BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-156F09
Chromosome16 (Build37)
Map Location 34,851,193 - 35,019,154
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMylk
Upstream geneItgb5, Umps, Kalrn, LOC100043670, Ropn1, Ccdc14
Downstream genePtplb, Adcy5, Sec22a, Pdia5, Sema5b, EG546663, Dirc2, Hspbap1, Parp14, LOC667133, LOC100043217, Dtx3l, Parp9, Kpna1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-156F09.bB6Ng01-156F09.g
ACCDH950866DH950867
length7761,058
definitionDH950866|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-156F09, 5' end.DH950867|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-156F09, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(35,018,379 - 35,019,154)(34,851,193 - 34,852,254)
sequence
gaattcaatctgtagaccaggctggtctcaaactcagagagctacctgcc
tctgcctcccagtgctgggattaaaggtgtgtggcacaccacccagtttg
aatagtttgttttctacctgcctcttcagttttactaccggagctttagg
taataagtaagccctgggtccaagtgccaacatgccatgcacaaacaccc
attccagtacacacacaatttatgatgtaaagagataagtaattatgaaa
agcatagaagagagatttaatcaatgtgattacattgggaaatacagatt
aataggtgtaatgactccaagttaattttcagagtactgacacaagcctt
attatataaacaggagaagaattggaacatggggcaagaagtactcatgg
ttaagcagtcttggccaaagatggatgatctgtatgaaggctttgctgtc
ctggatccaaggtgagtacaggacaatgactggagactttctggcccttg
agagtttctggaacatgacactgtaaaaagctgacagtaaaatagctcag
ttaccattcttgtgtctttagctttaaagagttatgagataggttaagta
ttattaccatgtgcctttgtcactcttatattgtgaacagacacaatgac
cggaggcaactctaaggaaagaaaacactaactggggacttgcttacatg
gcattggagtagtagcccagttctacatcctggttgccagaccgtgtgtg
tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
gaattctcttttttatggatgaaaatctttgcttccccggttatctattg
atagatacttgagttgctttctctattttgaatgttattataagtatggg
cataaattgacgtccttacttccagttttcttgagtatttatcccaaagt
ggaattactggctcatatcataattttaggtttcaatttttttagattta
ttttattttatgtgtatgagtgtttcatctacatgtatgtttatgtgccc
ggagagttcagaagagggtgtcagatccctggaactggagttacagacag
ttgtgagttgcatgtcttcgctggggatgaacttgggtccactaccagag
caacaagtgcccttaaccactgagccatctccctgagtcctgtgtcccca
gatctactggttgaagaatgatgatggtctctgtgtggttcagagagcag
ctctctgctccacccatcccttgtgccagtggtgtacatccctttctctg
gactcaccatgactggttagaaaggcagatttgttagcccagatacttcc
ttcccaacccttgcctgtggccattcaaattccagtgtagcactagtcag
tgaagcagaaagtcaagatactccctatctcaaaatggcattgtggtatt
ccgcaaagggaattatggtgtggtaaaatgacaggtcggatatttgtttt
taaatgtgctttgccatgctacataaaaaaataatggtcactttttaatt
tggtttcattgtttagataaaaataacaaactacttcacccagaacaaca
aaaaaaatgttctagttaaagtgttaggtttttgcctaattaagagttca
aacccacatactgaggcacaccctcccaatgacaaaataaaccaaaacac
aacaaaagaaaaccatacaccactctctggacctacaggacagctcagca
gtaactaactgtcttgctgacaagccttgcaatttgggttcaatcctcag
gacctacatggtggaagactgaccaaccaccacttggcccaccatgacat
ggagtctt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_35018379_35019154
seq2: B6Ng01-156F09.b_47_822 (reverse)

seq1  CACACACACACACACACACACACACACACACACGGTCTGGCAACCAGGAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACACACACACACACACACACACACACGGTCTGGCAACCAGGAT  50

seq1  GTAGAACTGGGCTACTACTCCAATGCCATGTAAGCAAGTCCCCAGTTAGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGAACTGGGCTACTACTCCAATGCCATGTAAGCAAGTCCCCAGTTAGT  100

seq1  GTTTTCTTTCCTTAGAGTTGCCTCCGGTCATTGTGTCTGTTCACAATATA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTCTTTCCTTAGAGTTGCCTCCGGTCATTGTGTCTGTTCACAATATA  150

seq1  AGAGTGACAAAGGCACATGGTAATAATACTTAACCTATCTCATAACTCTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTGACAAAGGCACATGGTAATAATACTTAACCTATCTCATAACTCTT  200

seq1  TAAAGCTAAAGACACAAGAATGGTAACTGAGCTATTTTACTGTCAGCTTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGCTAAAGACACAAGAATGGTAACTGAGCTATTTTACTGTCAGCTTT  250

seq1  TTACAGTGTCATGTTCCAGAAACTCTCAAGGGCCAGAAAGTCTCCAGTCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAGTGTCATGTTCCAGAAACTCTCAAGGGCCAGAAAGTCTCCAGTCA  300

seq1  TTGTCCTGTACTCACCTTGGATCCAGGACAGCAAAGCCTTCATACAGATC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCCTGTACTCACCTTGGATCCAGGACAGCAAAGCCTTCATACAGATC  350

seq1  ATCCATCTTTGGCCAAGACTGCTTAACCATGAGTACTTCTTGCCCCATGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCATCTTTGGCCAAGACTGCTTAACCATGAGTACTTCTTGCCCCATGT  400

seq1  TCCAATTCTTCTCCTGTTTATATAATAAGGCTTGTGTCAGTACTCTGAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAATTCTTCTCCTGTTTATATAATAAGGCTTGTGTCAGTACTCTGAAA  450

seq1  ATTAACTTGGAGTCATTACACCTATTAATCTGTATTTCCCAATGTAATCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAACTTGGAGTCATTACACCTATTAATCTGTATTTCCCAATGTAATCA  500

seq1  CATTGATTAAATCTCTCTTCTATGCTTTTCATAATTACTTATCTCTTTAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGATTAAATCTCTCTTCTATGCTTTTCATAATTACTTATCTCTTTAC  550

seq1  ATCATAAATTGTGTGTGTACTGGAATGGGTGTTTGTGCATGGCATGTTGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATAAATTGTGTGTGTACTGGAATGGGTGTTTGTGCATGGCATGTTGG  600

seq1  CACTTGGACCCAGGGCTTACTTATTACCTAAAGCTCCGGTAGTAAAACTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTGGACCCAGGGCTTACTTATTACCTAAAGCTCCGGTAGTAAAACTG  650

seq1  AAGAGGCAGGTAGAAAACAAACTATTCAAACTGGGTGGTGTGCCACACAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGGCAGGTAGAAAACAAACTATTCAAACTGGGTGGTGTGCCACACAC  700

seq1  CTTTAATCCCAGCACTGGGAGGCAGAGGCAGGTAGCTCTCTGAGTTTGAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTAATCCCAGCACTGGGAGGCAGAGGCAGGTAGCTCTCTGAGTTTGAG  750

seq1  ACCAGCCTGGTCTACAGATTGAATTC  776
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGCCTGGTCTACAGATTGAATTC  776

seq1: chr16_34851193_34852254
seq2: B6Ng01-156F09.g_67_1123

seq1  GAATTCTCTTTTTTATGGATGAAAATCTTTGCTTCCCCGGTTATCTATTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTTTTTTATGGATGAAAATCTTTGCTTCCCCGGTTATCTATTG  50

seq1  ATAGATACTTGAGTTGCTTTCTCTATTTTGAATGTTATTATAAGTATGGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGATACTTGAGTTGCTTTCTCTATTTTGAATGTTATTATAAGTATGGG  100

seq1  CATAAATTGACGTCCTTACTTCCAGTTTTCTTGAGTATTTATCCCAAAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAATTGACGTCCTTACTTCCAGTTTTCTTGAGTATTTATCCCAAAGT  150

seq1  GGAATTACTGGCTCATATCATAATTTTAGGTTTCAATTTTTTTAGATTTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATTACTGGCTCATATCATAATTTTAGGTTTCAATTTTTTTAGATTTA  200

seq1  TTTTATTTTATGTGTATGAGTGTTTCATCTACATGTATGTTTATGTGCCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATTTTATGTGTATGAGTGTTTCATCTACATGTATGTTTATGTGCCC  250

seq1  GGAGAGTTCAGAAGAGGGTGTCAGATCCCTGGAACTGGAGTTACAGACAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAGTTCAGAAGAGGGTGTCAGATCCCTGGAACTGGAGTTACAGACAG  300

seq1  TTGTGAGTTGCATGTCTTCGCTGGGGATGAACTTGGGTCCACTACCAGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGAGTTGCATGTCTTCGCTGGGGATGAACTTGGGTCCACTACCAGAG  350

seq1  CAACAAGTGCCCTTAACCACTGAGCCATCTCCCTGAGTCCTGTGTCCCCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAAGTGCCCTTAACCACTGAGCCATCTCCCTGAGTCCTGTGTCCCCA  400

seq1  GATCTACTGGTTGAAGAATGATGATGGTCTCTGTGTGGTTCAGAGAGCAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTACTGGTTGAAGAATGATGATGGTCTCTGTGTGGTTCAGAGAGCAG  450

seq1  CTCTCTGCTCCACCCATCCCTTGTGCCAGTGGTGTACATCCCTTTCTCTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTGCTCCACCCATCCCTTGTGCCAGTGGTGTACATCCCTTTCTCTG  500

seq1  GACTCACCATGACTGGTTAGAAAGGCAGATTTGTTAGCCCAGATACTTCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTCACCATGACTGGTTAGAAAGGCAGATTTGTTAGCCCAGATACTTCC  550

seq1  TTCCCAACCCTTGCCTGTGGCCATTCAAATTCCAGTGTAGCACTAGTCAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCAACCCTTGCCTGTGGCCATTCAAATTCCAGTGTAGCACTAGTCAG  600

seq1  TGAAGCAGAAAGTCAAGATACTCCCTATCTCAAAATGGCATTGTGGTATT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGCAGAAAGTCAAGATACTCCCTATCTCAAAATGGCATTGTGGTATT  650

seq1  CCGCAAAGGGAATTATGGTGTGGTAAAATGACAGGTCGGATATTTGTTTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGCAAAGGGAATTATGGTGTGGTAAAATGACAGGTCGGATATTTGTTTT  700

seq1  CAAATGTGCTTTGCCATGCTACATAAAAAAATAATGGTCACTTTTTAAAT  750
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TAAATGTGCTTTGCCATGCTACATAAAAAAATAATGGTCACTTTTT-AAT  749

seq1  TTGGTTTCATTGTTTAGATAAAAATAACAAACTACTTCACCCAGAACAAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTTTCATTGTTTAGATAAAAATAACAAACTACTTCACCCAGAACAAC  799

seq1  AAAAAAAATGTTCTTAGTTAAAGTGTTAGGTTTTTGCCTAATTAAGAGTC  850
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  AAAAAAAATGTTC-TAGTTAAAGTGTTAGGTTTTTGCCTAATTAAGAGTT  848

seq1  CAAACCCACATACTGAGGCACACCCTCCCAATGACAAAATAAACCAAAAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACCCACATACTGAGGCACACCCTCCCAATGACAAAATAAACCAAAAC  898

seq1  AACAACAAAAGAAAAACCATACACCAACTCTCTGGACCTACAGGACAGCT  950
       |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  -ACAACAAAAG-AAAACCATACACC-ACTCTCTGGACCTACAGGACAGCT  945

seq1  CAGCAGGTAACTAACTGTCTTGCTGACAAGCCTGGCAATTTGGGTTCAAT  1000
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  CAGCA-GTAACTAACTGTCTTGCTGACAAGCCTTGCAATTTGGGTTCAAT  994

seq1  CCTCAGGACCCACATGGTGGAAGAACTGACCAACCACCACTT-GCCCACC  1049
      |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||
seq2  CCTCAGGACCTACATGGTGGAAG-ACTGACCAACCACCACTTGGCCCACC  1043

seq1  ATGACAT-GAGTCT  1062
      ||||||| ||||||
seq2  ATGACATGGAGTCT  1057