BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-186G24
Chromosome16 (Build37)
Map Location 12,851,595 - 13,037,468
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC622553
Upstream geneC530044N13Rik, 2700045P11Rik, EG622509
Downstream geneErcc4, Gt4-1, Mkl2, Parn, LOC100043196, 3110001I22Rik, Pla2g10, A930007A09Rik, LOC622757, Rrn3, Ntan1, Pdxdc1, Mpv17l, Ifitm7, 2900011O08Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-186G24.bB6Ng01-186G24.g
ACCGA011283GA011284
length1,0861,089
definitionB6Ng01-186G24.b B6Ng01-186G24.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(13,036,400 - 13,037,468)(12,851,595 - 12,852,652)
sequence
gaattctgacaagactcttccaccctaatttctaactgcccaactccttg
gctctgctttctcactgtgcagctctcccactgctcactgtccgtccgtc
ctcctcattgtcctatgtttggaattgagttcacttttcttccttgtgaa
ggttagcactaaagttaattaaagttaactaaagctaagtctacatggca
gaatctagaatcagctgggagatgggcctctgggaaagcctggggctcat
cttagtgttaattgaggtgggcaggtgggctcattatgggcatggcttcc
catagaccgtggtgcttcaagctcctgctgcccctacttcatttttatct
ttagaacaaaaattacttgtagaagtaaatgcttccttactgtgatacaa
tatttcatattgcatactacccttttagagtcttaccatccctcctacca
aattcatccaccttctgattccttcctacaccccatgtcttcagcagcaa
gcgccaccaccaactttaaggttaaatttttccaaaagacatcggttggg
aagtcaaccatcaagggcaaagcacatcgggtcagggtcagtgtctgctc
acctgcctcactgtcctcctgggattagcagcagtggcacatgctcctgc
actaaattgtccgctccatttcttgccctgaccccaagacataagtcagt
ccatgtggctgatgacatgagacaagaagaaattaacaaaaattgttact
gtgtgtcaaaggaaaatacccagataagtagacgatgccgggtaagagaa
ctgtaatgaggactaagctgaccacagctgagggcaggcttttccactgt
agaaaaaaattaaaggaagaaaggcacagtgcaaggttcagttccaccgt
ggcccatgaagtagcgagcctgttaaggggacattttcagttccacagcc
atcacagtgttgctttgggttgccattgtgggaaactcactgtggccgta
gcgtgtaggccactggttggattcctgtggttgcctggccattttgcctg
aaggagtgtttgtttgcatggcaaagaagaatgatc
gaattcatgatctctctcccctggcttctctcaccactcaacagacgttg
gtttctactgtcccacatcagtctgtgagccctctccataaaacaaacct
gaactgatattcttcttgctaaagtgttgtcaccatcagtggacattcaa
gcccctttggctagaaactgcacctcctatggcctctctcagagcacaaa
gaagccactagaactcagtttttcagataccttgctgtcattggctcaca
tatgggaatgctgttgtcagagctgcaggtgactcagccatgctaactct
tttctcattacccttagagactcagcaaggccagcactcctctcttatca
gctcagatacttaggactatttgacaacacagacgaagctctgcttcctg
aatattcctcaaattagattcctaatgtcaggctctagtttttcttcccc
atgggtttttccttcttataactacaggatcccacctgtgggatcctgtc
atctatgtgatcccatctgtggtgtcccatctgtgggattctgtcatctg
tggtgtcccatctgtgggatcctgtcatctgtgggatcctgtcatctgtg
gaatcctgtcatctgtgggatcccatctgtagggtcctatctatggggtc
ctgtttgtgggatcctatctataggatcctgtctgtgggatcgtgtctgt
gggtctgttctctcctccttttatatttattctcataatgatctctagac
ttagtctcaggaagtgcatatgtccagaaatgagtctttagctcagctca
agctagatggtagaaagaattttatggtgcttagataaagcccagcatcc
ctcagaaactttcagaaattgggttccccatgaaggcaaaagaagtcatt
ttcctagcctcttctcagccccaattggttgtccctgcacctccgtagga
aaaggaatactataatattttgtcagcatgagttcttttcttcccctgca
aaccagttcttcttatccttactttgcattgcaatttccaggcttctcag
tggcatcaactggctcttctgaattcgaatttgcccact
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_13036400_13037468
seq2: B6Ng01-186G24.b_46_1131 (reverse)

seq1  GATCATTC-TCTTTCCCATGCAAACAAACACTCC-TCA-GCAAAAT-GCC  46
      |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||
seq2  GATCATTCTTCTTTGCCATGCAAACAAACACTCCTTCAGGCAAAATGGCC  50

seq1  A-GCAA-CACA-GAATCC-ACCAGT-GCCTACACGCTACGGCCACAGTGA  91
      | |||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAACCACAGGAATCCAACCAGTGGCCTACACGCTACGGCCACAGTGA  100

seq1  GTTTCCCACAATGGC-ACCCAAAGC-ACACTGTTGAT-GCTGTGGAACTG  138
      ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||
seq2  GTTTCCCACAATGGCAACCCAAAGCAACACTG-TGATGGCTGTGGAACTG  149

seq1  -AAATGTCCCCT--ACAGGCTCGCTACTTCAT-GGCCACGGTGG-ACTGA  183
       |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||
seq2  AAAATGTCCCCTTAACAGGCTCGCTACTTCATGGGCCACGGTGGAACTGA  199

seq1  ACCTTGCACTGTGCCTTTCTTCC-TTAATTTTTTTCTACAGTGGAAAAGC  232
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTGCACTGTGCCTTTCTTCCTTTAATTTTTTTCTACAGTGGAAAAGC  249

seq1  CTGCCCTCAGCTGTGGTCAGCTTAGTCCTCATTACAGTTCTCTTACCCGG  282
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCCTCAGCTGTGGTCAGCTTAGTCCTCATTACAGTTCTCTTACCCGG  299

seq1  CATCGTCTACTTATCTGGGTATTTTCCTTTGACACACAGTAACAATTTTT  332
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCGTCTACTTATCTGGGTATTTTCCTTTGACACACAGTAACAATTTTT  349

seq1  GTTAATTTCTTCTTGTCTCATGTCATCAGCCACATGGACTGACTTATGTC  382
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAATTTCTTCTTGTCTCATGTCATCAGCCACATGGACTGACTTATGTC  399

seq1  TTGGGGTCAGGGCAAGAAATGGAGCGGACAATTTAGTGCAGGAGCATGTG  432
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGGTCAGGGCAAGAAATGGAGCGGACAATTTAGTGCAGGAGCATGTG  449

seq1  CCACTGCTGCTAATCCCAGGAGGACAGTGAGGCAGGTGAGCAGACACTGA  482
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTGCTGCTAATCCCAGGAGGACAGTGAGGCAGGTGAGCAGACACTGA  499

seq1  CCCTGACCCGATGTGCTTTGCCCTTGATGGTTGACTTCCCAACCGATGTC  532
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGACCCGATGTGCTTTGCCCTTGATGGTTGACTTCCCAACCGATGTC  549

seq1  TTTTGGAAAAATTTAACCTTAAAGTTGGTGGTGGCGCTTGCTGCTGAAGA  582
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGGAAAAATTTAACCTTAAAGTTGGTGGTGGCGCTTGCTGCTGAAGA  599

seq1  CATGGGGTGTAGGAAGGAATCAGAAGGTGGATGAATTTGGTAGGAGGGAT  632
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGGGTGTAGGAAGGAATCAGAAGGTGGATGAATTTGGTAGGAGGGAT  649

seq1  GGTAAGACTCTAAAAGGGTAGTATGCAATATGAAATATTGTATCACAGTA  682
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAAGACTCTAAAAGGGTAGTATGCAATATGAAATATTGTATCACAGTA  699

seq1  AGGAAGCATTTACTTCTACAAGTAATTTTTGTTCTAAAGATAAAAATGAA  732
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGCATTTACTTCTACAAGTAATTTTTGTTCTAAAGATAAAAATGAA  749

seq1  GTAGGGGCAGCAGGAGCTTGAAGCACCACGGTCTATGGGAAGCCATGCCC  782
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGGGGCAGCAGGAGCTTGAAGCACCACGGTCTATGGGAAGCCATGCCC  799

seq1  ATAATGAGCCCACCTGCCCACCTCAATTAACACTAAGATGAGCCCCAGGC  832
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATGAGCCCACCTGCCCACCTCAATTAACACTAAGATGAGCCCCAGGC  849

seq1  TTTCCCAGAGGCCCATCTCCCAGCTGATTCTAGATTCTGCCATGTAGACT  882
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCCAGAGGCCCATCTCCCAGCTGATTCTAGATTCTGCCATGTAGACT  899

seq1  TAGCTTTAGTTAACTTTAATTAACTTTAGTGCTAACCTTCACAAGGAAGA  932
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTTTAGTTAACTTTAATTAACTTTAGTGCTAACCTTCACAAGGAAGA  949

seq1  AAAGTGAACTCAATTCCAAACATAGGACAATGAGGAGGACGGACGGACAG  982
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTGAACTCAATTCCAAACATAGGACAATGAGGAGGACGGACGGACAG  999

seq1  TGAGCAGTGGGAGAGCTGCACAGTGAGAAAGCAGAGCCAAGGAGTTGGGC  1032
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCAGTGGGAGAGCTGCACAGTGAGAAAGCAGAGCCAAGGAGTTGGGC  1049

seq1  AGTTAGAAATTAGGGTGGAAGAGTCTTGTCAGAATTC  1069
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTAGAAATTAGGGTGGAAGAGTCTTGTCAGAATTC  1086

seq1: chr16_12851595_12852652
seq2: B6Ng01-186G24.g_67_1155

seq1  GAATTCATGATCTCTCTCCCCTGGCTTCTCTCACCACTCAACAGACGTTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATGATCTCTCTCCCCTGGCTTCTCTCACCACTCAACAGACGTTG  50

seq1  GTTTCTACTGTCCCACATCAGTCTGTGAGCCCTCTCCATAAAACAAACCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCTACTGTCCCACATCAGTCTGTGAGCCCTCTCCATAAAACAAACCT  100

seq1  GAACTGATATTCTTCTTGCTAAAGTGTTGTCACCATCAGTGGACATTCAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTGATATTCTTCTTGCTAAAGTGTTGTCACCATCAGTGGACATTCAA  150

seq1  GCCCCTTTGGCTAGAAACTGCACCTCCTATGGCCTCTCTCAGAGCACAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCTTTGGCTAGAAACTGCACCTCCTATGGCCTCTCTCAGAGCACAAA  200

seq1  GAAGCCACTAGAACTCAGTTTTTCAGATACCTTGCTGTCATTGGCTCACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCCACTAGAACTCAGTTTTTCAGATACCTTGCTGTCATTGGCTCACA  250

seq1  TATGGGAATGCTGTTGTCAGAGCTGCAGGTGACTCAGCCATGCTAACTCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGGAATGCTGTTGTCAGAGCTGCAGGTGACTCAGCCATGCTAACTCT  300

seq1  TTTCTCATTACCCTTAGAGACTCAGCAAGGCCAGCACTCCTCTCTTATCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTCATTACCCTTAGAGACTCAGCAAGGCCAGCACTCCTCTCTTATCA  350

seq1  GCTCAGATACTTAGGACTATTTGACAACACAGACGAAGCTCTGCTTCCTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCAGATACTTAGGACTATTTGACAACACAGACGAAGCTCTGCTTCCTG  400

seq1  AATATTCCTCAAATTAGATTCCTAATGTCAGGCTCTAGTTTTTCTTCCCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATTCCTCAAATTAGATTCCTAATGTCAGGCTCTAGTTTTTCTTCCCC  450

seq1  ATGGGTTTTTCCTTCTTATAACTACAGGATCCCACCTGTGGGATCCTGTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGTTTTTCCTTCTTATAACTACAGGATCCCACCTGTGGGATCCTGTC  500

seq1  ATCTATGTGATCCCATCTGTGGTGTCCCATCTGTGGGATTCTGTCATCTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTATGTGATCCCATCTGTGGTGTCCCATCTGTGGGATTCTGTCATCTG  550

seq1  TGGTGTCCCATCTGTGGGATCCTGTCATCTGTGGGATCCTGTCATCTGTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGTCCCATCTGTGGGATCCTGTCATCTGTGGGATCCTGTCATCTGTG  600

seq1  GAATCCTGTCATCTGTGGGATCCCATCTGTAGGGTCCTATCTATGGGGTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCCTGTCATCTGTGGGATCCCATCTGTAGGGTCCTATCTATGGGGTC  650

seq1  CTGTTTGTGGGATCCTATCTATAGGATCCTGTCTGTGGGATCGTGTCTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTTGTGGGATCCTATCTATAGGATCCTGTCTGTGGGATCGTGTCTGT  700

seq1  GGGTCTGTTCTCTCCTCCTTTTATATTTATTCTCATAATGATCTCTAGAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCTGTTCTCTCCTCCTTTTATATTTATTCTCATAATGATCTCTAGAC  750

seq1  TTAGTCTCAGGAAGTGCATATGTCCAGAAATGAGTC-TTAGCTCAGCTCA  799
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TTAGTCTCAGGAAGTGCATATGTCCAGAAATGAGTCTTTAGCTCAGCTCA  800

seq1  AGCTAGATGGTAG-AAGAA-TTTATGGTGCTTAGATAAAG-CCAGCAT-C  845
      ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |
seq2  AGCTAGATGGTAGAAAGAATTTTATGGTGCTTAGATAAAGCCCAGCATCC  850

seq1  CTCAGAAAC-TTCAGAAA-TGGGTT-CCCATGAA-GCAAAAGAAGTCATT  891
      ||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||
seq2  CTCAGAAACTTTCAGAAATTGGGTTCCCCATGAAGGCAAAAGAAGTCATT  900

seq1  TCCCTAGC--CCTCTCAGCCCCAA-TGGTTG-CCCTGCA-CTCC-TAGGA  935
      | ||||||  | |||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||
seq2  TTCCTAGCCTCTTCTCAGCCCCAATTGGTTGTCCCTGCACCTCCGTAGGA  950

seq1  AAA-GAATCCTA-AATA-TTTGTCAAGCA-GAGTTC-TTTCT--CCCTGC  978
      ||| |||| ||| |||| |||||| |||| |||||| |||||  ||||||
seq2  AAAGGAATACTATAATATTTTGTC-AGCATGAGTTCTTTTCTTCCCCTGC  999

seq1  AAACCAG-TCTCCTTATCCTTAC-TTGCA-TGCAA-TTCCAG--CTCTCA  1022
      ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||   |||||
seq2  AAACCAGTTCTTCTTATCCTTACTTTGCATTGCAATTTCCAGGCTTCTCA  1049

seq1  GT-GCATCAACT-GCTCTTCTG-ATTC-ACATTGCCCACT  1058
      || ||||||||| ||||||||| |||| |  |||||||||
seq2  GTGGCATCAACTGGCTCTTCTGAATTCGAATTTGCCCACT  1089