seq1: chr16_6347719_6347833
seq2: B6Ng01-250K06.b_139_282 (reverse)
seq1 CACACACACACACACACACACACACAC-----------------GAGAGA 33
||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2 CACACACACACACACACACACACACACGCACATGCACACGCACAGAGAGG 50
seq1 GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGA-- 81
||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||
seq2 GAGAGAGAGAGGGAGAGAGAGAGACAGAGACAGAGAGAGAGACAGAGAGA 100
seq1 ----------GAGGGAGGGAGGGAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGA 115
||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAGGGAGAAGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGA 144
| seq1: chr7_19718473_19719449
seq2: B6Ng01-250K06.g_73_1055
seq1 GAATTCTTAAGACTGGGGTCCTGTCACTGGTGATGGTGTGTGGAGGCTGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAATTCTTAAGACTGGGGTCCTGTCACTGGTGATGGTGTGTGGAGGCTGA 50
seq1 GTTTTGAATGGCACCTGCAGGACCGTGAAGTGCTAGTTTACCAGAATTGT 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTTTTGAATGGCACCTGCAGGACCGTGAAGTGCTAGTTTACCAGAATTGT 100
seq1 CTGGACTTAGAGTGGGCAGTCTATCCCACAGCATCAGCTAACTTTTTCTG 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTGGACTTAGAGTGGGCAGTCTATCCCACAGCATCAGCTAACTTTTTCTG 150
seq1 TGACGGACTAGGTAATGAACTATTTCCAGCCAAACAGTTATTGATGCAGC 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGACGGACTAGGTAATGAACTATTTCCAGCCAAACAGTTATTGATGCAGC 200
seq1 CCTGTTCTTTTTGCATGAAAGCAGCCATAATTTGTTTCCATAAAACTTAA 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCTGTTCTTTTTGCATGAAAGCAGCCATAATTTGTTTCCATAAAACTTAA 250
seq1 TTTACAAAGACACACAGTGGACTGGACCTAATTCTCGGCATGTAGTTTTA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTTACAAAGACACACAGTGGACTGGACCTAATTCTCGGCATGTAGTTTTA 300
seq1 CTTTAGTTCTGTTTCATTGGCATGATCAGGGCTTAAAAGTATGAAGGGTT 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTTTAGTTCTGTTTCATTGGCATGATCAGGGCTTAAAAGTATGAAGGGTT 350
seq1 ATTCTCTTCATTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGGTGGTTTATTTTTAGACA 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATTCTCTTCATTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGGTGGTTTATTTTTAGACA 400
seq1 CGGTCTGACAATGTAGCCCAGGTTGATCTGGACCGCTGCATCTTTTTGCC 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CGGTCTGACAATGTAGCCCAGGTTGATCTGGACCGCTGCATCTTTTTGCC 450
seq1 TCAGCCTCTCCAGTTCTGAGATTACAGGCATAAATTACCATGCCCTGCTG 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCAGCCTCTCCAGTTCTGAGATTACAGGCATAAATTACCATGCCCTGCTG 500
seq1 GAGGGTTATTTGCATGTTGAGATGTCTGGAAGGGATGGGCCAAAGATGGA 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAGGGTTATTTGCATGTTGAGATGTCTGGAAGGGATGGGCCAAAGATGGA 550
seq1 GACAAGGGGTCTGCTACTCACTGGTAAGTAGAAAGTGGAACAGAAAATGT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GACAAGGGGTCTGCTACTCACTGGTAAGTAGAAAGTGGAACAGAAAATGT 600
seq1 TGCCATCGGACTCGTTAACAAAACTGCTTCCAGATTAGTTGATGCATGCA 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGCCATCGGACTCGTTAACAAAACTGCTTCCAGATTAGTTGATGCATGCA 650
seq1 AAGTCATGGAAAAACAGAAAAGAATCATTATTAAGGATACCCTCAATAGA 700
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TAGTCATGGAAAAACAGAAAAGAATCATTATTAAGGATACCCTCAATAGA 700
seq1 TGCTGTGACTGGGGCCTG-TGGTCCCACATACCT-GGGAGGCTGAGGCAA 748
|||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2 TGCTGTGACTGGGGCCTGTTGGTCCCACATACCTGGGGAGGCTGAGGCAA 750
seq1 GGTGACTGCTAGGAACCTGGTGAGAGCCTGTCTTACCTAGTGAGTTTCAA 798
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGTGACTGCTAGGAACCTGGTGAGAGCCTGTCTTACCTAGTGAGTTTCAA 800
seq1 -GGCAGCTGGGGGCTAAAGAGTGAGATCATGTCT-CCAAAAATAAACAAT 846
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2 GGGCAGCTGGGGGCTAAAGAGTGAGATCATGTCTCCCAAAAATAAACAAT 850
seq1 C-TCAAAAAAACCATGAGTATAGTGTTTTACCTTTGTAACCCCAGAATGA 895
| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2 CTTCAAAAAAACCATGAGTATAGTGTTTTA-CTTTGTAACCCCAGAATGA 899
seq1 G-GAATCCCAGAGGATTGGGTTGCTGTGAGTTCAAGACTAGCCT-GAGCT 943
| || |||||| |||||||| |||||| |||||| || ||| || ||
seq2 GTGATCCCCAGAAGATTGGGTGCCTGTGAAGTCAAGAATAACCTGGACCT 949
seq1 ACCA-TGAGGCCCTGTCCTCAAAAGGACAGAAAGA 977
| || | | ||||||||||||||||||| ||||||
seq2 AACATTAAAGCCCTGTCCTCAAAAGGAC-GAAAGA 983
|
