BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-319G06
Chromosome16 (Build37)
Map Location 32,888,682 - 33,016,708
singlet/doubletdoublet
Overlap geneFyttd1, Lrch3, EG625660, Iqcg
Upstream geneMfi2, LOC677155, Pigz, 0610012G03Rik, Ncbp2, Senp5, Pak2, Pigx, 1500031L02Rik, Lrrc33, Bex6, Fbxo45, Wdr53, 2310010M20Rik, Rnf168, LOC666966, Ubxd7, Tm4sf19, 0610012D17Rik, Pcyt1a, Osta, Zdhhc19, LOC385820, Tfrc, Tnk2, ENSMUSG00000075265, LOC672302, Muc4, Muc20, 1700021K19Rik
Downstream geneRpl35a, Lmln, LOC638791, Osbpl11, Snx4, Zfp148, Slc12a8, 4632417D23Rik, Heg1, Muc13, Itgb5, Umps, Kalrn, LOC100043670
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-319G06.bB6Ng01-319G06.g
ACCGA109033GA109034
length1,0781,075
definitionB6Ng01-319G06.b B6Ng01-319G06.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(32,888,682 - 32,889,768)(33,015,631 - 33,016,708)
sequence
gaattcaatctctagtaccaaggggaaaacaaaagtctccagaaaaataa
tgcaaaaggttatataactgagttccatgtaatagtttattaaaaaggaa
gataaacactgcatgttttctctcatatgcagaatcttatgtatgttcat
gtaggtacaacatgtatgttcatgtgcatataacatgaaagcagtggagg
actatttaagtgaaggaagaagacttttggggtgtagctcagcatctgtc
tagcatctgtaagacactgaattgaatccccagcaccagaaaaagaaagt
agtaattagggactgtgagtgtcgcttcctgatagagctctggcctggca
tgcaggccactccaggtttaaccctcagcacaaccagaggaggagaagtt
attaagaccataatacctttctatgatgctatgagtgacagcttaacaat
tattaggagaaatgaattttttatgtgagtggtaaaaaagtatatagtat
atctagtgataagtatgataaagaaatgggtaaaacaaaatgtcacttag
ctaccatttagctagtgacacaaaaatatttgtatgatgaaataatatac
cagattcctggatagtaaagtgatgtgacaatgcttaaagttaattataa
ataaatgtaattccccatttgcttgtttgtttatttgtttatagttattt
ttcttgagacagggtctttcaacataactctggctgtactggaactcatt
atgtagaccaggccagcctagaacttacagagatccacttgcctctgttt
tcttgtgctgggattaatggtgtgtgatacctgccagtttcccttttaaa
gccctgaaagacataacttagtcacagaaatcttgtttgtaggatagttg
atcacattgtgaaccctgagactgtgcactggaaaacctgtttcttgttg
tggtgtggttctgctctagcacacaccttttaacccagagcttttcttgt
agcagagctaaataaagcacttgtagacagagcagatgaagcagccagtg
acagggaatgaacatagtaatccaggaa
gaattctcacctagcatcatgtgcacgcacatgtagttaataaacattgg
ctctgcctgtcttgcagggcgaccattagtctagggttggtggtgttggg
ggacagcacataaaacacctcttacataagcagttccagtgacttttctg
gggacagatagggatggaagcatctgatacaagatggaaatggcatgtag
atacacagtcctccaggggtaaagaatggggcacgggttctccagaggct
agtttagagatacacttgtcaaaggagacacaactatgtccatcatctgg
attttaagacgtaaagaaaccaaccaaaccaaccaaccaaccaaccaacc
aaccaaccaaccagtgtatatgtgggcccaggcttggaaacgtgtgcatg
ccacagtgtgcagggggtggagtcagaggacaggttccaagaattgtttc
cttctaatgtatctctttgtactatttgggtctcagatatcaaactcaag
tcattggacttggcagcaagccccttttcctgctgagccatttcattggc
cctcaactgtggtttttttttttcccctgagagaaatgttaccttaatgt
gtctcacatatttcatgaatataaaatttaaactttttgatgcagggtct
catgtggcccaggttggtttcaaattcactacgtagtctagtggccttga
acctcatgttgtgcctcctaagtgctagaactacaggggcgagtgaccat
acctggtttatgcagcgttgggaatggaacttggactccatgcatgctag
taggcacacttctgactgtactccagccccagcctgagtggagcctttct
catccactgcctacgcaggccagcctgctatctgtacctctttaagaaag
agacttgtgagcctcaaagggtcagtgagccagataatgggcctttccat
gactggtctctggcagaaaaccatgctttaggctggaacaatttaaagtg
ttattacatgctactggagatattggctttttatgtccacatatagatga
cttacaggcaattaaaataccatac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_32888682_32889768
seq2: B6Ng01-319G06.b_45_1122

seq1  GAATTCAATCTCTAGTACCAAGGGGAAAACAAAAGTCTCCAGAAAAATAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATCTCTAGTACCAAGGGGAAAACAAAAGTCTCCAGAAAAATAA  50

seq1  TGCAAAAGGTTATATAACTGAGTTCCATGTAATAGTTTATTAAAAAGGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAAAAGGTTATATAACTGAGTTCCATGTAATAGTTTATTAAAAAGGAA  100

seq1  GATAAACACTGCATGTTTTCTCTCATATGCAGAATCTTATGTATGTTCAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAACACTGCATGTTTTCTCTCATATGCAGAATCTTATGTATGTTCAT  150

seq1  GTAGGTACAACATGTATGTTCATGTGCATATAACATGAAAGCAGTGGAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGGTACAACATGTATGTTCATGTGCATATAACATGAAAGCAGTGGAGG  200

seq1  ACTATTTAAGTGAAGGAAGAAGACTTTTGGGGTGTAGCTCAGCATCTGTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATTTAAGTGAAGGAAGAAGACTTTTGGGGTGTAGCTCAGCATCTGTC  250

seq1  TAGCATCTGTAAGACACTGAATTGAATCCCCAGCACCAGAAAAAGAAAGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCATCTGTAAGACACTGAATTGAATCCCCAGCACCAGAAAAAGAAAGT  300

seq1  AGTAATTAGGGACTGTGAGTGTCGCTTCCTGATAGAGCTCTGGCCTGGCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAATTAGGGACTGTGAGTGTCGCTTCCTGATAGAGCTCTGGCCTGGCA  350

seq1  TGCAGGCCACTCCAGGTTTAACCCTCAGCACAACCAGAGGAGGAGAAGTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGGCCACTCCAGGTTTAACCCTCAGCACAACCAGAGGAGGAGAAGTT  400

seq1  ATTAAGACCATAATACCTTTCTATGATGCTATGAGTGACAGCTTAACAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAGACCATAATACCTTTCTATGATGCTATGAGTGACAGCTTAACAAT  450

seq1  TATTAGGAGAAATGAATTTTTTATGTGAGTGGTAAAAAAGTATATAGTAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTAGGAGAAATGAATTTTTTATGTGAGTGGTAAAAAAGTATATAGTAT  500

seq1  ATCTAGTGATAAGTATGATAAAGAAATGGGTAAAACAAAATGTCACTTAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTAGTGATAAGTATGATAAAGAAATGGGTAAAACAAAATGTCACTTAG  550

seq1  CTACCATTTAGCTAGTGACACAAAAATATTTGTATGATGAAATAATATAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACCATTTAGCTAGTGACACAAAAATATTTGTATGATGAAATAATATAC  600

seq1  CAGATTCCTGGATAGTAAAGTGATGTGACAATGCTTAAAGTTAATTATAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATTCCTGGATAGTAAAGTGATGTGACAATGCTTAAAGTTAATTATAA  650

seq1  ATAAATGTAATTCCCCATTTGCTTGTTTGTTTATTTGTTTATAGTTATTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATGTAATTCCCCATTTGCTTGTTTGTTTATTTGTTTATAGTTATTT  700

seq1  TTCTTGAGACAGGGTCTTTCAACATAACTCTGGCTGTACTGGAACTCATT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTGAGACAGGGTCTTTCAACATAACTCTGGCTGTACTGGAACTCATT  750

seq1  ATGTAGACCAGGCCAGCCTAGAACTTACAGAGATCCACTTGCCTCTGTTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAGACCAGGCCAGCCTAGAACTTACAGAGATCCACTTGCCTCTGTTT  800

seq1  TCTTGTGCTGGGATTAATGGTGTGTGATACCTGCCAGTTTCCCTTTTAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGTGCTGGGATTAATGGTGTGTGATACCTGCCAGTTTCCCTTTTAAA  850

seq1  GCCCTGAAAGACATAACTTAGTCACAGAAATCTTGTTTGTAGGATAGTTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTGAAAGACATAACTTAGTCACAGAAATCTTGTTTGTAGGATAGTTG  900

seq1  ATCACATTGTGAACCCTGAGACTGTGCACTGGAAAAACCTGTTTCTTGTT  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  ATCACATTGTGAACCCTGAGACTGTGCACTGG-AAAACCTGTTTCTTGTT  949

seq1  GTGGTGTGGTTCTGCTCTAGCACACACCTTTAACCCAAGAGCTTTTCTGT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||  
seq2  GTGGTGTGGTTCTGCTCTAGCACACACCTTTTAACCCAGAGCTTTTCTTG  999

seq1  AAGCAAGAGCTAAATAAAAGCAACTGTAGGACAAGAGGCAGATGAAGCAG  1050
       ||| |||||||||| ||||||  |||| ||| ||| |||||||||||||
seq2  TAGC-AGAGCTAAAT-AAAGCACTTGTA-GAC-AGA-GCAGATGAAGCAG  1044

seq1  CCAGTTGACAGGGAGTGAACATAAGGAAACCCAGGAA  1087
      |||| ||||||||| ||||||||  | || |||||||
seq2  CCAG-TGACAGGGAATGAACATA--GTAATCCAGGAA  1078

seq1: chr16_33015631_33016708
seq2: B6Ng01-319G06.g_71_1145 (reverse)

seq1  GTATGTTATTTTAAATTGCCTGTATGTCATCTTATATGTGGACATTAAAA  50
      ||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||
seq2  GTATGGTATTTT-AATTGCCTGTAAGTCATC-TATATGTGGACATAAAAA  48

seq1  GCCAATATACTCCAGTAGCATGTAATAAACACTTTAAATTGTTCCAGCCT  100
      |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAATAT-CTCCAGTAGCATGTAAT-AACACTTTAAATTGTTCCAGCCT  96

seq1  AAAGCATGGTTTTCTTGCCAGAGACCAGTCATGGAAAGGCCATTTATCTG  150
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||
seq2  AAAGCATGGTTTTC-TGCCAGAGACCAGTCATGGAAAGGCCCATTATCTG  145

seq1  GCTCACTGAACCTTTGAGGCTCAC-AGTCTCTTTCTTAAAGAGGTACAGA  199
      ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCACTGACCCTTTGAGGCTCACAAGTCTCTTTCTTAAAGAGGTACAGA  195

seq1  TAGCAGGCTGGCCTGCGTAGGCAGTGGATGAG-AAGGCTCCACTCAGGCT  248
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TAGCAGGCTGGCCTGCGTAGGCAGTGGATGAGAAAGGCTCCACTCAGGCT  245

seq1  GGGGCTGGAGTACAGTCAGAAGTGTGCCTACTAGCATGCATGGAGTCCAA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGCTGGAGTACAGTCAGAAGTGTGCCTACTAGCATGCATGGAGTCCAA  295

seq1  GTTCCATTCCCAACGCTGCATAAACCAGGTATGGTCACTCGCCCCTGTAG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCCATTCCCAACGCTGCATAAACCAGGTATGGTCACTCGCCCCTGTAG  345

seq1  TTCTAGCACTTAGGAGGCACAACATGAGGTTCAAGGCCACTAGACTACGT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAGCACTTAGGAGGCACAACATGAGGTTCAAGGCCACTAGACTACGT  395

seq1  AGTGAATTTGAAACCAACCTGGGCCACATGAGACCCTGCATCAAAAAGTT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAATTTGAAACCAACCTGGGCCACATGAGACCCTGCATCAAAAAGTT  445

seq1  TAAATTTTATATTCATGAAATATGTGAGACACATTAAGGTAACATTTCTC  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATTTTATATTCATGAAATATGTGAGACACATTAAGGTAACATTTCTC  495

seq1  TCAGGGGAAAAAAAAAAACCACAGTTGAGGGCCAATGAAATGGCTCAGCA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGGGAAAAAAAAAAACCACAGTTGAGGGCCAATGAAATGGCTCAGCA  545

seq1  GGAAAAGGGGCTTGCTGCCAAGTCCAATGACTTGAGTTTGATATCTGAGA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAAGGGGCTTGCTGCCAAGTCCAATGACTTGAGTTTGATATCTGAGA  595

seq1  CCCAAATAGTACAAAGAGATACATTAGAAGGAAACAATTCTTGGAACCTG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAAATAGTACAAAGAGATACATTAGAAGGAAACAATTCTTGGAACCTG  645

seq1  TCCTCTGACTCCACCCCCTGCACACTGTGGCATGCACACGTTTCCAAGCC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCTGACTCCACCCCCTGCACACTGTGGCATGCACACGTTTCCAAGCC  695

seq1  TGGGCCCACATATACACTGGTTGGTTGGTTGGTTGGTTGGTTGGTTGGTT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCCCACATATACACTGGTTGGTTGGTTGGTTGGTTGGTTGGTTGGTT  745

seq1  GGTTTGGTTGGTTTCTTTACGTCTTAAAATCCAGATGATGGACATAGTTG  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTGGTTGGTTTCTTTACGTCTTAAAATCCAGATGATGGACATAGTTG  795

seq1  TGTCTCCTTTGACAAGTGTATCTCTAAACTAGCCTCTGGAGAACCCGTGC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTCCTTTGACAAGTGTATCTCTAAACTAGCCTCTGGAGAACCCGTGC  845

seq1  CCCATTCTTTACCCCTGGAGGACTGTGTATCTACATGCCATTTCCATCTT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATTCTTTACCCCTGGAGGACTGTGTATCTACATGCCATTTCCATCTT  895

seq1  GTATCAGATGCTTCCATCCCTATCTGTCCCCAGAAAAGTCACTGGAACTG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATCAGATGCTTCCATCCCTATCTGTCCCCAGAAAAGTCACTGGAACTG  945

seq1  CTTATGTAAGAGGTGTTTTATGTGCTGTCCCCCAACACCACCAACCCTAG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATGTAAGAGGTGTTTTATGTGCTGTCCCCCAACACCACCAACCCTAG  995

seq1  ACTAATGGTCGCCCTGCAAGACAGGCAGAGCCAATGTTTATTAACTACAT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAATGGTCGCCCTGCAAGACAGGCAGAGCCAATGTTTATTAACTACAT  1045

seq1  GTGCGTGCACATGATGCTAGGTGAGAATTC  1078
      ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCGTGCACATGATGCTAGGTGAGAATTC  1075