BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-159N17
Chromosome16 (Build37)
Map Location 77,425,722 - 77,564,941
singlet/doubletdoublet
Overlap gene2810055G20Rik
Upstream gene1700063K16Rik, LOC665120, Usp25
Downstream geneLOC435483, LOC100039561, Cxadr, Btg3, D16Ertd472e
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-159N17.bB6Ng01-159N17.g
ACCDH953399DH953400
length843661
definitionDH953399|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-159N17, 5' end.DH953400|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-159N17, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(77,425,722 - 77,426,564)(77,564,281 - 77,564,941)
sequence
gaattcatctttgtcatttgactgacttttacatactaaatgcctgggaa
taggctagatgcccaatgtctaagggtggacatctggaaagattagatat
ctggagaactaataaagaactgagactcctgactggatgcagttcttaag
ttggagagcactgagtttcatgatgataggtcttgaaaggtatctgggca
actactgtgaatatccatggggtatctatagggtggttataatttacctt
cccaaaatatgcactctaaacactaagcacttctgctcatatgctgtgaa
gatgtagttacataacattggatggtcattgggaattaaagatgatttta
cccatgatttcgactcttatataactcatggtatggtgcatagacagctt
gtgtgtccttctaccactagagaaaatcaactggatagacttttcttcct
tgaaatcaatctgcacattgacattaagtattcccagaatgatccatgtt
tcctctcagaatcacatagatttctctagattgtatgcttcacaggtgtt
gatccatcagagagagatcacaatcacgaatgtgatgataagcaggagag
ttgggggagacaagactggaatccccaatgatgccttaaagaaagagcaa
gagaagaattatagaaattagttgattctactcatattcatgagcatatg
gggtaagcttcatgaagcagcaattcttaaaggataccttccactcacca
taaggcaaacatgaactctaagcataattagaattggtaccagaattcaa
tttagatgctatggggtatatgtgtgtgtgtgtgtagggggta
gaattcatgacttctttttaactaattttattacatgcatatatgtattt
ttatataacatatattcctgagtatgacctgttgagtccatataacattg
cttgtacgtatgttttcaggagtgaccttttggtactggaaaaccaattg
ttgtgctataaaaggctactcatattagaccttcaatgtgaacgagattt
attttctaatatgttcttgctaccagaaatacaaccatgtacttattttt
gctcatgaaattctaaagtggaaaactatgttagtaatgtaagtggcgac
ttatttttagatactaatcagggaagcacctgataaaaataccataggaa
ccttttgctaaaagaagagtggaccaattttgaacaagggcgtactatta
tagtttgtatcaagaaactcgggaaaaatcccagtcttaaatgatggaat
tcaccataatctcaaggactccgttagtttagccaaaagtaggcttctgc
ttttcctcttccctgatgccctgtctggctaaacatagcctatgtttaag
aaatcatgaaaagaagaaattttgggaggccccttggtattgcaaacttg
atataccccagtacaggggaatttcagggccaagaagtgggagtgggtgg
ggaggggagca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_77425722_77426564
seq2: B6Ng01-159N17.b_46_888

seq1  GAATTCATCTTTGTCATTTGACTGACTTTTACATACTAAATGCCTGGGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATCTTTGTCATTTGACTGACTTTTACATACTAAATGCCTGGGAA  50

seq1  TAGGCTAGATGCCCAATGTCTAAGGGTGGACATCTGGAAAGATTAGATAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGCTAGATGCCCAATGTCTAAGGGTGGACATCTGGAAAGATTAGATAT  100

seq1  CTGGAGAACTAATAAAGAACTGAGACTCCTGACTGGATGCAGTTCTTAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAGAACTAATAAAGAACTGAGACTCCTGACTGGATGCAGTTCTTAAG  150

seq1  TTGGAGAGCACTGAGTTTCATGATGATAGGTCTTGAAAGGTATCTGGGCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGAGAGCACTGAGTTTCATGATGATAGGTCTTGAAAGGTATCTGGGCA  200

seq1  ACTACTGTGAATATCCATGGGGTATCTATAGGGTGGTTATAATTTACCTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACTGTGAATATCCATGGGGTATCTATAGGGTGGTTATAATTTACCTT  250

seq1  CCCAAAATATGCACTCTAAACACTAAGCACTTCTGCTCATATGCTGTGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAAAATATGCACTCTAAACACTAAGCACTTCTGCTCATATGCTGTGAA  300

seq1  GATGTAGTTACATAACATTGGATGGTCATTGGGAATTAAAGATGATTTTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTAGTTACATAACATTGGATGGTCATTGGGAATTAAAGATGATTTTA  350

seq1  CCCATGATTTCGACTCTTATATAACTCATGGTATGGTGCATAGACAGCTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATGATTTCGACTCTTATATAACTCATGGTATGGTGCATAGACAGCTT  400

seq1  GTGTGTCCTTCTACCACTAGAGAAAATCAACTGGATAGACTTTTCTTCCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTCCTTCTACCACTAGAGAAAATCAACTGGATAGACTTTTCTTCCT  450

seq1  TGAAATCAATCTGCACATTGACATTAAGTATTCCCAGAATGATCCATGTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAATCAATCTGCACATTGACATTAAGTATTCCCAGAATGATCCATGTT  500

seq1  TCCTCTCAGAATCACATAGATTTCTCTAGATTGTATGCTTCACAGGTGTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCTCAGAATCACATAGATTTCTCTAGATTGTATGCTTCACAGGTGTT  550

seq1  GATCCATCAGAGAGAGATCACAATCACGAATGTGATGATAAGCAGGAGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCCATCAGAGAGAGATCACAATCACGAATGTGATGATAAGCAGGAGAG  600

seq1  TTGGGGGAGACAAGACTGGAATCCCCAATGATGCCTTAAAGAAAGAGCAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGGGAGACAAGACTGGAATCCCCAATGATGCCTTAAAGAAAGAGCAA  650

seq1  GAGAAGAATTATAGAAATTAGTTGATTCTACTCATATTCATGAGCATATG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAGAATTATAGAAATTAGTTGATTCTACTCATATTCATGAGCATATG  700

seq1  GGGTAAGCTTCATGAAGCAGCAATTCTTAAAGGATACCTTCCACTCACCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTAAGCTTCATGAAGCAGCAATTCTTAAAGGATACCTTCCACTCACCA  750

seq1  TAAGGCAAACATGAACTCTAAGCATAATTAGAATTGGTACCAGAATTCAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGCAAACATGAACTCTAAGCATAATTAGAATTGGTACCAGAATTCAA  800

seq1  TTTAGATGCTATGGGGTATATGTGTGTGTGTGTGTAGGGGGTA  843
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGATGCTATGGGGTATATGTGTGTGTGTGTGTAGGGGGTA  843

seq1: chr16_77564281_77564941
seq2: B6Ng01-159N17.g_69_729 (reverse)

seq1  TGCTCCCCTCCCCACCCACTCCCACTTCTTGGCCCTGAAATTCCCCTGTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCCCCTCCCCACCCACTCCCACTTCTTGGCCCTGAAATTCCCCTGTA  50

seq1  CTGGGGTATATCAAGTTTGCAATACCAAGGGGCCTCCCAAAATTTCTTCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGGTATATCAAGTTTGCAATACCAAGGGGCCTCCCAAAATTTCTTCT  100

seq1  TTTCATGATTTCTTAAACATAGGCTATGTTTAGCCAGACAGGGCATCAGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCATGATTTCTTAAACATAGGCTATGTTTAGCCAGACAGGGCATCAGG  150

seq1  GAAGAGGAAAAGCAGAAGCCTACTTTTGGCTAAACTAACGGAGTCCTTGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAGGAAAAGCAGAAGCCTACTTTTGGCTAAACTAACGGAGTCCTTGA  200

seq1  GATTATGGTGAATTCCATCATTTAAGACTGGGATTTTTCCCGAGTTTCTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTATGGTGAATTCCATCATTTAAGACTGGGATTTTTCCCGAGTTTCTT  250

seq1  GATACAAACTATAATAGTACGCCCTTGTTCAAAATTGGTCCACTCTTCTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATACAAACTATAATAGTACGCCCTTGTTCAAAATTGGTCCACTCTTCTT  300

seq1  TTAGCAAAAGGTTCCTATGGTATTTTTATCAGGTGCTTCCCTGATTAGTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGCAAAAGGTTCCTATGGTATTTTTATCAGGTGCTTCCCTGATTAGTA  350

seq1  TCTAAAAATAAGTCGCCACTTACATTACTAACATAGTTTTCCACTTTAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAAAATAAGTCGCCACTTACATTACTAACATAGTTTTCCACTTTAGA  400

seq1  ATTTCATGAGCAAAAATAAGTACATGGTTGTATTTCTGGTAGCAAGAACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCATGAGCAAAAATAAGTACATGGTTGTATTTCTGGTAGCAAGAACA  450

seq1  TATTAGAAAATAAATCTCGTTCACATTGAAGGTCTAATATGAGTAGCCTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTAGAAAATAAATCTCGTTCACATTGAAGGTCTAATATGAGTAGCCTT  500

seq1  TTATAGCACAACAATTGGTTTTCCAGTACCAAAAGGTCACTCCTGAAAAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAGCACAACAATTGGTTTTCCAGTACCAAAAGGTCACTCCTGAAAAC  550

seq1  ATACGTACAAGCAATGTTATATGGACTCAACAGGTCATACTCAGGAATAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACGTACAAGCAATGTTATATGGACTCAACAGGTCATACTCAGGAATAT  600

seq1  ATGTTATATAAAAATACATATATGCATGTAATAAAATTAGTTAAAAAGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTATATAAAAATACATATATGCATGTAATAAAATTAGTTAAAAAGAA  650

seq1  GTCATGAATTC  661
      |||||||||||
seq2  GTCATGAATTC  661