BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-214L11
Chromosome16 (Build37)
Map Location 41,243,964 - 41,358,717
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream genenone
Downstream geneEG667450, Lsamp, Gap43
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-214L11.bB6Ng01-214L11.g
ACCGA031893GA031894
length1,1601,054
definitionB6Ng01-214L11.b B6Ng01-214L11.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(41,357,561 - 41,358,717)(41,243,964 - 41,245,019)
sequence
gaattccaatctcttagtgctttggttccagggctgctgtgatgttctgt
tggggtcagcctagctcatcaatgtatagctttttaaatttttcttctgt
ctttctctttcagatgatgatttttcttaacactttgggcttcaccaaat
cttctccagagctcacctacctgcagcatagctgcctgttctccatgagg
cttacttccatgccagcttacctcaaccaaaatggatttttctatttctc
ttttctgtctaacactcctaactatctaccaagttttaaagatcgtctgc
cctagggtttttctttctatctctagtaaaattcttcttgagcttttatt
tgggtccttcttaaattcttctattgacaagactaagaagcacaagagca
gactctgattccctgatagctacagaataataaaatatttgtttagaagt
ttttgccctgggttcctgacgtagactttatagaatgctttaaccaccca
agtggtagaagtgttatttgtgagtcttttgattcagtcttaagagagta
tactaatgatattcttgattggaaccctataaatactcagtttaacaaac
aaaaaaaatgttgtgactttgggctagcttgagctttgcagagagggaag
ggctagagatagaatccaattcaccaagttcacataatgattcaacacta
tggaatccagatgcagagacttgatggagctctattattgacaagcattc
cagtatgctaaaggagtgctgttccatgactccacaaggaaaggacacag
agccaagccacttacttccctatgtgtctcttcatctggcagtcttgact
tccatctttcatcatttagccccaattctaaacaacatttttaacatctc
cattttattttgaaggaactgtcaaacatgacccaaagtcataggacgcg
tgatatttgtagttagtcagaaggatcagtgctcttatgactctcaatgg
acaactagcatctaaaatgaagcagtgctggttcaaatattgtctttcaa
cataatatacagtcttgttagttactctgtgtctagtgcagacctaaatt
tgcagcattgcagttgtccagaataaacattattgcctgtgcaagtgtga
cctgattatg

gaattcagatcatcatacttgtgtggcagacatttctactactgaccaat
ctctaacaccctaaaatataattatatctacttattctttttaaaaataa
tttcgatattttaattatttatgttcctaataacaatttctaggggtctc
ttcccttcacatcctcactaggattatagctattgagttctttttttaag
gcattttttattaaatattttcttcatttacatttcaaatgctatcccca
aagccacctataccctcctcctgccctgctccctaacccacccactcctg
cttcctggccctggcattcccctgtactggggcatatgattatgactcaa
aagatatgccatggactgtcacaagtagtgacagaactaagaacacccta
gttgcttcagtgtgtaagctggtgttgagtttgagagaggatgatgttgg
aagtgtgctgagtaaacatgaacatggtatctataacctagacactccta
cataaaacgagttcagtatataaatggtataaatgtctttcattgcaaag
ttatcagatctgtggtgataatggctggatttatgttgagtctagacata
caacaaagtaagaaaatgcatacattttcagaaattaattcctcatcctt
tcacgttattggacacccaactattgaatactacagctcaatgagcactt
gagaggggaaagccagagtctgctttgtatgttgtcttgcacagtaactt
agggatttgggggagttaactattctaaatcacctaaaggagtatttatt
gaacccacccacacagagacaaaatggaaaagtcacttgatcggcctgta
aaatgaatgcacccattatacacagtttctgactgttctgcccaaaactg
tatttcattctgcataaaaggtggatgctgtcagtgttgtgagttagatt
tgactgcccattctctcagcctctctcatctcttgccttcttcttgctga
agatcctgtgtgccctcttttccaaagctttcatgccacacgcattgctc
taaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_41357561_41358717
seq2: B6Ng01-214L11.b_45_1204 (reverse)

seq1  CATAATCAGTTCACACTTTGCACAGCAAATAATGTTTATTCT-GACAACT  49
      ||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||
seq2  CATAATCAGGTCACAC-TTGCACAGGCAATAATGTTTATTCTGGACAACT  49

seq1  GCTATGCTGC-AATTTAGTTCTGGCACTAGACACAGAGTTACTAAC-AGA  97
      || ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||
seq2  GCAATGCTGCAAATTTAGGTCT-GCACTAGACACAGAGTAACTAACAAGA  98

seq1  CTGTATA-TATGTTGAAAGAC-ATATTTGAAACCAGCACTGCCTTCATTT  145
      ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||
seq2  CTGTATATTATGTTGAAAGACAATATTTG-AACCAGCACTG-CTTCATTT  146

seq1  TAGATGCTAGTTGTCCATTGAGAGTCATAAGAGCACTGATCCTTCTGACT  195
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATGCTAGTTGTCCATTGAGAGTCATAAGAGCACTGATCCTTCTGACT  196

seq1  AACTACAAATATCACGCGTCCTATGACTTT-GGTCATGTTTGACAGTTCC  244
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  AACTACAAATATCACGCGTCCTATGACTTTGGGTCATGTTTGACAGTTCC  246

seq1  TTC-AAATAAAATGGAGATGTTAAAAATGTTGTTTAGAATTGGGGCTAAA  293
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAAATAAAATGGAGATGTTAAAAATGTTGTTTAGAATTGGGGCTAAA  296

seq1  TGATGAAAGATGGAAGTCAAGACTGCCAGATGAAGAGACACATAGGGAAG  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGAAAGATGGAAGTCAAGACTGCCAGATGAAGAGACACATAGGGAAG  346

seq1  TAAGTGGCTTGGCTCTGTGTCCTTTCCTTGTGGAGTCATGGAACAGCACT  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTGGCTTGGCTCTGTGTCCTTTCCTTGTGGAGTCATGGAACAGCACT  396

seq1  CCTTTAGCATACTGGAATGCTTGTCAATAATAGAGCTCCATCAAGTCTCT  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTAGCATACTGGAATGCTTGTCAATAATAGAGCTCCATCAAGTCTCT  446

seq1  GCATCTGGATTCCATAGTGTTGAATCATTATGTGAACTTGGTGAATTGGA  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCTGGATTCCATAGTGTTGAATCATTATGTGAACTTGGTGAATTGGA  496

seq1  TTCTATCTCTAGCCCTTCCCTCTCTGCAAAGCTCAAGCTAGCCCAAAGTC  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTATCTCTAGCCCTTCCCTCTCTGCAAAGCTCAAGCTAGCCCAAAGTC  546

seq1  ACAACATTTTTTTTGTTTGTTAAACTGAGTATTTATAGGGTTCCAATCAA  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACATTTTTTTTGTTTGTTAAACTGAGTATTTATAGGGTTCCAATCAA  596

seq1  GAATATCATTAGTATACTCTCTTAAGACTGAATCAAAAGACTCACAAATA  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATATCATTAGTATACTCTCTTAAGACTGAATCAAAAGACTCACAAATA  646

seq1  ACACTTCTACCACTTGGGTGGTTAAAGCATTCTATAAAGTCTACGTCAGG  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTTCTACCACTTGGGTGGTTAAAGCATTCTATAAAGTCTACGTCAGG  696

seq1  AACCCAGGGCAAAAACTTCTAAACAAATATTTTATTATTCTGTAGCTATC  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCAGGGCAAAAACTTCTAAACAAATATTTTATTATTCTGTAGCTATC  746

seq1  AGGGAATCAGAGTCTGCTCTTGTGCTTCTTAGTCTTGTCAATAGAAGAAT  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAATCAGAGTCTGCTCTTGTGCTTCTTAGTCTTGTCAATAGAAGAAT  796

seq1  TTAAGAAGGACCCAAATAAAAGCTCAAGAAGAATTTTACTAGAGATAGAA  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGAAGGACCCAAATAAAAGCTCAAGAAGAATTTTACTAGAGATAGAA  846

seq1  AGAAAAACCCTAGGGCAGACGATCTTTAAAACTTGGTAGATAGTTAGGAG  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAAACCCTAGGGCAGACGATCTTTAAAACTTGGTAGATAGTTAGGAG  896

seq1  TGTTAGACAGAAAAGAGAAATAGAAAAATCCATTTTGGTTGAGGTAAGCT  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAGACAGAAAAGAGAAATAGAAAAATCCATTTTGGTTGAGGTAAGCT  946

seq1  GGCATGGAAGTAAGCCTCATGGAGAACAGGCAGCTATGCTGCAGGTAGGT  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATGGAAGTAAGCCTCATGGAGAACAGGCAGCTATGCTGCAGGTAGGT  996

seq1  GAGCTCTGGAGAAGATTTGGTGAAGCCCAAAGTGTTAAGAAAAATCATCA  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTCTGGAGAAGATTTGGTGAAGCCCAAAGTGTTAAGAAAAATCATCA  1046

seq1  TCTGAAAGAGAAAGACAGAAGAAAAATTTAAAAAGCTATACATTGATGAG  1093
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAAAGAGAAAGACAGAAGAAAAATTTAAAAAGCTATACATTGATGAG  1096

seq1  CTAGGCTGACCCCAACAGAACATCACAGCAGCCCTGGAACCAAAGCACTA  1143
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGGCTGACCCCAACAGAACATCACAGCAGCCCTGGAACCAAAGCACTA  1146

seq1  AGAGATTGGAATTC  1157
      ||||||||||||||
seq2  AGAGATTGGAATTC  1160


seq1: chr16_41243964_41245019
seq2: B6Ng01-214L11.g_65_1118

seq1  GAATTCAGATCATCATACTTGTGTGGCAGACATTTCTACTACTGACCAAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGATCATCATACTTGTGTGGCAGACATTTCTACTACTGACCAAT  50

seq1  CTCTAACACCCTAAAATATAATTATATCTACTTATTCTTTTTAAAAATAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTAACACCCTAAAATATAATTATATCTACTTATTCTTTTTAAAAATAA  100

seq1  TTTCGATATTTTAATTATTTATGTTCCTAATAACAATTTCTAGGGGTCTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCGATATTTTAATTATTTATGTTCCTAATAACAATTTCTAGGGGTCTC  150

seq1  TTCCCTTCACATCCTCACTAGGATTATAGCTATTGAGTTCTTTTTTTAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCTTCACATCCTCACTAGGATTATAGCTATTGAGTTCTTTTTTTAAG  200

seq1  GCATTTTTTATTAAATATTTTCTTCATTTACATTTCAAATGCTATCCCCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTTTTTATTAAATATTTTCTTCATTTACATTTCAAATGCTATCCCCA  250

seq1  AAGCCACCTATACCCTCCTCCTGCCCTGCTCCCTAACCCACCCACTCCTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCACCTATACCCTCCTCCTGCCCTGCTCCCTAACCCACCCACTCCTG  300

seq1  CTTCCTGGCCCTGGCATTCCCCTGTACTGGGGCATATGATTATGACTCAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTGGCCCTGGCATTCCCCTGTACTGGGGCATATGATTATGACTCAA  350

seq1  AAGATATGCCATGGACTGTCACAAGTAGTGACAGAACTAAGAACACCCTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATATGCCATGGACTGTCACAAGTAGTGACAGAACTAAGAACACCCTA  400

seq1  GTTGCTTCAGTGTGTAAGCTGGTGTTGAGTTTGAGAGAGGATGATGTTGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGCTTCAGTGTGTAAGCTGGTGTTGAGTTTGAGAGAGGATGATGTTGG  450

seq1  AAGTGTGCTGAGTAAACATGAACATGGTATCTATAACCTAGACACTCCTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGTGCTGAGTAAACATGAACATGGTATCTATAACCTAGACACTCCTA  500

seq1  CATAAAACGAGTTCAGTATATAAATGGTATAAATGTCTTTCATTGCAAAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAAACGAGTTCAGTATATAAATGGTATAAATGTCTTTCATTGCAAAG  550

seq1  TTATCAGATCTGTGGTGATAATGGCTGGATTTATGTTGAGTCTAGACATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCAGATCTGTGGTGATAATGGCTGGATTTATGTTGAGTCTAGACATA  600

seq1  CAACAAAGTAAGAAAATGCATACATTTTCAGAAATTAATTCCTCATCCTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAAAGTAAGAAAATGCATACATTTTCAGAAATTAATTCCTCATCCTT  650

seq1  TCACGTTATTGGACACCCAACTATTGAATACTACAGCTCAATGAGCACTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACGTTATTGGACACCCAACTATTGAATACTACAGCTCAATGAGCACTT  700

seq1  GAGAGGGGAAAGCCAGAGTCTGCTTTGTATGTTGTCTTGCACAGTAACTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGGGGAAAGCCAGAGTCTGCTTTGTATGTTGTCTTGCACAGTAACTT  750

seq1  AGGGATTTGGGGGAGTTAACTATTCTAAATCACCTAAAGGAGTATTTATT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGATTTGGGGGAGTTAACTATTCTAAATCACCTAAAGGAGTATTTATT  800

seq1  GAACCCACCCACACAGAGACAAAATGGAAAAGTCACTTGATCGGCCTGTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCCACCCACACAGAGACAAAATGGAAAAGTCACTTGATCGGCCTGTA  850

seq1  AAATGAATGCACCCATTATACACAGTTTCTGACTGTTCTGCCCAAAACTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGAATGCACCCATTATACACAGTTTCTGACTGTTCTGCCCAAAACTG  900

seq1  TATTTCATTCTGCATAAAAGGTGGATGCTGTCAGTGTTGTGGAGTTTAGA  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||
seq2  TATTTCATTCTGCATAAAAGGTGGATGCTGTCAGTGTTGT-GAG-TTAGA  948

seq1  TTTGACTGCCCATTCTCTCAGCCTCTCTCATCTCCTTGCCTTCTTCCTGC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||
seq2  TTTGACTGCCCATTCTCTCAGCCTCTCTCATCT-CTTGCCTTCTTCTTGC  997

seq1  TGAAGATCCTGTGGTGCCTCTTTTCCAAAGCTTTCATGCCACACGCA-TG  1049
      |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TGAAGATCCTGTGTGCCCTCTTTTCCAAAGCTTTCATGCCACACGCATTG  1047

seq1  CTCTAAA  1056
      |||||||
seq2  CTCTAAA  1054


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |