BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-183J15
Chromosome16 (Build37)
Map Location 34,734,681 - 34,872,717
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMylk
Upstream geneHeg1, Muc13, Itgb5, Umps, Kalrn, LOC100043670, Ropn1, Ccdc14
Downstream genePtplb, Adcy5, Sec22a, Pdia5, Sema5b, EG546663, Dirc2, Hspbap1, Parp14
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-183J15.bB6Ng01-183J15.g
ACCGA009184GA009185
length1,1451,074
definitionB6Ng01-183J15.b B6Ng01-183J15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(34,734,681 - 34,735,818)(34,871,649 - 34,872,717)
sequence
gaattccttcctctccggaaaacgatatgactttcagtttattaaaatcc
catcttgtacctttggtacgtttgtccatatttgacagtgttgatctcaa
atcatttggttaaatttattcgtaagcgtttaggatctctgttactagga
taccctgagtaggtttttattagcattgtgatcgacaacgtaagcatagg
aaagagcttcccaggtagaacttcagttgctgagatgtgtgcattggagg
ctgtctctcacgttcccagagaagaaagctggatgcatcccttactaagg
ccatttaagttcagtcatgctgagagatgagccctggatgacccacagag
aagaagaatccggaacattgctgtcttagctaacctcctaatgtcaagcc
ctcttcaggccaggggctgttgacctaattagttggtttttctggtgggt
acatggacatggagggacccattctaaaacaggctgggctaatccagagt
acaagtttcccccagtatatttactttttgtccaacccttaaaaattcca
ttttgagggatggagagatggcttagtaggttatgaacactgactgctct
tccaaagaagccgggttcaatacctagtccctatgtggcagctcacaatt
gtctttaaccctagttccagggtgtcagacgctctcttttgacctccatg
gatactaagcatacacatgatgtgcatataagcaaaacacccatatacat
agaataattttttctaaaaaaaatgagattgtttggttgggggttattat
catcacaatattaggtttccccagaggggaaatagaaatagaaatagagc
cacgagaggggctctactaggttaattggctcatacaatcatggggaata
agaagtccaatgacagaccagctacagcctagagaaactgggatgcaaga
agtgtgaagggctcagaaccaggggcctgatgctcttccttcttcagtct
gaggatgttggagagccgctgctctaagttcctgaagtccaaaaggccag
agagcctggaacttcttcaactacagggaacaagaagaagaggttcccat
gctagggaggaaaacaaaaatcacgtctcagcctttctgtttttc
gaattcatcaggcctcccaagttctagaatactcaacctcctagctgagt
tgtgaggtagtatttgggactttctattgttagaatcacctatagagatc
caggactggtccagaatatgccacagcttaagtgagggaaggagatgcac
atctcttaccatatctatttacgatgaacagaatcaatgctcagttcttc
cacagaaggcccagcaaatagcaacaagcagaaatagaacaggaatgagt
gagccgctgcgaagccacacctcccagaatcagcagtactgccaggcctc
ggcaagctgctgctgtgctaggtaccgccagttctagctgaaaagttact
atgcccagtgccaccgagcctgggtgagctgctgatgtaccaggcaggaa
acagcagtatagcaaacctagagacaccacatggggaaccctttatcggg
gggctgcagctggggaggagatataaaatgtgaccagaaaacaatgcagt
aacataactacacaatagtggtttggttttgggttaggagaaggaggaaa
gagccatcaccctggaagttggtctctttcttctataagctgtgaatgcg
tataaaaagcctactaaggaaggctgggtcgtcgtgctcatatgagagag
tgtctgctgcagggaatgcacaggacatttattggggaatggtagacttc
cttacgctctctcagctatcacatttccatgacaggacaggaatggaccc
atgggtagagacttaacgtcacagttagcatttccctagccacacctatc
ttgagattctgacagaacatcagtgagacaggagccacaccaaaatgctc
aggccacactgaacttgggatgccatggaccagtgatcactgctgatgta
tttgtccaatatgaccactggggcgagcagtctgccaactcactctctag
cccaaggttggaagacactttatgctcatcaaaggaagagacaggttttg
aaagaacccagtttgacatgaacagtagaatagatgctgggcttctttcc
atgctgttgggaggaggcacaaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_34734681_34735818
seq2: B6Ng01-183J15.b_43_1187

seq1  GAATTCCTTCCTCTCCGGAAAACGATATGACTTTCAGTTTATTAAAATCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTCCTCTCCGGAAAACGATATGACTTTCAGTTTATTAAAATCC  50

seq1  CATCTTGTACCTTTGGTACGTTTGTCCATATTTGACAGTGTTGATCTCAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTTGTACCTTTGGTACGTTTGTCCATATTTGACAGTGTTGATCTCAA  100

seq1  ATCATTTGGTTAAATTTATTCGTAAGCGTTTAGGATCTCTGTTACTAGGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATTTGGTTAAATTTATTCGTAAGCGTTTAGGATCTCTGTTACTAGGA  150

seq1  TACCCTGAGTAGGTTTTTATTAGCATTGTGATCGACAACGTAAGCATAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCCTGAGTAGGTTTTTATTAGCATTGTGATCGACAACGTAAGCATAGG  200

seq1  AAAGAGCTTCCCAGGTAGAACTTCAGTTGCTGAGATGTGTGCATTGGAGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAGCTTCCCAGGTAGAACTTCAGTTGCTGAGATGTGTGCATTGGAGG  250

seq1  CTGTCTCTCACGTTCCCAGAGAAGAAAGCTGGATGCATCCCTTACTAAGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCTCTCACGTTCCCAGAGAAGAAAGCTGGATGCATCCCTTACTAAGG  300

seq1  CCATTTAAGTTCAGTCATGCTGAGAGATGAGCCCTGGATGACCCACAGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTTAAGTTCAGTCATGCTGAGAGATGAGCCCTGGATGACCCACAGAG  350

seq1  AAGAAGAATCCGGAACATTGCTGTCTTAGCTAACCTCCTAATGTCAAGCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAGAATCCGGAACATTGCTGTCTTAGCTAACCTCCTAATGTCAAGCC  400

seq1  CTCTTCAGGCCAGGGGCTGTTGACCTAATTAGTTGGTTTTTCTGGTGGGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTCAGGCCAGGGGCTGTTGACCTAATTAGTTGGTTTTTCTGGTGGGT  450

seq1  ACATGGACATGGAGGGACCCATTCTAAAACAGGCTGGGCTAATCCAGAGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGGACATGGAGGGACCCATTCTAAAACAGGCTGGGCTAATCCAGAGT  500

seq1  ACAAGTTTCCCCCAGTATATTTACTTTTTGTCCAACCCTTAAAAATTCCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGTTTCCCCCAGTATATTTACTTTTTGTCCAACCCTTAAAAATTCCA  550

seq1  TTTTGAGGGATGGAGAGATGGCTTAGTAGGTTATGAACACTGACTGCTCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGAGGGATGGAGAGATGGCTTAGTAGGTTATGAACACTGACTGCTCT  600

seq1  TCCAAAGAAGCCGGGTTCAATACCTAGTCCCTATGTGGCAGCTCACAATT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAAGAAGCCGGGTTCAATACCTAGTCCCTATGTGGCAGCTCACAATT  650

seq1  GTCTTTAACCCTAGTTCCAGGGTGTCAGACGCTCTCTTTTGACCTCCATG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTTAACCCTAGTTCCAGGGTGTCAGACGCTCTCTTTTGACCTCCATG  700

seq1  GATACTAAGCATACACATGATGTGCATATAAGCAAAACACCCATATACAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATACTAAGCATACACATGATGTGCATATAAGCAAAACACCCATATACAT  750

seq1  AGAATAATTTTTTCTAAAAAAAATGAGATTGTTTGGTTGGGGGTTATTAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATAATTTTTTCTAAAAAAAATGAGATTGTTTGGTTGGGGGTTATTAT  800

seq1  CATCACAATATTAGGTTTCCCCAGAGGGGAAATAGAAATAGAAATAGAGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCACAATATTAGGTTTCCCCAGAGGGGAAATAGAAATAGAAATAGAGC  850

seq1  CACGAGAGGGGCTCTACTAGGTTAATTGGCTCATACAATCATGGGGAATA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGAGAGGGGCTCTACTAGGTTAATTGGCTCATACAATCATGGGGAATA  900

seq1  AGAAGTCCAATGACAGACCAGCTACAGCCTAGAGAAACTGGGATGCAAGA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGTCCAATGACAGACCAGCTACAGCCTAGAGAAACTGGGATGCAAGA  950

seq1  AGTGTGAAGGGCTCAGAACCAGGGGGCCTGATGCTCTTCCT--CTCAGTC  998
      ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||
seq2  AGTGTGAAGGGCTCAGAACCA-GGGGCCTGATGCTCTTCCTTCTTCAGTC  999

seq1  TGAGGATG-TGGAGAGCCGCTGCTCTAAG-TCCTGAAGTCC-AAAGGCCA  1045
      |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
seq2  TGAGGATGTTGGAGAGCCGCTGCTCTAAGTTCCTGAAGTCCAAAAGGCCA  1049

seq1  GAGAGCCTGGA--CTCTTCAACTACAGGG-ACAAG-AGAAGAGGTTCCCA  1091
      |||||||||||   ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| 
seq2  GAGAGCCTGGAACTTCTTCAACTACAGGGAACAAGAAGAAGAGGTTCCC-  1098

seq1  ATGCTAGGGAGGAAAACAAAAATCACCTTCTCAG-CTTTCTGTTTTTC  1138
      ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||
seq2  ATGCTAGGGAGGAAAACAAAAATCA-CGTCTCAGCCTTTCTGTTTTTC  1145

seq1: chr16_34871649_34872717
seq2: B6Ng01-183J15.g_67_1140 (reverse)

seq1  TTTTGTGCTTCCT-CCAACAGCATGG-AAGGAGCCCAGCATCTATCTTAA  48
      |||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| |  |
seq2  TTTTGTGCCTCCTCCCAACAGCATGGAAAGAAGCCCAGCATCTAT-TCTA  49

seq1  CTGTCCATGTC-AACTGGGTTCTTTCAAAACCTGTCTC-TCCTTTGATGA  96
      |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  CTGTTCATGTCAAACTGGGTTCTTTCAAAACCTGTCTCTTCCTTTGATGA  99

seq1  GCTTAAAGTGTCTTTCAACCTT-GGCTAGAGAGTGAGTTGGCAGACTGCT  145
      || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATAAAGTGTCTTCCAACCTTGGGCTAGAGAGTGAGTTGGCAGACTGCT  149

seq1  CG-CCCAGTGGTCATATTGGACAAATACATCAGCAGTGATCACTGGTCCA  194
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCCCCAGTGGTCATATTGGACAAATACATCAGCAGTGATCACTGGTCCA  199

seq1  TGGCATCCCAAGTTCAGTGTGGCCTGAGCATTTTGGTGTGGCTCCTGTCT  244
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCATCCCAAGTTCAGTGTGGCCTGAGCATTTTGGTGTGGCTCCTGTCT  249

seq1  CACTGATGTTCTGTCAGAATCTCAAGATAGGTGTGGCTAGGGAAATGCTA  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGATGTTCTGTCAGAATCTCAAGATAGGTGTGGCTAGGGAAATGCTA  299

seq1  ACTGTGACGTTAAGTCTCTACCCATGGGTCCATTCCTGTCCTGTCATGGA  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTGACGTTAAGTCTCTACCCATGGGTCCATTCCTGTCCTGTCATGGA  349

seq1  AATGTGATAGCTGAGAGAGCGTAAGGAAGTCTACCATTCCCCAATAAATG  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTGATAGCTGAGAGAGCGTAAGGAAGTCTACCATTCCCCAATAAATG  399

seq1  TCCTGTGCATTCCCTGCAGCAGACACTCTCTCATATGAGCACGACGACCC  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGTGCATTCCCTGCAGCAGACACTCTCTCATATGAGCACGACGACCC  449

seq1  AGCCTTCCTTAGTAGGCTTTTTATACGCATTCACAGCTTATAGAAGAAAG  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTTCCTTAGTAGGCTTTTTATACGCATTCACAGCTTATAGAAGAAAG  499

seq1  AGACCAACTTCCAGGGTGATGGCTCTTTCCTCCTTCTCCTAACCCAAAAC  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCAACTTCCAGGGTGATGGCTCTTTCCTCCTTCTCCTAACCCAAAAC  549

seq1  CAAACCACTATTGTGTAGTTATGTTACTGCATTGTTTTCTGGTCACATTT  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACCACTATTGTGTAGTTATGTTACTGCATTGTTTTCTGGTCACATTT  599

seq1  TATATCTCCTCCCCAGCTGCAGCCCCCCGATAAAGGGTTCCCCATGTGGT  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATCTCCTCCCCAGCTGCAGCCCCCCGATAAAGGGTTCCCCATGTGGT  649

seq1  GTCTCTAGGTTTGCTATACTGCTGTTTCCTGCCTGGTACATCAGCAGCTC  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCTAGGTTTGCTATACTGCTGTTTCCTGCCTGGTACATCAGCAGCTC  699

seq1  ACCCAGGCTCGGTGGCACTGGGCATAGTAACTTTTCAGCTAGAACTGGCG  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAGGCTCGGTGGCACTGGGCATAGTAACTTTTCAGCTAGAACTGGCG  749

seq1  GTACCTAGCACAGCAGCAGCTTGCCGAGGCCTGGCAGTACTGCTGATTCT  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACCTAGCACAGCAGCAGCTTGCCGAGGCCTGGCAGTACTGCTGATTCT  799

seq1  GGGAGGTGTGGCTTCGCAGCGGCTCACTCATTCCTGTTCTATTTCTGCTT  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGGTGTGGCTTCGCAGCGGCTCACTCATTCCTGTTCTATTTCTGCTT  849

seq1  GTTGCTATTTGCTGGGCCTTCTGTGGAAGAACTGAGCATTGATTCTGTTC  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGCTATTTGCTGGGCCTTCTGTGGAAGAACTGAGCATTGATTCTGTTC  899

seq1  ATCGTAAATAGATATGGTAAGAGATGTGCATCTCCTTCCCTCACTTAAGC  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCGTAAATAGATATGGTAAGAGATGTGCATCTCCTTCCCTCACTTAAGC  949

seq1  TGTGGCATATTCTGGACCAGTCCTGGATCTCTATAGGTGATTCTAACAAT  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGCATATTCTGGACCAGTCCTGGATCTCTATAGGTGATTCTAACAAT  999

seq1  AGAAAGTCCCAAATACTACCTCACAACTCAGCTAGGAGGTTGAGTATTCT  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGTCCCAAATACTACCTCACAACTCAGCTAGGAGGTTGAGTATTCT  1049

seq1  AGAACTTGGGAGGCCTGATGAATTC  1069
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACTTGGGAGGCCTGATGAATTC  1074