BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-166O18
Chromosome16 (Build37)
Map Location 92,923,377 - 93,060,722
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneAtp5o, Mrps6, Slc5a3, Kcne2, 1190017O12Rik, 4930563D23Rik, Kcne1, Dscr1, 2410124H12Rik, Clic6, Runx1, EG666023
Downstream geneLOC100040747, Setd4, LOC670912, Cbr1, EG435489, Cbr3, Dopey2, Morc3, Chaf1b, Cldn14
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-166O18.bB6Ng01-166O18.g
ACCDH958560DH958561
length1,0681,008
definitionDH958560|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-166O18, 5' end.DH958561|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-166O18, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(93,059,632 - 93,060,722)(92,923,377 - 92,924,383)
sequence
gaattcttctcaattccactgacttttctacacatactttgcatcccgcc
tccctgctgtggagactgtttcctacaaggtggtccccctgctcaattac
agctgattgaaccaaggaatcaatttgttccaatttgaagcaatcatctt
ctctgcaagagtctccagggcttgctgagagggctggccctggcttcaga
gagacacagagaaggccagccagaggcaggaaaacaggagcaataagaat
aagatgtaaaccagaaataagactccatgtttgtccagaaagctagaggg
agctgcgtgtgtggtagctgtgttgttcgtacttcctgtctggtgttagg
ctcctatgtccttcctgggactcatggagtgcattcatatcctctgaatt
atgttgcctgatcctctagcgatttagttatgcttcagcttcttttggaa
gtggagcaactgatcaagaaaggcgcctgtaagatttttcttaccatgaa
tattagtgagaatgaatatcacttcccattttactttccatgttaataag
caagcatggatgtctcagtggtttaacatgacacaaataaactcattcga
ataatagtggtggatacatggtgaatggcttcccacaggtcaattcagac
gaccccccaagttccagtggtttgacccctgaggttttggttttggtgct
atggtgtaagagcttgctcaaagaacagatatcctttcacggtggtacaa
aagagttgataagtgacaaaagacattgctagcattctatcaaaaaatag
actttatgtaggatggttgtgttttccccagctgcaggtgactgaaagtg
ctgagtctactggtgcaggctagcccctgcagtgaacttatgtggggatc
tggggatcgtagccaatgtgtcttcacgtgttttgaattaacagtgagat
tattttcgtctgcagtggaaagggacactggtttcattacattcatgcta
tccaaagtccccttaccaccacccactccctaccaccaactcccatttag
tctgggttcctgtactgg
gaattcctgtgcttaaggctcaggtaacgctgcagaagaagcagaaagac
tctaagtgccataagacatggcaatcttctgtgaccttctgtctccaaga
aatgacagggatgctactcccgtgaatcctcaacactatggctgccaaga
gaagacccgaagaggaacaacaccaggagacacgctaatgtggtaggaga
aaatctgacagggcaccagccctagacaacaggcaaatgagaaatgctaa
gagagacatcacccttctctaggaatagtctctcgtttctcatgcaatat
catatgctaagccctgaagtcatatacaaacatggctaaatggacgcggg
gagattatgcatacatatgtatgcataggtatggatatgcattatatcgc
attttgtgtgtgtgtgactataaaacaaagatgtaaaacaaagatggata
acttactcaggatccgaaaagatgactataactggcgagccattcaacaa
acatatcatgaagatttaccataggatatgtattattctagggctaagtg
tgcaacataaacctatgtatgtgtttcaaatgttctgtaataatgataga
tatgtagatgatagatatatagatagattaatatagattagttaaattct
tagattagatagatgatagataaattaaatagataaattagttaaataca
taatagtaatagattagataggtagatagacaggtagaagatagatagat
gtaagatagtagacagacagatgatagatatatagatagatagacgataa
atagattagttaaatatctagataaaatatagatagagatagatagatga
caggcagatataaatatagacagatacatacatgaaagattgatagaaag
attatagataaataggtagatgaaagattgatttgttgatagattcatga
aatatagatatagatagaatgactgatagatatcgataaatagataatat
aattgata
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_93059632_93060722
seq2: B6Ng01-166O18.b_46_1113 (reverse)

seq1  CCAGTACAGGGGAACGCCAGGGCCAAAAAGGGGGAGTGGGTGGGTAGGGG  50
      ||||||||  ||||| ||||    |  ||  |||||| ||| |||| |||
seq2  CCAGTACA--GGAAC-CCAG----ACTAAATGGGAGTTGGT-GGTA-GGG  41

seq1  AGTGGGGTGGGTGGGTAGGGGGGACTTTTGGGATAGCATTGGAAATGTAA  100
      ||||||   |||||  |  |||||||||  |||||||||    ||||| |
seq2  AGTGGG--TGGTGGTAA--GGGGACTTT--GGATAGCAT---GAATGT-A  81

seq1  ATGAAAACCAGTGTCCCCTTTCCACTGCAGACGAAAATAATCTCACTGTT  150
      ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATG-AAACCAGTGT-CCCTTTCCACTGCAGACGAAAATAATCTCACTGTT  129

seq1  AATTCAAAACACGGTTGAAGACACATTGGCTACGATCCCCAGATCCCCAC  200
      |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCAAAACACG--TGAAGACACATTGGCTACGATCCCCAGATCCCCAC  177

seq1  ATAAGTTCACTGCAGGGGCTAGCCTGCACCAGTAGACTCAGCACTTTCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGTTCACTGCAGGGGCTAGCCTGCACCAGTAGACTCAGCACTTTCAG  227

seq1  TCACCTGCAGCTGGGGAAAACACAACCATCCTACATAAAGTCTATTTTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCTGCAGCTGGGGAAAACACAACCATCCTACATAAAGTCTATTTTTT  277

seq1  GATAGAATGCTAGCAATGTCTTTTGTCACTTATCAACTCTTTTGTACCAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGAATGCTAGCAATGTCTTTTGTCACTTATCAACTCTTTTGTACCAC  327

seq1  CGTGAAAGGATATCTGTTCTTTGAGCAAGCTCTTACACCATAGCACCAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGAAAGGATATCTGTTCTTTGAGCAAGCTCTTACACCATAGCACCAAA  377

seq1  ACCAAAACCTCAGGGGTCAAACCACTGGAACTTGGGGGGTCGTCTGAATT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAAAACCTCAGGGGTCAAACCACTGGAACTTGGGGGGTCGTCTGAATT  427

seq1  GACCTGTGGGAAGCCATTCACCATGTATCCACCACTATTATTCGAATGAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTGTGGGAAGCCATTCACCATGTATCCACCACTATTATTCGAATGAG  477

seq1  TTTATTTGTGTCATGTTAAACCACTGAGACATCCATGCTTGCTTATTAAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTTGTGTCATGTTAAACCACTGAGACATCCATGCTTGCTTATTAAC  527

seq1  ATGGAAAGTAAAATGGGAAGTGATATTCATTCTCACTAATATTCATGGTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAAAGTAAAATGGGAAGTGATATTCATTCTCACTAATATTCATGGTA  577

seq1  AGAAAAATCTTACAGGCGCCTTTCTTGATCAGTTGCTCCACTTCCAAAAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAAATCTTACAGGCGCCTTTCTTGATCAGTTGCTCCACTTCCAAAAG  627

seq1  AAGCTGAAGCATAACTAAATCGCTAGAGGATCAGGCAACATAATTCAGAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTGAAGCATAACTAAATCGCTAGAGGATCAGGCAACATAATTCAGAG  677

seq1  GATATGAATGCACTCCATGAGTCCCAGGAAGGACATAGGAGCCTAACACC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATGAATGCACTCCATGAGTCCCAGGAAGGACATAGGAGCCTAACACC  727

seq1  AGACAGGAAGTACGAACAACACAGCTACCACACACGCAGCTCCCTCTAGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAGGAAGTACGAACAACACAGCTACCACACACGCAGCTCCCTCTAGC  777

seq1  TTTCTGGACAAACATGGAGTCTTATTTCTGGTTTACATCTTATTCTTATT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTGGACAAACATGGAGTCTTATTTCTGGTTTACATCTTATTCTTATT  827

seq1  GCTCCTGTTTTCCTGCCTCTGGCTGGCCTTCTCTGTGTCTCTCTGAAGCC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCTGTTTTCCTGCCTCTGGCTGGCCTTCTCTGTGTCTCTCTGAAGCC  877

seq1  AGGGCCAGCCCTCTCAGCAAGCCCTGGAGACTCTTGCAGAGAAGATGATT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCCAGCCCTCTCAGCAAGCCCTGGAGACTCTTGCAGAGAAGATGATT  927

seq1  GCTTCAAATTGGAACAAATTGATTCCTTGGTTCAATCAGCTGTAATTGAG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCAAATTGGAACAAATTGATTCCTTGGTTCAATCAGCTGTAATTGAG  977

seq1  CAGGGGGACCACCTTGTAGGAAACAGTCTCCACAGCAGGGAGGCGGGATG  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGGGACCACCTTGTAGGAAACAGTCTCCACAGCAGGGAGGCGGGATG  1027

seq1  CAAAGTATGTGTAGAAAAGTCAGTGGAATTGAGAAGAATTC  1091
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGTATGTGTAGAAAAGTCAGTGGAATTGAGAAGAATTC  1068

seq1: chr16_92923377_92924383
seq2: B6Ng01-166O18.g_70_1077

seq1  GAATTCCTGTGCTTAAGGCTCAGGTAACGCTGCAGAAGAAGCAGAAAGAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTGTGCTTAAGGCTCAGGTAACGCTGCAGAAGAAGCAGAAAGAC  50

seq1  TCTAAGTGCCATAAGACATGGCAATCTTCTGTGACCTTCTGTCTCCAAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAGTGCCATAAGACATGGCAATCTTCTGTGACCTTCTGTCTCCAAGA  100

seq1  AATGACAGGGATGCTACTCCCGTGAATCCTCAACACTATGGCTGCCAAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGACAGGGATGCTACTCCCGTGAATCCTCAACACTATGGCTGCCAAGA  150

seq1  GAAGACCCGAAGAGGAACAACACCAGGAGACACGCTAATGTGGTAGGAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGACCCGAAGAGGAACAACACCAGGAGACACGCTAATGTGGTAGGAGA  200

seq1  AAATCTGACAGGGCACCAGCCCTAGACAACAGGCAAATGAGAAATGCTAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCTGACAGGGCACCAGCCCTAGACAACAGGCAAATGAGAAATGCTAA  250

seq1  GAGAGACATCACCCTTCTCTAGGAATAGTCTCTCGTTTCTCATGCAATAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGACATCACCCTTCTCTAGGAATAGTCTCTCGTTTCTCATGCAATAT  300

seq1  CATATGCTAAGCCCTGAAGTCATATACAAACATGGCTAAATGGACGCGGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATGCTAAGCCCTGAAGTCATATACAAACATGGCTAAATGGACGCGGG  350

seq1  GAGATTATGCATACATATGTATGCATAGGTATGGATATGCATTATATCGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATTATGCATACATATGTATGCATAGGTATGGATATGCATTATATCGC  400

seq1  ATTTTGTGTGTGTGTGACTATAAAACAAAGATGTAAAACAAAGATGGATA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTGTGTGTGTGTGACTATAAAACAAAGATGTAAAACAAAGATGGATA  450

seq1  ACTTACTCAGGATCCGAAAAGATGACTATAACTGGCGAGCCATTCAACAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTACTCAGGATCCGAAAAGATGACTATAACTGGCGAGCCATTCAACAA  500

seq1  ACATATCATGAAGATTTACCATAGGATATGTATTATTCTAGGGCTAAGTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATATCATGAAGATTTACCATAGGATATGTATTATTCTAGGGCTAAGTG  550

seq1  TGCAACATAAACCTATGTATGTGTTTCAAATGTTCTGTAATAATGATAGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAACATAAACCTATGTATGTGTTTCAAATGTTCTGTAATAATGATAGA  600

seq1  TATGTAGATGATAGATATATAGATAGATTAATATAGATTAGTTAAATTCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTAGATGATAGATATATAGATAGATTAATATAGATTAGTTAAATTCT  650

seq1  TAGATTAGATAGATGATAGATAAATTAAATAGATAAATTAGTTAAATACA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATTAGATAGATGATAGATAAATTAAATAGATAAATTAGTTAAATACA  700

seq1  TAATAGTAATAGATTAGATAGGTAGATAGACAGGTAGAAGATAGATAGAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAGTAATAGATTAGATAGGTAGATAGACAGGTAGAAGATAGATAGAT  750

seq1  GTAAGATAGTAGACAGACAGATGATAGATATATAGATAGATAGACGATAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAGATAGTAGACAGACAGATGATAGATATATAGATAGATAGACGATAA  800

seq1  ATAGATTAGTTAAATATCTAGATAAAATATAGATAGAGATAGATAGATGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGATTAGTTAAATATCTAGATAAAATATAGATAGAGATAGATAGATGA  850

seq1  CAGGCAGATATAAATATAGACAGATACATACATGAAAGATTGATAGAAAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCAGATATAAATATAGACAGATACATACATGAAAGATTGATAGAAAG  900

seq1  ATTATAGATAAATAGGTAGATGAAAGATTGATTTGTTGATAGATTCATGA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATAGATAAATAGGTAGATGAAAGATTGATTTGTTGATAGATTCATGA  950

seq1  TATATAGATATAGATAG-ATGACTGATAGATAATAGATAAATAGATAATA  999
       |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||
seq2  AATATAGATATAGATAGAATGACTGATAGAT-ATCGATAAATAGATAATA  999

seq1  T-ATTGATA  1007
      | |||||||
seq2  TAATTGATA  1008