BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-321K02
Chromosome16 (Build37)
Map Location 77,610,462 - 77,715,823
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream gene1700063K16Rik, LOC665120, Usp25, 2810055G20Rik
Downstream geneLOC435483, LOC100039561, Cxadr, Btg3, D16Ertd472e, LOC100039605, 4930570E03Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-321K02.bB6Ng01-321K02.g
ACCGA110684GA110685
length1941,166
definitionB6Ng01-321K02.b B6Ng01-321K02.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(77,610,462 - 77,610,655)(77,714,645 - 77,715,823)
sequence
attgggccaacctagccctagttctttttcttaatgtagaaaggccttgt
ctgacatcaatgggaggggaggcccttggtcctatggaggtttgatgccc
tggcatagggggatgctggaggggtggggccgaaaaggattggggtgttg
gtgcacactcatagaggcatggtagggggtgaggagagggatat

gaattccacaccccaaagccccttagcccataaaacccccctagcttccg
agcctcgtgacctacatccgttatctcctgtgtgggatgcatgtcagtcc
ggagctctgtcattaaactacctcatgtaattacatcagggcagtctatt
catgattctttaggtgcacgccgaatcagaaattgagtgggggtttcccc
actaggttttatcacagaaattatcttggattctttatttaaaaaatcac
aaattaaataaagtagaaaatacaagttaagatataaagtacagctgaaa
tagtacattactgtattttaaaactgcactagttgcctagttactctgat
actttattaatctttacgatttatcttgtttattatctatctgattgttg
aatcatttctatgggacttaaatatgtatttgaatatggtactgtctgac
ttgtaaagtagccagaagagccaggatagataatattataatgatatgtt
ttatagacattggttaataataattagaaaaaggtcaaaagtcatggatt
aaactgaagttttgttcacaagcattaggctgacagcagggatatgacag
tgagatctgcagatgacttcagaaagtccccttctcagaaggtcacaatt
cagcggagcagagaggacagcagaagggtgaactgcagactgtggataca
gggacatccacagggacatggcctaaggacacctggcttcacctgtatca
ctcagtgattcctgccacacccatagccagagctccagatctgtctcatg
gtactttgtcgaacttatgacagagctggtgaaaggaagccaattccaga
gagccatatcattcaaggacaaattcactgtggaccataacttgaaataa
gagctacttagagttatttttggtacctggctataaatcatgaaaagatg
agcctctttgctcattgtaaacaaatatgaaaagacaacatttcctttgg
ttgttcaattacttacatcattttggctatcatacaattgagtagcttta
atactaaagattgaaggacttgtaaaccatggatatgtacagcttctcaa
tttcctatttcaacttaaatttaacaaagcctcctctatcaaatgccatg
atttcgagtggttaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_77610462_77610655
seq2: B6Ng01-321K02.b_52_245

seq1  ATTGGGCCAACCTAGCCCTAGTTCTTTTTCTTAATGTAGAAAGGCCTTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGGCCAACCTAGCCCTAGTTCTTTTTCTTAATGTAGAAAGGCCTTGT  50

seq1  CTGACATCAATGGGAGGGGAGGCCCTTGGTCCTATGGAGGTTTGATGCCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACATCAATGGGAGGGGAGGCCCTTGGTCCTATGGAGGTTTGATGCCC  100

seq1  TGGCATAGGGGGATGCTGGAGGGGTGGGGCCGAAAAGGATTGGGGTGTTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCATAGGGGGATGCTGGAGGGGTGGGGCCGAAAAGGATTGGGGTGTTG  150

seq1  GTGCACACTCATAGAGGCATGGTAGGGGGTGAGGAGAGGGATAT  194
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCACACTCATAGAGGCATGGTAGGGGGTGAGGAGAGGGATAT  194


seq1: chr16_77714645_77715823
seq2: B6Ng01-321K02.g_67_1232 (reverse)

seq1  TCTAACCACTCTGAGATCATGCCCATTTTGATAGAGAGGGTTTTTTGTTT  50
      ||||||||||| || |||||| |   ||||||||||  || |||    ||
seq2  TCTAACCACTC-GAAATCATGGC--ATTTGATAGAGGAGGCTTT---GTT  44

seq1  AATTTTAAGGTTTGAAATAGGAAA-TGAG-AGCTGTACATTAATCCATTG  98
      || ||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||| |
seq2  AAATTTAAG--TTGAAATAGGAAATTGAGAAGCTGTACAT--ATCCATGG  90

seq1  TTTACAAGTCTTTTCAATCTTTAGTATTAAAGGCTACTCAATTGTAATGA  148
      ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||
seq2  TTTACAAGTC-CTTCAATCTTTAGTATTAAA-GCTACTCAATTGT-ATGA  137

seq1  TAGCCAAAATGATTGTAAGTAATTGAACAACCAAAGGAAATGTTGTCTTT  198
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCAAAATGA-TGTAAGTAATTGAACAACCAAAGGAAATGTTGTCTTT  186

seq1  TCATATTTTGTTTACAATGAGCAAAGAGGCTCATCTTTTCATGATTTATA  248
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATA-TTTGTTTACAATGAGCAAAGAGGCTCATCTTTTCATGATTTATA  235

seq1  GCCAGGTACCAAAAATAACTCTAAGTAGCTCTTATTTCAAGTTATGGTCC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGGTACCAAAAATAACTCTAAGTAGCTCTTATTTCAAGTTATGGTCC  285

seq1  ACAGTGAATTTGTCCTTGAATGATATGGCTCTCTGGAATTGGCTTCCTTT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTGAATTTGTCCTTGAATGATATGGCTCTCTGGAATTGGCTTCCTTT  335

seq1  CACCAGCTCTGTCATAAGTTCGACAAAGTACCATGAGACAGATCTGGAGC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCAGCTCTGTCATAAGTTCGACAAAGTACCATGAGACAGATCTGGAGC  385

seq1  TCTGGCTATGGGTGTGGCAGGAATCACTGAGTGATACAGGTGAAGCCAGG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGCTATGGGTGTGGCAGGAATCACTGAGTGATACAGGTGAAGCCAGG  435

seq1  TGTCCTTAGGCCATGTCCCTGTGGATGTCCCTGTATCCACAGTCTGCAGT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCTTAGGCCATGTCCCTGTGGATGTCCCTGTATCCACAGTCTGCAGT  485

seq1  TCACCCTTCTGCTGTCCTCTCTGCTCCGCTGAATTGTGACCTTCTGAGAA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCCTTCTGCTGTCCTCTCTGCTCCGCTGAATTGTGACCTTCTGAGAA  535

seq1  GGGGACTTTCTGAAGTCATCTGCAGATCTCACTGTCATATCCCTGCTGTC  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGACTTTCTGAAGTCATCTGCAGATCTCACTGTCATATCCCTGCTGTC  585

seq1  AGCCTAATGCTTGTGAACAAAACTTCAGTTTAATCCATGACTTTTGACCT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTAATGCTTGTGAACAAAACTTCAGTTTAATCCATGACTTTTGACCT  635

seq1  TTTTCTAATTATTATTAACCAATGTCTATAAAACATATCATTATAATATT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTAATTATTATTAACCAATGTCTATAAAACATATCATTATAATATT  685

seq1  ATCTATCCTGGCTCTTCTGGCTACTTTACAAGTCAGACAGTACCATATTC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTATCCTGGCTCTTCTGGCTACTTTACAAGTCAGACAGTACCATATTC  735

seq1  AAATACATATTTAAGTCCCATAGAAATGATTCAACAATCAGATAGATAAT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATACATATTTAAGTCCCATAGAAATGATTCAACAATCAGATAGATAAT  785

seq1  AAACAAGATAAATCGTAAAGATTAATAAAGTATCAGAGTAACTAGGCAAC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAAGATAAATCGTAAAGATTAATAAAGTATCAGAGTAACTAGGCAAC  835

seq1  TAGTGCAGTTTTAAAATACAGTAATGTACTATTTCAGCTGTACTTTATAT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGCAGTTTTAAAATACAGTAATGTACTATTTCAGCTGTACTTTATAT  885

seq1  CTTAACTTGTATTTTCTACTTTATTTAATTTGTGATTTTTTAAATAAAGA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAACTTGTATTTTCTACTTTATTTAATTTGTGATTTTTTAAATAAAGA  935

seq1  ATCCAAGATAATTTCTGTGATAAAACCTAGTGGGGAAACCCCCACTCAAT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCAAGATAATTTCTGTGATAAAACCTAGTGGGGAAACCCCCACTCAAT  985

seq1  TTCTGATTCGGCGTGCACCTAAAGAATCATGAATAGACTGCCCTGATGTA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGATTCGGCGTGCACCTAAAGAATCATGAATAGACTGCCCTGATGTA  1035

seq1  ATTACATGAGGTAGTTTAATGACAGAGCTCCGGACTGACATGCATCCCAC  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACATGAGGTAGTTTAATGACAGAGCTCCGGACTGACATGCATCCCAC  1085

seq1  ACAGGAGATAACGGATGTAGGTCACGAGGCTCGGAAGCTAGGGGGGTTTT  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGAGATAACGGATGTAGGTCACGAGGCTCGGAAGCTAGGGGGGTTTT  1135

seq1  ATGGGCTAAGGGGCTTTGGGGTGTGGAATTC  1179
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGCTAAGGGGCTTTGGGGTGTGGAATTC  1166


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |