BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-237L14
Chromosome16 (Build37)
Map Location 9,303,263 - 9,453,152
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream gene4930511J11Rik, BC024814, Abat, LOC665207, Tmem186, Pmm2, Carhsp1, EG436336, Usp7, LOC665231, 1810013L24Rik, LOC100043106
Downstream geneGrin2a, LOC665291, LOC100042534, 4930517K11Rik, Atf7ip2, Emp2, Tekt5, Nubp1, BC068110
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-237L14.bB6Ng01-237L14.g
ACCGA048604GA048605
length1,125641
definitionB6Ng01-237L14.b B6Ng01-237L14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(9,452,029 - 9,453,152)(9,303,263 - 9,303,826)
sequence
gaattctagcactggtgaggagatctctcagaagcaggatagaagcttgc
tgaccagaatgggggcaagcagggaaaaggaaaagcttccttctttaatc
gccaagtatggagcttcgtcaccagaagatggagcccagattcagagtag
gtcttggacctcaaattatccaggtttagggtggagctttctacctgaaa
taacccagcccacaaaaatccctcactggagtgcccccagctgtctatgt
tttagttatttctggatgcagtcaagttgacagtcaagattagccaccac
actaagttccctaagcactaaaaatttacataaggataaaacagaaatgc
atgacagaaaaaaatggatttaaggagttatagtaaggcacacaaacaag
accattggaaacagtaatccctcatcaataacagatagttgagtcccatg
agctttgcaggaaatcttaaaaatttccaaggaccaatggcttgaatcaa
ggagcattaggaaggaacttcctagtaggaacagcacagggaggacaaga
gcagatacacagagatacaaagtgccaggcagtctgcaaggctatgtgac
atagcagcagaatccagggctctgagtgtgaaaatctccatacccctgcc
ctagtcagtcagtaggaccacatataacaagacatggcacaagacattac
aactctgcagcgggacataaatccagtctaacaggcctgggtgattctcc
gtatgagatgtaacaatgtgttacagggaactgtggtccaacaaggttga
agctgcataattcaacatgacagctggggatgtctgggaagaggcatctg
tcgccacacaaaatgtgctactttgcatggcagtcgtatgagaagacatg
aataagaatacaacaccaaccagaaacttgccagaaatcagatgtggaaa
gagatcacagacacagagaacaaaatactaggacttctatcacaggggct
cttttatgacccttagagttaaagccttcactaataaccatacgttgttt
actattaccatcatgtgttgcacaacgtcttgtccagcatcggagttact
ggacaagcaggactcaggcacgcag
gaattccagcgtggatcagggaagaaccctaaaagcccaagactctatcc
atagcagaagtgccattgtggggcaaatgaaaccatgtcaccagagaaga
actggaaggttgagtgaattcagaaaccccagtaaatttgcatatttgag
aatcgtagtcatttcatccactcccgactcagttcctgtacatgactatg
acaccccacatgaggattgtgactgctagtcacgtagcacagagcatgtg
cttctccatgctaatgaggtacttagatgggtcagctgctagtgtttagc
caacaagcttcctgtcaaggtcattcctctctgcaaaaggtttggtccac
ccagaggaagttgtatgcatcattttcaccatggataaacagtttagata
aagattgcctttctcatcaagaatgggtgtggagggaagccttcatcata
cagggccataccatctaagtctcctgtagaagggtgagggagtggggagt
cactttcttttggacacatggttgcttgtaggatgcccatggtccagtgg
gtgacccacatccatgcaaaatagacaacattgcttggactcaagtttct
gataatatatatatatatatatatatatatatatatataga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_9452029_9453152
seq2: B6Ng01-237L14.b_48_1172 (reverse)

seq1  CTGCGTGCCTGGGTCCTGCTGGTCCCAGTTACTCCCGATGCTGGGACAGA  50
      ||||||||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||||||   |||
seq2  CTGCGTGCCTGAGTCCTGCTTGT-CCAGTAACT-CCGATGCTGGACAAGA  48

seq1  CGTTGTGCAACACATTGATTGTTAATAGTAAAC-ACGTATGGTTATTAGT  99
      |||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  CGTTGTGCAACACA-TGA-TGGTAATAGTAAACAACGTATGGTTATTAGT  96

seq1  GGAGGCTTT-ACTCTTAGGGTCAT-AAAGAGCCCCTGTGATAG-AGTCCT  146
      | ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||
seq2  GAAGGCTTTAACTCTAAGGGTCATAAAAGAGCCCCTGTGATAGAAGTCCT  146

seq1  AGTATTTTGTTCTCTGTGTCTGTGATCTCTTTCCACATCTGATTTCTGGC  196
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATTTTGTTCTCTGTGTCTGTGATCTCTTTCCACATCTGATTTCTGGC  196

seq1  AAG-TTCTGGTTGGTGTTGTATTCTTATTCATGTCTTCTCATACGACTGC  245
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTTCTGGTTGGTGTTGTATTCTTATTCATGTCTTCTCATACGACTGC  246

seq1  CATGCAAAGTAGCACATTTTGTGTGGCGACAGATGCCTCTTCCCAGACAT  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCAAAGTAGCACATTTTGTGTGGCGACAGATGCCTCTTCCCAGACAT  296

seq1  CCCCAGCTGTCATGTTGAATTATGCAGCTTCAACCTTGTTGGACCACAGT  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAGCTGTCATGTTGAATTATGCAGCTTCAACCTTGTTGGACCACAGT  346

seq1  TCCCTGTAACACATTGTTACATCTCATACGGAGAATCACCCAGGCCTGTT  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTGTAACACATTGTTACATCTCATACGGAGAATCACCCAGGCCTGTT  396

seq1  AGACTGGATTTATGTCCCGCTGCAGAGTTGTAATGTCTTGTGCCATGTCT  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTGGATTTATGTCCCGCTGCAGAGTTGTAATGTCTTGTGCCATGTCT  446

seq1  TGTTATATGTGGTCCTACTGACTGACTAGGGCAGGGGTATGGAGATTTTC  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTATATGTGGTCCTACTGACTGACTAGGGCAGGGGTATGGAGATTTTC  496

seq1  ACACTCAGAGCCCTGGATTCTGCTGCTATGTCACATAGCCTTGCAGACTG  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTCAGAGCCCTGGATTCTGCTGCTATGTCACATAGCCTTGCAGACTG  546

seq1  CCTGGCACTTTGTATCTCTGTGTATCTGCTCTTGTCCTCCCTGTGCTGTT  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGCACTTTGTATCTCTGTGTATCTGCTCTTGTCCTCCCTGTGCTGTT  596

seq1  CCTACTAGGAAGTTCCTTCCTAATGCTCCTTGATTCAAGCCATTGGTCCT  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTACTAGGAAGTTCCTTCCTAATGCTCCTTGATTCAAGCCATTGGTCCT  646

seq1  TGGAAATTTTTAAGATTTCCTGCAAAGCTCATGGGACTCAACTATCTGTT  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAATTTTTAAGATTTCCTGCAAAGCTCATGGGACTCAACTATCTGTT  696

seq1  ATTGATGAGGGATTACTGTTTCCAATGGTCTTGTTTGTGTGCCTTACTAT  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGATGAGGGATTACTGTTTCCAATGGTCTTGTTTGTGTGCCTTACTAT  746

seq1  AACTCCTTAAATCCATTTTTTTCTGTCATGCATTTCTGTTTTATCCTTAT  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCCTTAAATCCATTTTTTTCTGTCATGCATTTCTGTTTTATCCTTAT  796

seq1  GTAAATTTTTAGTGCTTAGGGAACTTAGTGTGGTGGCTAATCTTGACTGT  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAATTTTTAGTGCTTAGGGAACTTAGTGTGGTGGCTAATCTTGACTGT  846

seq1  CAACTTGACTGCATCCAGAAATAACTAAAACATAGACAGCTGGGGGCACT  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTTGACTGCATCCAGAAATAACTAAAACATAGACAGCTGGGGGCACT  896

seq1  CCAGTGAGGGATTTTTGTGGGCTGGGTTATTTCAGGTAGAAAGCTCCACC  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTGAGGGATTTTTGTGGGCTGGGTTATTTCAGGTAGAAAGCTCCACC  946

seq1  CTAAACCTGGATAATTTGAGGTCCAAGACCTACTCTGAATCTGGGCTCCA  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAACCTGGATAATTTGAGGTCCAAGACCTACTCTGAATCTGGGCTCCA  996

seq1  TCTTCTGGTGACGAAGCTCCATACTTGGCGATTAAAGAAGGAAGCTTTTC  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCTGGTGACGAAGCTCCATACTTGGCGATTAAAGAAGGAAGCTTTTC  1046

seq1  CTTTTCCCTGCTTGCCCCCATTCTGGTCAGCAAGCTTCTATCCTGCTTCT  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTCCCTGCTTGCCCCCATTCTGGTCAGCAAGCTTCTATCCTGCTTCT  1096

seq1  GAGAGATCTCCTCACCAGTGCTAGAATTC  1124
      |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGATCTCCTCACCAGTGCTAGAATTC  1125

seq1: chr16_9303263_9303826
seq2: B6Ng01-237L14.g_64_627

seq1  GAATTCCAGCGTGGATCAGGGAAGAACCCTAAAAGCCCAAGACTCTATCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGCGTGGATCAGGGAAGAACCCTAAAAGCCCAAGACTCTATCC  50

seq1  ATAGCAGAAGTGCCATTGTGGGGCAAATGAAACCATGTCACCAGAGAAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGCAGAAGTGCCATTGTGGGGCAAATGAAACCATGTCACCAGAGAAGA  100

seq1  ACTGGAAGGTTGAGTGAATTCAGAAACCCCAGTAAATTTGCATATTTGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGAAGGTTGAGTGAATTCAGAAACCCCAGTAAATTTGCATATTTGAG  150

seq1  AATCGTAGTCATTTCATCCACTCCCGACTCAGTTCCTGTACATGACTATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCGTAGTCATTTCATCCACTCCCGACTCAGTTCCTGTACATGACTATG  200

seq1  ACACCCCACATGAGGATTGTGACTGCTAGTCACGTAGCACAGAGCATGTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCCCACATGAGGATTGTGACTGCTAGTCACGTAGCACAGAGCATGTG  250

seq1  CTTCTCCATGCTAATGAGGTACTTAGATGGGTCAGCTGCTAGTGTTTAGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTCCATGCTAATGAGGTACTTAGATGGGTCAGCTGCTAGTGTTTAGC  300

seq1  CAACAAGCTTCCTGTCAAGGTCATTCCTCTCTGCAAAAGGTTTGGTCCAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAAGCTTCCTGTCAAGGTCATTCCTCTCTGCAAAAGGTTTGGTCCAC  350

seq1  CCAGAGGAAGTTGTATGCATCATTTTCACCATGGATAAACAGTTTAGATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAGGAAGTTGTATGCATCATTTTCACCATGGATAAACAGTTTAGATA  400

seq1  AAGATTGCCTTTCTCATCAAGAATGGGTGTGGAGGGAAGCCTTCATCATA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATTGCCTTTCTCATCAAGAATGGGTGTGGAGGGAAGCCTTCATCATA  450

seq1  CAGGGCCATACCATCTAAGTCTCCTGTAGAAGGGTGAGGGAGTGGGGAGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGCCATACCATCTAAGTCTCCTGTAGAAGGGTGAGGGAGTGGGGAGT  500

seq1  CACTTTCTTTTGGACACATGGTTGCTTGTAGGATGCCCATGGTCCAGTGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTTCTTTTGGACACATGGTTGCTTGTAGGATGCCCATGGTCCAGTGG  550

seq1  GTGACCCACATCCA  564
      ||||||||||||||
seq2  GTGACCCACATCCA  564