seq1: chr16_5188074_5188330
seq2: B6Ng01-319J19.b_52_308
seq1 CAGGCCAGCTTGGGCTGCAATTCGAGACCCTGTTATACACACACACACAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAGGCCAGCTTGGGCTGCAATTCGAGACCCTGTTATACACACACACACAC 50
seq1 ACACACACACACCACAAACAATACCACAAACAACATCACAAACAAAACCC 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACACACACACACCACAAACAATACCACAAACAACATCACAAACAAAACCC 100
seq1 AAACTTGAGAATTTCCCAGCTGTTTTTTCTGAGGGCCGAGCCACAGCTGA 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AAACTTGAGAATTTCCCAGCTGTTTTTTCTGAGGGCCGAGCCACAGCTGA 150
seq1 TCTTTCTGCCTCAGAAAGAGCCCAAGGCTCCACGTTGTCCCCTCAGGCAG 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCTTTCTGCCTCAGAAAGAGCCCAAGGCTCCACGTTGTCCCCTCAGGCAG 200
seq1 GGCTAAGCGGGGTGCTGGTTACTGTGTGGAGTTTATGGTGTGCAGAGTGT 250
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||
seq2 GGCTAAGCGGGGAGCTGGTTACTGTGTGGAGTTTATGGTGTGTAAAGTGT 250
seq1 GGGGGTG 257
|||||||
seq2 GGGGGTG 257
| seq1: chr16_5335265_5336465
seq2: B6Ng01-319J19.g_67_1264 (reverse)
seq1 TATATG-CCTTCCCGCGTGGTGTATTGTACCCTTGAAGTGTCAGCCCAAA 49
|||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||
seq2 TATATGCCCTCCCCGCGTGGTGTATTGTACC--TGAAAGGTCAGCCCA-- 46
seq1 TAAAGATG--CTTTCTCTGGTGTTCTCTTCCAGC-GGTGAGAAAAGTAAC 96
|||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |
seq2 -TAAGATGGCTTTTCTCGGGTGTTCTCTTCCAGCGGGTGAGAAAAGTATC 95
seq1 CAGTG-TAGTAGTTAGGTATGTTGCTTGTGGGCGTTGCTTGTGGGCGTTG 145
||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| ||| |||||||| ||
seq2 CAGTGTTAGTAGTTA-GTA-GTTGC-TGTGGGCG-TGCCTGTGGGCG-TG 140
seq1 CAAGTGGGCTGAGGGGTAGACTCCATTGGTTACTTTTATGTCACT-CTGA 194
||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||
seq2 CAAGTGGACTGAGGGGTAGACTCCA-TGGTTACTTTTATGTCACTCCTGA 189
seq1 -CCAAATACCTGACAGAAGCTAAGAGAGGAAGGAGTTGCTTTAGCTCGTG 243
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCCAAATACCTGACAGAAGCTAAGAGAGGAAGGAGTTGCTTTAGCTCGTG 239
seq1 GTTTCAGGTCAATTAAAGCATGGATGGCATTGCA-CCAGTGATGGCGGAA 292
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2 GTTTCAGGTCAATTAAAGCATGGATGGCATTGCACCCAGTGATGGCGGAA 289
seq1 GCTTGCAGCTTGTTCACAGCATGGCTGATCAGGAAGCAGAAAACGTAGGC 342
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCTTGCAGCTTGTTCACAGCATGGCTGATCAGGAAGCAGAAAACGTAGGC 339
seq1 TAGAAGTGGCTCCAGGCTCCAGTCCTTAAGGCCCTCAGTGGGTCATAGCT 392
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TAGAAGTGGCTCCAGGCTCCAGTCCTTAAGGCCCTCAGTGGGTCATAGCT 389
seq1 ATGCTTCCAGCTGAAAAGCTTAGACAGAGGGAGGGCATTTCACATCCAAA 442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATGCTTCCAGCTGAAAAGCTTAGACAGAGGGAGGGCATTTCACATCCAAA 439
seq1 CCATAGTAGTTGTCCCATGTAGAGAAGTCTGGCCCCTCTGCAACTGACTG 492
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCATAGTAGTTGTCCCATGTAGAGAAGTCTGGCCCCTCTGCAACTGACTG 489
seq1 GTCACATCAGTATGGGACCAAGTGGGACACACATTGGAGACAAAGCCTGA 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTCACATCAGTATGGGACCAAGTGGGACACACATTGGAGACAAAGCCTGA 539
seq1 TATACATCATTCGAGAATCTGGGCTTGATGAGAAGAGAGTCAAGCAGCCC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TATACATCATTCGAGAATCTGGGCTTGATGAGAAGAGAGTCAAGCAGCCC 589
seq1 CTATGGCCTTCAATGGTTGTCAGTAAAATCTTAGTAGAGATTCTCAGAGT 642
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTATGGCCTTCAATGGTTGTCAGTAAAATCTTAGTAGAGATTCTCAGAGT 639
seq1 GTCTAAGATATGGGCCTTACTTCTGTGGTGGATGACTGATGGTGGAGGCG 692
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTCTAAGATATGGGCCTTACTTCTGTGGTGGATGACTGATGGTGGAGGCG 689
seq1 GGGGTTGTGGTAAACAGTGGGTGCCGTTTTTCTCCTCAGCTCTGCATCTG 742
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGGGTTGTGGTAAACAGTGGGTGCCGTTTTTCTCCTCAGCTCTGCATCTG 739
seq1 TCTCTCGATGTTTCTTTGATGTTTTTAAAGACCATGTTTCACTCTATTGA 792
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCTCTCGATGTTTCTTTGATGTTTTTAAAGACCATGTTTCACTCTATTGA 789
seq1 TCGGGAAAACAAAGCGGTGCTCAGAGCTCTCGTGTGGAGATCCTCGAGGT 842
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCGGGAAAACAAAGCGGTGCTCAGAGCTCTCGTGTGGAGATCCTCGAGGT 839
seq1 TTTATTGAACGATAGCCCTCTATATTTCTTGCTCTTGCAAGAACTATCTT 892
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTTATTGAACGATAGCCCTCTATATTTCTTGCTCTTGCAAGAACTATCTT 889
seq1 GTGAAAATAAAGGCTGTGAAGAAGAAATGGGAAGTACCTGAGGTTCAGAG 942
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTGAAAATAAAGGCTGTGAAGAAGAAATGGGAAGTACCTGAGGTTCAGAG 939
seq1 GCCATACGGAGACTTCCTAAGACTTGTACATGGCTTACTTCCTGAGCCTC 992
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCCATACGGAGACTTCCTAAGACTTGTACATGGCTTACTTCCTGAGCCTC 989
seq1 AGAAGCCTCCCTCCAGGATAGAATGTTTCAATTAGGGGGAAATTACCACA 1042
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGAAGCCTCCCTCCAGGATAGAATGTTTCAATTAGGGGGAAATTACCACA 1039
seq1 GTACACCATCCCAACATGCTGTACCCCATGCAGACATTACTAATTGATCC 1092
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTACACCATCCCAACATGCTGTACCCCATGCAGACATTACTAATTGATCC 1089
seq1 AGACTCATTTTCAGGAAGCTTATCTTGTACAGTATCCTTGGATATCTCTG 1142
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGACTCATTTTCAGGAAGCTTATCTTGTACAGTATCCTTGGATATCTCTG 1139
seq1 ATAATGAGTTGAGGCTCACTTGTACGTGGAATTATCTTTGTCTGACCTCA 1192
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATAATGAGTTGAGGCTCACTTGTACGTGGAATTATCTTTGTCTGACCTCA 1189
seq1 CTGGAATTC 1201
|||||||||
seq2 CTGGAATTC 1198
|