC  400

seq1  AGGGTATGATCAAACCCTGGAAATATATCCTCCTGAGATCATCAAGAGTG  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTATGATCAAACCCTGGAAATATATCCTCCTGAGATCATCAAGAGTG  450

seq1  GAATTCCTCCTCCACACCCTACAGCCCCCCACTTCCCATTTTCCCTAGCC  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTCCTCCACACCCTACAGCCCCCCACTTCCCATTTTCCCTAGCC  500

seq1  TGCCTGGATCTTGCACTTCCTGGCTACCATCGCCTCTGTTTTCTGGTCTG  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTGGATCTTGCACTTCCTGGCTACCATCGCCTCTGTTTTCTGGTCTG  550

seq1  GTCTTACACTTCCTGACTACATAGGCCCATGCTCCCCACCTTTGCCTCCT  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTACACTTCCTGACTACATAGGCCCATGCTCCCCACCTTTGCCTCCT  600

seq1  CAGAGGAGGTCAAGTAGCTGGGAGCCGGTTAAAACTTCCTCTCCTTTTAT  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGGAGGTCAAGTAGCTGGGAGCCGGTTAAAACTTCCTCTCCTTTTAT  650

seq1  AAGGTCATGTCCAGGAGC  664
      ||||||||||||||||||
seq2  AAGGTCATGTCCAGGAGC  668

seq1: chr16_70067956_70068786
seq2: B6Ng01-138B07.g_67_897

seq1  GAATTCATTTCTAAACTAAAACTGACTTGAGAGATAAACAGGGAGTTATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTTCTAAACTAAAACTGACTTGAGAGATAAACAGGGAGTTATG  50

seq1  AATATTGTCAGGAATGCATCAATTTTTAACCAAGGAGAGAGAGTACTGAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATTGTCAGGAATGCATCAATTTTTAACCAAGGAGAGAGAGTACTGAG  100

seq1  CCTACATGTGGTGGAAACATGAAAGTCTGGAAGTTAACATTTAGAAGACC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTACATGTGGTGGAAACATGAAAGTCTGGAAGTTAACATTTAGAAGACC  150

seq1  TTTCCCCATCACTATACAATGCTGAAAAAATGTGGACGGTGAATTACATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCCCATCACTATACAATGCTGAAAAAATGTGGACGGTGAATTACATG  200

seq1  ATCCTCATAGGCATGTACAATATTTAAAAAATCTTCCACACTCAAGTTGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTCATAGGCATGTACAATATTTAAAAAATCTTCCACACTCAAGTTGC  250

seq1  TATAATTTATAGACCACTAAATGTGTGGAACTAACGGTTATGTGACTCTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAATTTATAGACCACTAAATGTGTGGAACTAACGGTTATGTGACTCTG  300

seq1  ATCAAGGCATTTTTCTGTGTTGAATTGATGGGCCAACATATATACAAAGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAGGCATTTTTCTGTGTTGAATTGATGGGCCAACATATATACAAAGC  350

seq1  CCCCTTCCCTTTCAATAAATTCTGAAAGTTGACAGTTAGGAAAGTTAAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTTCCCTTTCAATAAATTCTGAAAGTTGACAGTTAGGAAAGTTAAAT  400

seq1  TTTATCTTAACTGTAAATAAATATGTAAAAAATAGAGGAGGTGGCCTTAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATCTTAACTGTAAATAAATATGTAAAAAATAGAGGAGGTGGCCTTAT  450

seq1  TGAGTAATACCACCTTTGAGAGGATAATGAGATCCTGTAATAGAAAAAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTAATACCACCTTTGAGAGGATAATGAGATCCTGTAATAGAAAAAAA  500

seq1  TTAATACGAATTATTCTAGTGTCATATAGAATGAGTCATTAATGTGAGTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATACGAATTATTCTAGTGTCATATAGAATGAGTCATTAATGTGAGTC  550

seq1  TTAAAACAAAGACATTAAAAGTTCATATTTTGGTTTGAATATCATACACC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAACAAAGACATTAAAAGTTCATATTTTGGTTTGAATATCATACACC  600

seq1  TGACCAACTCATGTGTTGGAATGTTTGGTCACCAGTTGGTGGCACTATTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACCAACTCATGTGTTGGAATGTTTGGTCACCAGTTGGTGGCACTATTA  650

seq1  GAGGAGATCACAGAACATTTTGGAACTGTTTTCTAGCTAGCAGGAATGAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAGATCACAGAACATTTTGGAACTGTTTTCTAGCTAGCAGGAATGAA  700

seq1  TTGCTGTTTATCTTTAAGATGTATTATTAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTGTTTATCTTTAAGATGTATTATTAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCG  750

seq1  TGTGCGTGTGCGTGTGCGTGTGCGTGTGCGTGTGCGTGTGCGCGTGCGCG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCGTGTGCGTGTGCGTGTGCGTGTGCGTGTGCGTGTGCGCGTGCGCG  800

seq1  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  831
      |||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGTGTGTGT  831