BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-148J10
Chromosome16 (Build37)
Map Location 82,189,906 - 82,310,294
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneNcam2, LOC621470, LOC435484, Pgk1-ps1
Downstream geneEG665260
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-148J10.bB6Ng01-148J10.g
ACCDH945149DH945150
length9241,019
definitionDH945149|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-148J10, 5' end.DH945150|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-148J10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(82,189,906 - 82,190,830)(82,309,273 - 82,310,294)
sequence
gaattcaatggacatcaatttaatcattttcatatatttaattatttata
ttgccgtatcttttttatcattgtttttaaagaaattaaatgaaatattg
ggaccaagcaatagcaggatcataatttaaatatattttcagataaagct
attatatacatttaaaatgaaatattctcttttgaatatggaaagatatt
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aaaactctatttttacatataccgtcaatatattagaatgttgatatatc
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atcttgttttgttaatagaatgtcttcttgctatgctgtcaggcaatatg
cttgctttatctgtgtagcacatgataaaaaatgttaaaatctgacattt
agtggggagttgtaggttagacccaatcggccatcatcaggtggaatgaa
agaagccacaatttggaggactgaatttggaaagtattaggaattttgaa
ctttaatggttctatatca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_82189906_82190830
seq2: B6Ng01-148J10.b_43_966

seq1  GAATTCAATGGACATCAATTTAATCATTTTCATATATTTAATTATTTATA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATGGACATCAATTTAATCATTTTCATATATTTAATTATTTATA  50

seq1  TTGCCGTATCTTTTTTATCATTGTTTTTAAAGAAATTAAATGAAATATTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCGTATCTTTTTTATCATTGTTTTTAAAGAAATTAAATGAAATATTG  100

seq1  GGACCAAGCAATAGCAGGATCATAATTTAAATATATTTTCAGATAAAGCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACCAAGCAATAGCAGGATCATAATTTAAATATATTTTCAGATAAAGCT  150

seq1  ATTATATACATTTAAAATGAAATATTCTCTTTTGAATATGGAAAGATATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATATACATTTAAAATGAAATATTCTCTTTTGAATATGGAAAGATATT  200

seq1  ACAGTCTCAAATATTTAGTGCTTGGTTCTTAGTTGATGGTATAATTGTAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTCTCAAATATTTAGTGCTTGGTTCTTAGTTGATGGTATAATTGTAG  250

seq1  GGTAGGATATTGGACACGTTGAATAGTTATGAAAACGGGGTTTACATTGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGGATATTGGACACGTTGAATAGTTATGAAAACGGGGTTTACATTGG  300

seq1  AAGTTTAGATACATAGTCGCTGTTTCTTTCCTTTCTCTCTCTAGCTATTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTTAGATACATAGTCGCTGTTTCTTTCCTTTCTCTCTCTAGCTATTT  350

seq1  GATACAATTTTTAATGATCTGAAAATCTTTTGACACGAGTTCATGTTGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATACAATTTTTAATGATCTGAAAATCTTTTGACACGAGTTCATGTTGCT  400

seq1  ATGAAAATCTATCTCAACATGGGCCTCAAGTCAATGGAACTGCTGAGTAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAAATCTATCTCAACATGGGCCTCAAGTCAATGGAACTGCTGAGTAT  450

seq1  GCACTGAAACGTTGACGTAAAATAAGTATCTTCTAAAAAAAAATTATCTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTGAAACGTTGACGTAAAATAAGTATCTTCTAAAAAAAAATTATCTT  500

seq1  GCCTGACTAATTGCCAAACACTGAAGGGTTTTGACACTAAGAGGAATAAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGACTAATTGCCAAACACTGAAGGGTTTTGACACTAAGAGGAATAAT  550

seq1  ATAGAAGTTGAGCTGAAGCAACTATGTGTTAAATTTCATGTAATTGAATC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAAGTTGAGCTGAAGCAACTATGTGTTAAATTTCATGTAATTGAATC  600

seq1  TTAAAAATGAATGTGACATAAGAGTAAGATGAAGAGAAGTTAGGGTGTTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAAATGAATGTGACATAAGAGTAAGATGAAGAGAAGTTAGGGTGTTG  650

seq1  TAAACAGTGGTAGAAAAGACATGCAGACATGCCTCAAAAATATTATACCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACAGTGGTAGAAAAGACATGCAGACATGCCTCAAAAATATTATACCA  700

seq1  CATAGGTATAATCATCCCACATATATTTTTTGAGCCAAGGGATGCATAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGGTATAATCATCCCACATATATTTTTTGAGCCAAGGGATGCATAAA  750

seq1  TATTTGGAGGAAATATTATGGAAAGTAGAATGTTAAGTTTTGAGAGGTTA  800
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TATTTGGAGGAAATATTATGGAAAGTAG-ATGTTAAGTTTTGAGAGGTTA  799

seq1  ATATTTCAAGGACATTGTCAATATAACTACTAAAACTGAATGATAGATAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTTCAAGGACATTGTCAATATAACTACTAAAACTGAATGATAGATAT  849

seq1  AACTCGGGTGCTGAGAAGTCTCCTGATGATAATAGTGGATACCAGAACAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCGGGTGCTGAGAAGTCTCCTGATGATAATAGTGGATACCAGAACAT  899

seq1  GAAAAATTAACAACTTATAGGCATG  925
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAATTAACAACTTATAGGCATG  924

seq1: chr16_82309273_82310294
seq2: B6Ng01-148J10.g_66_1084 (reverse)

seq1  TGATATAGAAACATTTAAAGTTCAAAATTCCTATTAACTTTCCAATTTCA  50
      |||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||
seq2  TGATATAGAACCA-TTAAAGTTCAAAATTCCTAAT-ACTTTCCAAATTCA  48

seq1  GTCCTCCAAATTGTGGCTTCTTTCATTCCACCTGATGATTGCCGATTTGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||
seq2  GTCCTCCAAATTGTGGCTTCTTTCATTCCACCTGATGATGGCCGA-TTGG  97

seq1  GTCTAAACCTAC-ACTCCCCACTAAATGTCAGATTTTAACA-TTTTTATC  148
      |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  GTCT-AACCTACAACTCCCCACTAAATGTCAGATTTTAACATTTTTTATC  146

seq1  ATGTGCTACACAGATAAAGCAAGCATATTGCCTGACAGCATAGCAAGAAG  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGCTACACAGATAAAGCAAGCATATTGCCTGACAGCATAGCAAGAAG  196

seq1  ACATTCTATTAACAAAACAAGATACCAATTAGATTAGGGAATTCAAACCA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  ACATTCTATTAACAAAACAAGATACCAATTAGATTAGGGAA-TCAAACCA  245

seq1  CTACATAATGCAGACAATTGTTTGGATATATCAACATTCTAATATATTGA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACATAATGCAGACAATTGTTTGGATATATCAACATTCTAATATATTGA  295

seq1  CGGTATATGTAAAAATAGAGTTTTCACATACTTTATGATTAAAGGATGTA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGTATATGTAAAAATAGAGTTTTCACATACTTTATGATTAAAGGATGTA  345

seq1  GTATGAATTTCGGTTTATGTACAGATGTATCTGTTGGTCCATAACCAAAT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGAATTTCGGTTTATGTACAGATGTATCTGTTGGTCCATAACCAAAT  395

seq1  TTCAAAATCTACCATAAAATATGTAAAATATTTCCATGGGTGACCTCGTC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAAATCTACCATAAAATATGTAAAATATTTCCATGGGTGACCTCGTC  445

seq1  CAAATTAGCTTTTATTGTCATATGTGTTTATACATATTTTTGTGCATATT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATTAGCTTTTATTGTCATATGTGTTTATACATATTTTTGTGCATATT  495

seq1  TTTTGATTTATCATTGATATAGGAAAAGCTATTGTATAACTTCAGTCAAA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGATTTATCATTGATATAGGAAAAGCTATTGTATAACTTCAGTCAAA  545

seq1  AACTCCATAATATCATTTTCTTTAGGACATTATGGAGAGAAAAATTAAAT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCCATAATATCATTTTCTTTAGGACATTATGGAGAGAAAAATTAAAT  595

seq1  ATCTCTGGCAAATAGTAGGAAAATTTGATTCTGAAATGTATTTCAGTCAT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCTGGCAAATAGTAGGAAAATTTGATTCTGAAATGTATTTCAGTCAT  645

seq1  GATAGATGCTTATGTAATGACCATCAAAAGATATTTGTGAATTTAGTAAG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGATGCTTATGTAATGACCATCAAAAGATATTTGTGAATTTAGTAAG  695

seq1  ACTGGCCTTTTCTTTTAGAAACTTTTTAGAACTTTAGTTTTTCAGTTCTT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGCCTTTTCTTTTAGAAACTTTTTAGAACTTTAGTTTTTCAGTTCTT  745

seq1  TTTAGAACTTTAATTTCATAAAATAAAATGTTTGAGAATATTTACAACTT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGAACTTTAATTTCATAAAATAAAATGTTTGAGAATATTTACAACTT  795

seq1  ATTAGTGAGATAGAATTTATATATTATCTGTGACATTCACATGATCTAAA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGTGAGATAGAATTTATATATTATCTGTGACATTCACATGATCTAAA  845

seq1  ACTATACATAGTTCATTTGATAAATATATTGTCTTTTCATTTAATGATTT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATACATAGTTCATTTGATAAATATATTGTCTTTTCATTTAATGATTT  895

seq1  CAAAATTTAACTAGTATACAGCAGCCATAGGACAAGTTTATGTGTTGTTC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAATTTAACTAGTATACAGCAGCCATAGGACAAGTTTATGTGTTGTTC  945

seq1  CTCTCCCTCTACTTTATTTGAGACAGCATCACTTGTTTGCCCTGCGTATG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCCCTCTACTTTATTTGAGACAGCATCACTTGTTTGCCCTGCGTATG  995

seq1  CCAGAATAGCTGCTTTTAGAATTC  1022
      ||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAATAGCTGCTTTTAGAATTC  1019