BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-325I19
Chromosome3 (Build37)16 (Build37)
Map Location 32,574,740 - 32,575,58643,641,699 - 43,641,781
singlet/doubletsingletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneLOC625125, Kcnmb2, LOC665514, Zmat3, 4930429B21Rik, Pik3ca, Kcnmb3, Zfp639, Mfn1, Gnb4, LOC100040977
Downstream geneActl6a, Mrpl47, Ndufb5, Usp13, Pex2, EG545512
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-325I19.bB6Ng01-325I19.g
ACCGA113579GA113580
length980302
definitionB6Ng01-325I19.b B6Ng01-325I19.g
singlet/doubletsingletsinglet
BLAST hituniqueunique
Map location.(32,574,740 - 32,575,586)(43,641,699 - 43,641,781)
sequence
gaattccatcaggctgaatgtgtcatgaactttaagtaatataaataaaa
ttaaaataatataaataactcacttggcaatgggtaaagagacaccttgt
tggtgacattgccttatatcagtcagggacagagcagatgactgtctttt
gtcattcctagcttgatggccaaagctgtcttatgtctaggatacatgaa
tatcaaatcaaatcaaatctaggcagcacagcacaagaagagaaatacag
agatttgcataccaccatgctacccacggatctgccctcccacacatggc
acagacacccacttgccacctcatcgtggagcatggatgaagggtgttac
caccagacgtgtggtcgggcttcagccagagtcaccacaatgtgcaaata
tatggtgggcaactgggagagagagaaaaaaaagtggacaacttgagcat
tatgaagagagagggaactggagactgaagggtagaaaggagtcgcctgt
tctgagtgtccagcctatggtaaggccccagcctgggctgccactgaggg
ctgtatctgagtccatgagtccacagcagcagggctcagtgtggatatcc
gtgacacatgttatcactagagaacacggggaactccctggtcaggacag
ctgtagggacccacatggacgtacaggggctgtgcataactagccttgcc
tctcacaggatgaggcctttgggagagctggtggcagcacttgggagaga
gggccctacacctagcccagtcagcacagtggagctggccctgggggtgg
ggctggggtgactcagccccaagggcatgagtgtgggagagccgacctca
tcactcatctgctgcggggtggcaccagtgcagaggtgatgctcacccca
tcccccctgcaaccccttgtcacctctggaagttgggaaagctgcccaat
agggccatgaactccggagaactagccctg
cgggttggtgccagctttatttccctatgtcatatgaatcaagtatgtga
tctttagcaataatgccttagctttaagttctagaaggtaagcaagagga
atgcaatagtctataatattggggggggaggctatgtgaatttactgatc
aatgaatgactcagaaagttatgatactctaaacatgacattgggttatt
ttatttgatagcctatggtatctgggaaaaaacactgtccccctattata
ggataatcccatttgggctgtttgtgtgtgttgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_32574740_32575586
seq2: B6Ng01-325I19.b_46_892

seq1  GAATTCCATCAGGCTGAATGTGTCATGAACTTTAAGTAATATAAATAAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATCAGGCTGAATGTGTCATGAACTTTAAGTAATATAAATAAAA  50

seq1  TTAAAATAATATAAATAACTCACTTGGCAATGGGTAAAGAGACACCTTGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAATAATATAAATAACTCACTTGGCAATGGGTAAAGAGACACCTTGT  100

seq1  TGGTGACATTGCCTTATATCAGTCAGGGACAGAGCAGATGACTGTCTTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGACATTGCCTTATATCAGTCAGGGACAGAGCAGATGACTGTCTTTT  150

seq1  GTCATTCCTAGCTTGATGGCCAAAGCTGTCTTATGTCTAGGATACATGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATTCCTAGCTTGATGGCCAAAGCTGTCTTATGTCTAGGATACATGAA  200

seq1  TATCAAATCAAATCAAATCTAGGCAGCACAGCACAAGAAGAGAAATACAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCAAATCAAATCAAATCTAGGCAGCACAGCACAAGAAGAGAAATACAG  250

seq1  AGATTTGCATACCACCATGCTACCCACGGATCTGCCCTCCCACACATGGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTTGCATACCACCATGCTACCCACGGATCTGCCCTCCCACACATGGC  300

seq1  ACAGACACCCACTTGCCACCTCATCGTGGAGCATGGATGAAGGGTGTTAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGACACCCACTTGCCACCTCATCGTGGAGCATGGATGAAGGGTGTTAC  350

seq1  CACCAGACGTGTGGTCGGGCTTCAGCCAGAGTCACCACAATGTGCAAATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCAGACGTGTGGTCGGGCTTCAGCCAGAGTCACCACAATGTGCAAATA  400

seq1  TATGGTGGGCAACTGGGAGAGAGAGAAAAAAAAGTGGACAACTTGAGCAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGTGGGCAACTGGGAGAGAGAGAAAAAAAAGTGGACAACTTGAGCAT  450

seq1  TATGAAGAGAGAGGGAACTGGAGACTGAAGGGTAGAAAGGAGTCGCCTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGAAGAGAGAGGGAACTGGAGACTGAAGGGTAGAAAGGAGTCGCCTGT  500

seq1  TCTGAGTGTCCAGCCTATGGTAAGGCCCCAGCCTGGGCTGCCACTGAGGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAGTGTCCAGCCTATGGTAAGGCCCCAGCCTGGGCTGCCACTGAGGG  550

seq1  CTGTATCTGAGTCCATGAGTCCACAGCAGCAGGGCTCAGTGTGGATATCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTATCTGAGTCCATGAGTCCACAGCAGCAGGGCTCAGTGTGGATATCC  600

seq1  GTGACACATGTTATCACTAGAGAACACGGGGAACTCCCTGGTCAGGACAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACACATGTTATCACTAGAGAACACGGGGAACTCCCTGGTCAGGACAG  650

seq1  CTGTAGGGACCCACATGGACGTACAGGGGCTGTGCATAACTAGCCTTGCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTAGGGACCCACATGGACGTACAGGGGCTGTGCATAACTAGCCTTGCC  700

seq1  TCTCACAGGATGAGGCCTTTGGGAGAGCTGGTGGCAGCACTTGGGAGAGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCACAGGATGAGGCCTTTGGGAGAGCTGGTGGCAGCACTTGGGAGAGA  750

seq1  GGGCCCTACACCTAGCCCAGTCAGCACAGTGGAGCTGGCCCTGGGGGTGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCCCTACACCTAGCCCAGTCAGCACAGTGGAGCTGGCCCTGGGGGTGG  800

seq1  GGCTGGGGTGACTCAGCCCCAAGGGCATGAGTGTGGGAGAGCCGACC  847
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGGGGTGACTCAGCCCCAAGGGCATGAGTGTGGGAGAGCCGACC  847

seq1: chr16_43641699_43641781
seq2: B6Ng01-325I19.g_339_372 (reverse)

seq1  ACACACACACACACACACAC-ACACACACACACACACACACACACACACA  49
      |||||||||||||||||||| ||||||||| |||                
seq2  ACACACACACACACACACACAACACACACAAACA----------------  34

seq1  CTGTATATTCAGACATGATGTACACACACAAACA  83
                                        
seq2  ----------------------------------  34