BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-232H23
Chromosome16 (Build37)
Map Location 15,120,211 - 15,195,921
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream gene4921513D23Rik, Nde1, Myh11, 0610037P05Rik, Abcc1, Gm1758, Snai2, Efcab1, LOC100042737
Downstream geneLOC665653, LOC385748, LOC100042743, LOC547302, EG632352, Ube2v2, LOC665682, Mcm4, Prkdc, 2410018G20Rik, Cebpd, 2310008H04Rik, LOC100043266, LOC224010
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-232H23.bB6Ng01-232H23.g
ACCGA044821GA044822
length833216
definitionB6Ng01-232H23.b B6Ng01-232H23.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(15,120,211 - 15,121,030)(15,195,706 - 15,195,921)
sequence
tgccatgagagaggcataggactcatcacactttgaggaagagactcgtg
agacagctaatgttgtgtggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcatata
ttaaacaaatctttttttaaaaaagattagaatttaaaaaacacataatt
tccttggccaaaagcacatagactctggtaaatcattgctattgtaatca
ccacattttgtgaatgtattattattattaaatactttttgacactgtag
aaagacatgactatatttgtctatttctgatcacatatacctcaaatata
gatggacttagttactttgggtgtggtggttcataaatgcttggcccagg
gagtggcatgattagaaggtatggcccagttgaagtaggtgtgtcactgt
gggtatgggctaaaagacccttttccactatcagccttcagatgaagatg
tagaactcttagcttctcttgtaccatgcctacctggatgctgctatgct
ctcaccttgataatactagactgaacctctgaatctgtaagccagaacca
ttaaaatgatgtcctttataagacttgcctttggtcatggtgtctgttca
cagcagtaaaaccctaactaaaacattgggctagttgaaaaaaaattgct
acagaccatgtagtttcaacaaaatgtacttttcaatgtcctggagactg
agcagatcaagatgatgctgatgctgagagtccttccttcctagcttgca
gatggcttacatcccagttactgatcttctttgacataggcagagacaag
cagtaagctctctcctgtctgtctctcactttg
tctagagaagcctggtggtttgggacttgactgaagaccagaaacaaaga
gcaactgaactgaagcaaaaccatcagggccacagcatggaaagctagaa
gcaagcttcccaagctgcagcatgtgtgctgccagccagccggcgcctca
gcggcctggcttggcagcctcttactcaaactctgttttccttgggggta
ggtggaggaggtggag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_15120211_15121030
seq2: B6Ng01-232H23.b_55_875

seq1  TGCCATGAGAGAGGCATAGGACTCATCACACTTTGAGGAAGAGACTCGTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCATGAGAGAGGCATAGGACTCATCACACTTTGAGGAAGAGACTCGTG  50

seq1  AGACAGCTAATGTTGTGTGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATATA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAGCTAATGTTGTGTGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATATA  100

seq1  TTAAACAAATCTTTTTTTAAAAAAGATTAGAATTTAAAAAACACATAATT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAACAAATCTTTTTTTAAAAAAGATTAGAATTTAAAAAACACATAATT  150

seq1  TCCTTGGCCAAAAGCACATAGACTCTGGTAAATCATTGCTATTGTAATCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTGGCCAAAAGCACATAGACTCTGGTAAATCATTGCTATTGTAATCA  200

seq1  CCACATTTTGTGAATGTATTATTATTATTAAATACTTTTTGACACTGTAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACATTTTGTGAATGTATTATTATTATTAAATACTTTTTGACACTGTAG  250

seq1  AAAGACATGACTATATTTGTCTATTTCTGATCACATATACCTCAAATATA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGACATGACTATATTTGTCTATTTCTGATCACATATACCTCAAATATA  300

seq1  GATGGACTTAGTTACTTTGGGTGTGGTGGTTCATAAATGCTTGGCCCAGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGACTTAGTTACTTTGGGTGTGGTGGTTCATAAATGCTTGGCCCAGG  350

seq1  GAGTGGCATGATTAGAAGGTATGGCCCAGTTGAAGTAGGTGTGTCACTGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGGCATGATTAGAAGGTATGGCCCAGTTGAAGTAGGTGTGTCACTGT  400

seq1  GGGTATGGGCTAAAAGACCCTTTTCCACTATCAGCCTTCAGATGAAGATG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTATGGGCTAAAAGACCCTTTTCCACTATCAGCCTTCAGATGAAGATG  450

seq1  TAGAACTCTTAGCTTCTCTTGTACCATGCCTACCTGGATGCTGCTATGCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAACTCTTAGCTTCTCTTGTACCATGCCTACCTGGATGCTGCTATGCT  500

seq1  CTCACCTTGATAATACTAGACTGAACCTCTGAATCTGTAAGCCAGAACCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACCTTGATAATACTAGACTGAACCTCTGAATCTGTAAGCCAGAACCA  550

seq1  TTAAAATGATGTCCTTTATAAGACTTGCC-TTGGTCATGGTGTCTGTTCA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAATGATGTCCTTTATAAGACTTGCCTTTGGTCATGGTGTCTGTTCA  600

seq1  CAGCAGTAAAACCCTAACTAAAACATTGGGCTAGTTGAAAAAAAATTGCT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAGTAAAACCCTAACTAAAACATTGGGCTAGTTGAAAAAAAATTGCT  650

seq1  ACAGACCATGTAGTTTCAACAAAATGTACTTTTCAATGTCCTGGAGACTG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGACCATGTAGTTTCAACAAAATGTACTTTTCAATGTCCTGGAGACTG  700

seq1  AGCAGATCAAGATGATGCTGATGCTGAGAGTCCTTCCTTCCTAGCTTGCA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGATCAAGATGATGCTGATGCTGAGAGTCCTTCCTTCCTAGCTTGCA  750

seq1  GATGGCTTACATCCCAGTTACTGATCTTCTTTGACATAGGCAGAGACAAG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGCTTACATCCCAGTTACTGATCTTCTTTGACATAGGCAGAGACAAG  800

seq1  CAGTAAGCTCTCTCCTGTCTG  820
      |||||||||||||||||||||
seq2  CAGTAAGCTCTCTCCTGTCTG  821

seq1: chr16_15195706_15195921
seq2: B6Ng01-232H23.g_71_286 (reverse)

seq1  CTCCACCTCCTCCACCTACCCCCAAGGAAAACAGAGTTTGAGTAAGAGGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCACCTCCTCCACCTACCCCCAAGGAAAACAGAGTTTGAGTAAGAGGC  50

seq1  TGCCAAGCCAGGCCGCTGAGGCGCCGGCTGGCTGGCAGCACACATGCTGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCAAGCCAGGCCGCTGAGGCGCCGGCTGGCTGGCAGCACACATGCTGC  100

seq1  AGCTTGGGAAGCTTGCTTCTAGCTTTCCATGCTGTGGCCCTGATGGTTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTGGGAAGCTTGCTTCTAGCTTTCCATGCTGTGGCCCTGATGGTTTT  150

seq1  GCTTCAGTTCAGTTGCTCTTTGTTTCTGGTCTTCAGTCAAGTCCCAAACC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCAGTTCAGTTGCTCTTTGTTTCTGGTCTTCAGTCAAGTCCCAAACC  200

seq1  ACCAGGCTTCTCTAGA  216
      ||||||||||||||||
seq2  ACCAGGCTTCTCTAGA  216