BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-224N05
Chromosome16 (Build37)
Map Location 6,691,898 - 6,803,138
singlet/doubletdoublet
Overlap geneA2bp1
Upstream geneLOC100042436, LOC100042445
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-224N05.bB6Ng01-224N05.g
ACCGA039177GA039178
length1,087265
definitionB6Ng01-224N05.b B6Ng01-224N05.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(6,802,044 - 6,803,138)(6,691,898 - 6,692,162)
sequence
gaattcaaccataatcacgtaaataaaaaagtaatataaaaaactttgcc
ttttcaatgaggctgctaaagaaaaagaccgtggggtgagagaagggttt
tctcttgagttatcacagattgctctttgtttgcttatttgtttttgttt
gtttatttgtttgttttgattatccttcaaggctttgcttattctatcca
tatcctggcaataaaatcctatttcaggtcttcagcctaattctatgcat
tgtacatctcttatgttcaactactacccatgatggtgcacacccatcag
tcatggaagagtcaacttatttgcatgtttgacgactatgaacacatgct
gggttcttctctttgtgtttggagcattgagtacagatacgtgatgtgtt
ctttcctgtcttcctgaggatcaagactcaatcctgaaaaggtggctaaa
tcccagccaagtctctattacaacagcactcctccccaaatgtcccaacc
aaggtacaagcaggttcggagggcccataaaggcattgcaaggccccgta
aggctcttctttcagtggagctagggagagagctcatctagtaaatgcat
gaagctctgggttcaaatctcataaattatgcttccacatttaaaagctg
ggcatggtagcatggctctgaaatcccagtgattttatggagtcagaggc
tgatggatccctcatccttatctgccagctagcttagaatacttgatgag
ctccaaagcaatgaggcccctgtctcaaaagacaaggtggccagcaccta
aaggatgaccataaaggtacatatcaggcctccacactcatctgcacaca
caatttctccaccacaagactggatgtttaacggaaacaaaagtccctgt
aatttcattccttggtgatggaagagacccttattctgtagcctgaaaaa
gccagccctgaaaaataccttaaatgtaccacttcactaaatgtcacttc
atttgaaactactcatggcatttttccctttcccttggcagtatgccaca
agccaatatattttatgctaatgaaaaaaaggaaagt
cttagtggtgcttgtacattctcctctaagatgcaaggggtaattgacta
ggttcccagtaccaagtatgattttctttttgttgaggggttcttaagtc
taatcagagagctgttggtttctacaaaggtatggttactgccaaggtat
gtgtacaactacgccatccttaaagttatcatgccatgctagctgtattt
aggaatatatgtgaagatagatagatagatagatagatagatagatagat
agatagatagataga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_6802044_6803138
seq2: B6Ng01-224N05.b_49_1135 (reverse)

seq1  ACTTTCCCTTTTTTTCATTTAGGCCATAAAATATATTGGCTTTGTGCATT  50
      ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||   |
seq2  ACTTT-CCTTTTTTTCA-TTAG--CATAAAATATATTGGC-TTGTGGCAT  45

seq1  ACTGCCAAGGGAAGGGAAAAAATGCCATGAGTTAGTTTCCAAATGAAGTG  100
      ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||
seq2  ACTGCCAAGGGAAAGGGAAAAATGCCATGAG-TAGTTT-CAAATGAAGTG  93

seq1  ACATTTAGTGAAGT-GTACATTTAAGGTATTTTTCAGGGCTGGCTTTTTT  149
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  ACATTTAGTGAAGTGGTACATTTAAGGTATTTTTCAGGGCTGGC-TTTTT  142

seq1  CAGGCTACAGAATAAGGGTCTCTTCCATCACCCAAGGAATGAAATTACAG  199
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  CAGGCTACAGAATAAGGGTCTCTTCCATCA-CCAAGGAATGAAATTACAG  191

seq1  GGACTTTTGTTTCCGTTAAACATCCAGTCTTGTGGTGGAGAAATTGTGTG  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTTTTGTTTCCGTTAAACATCCAGTCTTGTGGTGGAGAAATTGTGTG  241

seq1  TGCAGATGAGTGTGGAGGCCTGATATGTACCTTTATGGTCATCCCTTAGG  299
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TGCAGATGAGTGTGGAGGCCTGATATGTACCTTTATGGTCATCCTTTAGG  291

seq1  TGCTGGCCACCTTGTCTTTTGAGACAGGGGCCTCATTGCTTTGGAGCTCA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGGCCACCTTGTCTTTTGAGACAGGGGCCTCATTGCTTTGGAGCTCA  341

seq1  TCAAGTATTCTAAGCTAGCTGGCAGATAAGGATGAGGGATCCATCAGCCT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGTATTCTAAGCTAGCTGGCAGATAAGGATGAGGGATCCATCAGCCT  391

seq1  CTGACTCCATAAAATCACTGGGATTTCAGAGCCATGCTACCATGCCCAGC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACTCCATAAAATCACTGGGATTTCAGAGCCATGCTACCATGCCCAGC  441

seq1  TTTTAAATGTGGAAGCATAATTTATGAGATTTGAACCCAGAGCTTCATGC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAATGTGGAAGCATAATTTATGAGATTTGAACCCAGAGCTTCATGC  491

seq1  ATTTACTAGATGAGCTCTCTCCCTAGCTCCACTGAAAGAAGAGCCTTACG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTACTAGATGAGCTCTCTCCCTAGCTCCACTGAAAGAAGAGCCTTACG  541

seq1  GGGCCTTGCAATGCCTTTATGGGCCCTCCGAACCTGCTTGTACCTTGGTT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCCTTGCAATGCCTTTATGGGCCCTCCGAACCTGCTTGTACCTTGGTT  591

seq1  GGGACATTTGGGGAGGAGTGCTGTTGTAATAGAGACTTGGCTGGGATTTA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACATTTGGGGAGGAGTGCTGTTGTAATAGAGACTTGGCTGGGATTTA  641

seq1  GCCACCTTTTCAGGATTGAGTCTTGATCCTCAGGAAGACAGGAAAGAACA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACCTTTTCAGGATTGAGTCTTGATCCTCAGGAAGACAGGAAAGAACA  691

seq1  CATCACGTATCTGTACTCAATGCTCCAAACACAAAGAGAAGAACCCAGCA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCACGTATCTGTACTCAATGCTCCAAACACAAAGAGAAGAACCCAGCA  741

seq1  TGTGTTCATAGTCGTCAAACATGCAAATAAGTTGACTCTTCCATGACTGA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTTCATAGTCGTCAAACATGCAAATAAGTTGACTCTTCCATGACTGA  791

seq1  TGGGTGTGCACCATCATGGGTAGTAGTTGAACATAAGAGATGTACAATGC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTGTGCACCATCATGGGTAGTAGTTGAACATAAGAGATGTACAATGC  841

seq1  ATAGAATTAGGCTGAAGACCTGAAATAGGATTTTATTGCCAGGATATGGA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAATTAGGCTGAAGACCTGAAATAGGATTTTATTGCCAGGATATGGA  891

seq1  TAGAATAAGCAAAGCCTTGAAGGATAATCAAAACAAACAAATAAACAAAC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAATAAGCAAAGCCTTGAAGGATAATCAAAACAAACAAATAAACAAAC  941

seq1  AAAAACAAATAAGCAAACAAAGAGCAATCTGTGATAACTCAAGAGAAAAC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAACAAATAAGCAAACAAAGAGCAATCTGTGATAACTCAAGAGAAAAC  991

seq1  CCTTCTCTCACCCCACGGTCTTTTTCTTTAGCAGCCTCATTGAAAAGGCA  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCTCTCACCCCACGGTCTTTTTCTTTAGCAGCCTCATTGAAAAGGCA  1041

seq1  AAGTTTTTTATATTACTTTTTTATTTACGTGATTATGGTTGAATTC  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTTTTTATATTACTTTTTTATTTACGTGATTATGGTTGAATTC  1087

seq1: chr16_6691898_6692162
seq2: B6Ng01-224N05.g_72_336

seq1  CTTAGTGGTGCTTGTACATTCTCCTCTAAGATGCAAGGGGTAATTGACTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGTGGTGCTTGTACATTCTCCTCTAAGATGCAAGGGGTAATTGACTA  50

seq1  GGTTCCCAGTACCAAGTATGATTTTCTTTTTGTTGAGGGGTTCTTAAGTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCCCAGTACCAAGTATGATTTTCTTTTTGTTGAGGGGTTCTTAAGTC  100

seq1  TAATCAGAGAGCTGTTGGTTTCTACAAAGGTATGGTTACTGCCAAGGTAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATCAGAGAGCTGTTGGTTTCTACAAAGGTATGGTTACTGCCAAGGTAT  150

seq1  GTGTACAACTACGCCATCCTTAAAGTTATCATGCCATGCTAGCTGTATTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTACAACTACGCCATCCTTAAAGTTATCATGCCATGCTAGCTGTATTT  200

seq1  AGGAATATATGTGAAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAATATATGTGAAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGAT  250

seq1  AGATAGATAGATAGA  265
      |||||||||||||||
seq2  AGATAGATAGATAGA  265