BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-262M03
Chromosome16 (Build37)
Map Location 7,207,642 - 7,291,841
singlet/doubletdoublet
Overlap geneA2bp1
Upstream genenone
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-262M03.bB6Ng01-262M03.g
ACCGA067090GA067091
length1,1861,179
definitionB6Ng01-262M03.b B6Ng01-262M03.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(7,207,642 - 7,208,817)(7,290,649 - 7,291,841)
sequence
gaattcttagaccagctaactagaatgtcaacataggttgcacacaataa
tttagccagactcttgatctgttaccatctgaacaaaattgtgtacttct
gggctgcttccatcttctctgccaataatacaaatgttttctaagtttct
agaaatgcctggtttctttggatttgccttgacatcacacagagcctttt
ctcccttaagtaagcaaagctctgtgagcttctcagcgtctgccgcctac
tcagctcagtgttcaaacaggcagatgtcctcaaaagaccacacacccca
gtctataaagaatagtactggtgccctggttaaccctgtgtgaatcatca
gtagtacaatcccaagtaatacatcagtttgagtatggtattaaagacct
tactggaagtaggggcaggctcaattacagaacttagaaaactggagctt
aatttcttggctcctctgaccagattttcaaagcagtgaactgtgctggt
gctgtactgcttgcacaaggctctcggtccacacttatagagggggattt
catcactggcatgtgtatagcatgtgtatgctcagttgtgtagtattgga
tgtggaaagcccatgaagttatagtgttcttgtattctgatgcctaacaa
cttgtgtttcattgttagcttgccatcaagtctatgttcagctttctgta
ctccccaaggaaagtttccagaagaatgagtggggtccacagatcatcag
ccatgcatacctattgctacccctatatttgtcaggttctatagatggaa
aacagggtgtattgaaaatagaatcaaatctcaaacaaattgtattaagt
gcctggcctttgagacttactgaatgagctccccttggatgctcaggtta
aattggcatgaaagatgcttactacccccctcccacctcccaggcttgca
tgtgaggttcaggtaggtattgaggagttgctcccagaaaccttccattc
taccttgggctgaaaatactaggagggtaccaatggagaaataaaaccac
caactggagaaaataataccctcactacataatattgaagcgaggacatt
ttccttcttcattccatgttcaaggcattggaacttgctttggcatggag
ctacagcaatatgaaggggtggtccagatctcctcc
gaattccacagtgaatgctcaagtcctgtcacattgcctacggaagtcat
gctgcgtggatttaagaacagttcttcttcatgcaattttagggttattc
aagtctgtcaactgtacagcctttgcttctcaaaaaataaaaggaacaag
cctaaaaaaaaggaaagaccttttttttatatataataaatcttgatctt
gtggttctaataaacaaaaacataaatcacatgaaatgaatacaaataaa
tttttttggttaacaatgtagataagcaagttccgttctatgtctgtgct
ttgcccttccctccccttcccccaaataaaagtacaagacattggaattt
gaccttttacattagtttattaaccagaaaacaatgttattgggtctagg
ctggtagttatctgctatatcaacaggtagaaaacatattttccagatat
ggtgaatctgtgcagcacattgaaaccttctttgacaaatagcaagtaca
ccctttgcttcacaagtatagtttttgcttttaatatttcagtgtctacc
acaaaccctactaacctatcttgtcaaaatccacatttttcttcactgac
atggttcttatgatgagtatggaaatctggtttactactacttctaaaat
ccttaagcttatttgtacattttggttagaaatacatacaccaacctttg
gaatgatgtggatacactggagtaagtgggagcaatttttcactgcatgg
gcatcatcaattcatcaatttgcacagaagaagcctcatgcacagtgaag
acatttgcttcatcctcatggatgacattcacccttacaaatgaaatgtg
cagtaatcatacatgtagagtggtagtagccatcctatagtcagcaccaa
tgatgacttcataactgagggatattgggagaaggatttctggatgcact
agctaggagacactgcaaaacacacttgtctgtggaaagtttgagctgtg
catgtgttcacgtgctgggagatgaggatctgtccataggagacccgtaa
agtcagaattgtagtaacttgactatgactcacatgcttttccgagataa
gatcataggtagatgcctggatgatcatagatacagtgacatgttcataa
aatttgttacagtgttgcctaccttaatc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_7207642_7208817
seq2: B6Ng01-262M03.b_47_1232

seq1  GAATTCTTAGACCAGCTAACTAGAATGTCAACATAGGTTGCACACAATAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTAGACCAGCTAACTAGAATGTCAACATAGGTTGCACACAATAA  50

seq1  TTTAGCCAGACTCTTGATCTGTTACCATCTGAACAAAATTGTGTACTTCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGCCAGACTCTTGATCTGTTACCATCTGAACAAAATTGTGTACTTCT  100

seq1  GGGCTGCTTCCATCTTCTCTGCCAATAATACAAATGTTTTCTAAGTTTCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTGCTTCCATCTTCTCTGCCAATAATACAAATGTTTTCTAAGTTTCT  150

seq1  AGAAATGCCTGGTTTCTTTGGATTTGCCTTGACATCACACAGAGCCTTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAATGCCTGGTTTCTTTGGATTTGCCTTGACATCACACAGAGCCTTTT  200

seq1  CTCCCTTAAGTAAGCAAAGCTCTGTGAGCTTCTCAGCGTCTGCCGCCTAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCTTAAGTAAGCAAAGCTCTGTGAGCTTCTCAGCGTCTGCCGCCTAC  250

seq1  TCAGCTCAGTGTTCAAACAGGCAGATGTCCTCAAAAGACCACACACCCCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCTCAGTGTTCAAACAGGCAGATGTCCTCAAAAGACCACACACCCCA  300

seq1  GTCTATAAAGAATAGTACTGGTGCCCTGGTTAACCCTGTGTGAATCATCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTATAAAGAATAGTACTGGTGCCCTGGTTAACCCTGTGTGAATCATCA  350

seq1  GTAGTACAATCCCAAGTAATACATCAGTTTGAGTATGGTATTAAAGACCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGTACAATCCCAAGTAATACATCAGTTTGAGTATGGTATTAAAGACCT  400

seq1  TACTGGAAGTAGGGGCAGGCTCAATTACAGAACTTAGAAAACTGGAGCTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGGAAGTAGGGGCAGGCTCAATTACAGAACTTAGAAAACTGGAGCTT  450

seq1  AATTTCTTGGCTCCTCTGACCAGATTTTCAAAGCAGTGAACTGTGCTGGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTCTTGGCTCCTCTGACCAGATTTTCAAAGCAGTGAACTGTGCTGGT  500

seq1  GCTGTACTGCTTGCACAAGGCTCTCGGTCCACACTTATAGAGGGGGATTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTACTGCTTGCACAAGGCTCTCGGTCCACACTTATAGAGGGGGATTT  550

seq1  CATCACTGGCATGTGTATAGCATGTGTATGCTCAGTTGTGTAGTATTGGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCACTGGCATGTGTATAGCATGTGTATGCTCAGTTGTGTAGTATTGGA  600

seq1  TGTGGAAAGCCCATGAAGTTATAGTGTTCTTGTATTCTGATGCCTAACAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGAAAGCCCATGAAGTTATAGTGTTCTTGTATTCTGATGCCTAACAA  650

seq1  CTTGTGTTTCATTGTTAGCTTGCCATCAAGTCTATGTTCAGCTTTCTGTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTGTTTCATTGTTAGCTTGCCATCAAGTCTATGTTCAGCTTTCTGTA  700

seq1  CTCCCCAAGGAAAGTTTCCAGAAGAATGAGTGGGGTCCACAGATCATCAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCCAAGGAAAGTTTCCAGAAGAATGAGTGGGGTCCACAGATCATCAG  750

seq1  CCATGCATACCTATTGCTACCCCTATATTTGTCAGGTTCTATAGATGGAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGCATACCTATTGCTACCCCTATATTTGTCAGGTTCTATAGATGGAA  800

seq1  AACAGGGTGTATTGAAAATAGAATCAAATCTCAAACAAATTGTATTAAGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGGGTGTATTGAAAATAGAATCAAATCTCAAACAAATTGTATTAAGT  850

seq1  GCCTGGCCTTTGAGACTTACTGAATGAGCTCCCCTTGGATGCTCAGGTTA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGGCCTTTGAGACTTACTGAATGAGCTCCCCTTGGATGCTCAGGTTA  900

seq1  AATTGGCATGAAAGATGCTTACTACCCCCCTCCCACCTCCCAGGCTTGCA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGGCATGAAAGATGCTTACTACCCCCCTCCCACCTCCCAGGCTTGCA  950

seq1  TGTGAGGTTCAGGAAGGTATTGAGGAGTTGCTCCCAGAAACCTTCCATTC  1000
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGGTTCAGGTAGGTATTGAGGAGTTGCTCCCAGAAACCTTCCATTC  1000

seq1  TACCCTTGGCTG-AGATACTAGGAGGGTACCAATGGAGAAATAAAA-CAC  1048
      |||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TACCTTGGGCTGAAAATACTAGGAGGGTACCAATGGAGAAATAAAACCAC  1050

seq1  C-ACTGGAG-AAATAATACCCTCACTACAT-ATA-TGAAGCGAAGGACAT  1094
      | ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||
seq2  CAACTGGAGAAAATAATACCCTCACTACATAATATTGAAGCG-AGGACAT  1099

seq1  TT--CCTCTTCATTTCCATG-TCAA-GCATTTG-ACTTGCTTT-GCATGA  1138
      ||  | |||||| ||||||| |||| ||||| | ||||||||| ||||| 
seq2  TTTCCTTCTTCA-TTCCATGTTCAAGGCATTGGAACTTGCTTTGGCATGG  1148

seq1  GGCTACAGCATCATGA--GGGTGGTTCCAGGATCTCCTCC  1176
       |||||||||  ||||  |||||| |||| ||||||||||
seq2  AGCTACAGCAATATGAAGGGGTGG-TCCA-GATCTCCTCC  1186

seq1: chr16_7290649_7291841
seq2: B6Ng01-262M03.g_65_1243 (reverse)

seq1  GATT-AGGTAGGCAACA-TGTACAAAATTTTTATGGAACATGTCACTGTA  48
      |||| |||||||||||| |||| | || |||||| |||||||||||||||
seq2  GATTAAGGTAGGCAACACTGTA-ACAAATTTTAT-GAACATGTCACTGTA  48

seq1  TATTAATTGGATCACTCAGGCATCTTACTTATGAATCCTTACTTCGGGAA  98
      | |  ||  |||||  |||||||| ||| |||||   ||||  || ||||
seq2  TCT--AT--GATCATCCAGGCATC-TACCTATGA--TCTTATCTC-GGAA  90

seq1  AAGCAATGTGAAGTCATTAAGTCAAAGTTACTACA--TCTGACCTTTTAC  146
      |||| ||||| ||||||  |||| |||||||||||  ||||||  |||| 
seq2  AAGC-ATGTG-AGTCAT--AGTC-AAGTTACTACAATTCTGAC--TTTA-  132

seq1  CGTGTCTTCTATGGACAGATCCTCATCTCCCAGCACGTGAACACATGCAC  196
      || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGGTCTCCTATGGACAGATCCTCATCTCCCAGCACGTGAACACATGCAC  182

seq1  AGCTCAAACTTTCCACAGACAAGTGTGGTTTTGCAGTGTCTCCTAGCTAG  246
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCAAACTTTCCACAGACAAGTGT-GTTTTGCAGTGTCTCCTAGCTAG  231

seq1  TGCATCCAGAAATCCTTCT-CCAATATCCCTCAGTTATGAAGTCATCATT  295
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATCCAGAAATCCTTCTCCCAATATCCCTCAGTTATGAAGTCATCATT  281

seq1  GGTGCTGACTATAGGATGGCTACTACCACTCTACATGTATGATTACTGCA  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGCTGACTATAGGATGGCTACTACCACTCTACATGTATGATTACTGCA  331

seq1  CATTTCATTTGTAAGGGTGAATGTCATCCATGAGGATGAAGCAAATGTCT  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTCATTTGTAAGGGTGAATGTCATCCATGAGGATGAAGCAAATGTCT  381

seq1  TCACTGTGCATGAGGCTTCTTCTGTGCAAATTGATGAATTGATGATGCCC  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTGTGCATGAGGCTTCTTCTGTGCAAATTGATGAATTGATGATGCCC  431

seq1  ATGCAGTGAAAAATTGCTCCCACTTACTCCAGTGTATCCACATCATTCCA  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAGTGAAAAATTGCTCCCACTTACTCCAGTGTATCCACATCATTCCA  481

seq1  AAGGTTGGTGTATGTATTTCTAACCAAAATGTACAAATAAGCTTAAGGAT  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTTGGTGTATGTATTTCTAACCAAAATGTACAAATAAGCTTAAGGAT  531

seq1  TTTAGAAGTAGTAGTAAACCAGATTTCCATACTCATCATAAGAACCATGT  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGAAGTAGTAGTAAACCAGATTTCCATACTCATCATAAGAACCATGT  581

seq1  CAGTGAAGAAAAATGTGGATTTTGACAAGATAGGTTAGTAGGGTTTGTGG  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGAAGAAAAATGTGGATTTTGACAAGATAGGTTAGTAGGGTTTGTGG  631

seq1  TAGACACTGAAATATTAAAAGCAAAAACTATACTTGTGAAGCAAAGGGTG  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGACACTGAAATATTAAAAGCAAAAACTATACTTGTGAAGCAAAGGGTG  681

seq1  TACTTGCTATTTGTCAAAGAAGGTTTCAATGTGCTGCACAGATTCACCAT  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTGCTATTTGTCAAAGAAGGTTTCAATGTGCTGCACAGATTCACCAT  731

seq1  ATCTGGAAAATATGTTTTCTACCTGTTGATATAGCAGATAACTACCAGCC  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGGAAAATATGTTTTCTACCTGTTGATATAGCAGATAACTACCAGCC  781

seq1  TAGACCCAATAACATTGTTTTCTGGTTAATAAACTAATGTAAAAGGTCAA  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGACCCAATAACATTGTTTTCTGGTTAATAAACTAATGTAAAAGGTCAA  831

seq1  ATTCCAATGTCTTGTACTTTTATTTGGGGGAAGGGGAGGGAAGGGCAAAG  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCAATGTCTTGTACTTTTATTTGGGGGAAGGGGAGGGAAGGGCAAAG  881

seq1  CACAGACATAGAACGGAACTTGCTTATCTACATTGTTAACCAAAAAAATT  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGACATAGAACGGAACTTGCTTATCTACATTGTTAACCAAAAAAATT  931

seq1  TATTTGTATTCATTTCATGTGATTTATGTTTTTGTTTATTAGAACCACAA  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTGTATTCATTTCATGTGATTTATGTTTTTGTTTATTAGAACCACAA  981

seq1  GATCAAGATTTATTATATATAAAAAAAAGGTCTTTCCTTTTTTTTAGGCT  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCAAGATTTATTATATATAAAAAAAAGGTCTTTCCTTTTTTTTAGGCT  1031

seq1  TGTTCCTTTTATTTTTTGAGAAGCAAAGGCTGTACAGTTGACAGACTTGA  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCCTTTTATTTTTTGAGAAGCAAAGGCTGTACAGTTGACAGACTTGA  1081

seq1  ATAACCCTAAAATTGCATGAAGAAGAACTGTTCTTAAATCCACGCAGCAT  1145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACCCTAAAATTGCATGAAGAAGAACTGTTCTTAAATCCACGCAGCAT  1131

seq1  GACTTCCGTAGGCAATGTGACAGGACTTGAGCATTCACTGTGGAATTC  1193
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTCCGTAGGCAATGTGACAGGACTTGAGCATTCACTGTGGAATTC  1179