BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-210P22
Chromosome16 (Build37)
Map Location 37,780,876 - 37,945,666
singlet/doubletdoublet
Overlap geneFstl1, LOC100043264, Lrrc58, Gpr156, LOC100043271
Upstream geneSlc15a2, Eaf2, Iqcb1, LOC628101, Golgb1, Hcls1, Fbxo40, LOC100043252, Polq, Stxbp5l, Gtf2e1, Rabl3, Hgd, Ndufb4, LOC100043709
Downstream geneLOC100043713, Gsk3b, Nr1i2, 4932425I24Rik, Cox17, LOC100043715, Popdc2, Pla1a, Adprh, Cd80, LOC667353, Ck-ps3, 4930455C21Rik, 9630046K23Rik, Tmem39a, Cdgap, B4galt4, LOC100043289, Upk1b, 4930435E12Rik, Igsf11
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-210P22.bB6Ng01-210P22.g
ACCGA029187GA029188
length713791
definitionB6Ng01-210P22.b B6Ng01-210P22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(37,780,876 - 37,781,587)(37,944,877 - 37,945,666)
sequence
gaattccaggtataagtttgtgtgcccctggagtcttgaggaatgtatat
tagttcctctgacatgacaggctagaggagacacacagcccaactgccag
cttcaaaaggacaatcttagtaagtgtccaagtgtccccctatgcaccct
ggcttagttttactctgcattctgggtctaggaattcattatgataaatt
acatatacaagggacagatttaccgaggagatcactcactccagcaagga
atccacacttgagccatgagctgggaatgtgtctcttgagacggtagtgt
ggagagccaataacagctccacagacagatgcgctgtgcttagctgttag
gcatgccatgctagcagactgtcagggctttgtccctaggaagctacact
gcttaatgtcatttacatctcctcacatgcatgtagttaaccactaggtt
agtatctgccaggctggggagggttgggagtgcctctgcattctatagaa
ttgttcattaatctacagagtaaaccttccacccccacccccacccccaa
ctacagcttcagaaagagcacttgcagcttacacatcagctagcaaaatg
atctcctgtttgtcctgtagcaaataaactacttgctgtgatgctaaagg
tgccgttgggaatccagaagttgaagcatagctagacaccactgaatagc
ccaaaacagatgg
gaattcttgtgctgtctggacagatgactgaatattaaattacgaagcaa
acaaggcatggctattcgtatcctaattttgttggaattccaacagaaag
ggtctttctctctttttttctagccacaccctactttcctactgagtatt
ctagcaatgagcaatgtgaggagtcacagagcaaactacactatggtagt
ctggaaggacgtgtgtttttacattgtcttctccatcttagtggtaaacc
aaagacctatttttggcttgataatgctttgttgtctggaccatcttttg
aagagaggatgtttggcagcatgcctggccctctcctaacagtttcaaca
actgccagtcactgccaactgtgcccagtatgtgccaaattgagactccc
tggcgtcatgagaattttggtccctttaaaagcacagaaatgttaaggga
ctatgtttttgttttaatcccaggtgtggggttgctttagactgtccaca
gcagctgactatgatttgtctcatgctcgggcagggatgttattttgcca
gctgaaaatagtttacatttggcattctggggacgcttcagagggtatac
aaatgctgctgcccttccttcttctgctatagctgattgctggttggagg
tatcctggtgatgaagatcacacttgccccaaggacttccttaatcaaca
ggaagcagtctaacaagatcaacaccttctttcccctctaaccttcttgc
tctcctacctagggtttggagggttggaaggttggagaagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_37780876_37781587
seq2: B6Ng01-210P22.b_48_760

seq1  GAATTCCAGGTATAAGTTTGTGTGCCCCTGGAGTCTTGAGGAATGTATAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGGTATAAGTTTGTGTGCCCCTGGAGTCTTGAGGAATGTATAT  50

seq1  TAGTTCCTCTGACATGACAGGCTAGAGGAGACACACAGCCCAACTGCCAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTCCTCTGACATGACAGGCTAGAGGAGACACACAGCCCAACTGCCAG  100

seq1  CTTCAAAAGGACAATCTTAGTAAGTGTCCAAGTGTCCCCCTATGCACCCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAAAAGGACAATCTTAGTAAGTGTCCAAGTGTCCCCCTATGCACCCT  150

seq1  GGCTTAGTTTTACTCTGCATTCTGGGTCTAGGAATTCATTATGATAAATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTAGTTTTACTCTGCATTCTGGGTCTAGGAATTCATTATGATAAATT  200

seq1  ACATATACAAGGGACAGATTTACCGAGGAGATCACTCACTCCAGCAAGGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATATACAAGGGACAGATTTACCGAGGAGATCACTCACTCCAGCAAGGA  250

seq1  ATCCACACTTGAGCCATGAGCTGGGAATGTGTCTCTTGAGACGGTAGTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCACACTTGAGCCATGAGCTGGGAATGTGTCTCTTGAGACGGTAGTGT  300

seq1  GGAGAGCCAATAACAGCTCCACAGACAGATGCGCTGTGCTTAGCTGTTAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAGCCAATAACAGCTCCACAGACAGATGCGCTGTGCTTAGCTGTTAG  350

seq1  GCATGCCATGCTAGCAGACTGTCAGGGCTTTGTCCCTAGGAAGCTACACT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGCCATGCTAGCAGACTGTCAGGGCTTTGTCCCTAGGAAGCTACACT  400

seq1  GCTTAATGTCATTTACATCTCCTCACATGCATGTAGTTAACCACTAGGTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTAATGTCATTTACATCTCCTCACATGCATGTAGTTAACCACTAGGTT  450

seq1  AGTATCTGCCAGGCTGGGGAGGGTTGGGAGTGCCTCTGCATTCTATAGAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATCTGCCAGGCTGGGGAGGGTTGGGAGTGCCTCTGCATTCTATAGAA  500

seq1  TTGTTCATTAATCTACAGAGTAAACCTTCCACCCCCACCCCCACCCCCAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTCATTAATCTACAGAGTAAACCTTCCACCCCCACCCCCACCCCCAA  550

seq1  CTACAGCTTCAGAAAGAGCACTTGCAGCTTACACATCAGCTAGCAAAATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACAGCTTCAGAAAGAGCACTTGCAGCTTACACATCAGCTAGCAAAATG  600

seq1  ATCTCCTGTTTGTCCTGTAGCAAATAAACTACTTGCTGTGATGCTAAAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCCTGTTTGTCCTGTAGCAAATAAACTACTTGCTGTGATGCTAAAGG  650

seq1  TGCCGTTGGGAATCGAGAAGTTGAAGCATAGCTAGACACCACTGAATAG-  699
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TGCCGTTGGGAATCCAGAAGTTGAAGCATAGCTAGACACCACTGAATAGC  700

seq1  CCAAAACAGATGG  712
      |||||||||||||
seq2  CCAAAACAGATGG  713

seq1: chr16_37944877_37945666
seq2: B6Ng01-210P22.g_65_855 (reverse)

seq1  CCTTCTCCAACCTTCCAACCCTCC-AACCCTAGGTAGGAGAGCAAGAAGG  49
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCTCCAACCTTCCAACCCTCCAAACCCTAGGTAGGAGAGCAAGAAGG  50

seq1  TTAGAGGGGAAAGAAGGTGTTGATCTTGTTAGACTGCTTCCTGTTGATTA  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAGGGGAAAGAAGGTGTTGATCTTGTTAGACTGCTTCCTGTTGATTA  100

seq1  AGGAAGTCCTTGGGGCAAGTGTGATCTTCATCACCAGGATACCTCCAACC  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGTCCTTGGGGCAAGTGTGATCTTCATCACCAGGATACCTCCAACC  150

seq1  AGCAATCAGCTATAGCAGAAGAAGGAAGGGCAGCAGCATTTGTATACCCT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAATCAGCTATAGCAGAAGAAGGAAGGGCAGCAGCATTTGTATACCCT  200

seq1  CTGAAGCGTCCCCAGAATGCCAAATGTAAACTATTTTCAGCTGGCAAAAT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAGCGTCCCCAGAATGCCAAATGTAAACTATTTTCAGCTGGCAAAAT  250

seq1  AACATCCCTGCCCGAGCATGAGACAAATCATAGTCAGCTGCTGTGGACAG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATCCCTGCCCGAGCATGAGACAAATCATAGTCAGCTGCTGTGGACAG  300

seq1  TCTAAAGCAACCCCACACCTGGGATTAAAACAAAAACATAGTCCCTTAAC  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAAGCAACCCCACACCTGGGATTAAAACAAAAACATAGTCCCTTAAC  350

seq1  ATTTCTGTGCTTTTAAAGGGACCAAAATTCTCATGACGCCAGGGAGTCTC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCTGTGCTTTTAAAGGGACCAAAATTCTCATGACGCCAGGGAGTCTC  400

seq1  AATTTGGCACATACTGGGCACAGTTGGCAGTGACTGGCAGTTGTTGAAAC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTGGCACATACTGGGCACAGTTGGCAGTGACTGGCAGTTGTTGAAAC  450

seq1  TGTTAGGAGAGGGCCAGGCATGCTGCCAAACATCCTCTCTTCAAAAGATG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAGGAGAGGGCCAGGCATGCTGCCAAACATCCTCTCTTCAAAAGATG  500

seq1  GTCCAGACAACAAAGCATTATCAAGCCAAAAATAGGTCTTTGGTTTACCA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCAGACAACAAAGCATTATCAAGCCAAAAATAGGTCTTTGGTTTACCA  550

seq1  CTAAGATGGAGAAGACAATGTAAAAACACACGTCCTTCCAGACTACCATA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGATGGAGAAGACAATGTAAAAACACACGTCCTTCCAGACTACCATA  600

seq1  GTGTAGTTTGCTCTGTGACTCCTCACATTGCTCATTGCTAGAATACTCAG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTAGTTTGCTCTGTGACTCCTCACATTGCTCATTGCTAGAATACTCAG  650

seq1  TAGGAAAGTAGGGTGTGGCTAGAAAAAAAGAGAGAAAGACCCTTTCTGTT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGAAAGTAGGGTGTGGCTAGAAAAAAAGAGAGAAAGACCCTTTCTGTT  700

seq1  GGAATTCCAACAAAATTAGGATACGAATAGCCATGCCTTGTTTGCTTCGT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATTCCAACAAAATTAGGATACGAATAGCCATGCCTTGTTTGCTTCGT  750

seq1  AATTTAATATTCAGTCATCTGTCCAGACAGCACAAGAATTC  790
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTAATATTCAGTCATCTGTCCAGACAGCACAAGAATTC  791