BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-158D16
Chromosome16 (Build37)
Map Location 61,597,984 - 61,723,379
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneEpha6, EG668168, LOC668170, LOC100043524, LOC668183
Downstream geneLOC100043806
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-158D16.bB6Ng01-158D16.g
ACCDH952240DH952241
length1,1631,105
definitionDH952240|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-158D16, 5' end.DH952241|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-158D16, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(61,597,984 - 61,599,160)(61,722,264 - 61,723,379)
sequence
gaattcagttggaactaaactcaactcactgaacagaactcagagatctg
cattcctgtcccagtgtgctgggattaaaggaatgtattgctatgcctgg
atctaggatttcctttacatgaaactgtctctatacaaggttggtcttga
actcagagatcaggttgtcaatgtctcctgagattaaagatatgtctgta
ttcccgagggatctcacaatttagaagatctttggatatgatttctgacc
agaacagcaatgttgttagattaaattcctctagagcctatgagtatgtg
tgagagaaactatctaagttaattgtatggaaagacccagctctttgttg
agtctaccaatgccttatccaggagttcttgagctgtttaaatgtaagca
aagctagttcggcattgggaaccaagcaatgaagcaggtacagatttctt
tctcccagatactgatagtggttataccatgactaactgcttctaacccc
tgccactgtgacttcctttaaatgatagactttaacctggaagtttaacc
taagataaaccctattctgcaagttacattttctaaggaggtgttattac
cacaccagaaataaaactaggacacatagaacatgtgcataatagaaaaa
atgtgtttagtatcagaaaagaataaaagtctgacatttgttaaaacata
agtggaaagggaaaataattattcatcgtgtgaagtaaaataaactagac
acacaaataccaaaattgcagacctgtgcaatctaaccaagttgagcttg
caaaagttttcagtcaaatggtagttactggaggctgaagtgactagaat
tgagggagagacacaaaaggattgatacccaagggtcaaagttaaaatca
ggagaaagaaagtctgcaagtgctattttctcaggagagtgagtcatgat
aataatgtagtgcacagtacaaagtatgagggggaaaaagattctaaatg
tggtcactatacatatggaatttattcagaaaatagagcatttactagat
ttaaatattaacatttaggattctgagaacaccaaagcgtctggtatatg
gtgctatttcagttctttgtagaaataagttagatgttcatgaaaagaat
taagcccaagaaa
gaattctccatcacagatcatttgagaacttctgtcacataagcgcttta
acacttctggggaagagagaggctgtttcccaaagcttttgccactggaa
gcttccagggcccacataggtaacttcctgccagatggctctgatctagc
cactgcacctaaactgctagcagagcccacactggcttgtgtatcctaca
gcaggttcgtgcctaattaacctctacgggactcctatctccttgggaca
ttgaaactctttgactactaccactggtcaagagcccccgtaggtctcca
tgaacagtatgtagcatatagactgggaaggtattgtgttagatttttta
aataattcctctggccacaaagcacattcctctgtgaactacaaaataca
cagtatgttacctctttgaattttgaaccacaaaatatacagtatgatta
cagtaaaattatgacaatgttttaattatattctttccctagaataacac
taattataaaataaaaactcaatgtaataagacacaagtcacaaaagtct
aaaaataaacaaaacaaaataaacaaacaaacaaaaaacaggtctgttac
attttaacagcattttctccatgataacactattaagtaagttcattttc
agcttgttccagacacttggtgggcatataaggatccgatccaagctgtg
tgacacatcatataactatggctggtaatatgattctgtgcttgttaagg
aacttctcttctctgggtatgaaaacccaaggaaaagaagacatttaaat
gaatatgagattaagatgatatttgctagagttattgaaaatttcacatc
tacttagatattcataactattttatcctacatgggcaagaggagcatgg
atgttgaattgcaagtatagcatcagcactgtgtgttgacatatattagg
catacgatatatttttctactatagcctcagattctgcctgcctctgtgg
agtcaacatttgcatctatataaatgatttacttgaatggtgtacctgag
tgatatagcacatttataatgaatgaaatataaattattccgattcagaa
acagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_61597984_61599160
seq2: B6Ng01-158D16.b_50_1212

seq1  GAATTCAGTTGGAACTAAACTCAACTCACTGAACAGAACTCAGAGATCTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTTGGAACTAAACTCAACTCACTGAACAGAACTCAGAGATCTG  50

seq1  CATTCCTGTCCCAGTGTGCTGGGATTAAAGGAATGTATTGCTATGCCTGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCCTGTCCCAGTGTGCTGGGATTAAAGGAATGTATTGCTATGCCTGG  100

seq1  ATCTAGGATTTCCTTTACATGAAACTGTCTCTATACAAGGTTGGTCTTGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTAGGATTTCCTTTACATGAAACTGTCTCTATACAAGGTTGGTCTTGA  150

seq1  ACTCAGAGATCAGGTTGTCAATGTCTCCTGAGATTAAAGATATGTCTGTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAGAGATCAGGTTGTCAATGTCTCCTGAGATTAAAGATATGTCTGTA  200

seq1  TTCCCGAGGGATCTCACAATTTAGAAGATCTTTGGATATGATTTCTGACC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCGAGGGATCTCACAATTTAGAAGATCTTTGGATATGATTTCTGACC  250

seq1  AGAACAGCAATGTTGTTAGATTAAATTCCTCTAGAGCCTATGAGTATGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACAGCAATGTTGTTAGATTAAATTCCTCTAGAGCCTATGAGTATGTG  300

seq1  TGAGAGAAACTATCTAAGTTAATTGTATGGAAAGACCCAGCTCTTTGTTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAGAAACTATCTAAGTTAATTGTATGGAAAGACCCAGCTCTTTGTTG  350

seq1  AGTCTACCAATGCCTTATCCAGGAGTTCTTGAGCTGTTTAAATGTAAGCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTACCAATGCCTTATCCAGGAGTTCTTGAGCTGTTTAAATGTAAGCA  400

seq1  AAGCTAGTTCGGCATTGGGAACCAAGCAATGAAGCAGGTACAGATTTCTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTAGTTCGGCATTGGGAACCAAGCAATGAAGCAGGTACAGATTTCTT  450

seq1  TCTCCCAGATACTGATAGTGGTTATACCATGACTAACTGCTTCTAACCCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCCAGATACTGATAGTGGTTATACCATGACTAACTGCTTCTAACCCC  500

seq1  TGCCACTGTGACTTCCTTTAAATGATAGACTTTAACCTGGAAGTTTAACC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCACTGTGACTTCCTTTAAATGATAGACTTTAACCTGGAAGTTTAACC  550

seq1  TAAGATAAACCCTATTCTGCAAGTTACATTTTCTAAGGAGGTGTTATTAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGATAAACCCTATTCTGCAAGTTACATTTTCTAAGGAGGTGTTATTAC  600

seq1  CACACCAGAAATAAAACTAGGACACATAGAACATGTGCATAATAGAAAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACCAGAAATAAAACTAGGACACATAGAACATGTGCATAATAGAAAAA  650

seq1  ATGTGTTTAGTATCAGAAAAGAATAAAAGTCTGACATTTGTTAAAACATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGTTTAGTATCAGAAAAGAATAAAAGTCTGACATTTGTTAAAACATA  700

seq1  AGTGGAAAGGGAAAATAATTATTCATCGTGTGAAGTAAAATAAACTAGAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGAAAGGGAAAATAATTATTCATCGTGTGAAGTAAAATAAACTAGAC  750

seq1  ACACAAATACCAAAATTGCAGACCTGTGCAATCTAACCAAGTTGAGCTTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAAATACCAAAATTGCAGACCTGTGCAATCTAACCAAGTTGAGCTTG  800

seq1  CAAAAGTTTTCAGTCAAATGGTAGTTACTGGAGGCTGAAGTGACTAGAAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAGTTTTCAGTCAAATGGTAGTTACTGGAGGCTGAAGTGACTAGAAT  850

seq1  TGAGGGAGAGACACAAAAGGATTGATACCCAA-GGTCAAAGTTAAAATCA  899
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TGAGGGAGAGACACAAAAGGATTGATACCCAAGGGTCAAAGTTAAAATCA  900

seq1  GGAGAAAGAAAGTCTGCAAGTGCTA-TTTCCCAGGAGAGTGAGTCATGAT  948
      ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||
seq2  GGAGAAAGAAAGTCTGCAAGTGCTATTTTCTCAGGAGAGTGAGTCATGAT  950

seq1  AATAATGTAGTGCACAGTACAAAGTATGAGGGGGAAAAAAGATTCTAAAT  998
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  AATAATGTAGTGCACAGTACAAAGTATGAGGGGG-AAAAAGATTCTAAAT  999

seq1  GTGGTCACTATACAATATGGAATTTATTCAAGAAAATAGAGGCATTTTAC  1048
      ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||
seq2  GTGGTCACTATAC-ATATGGAATTTATTC-AGAAAATAGA-GCA-TTTAC  1045

seq1  TAGATTTAAATATTAAACATTTTAGGATTCTGAGAACACCAAAAGCGGTC  1098
      |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||
seq2  TAGATTTAAATATT-AACA-TTTAGGATTCTGAGAACACC-AAAGC-GTC  1091

seq1  TTGGTAATAT-GTGCTATTCCAGTTTCTTTTGTAGAAATTAAAGTATAGA  1147
       |||| |||| |||||||| |||||   |||||||||||  |||| ||||
seq2  -TGGT-ATATGGTGCTATTTCAGTT--CTTTGTAGAAAT--AAGT-TAGA  1134

seq1  TG-TCATGAAAAAGAATTAAGCCAAAAGAAA  1177
      || ||||| ||||||||||||||  ||||||
seq2  TGTTCATG-AAAAGAATTAAGCC-CAAGAAA  1163

seq1: chr16_61722264_61723379
seq2: B6Ng01-158D16.g_67_1171 (reverse)

seq1  CCTGTTTCTTGAATCTGTGATAATTTTATATTTCATTCATTATAGATGTT  50
      |||||||| |||||| |  |||| |||||||||||||||||||| ||| |
seq2  CCTGTTTC-TGAATC-GGAATAA-TTTATATTTCATTCATTATAAATG-T  46

seq1  GCTAATATCAACTCAGGTACA-CATTCAAGTAAATCATTTATATTAGAAT  99
      ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||
seq2  GCT-ATATC-ACTCAGGTACACCATTCAAGTAAATCATTTATA-TAG-AT  92

seq1  GCAAAATGTTGACTCCAACAGAGCCAGGCAGAATCTGA-GCTATAGTAAG  148
      || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||
seq2  GC-AAATGTTGACTCC-ACAGAGGCAGGCAGAATCTGAGGCTATAGT-AG  139

seq1  AAAAATATATCGTATGCCTAATATATGTCAACAACACAGTGCTGATGCTA  198
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  AAAAATATATCGTATGCCTAATATATGTCAAC-ACACAGTGCTGATGCTA  188

seq1  TACCTTGCAATTCAACATCCATGCTCCTCTTGCCCATGTAGGATAAAATA  248
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TA-CTTGCAATTCAACATCCATGCTCCTCTTGCCCATGTAGGATAAAATA  237

seq1  GTTATGAATATCTAAGTAGATGTGAAATTTTCAATAACTCTAGCAAATAT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATGAATATCTAAGTAGATGTGAAATTTTCAATAACTCTAGCAAATAT  287

seq1  CATCTTAATCTCATATTCATTTAAATGTCTTCTTTTCCTTGGGTTTTCAT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTTAATCTCATATTCATTTAAATGTCTTCTTTTCCTTGGGTTTTCAT  337

seq1  ACCCAGAGAAGAGAAGTTCCTTAACAAGCACAGAATCATATTACCAGCCA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAGAGAAGAGAAGTTCCTTAACAAGCACAGAATCATATTACCAGCCA  387

seq1  TAGTTATATGATGTGTCACACAGCTTGGATCGGATCCTTATATGCCCACC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTATATGATGTGTCACACAGCTTGGATCGGATCCTTATATGCCCACC  437

seq1  AAGTGTCTGGAACAAGCTGAAAATGAACTTACTTAATAGTGTTATCATGG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGTCTGGAACAAGCTGAAAATGAACTTACTTAATAGTGTTATCATGG  487

seq1  AGAAAATGCTGTTAAAATGTAACAGACCTGTTTTTTGTTTGTTTGTTTAT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAATGCTGTTAAAATGTAACAGACCTGTTTTTTGTTTGTTTGTTTAT  537

seq1  TTTGTTTTGTTTATTTTTAGACTTTTGTGACTTGTGTCTTATTACATTGA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTTTTGTTTATTTTTAGACTTTTGTGACTTGTGTCTTATTACATTGA  587

seq1  GTTTTTATTTTATAATTAGTGTTATTCTAGGGAAAGAATATAATTAAAAC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTTATTTTATAATTAGTGTTATTCTAGGGAAAGAATATAATTAAAAC  637

seq1  ATTGTCATAATTTTACTGTAATCATACTGTATATTTTGTGGTTCAAAATT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTCATAATTTTACTGTAATCATACTGTATATTTTGTGGTTCAAAATT  687

seq1  CAAAGAGGTAACATACTGTGTATTTTGTAGTTCACAGAGGAATGTGCTTT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGAGGTAACATACTGTGTATTTTGTAGTTCACAGAGGAATGTGCTTT  737

seq1  GTGGCCAGAGGAATTATTTAAAAAATCTAACACAATACCTTCCCAGTCTA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCCAGAGGAATTATTTAAAAAATCTAACACAATACCTTCCCAGTCTA  787

seq1  TATGCTACATACTGTTCATGGAGACCTACGGGGGCTCTTGACCAGTGGTA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCTACATACTGTTCATGGAGACCTACGGGGGCTCTTGACCAGTGGTA  837

seq1  GTAGTCAAAGAGTTTCAATGTCCCAAGGAGATAGGAGTCCCGTAGAGGTT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGTCAAAGAGTTTCAATGTCCCAAGGAGATAGGAGTCCCGTAGAGGTT  887

seq1  AATTAGGCACGAACCTGCTGTAGGATACACAAGCCAGTGTGGGCTCTGCT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTAGGCACGAACCTGCTGTAGGATACACAAGCCAGTGTGGGCTCTGCT  937

seq1  AGCAGTTTAGGTGCAGTGGCTAGATCAGAGCCATCTGGCAGGAAGTTACC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGTTTAGGTGCAGTGGCTAGATCAGAGCCATCTGGCAGGAAGTTACC  987

seq1  TATGTGGGCCCTGGAAGCTTCCAGTGGCAAAAGCTTTGGGAAACAGCCTC  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTGGGCCCTGGAAGCTTCCAGTGGCAAAAGCTTTGGGAAACAGCCTC  1037

seq1  TCTCTTCCCCAGAAGTGTTAAAGCGCTTATGTGACAGAAGTTCTCAAATG  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTTCCCCAGAAGTGTTAAAGCGCTTATGTGACAGAAGTTCTCAAATG  1087

seq1  ATCTGTGATGGAGAATTC  1116
      ||||||||||||||||||
seq2  ATCTGTGATGGAGAATTC  1105