BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-326G19
Chromosome16 (Build37)
Map Location 29,526,304 - 29,657,155
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAtp13a4, Opa1
Upstream geneFgf12, 1600021P15Rik, EG666717, Hrasls, Atp13a5
Downstream geneGm1968, LOC100043102, 9030404E10Rik, Hes1, EG547263, 1700025H01Rik, LOC100043110, Cpn2, Lrrc15, Gp5, Atp13a3, Tmem44, Lsg1, BC022623
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-326G19.bB6Ng01-326G19.g
ACCGA114237GA114238
length1,194830
definitionB6Ng01-326G19.b B6Ng01-326G19.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(29,526,304 - 29,527,502)(29,656,326 - 29,657,155)
sequence
gaattcatacagcaagtagaatgttcatggaagttgccttggataatggc
atcctgtgattcttcttaaattagaatgttctgtattttacacatgttaa
tcatcaaacgtgtctcagttttaaagtcagagaaatattttttacaatct
tattttttttaacctgctgggaaaacgatccatattgctgaaagaaagga
ctgtggcaaataaactaaacaaccctaggaggtccttgtgttttaagata
gggtcttattcagtagcaaaggctgggcttgaactcactctgatcctcta
ccctcagcctcccagttgctagaattgcaggcatcttcttgacaggactg
gactatttgaaacagtgtttgtttagtttcgttcactatttattgtctct
cagacatttatgtgtttattaatttgtataactgtttagactgcttaacc
tcagataacaatatccgtccggtacttccaattacttgtggcagaccaca
tcctcatgtcttcagccaaagtgcccaggtaagtcggactctgactcact
ccaggagaaggcatgtgactccacgcatggctttctgcaggccacaagac
tgaatgtgaagagatgaagagcgaaactaccccacatcccacagtaagaa
atcggtgcttgggtaggactggagagaggaaatttcctctttctacttga
ttgatgctgggagcatacagccctggagttgtcagaaaaccccgtatgga
gtgagagaataaacccacatgggaggtttaaccagtcagaaaaagagaag
ccagcactaagtctctgctccagggttatatgtgcctgagagcagtacta
catgtggcccttgcactgagctaaccaacttgttaacatgttagcatgag
ctaacatgtcttgcatgaaacatgtctttgagcttctcatttccatattt
aaaaaaatagtataaaagtatattaacacatttgaccagggagagacctg
gagaactagcaagagaagtcattttgagcttacgcaacccttgtgcaccg
ctgccatggctgttatgagtgttaactttcgctttcgactgaagcaccat
ttccgtgtcttctgcagaactaacttgtggactggtggggtcctgggcct
atacacagacagtctgcctcagtgaacctgaggtcgatccctgg
gaattctctgagccatctgttcaaacgacgagctcatctcgccatttctg
tgtatcgtgtaccgagctcccaatacctcacacgccatcactttccttcc
tccgagaactttgtagaggagctactctggaaagtggtttgttaatcgga
ctggcttccttaagtcttattttgtcaacgtcacaaattgctgtacatcc
ataaaatgggaacagttctgctagcgataaagctacaaaacccaacacat
attggacccgttgctctggatttgagtattctcaaccaagtgtcacaggc
acaagcctttgatccgatgccgaccatgagatgcttcagaggggttctag
acggatctcacattgctcacggctagtttgtagtactaccctttgcagtg
ctgagcctagtttgacctttgacaggcctttttcctaacacacttctggc
acctcctactcttgtgttgttcagtgaggtggcaaggccaccattgtccc
tgggcgtgtgcatgttgctgaagcattaatatggtgacttctgacttttg
ctatctataaataacagggaaaaaaaatcatacgtattaggcattccagt
agtctggtggcaagttcattactgtctgtgtggacactgtcaatttacac
ccacaagacaaacatgttcttagccaatagagaccagtgagccctgcact
ttgggctgggtggggctcagtgttagagtgtttggtcttccatctccagt
accgtggagaaggaagaggaggaaagagagagagaacaaaaaaagggaga
gaggggtcagggagggagagggagaggtgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_29526304_29527502
seq2: B6Ng01-326G19.b_48_1241

seq1  GAATTCATACAGCAAGTAGAATGTTCATGGAAGTTGCCTTGGATAATGGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATACAGCAAGTAGAATGTTCATGGAAGTTGCCTTGGATAATGGC  50

seq1  ATCCTGTGATTCTTCTTAAATTAGAATGTTCTGTATTTTACACATGTTAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTGTGATTCTTCTTAAATTAGAATGTTCTGTATTTTACACATGTTAA  100

seq1  TCATCAAACGTGTCTCAGTTTTAAAGTCAGAGAAATATTTTTTACAATCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCAAACGTGTCTCAGTTTTAAAGTCAGAGAAATATTTTTTACAATCT  150

seq1  TATTTTTTTTAACCTGCTGGGAAAACGATCCATATTGCTGAAAGAAAGGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTTTTTAACCTGCTGGGAAAACGATCCATATTGCTGAAAGAAAGGA  200

seq1  CTGTGGCAAATAAACTAAACAACCCTAGGAGGTCCTTGTGTTTTAAGATA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGGCAAATAAACTAAACAACCCTAGGAGGTCCTTGTGTTTTAAGATA  250

seq1  GGGTCTTATTCAGTAGCAAAGGCTGGGCTTGAACTCACTCTGATCCTCTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCTTATTCAGTAGCAAAGGCTGGGCTTGAACTCACTCTGATCCTCTA  300

seq1  CCCTCAGCCTCCCAGTTGCTAGAATTGCAGGCATCTTCTTGACAGGACTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCAGCCTCCCAGTTGCTAGAATTGCAGGCATCTTCTTGACAGGACTG  350

seq1  GACTATTTGAAACAGTGTTTGTTTAGTTTCGTTCACTATTTATTGTCTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTATTTGAAACAGTGTTTGTTTAGTTTCGTTCACTATTTATTGTCTCT  400

seq1  CAGACATTTATGTGTTTATTAATTTGTATAACTGTTTAGACTGCTTAACC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACATTTATGTGTTTATTAATTTGTATAACTGTTTAGACTGCTTAACC  450

seq1  TCAGATAACAATATCCGTCCGGTACTTCCAATTACTTGTGGCAGACCACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGATAACAATATCCGTCCGGTACTTCCAATTACTTGTGGCAGACCACA  500

seq1  TCCTCATGTCTTCAGCCAAAGTGCCCAGGTAAGTCGGACTCTGACTCACT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCATGTCTTCAGCCAAAGTGCCCAGGTAAGTCGGACTCTGACTCACT  550

seq1  CCAGGAGAAGGCATGTGACTCCACGCATGGCTTTCTGCAGGCCACAAGAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGAGAAGGCATGTGACTCCACGCATGGCTTTCTGCAGGCCACAAGAC  600

seq1  TGAATGTGAAGAGATGAAGAGCGAAACTACCCCACATCCCACAGTAAGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATGTGAAGAGATGAAGAGCGAAACTACCCCACATCCCACAGTAAGAA  650

seq1  ATCGGTGCTTGGGTAGGACTGGAGAGAGGAAATTTCCTCTTTCTACTTGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCGGTGCTTGGGTAGGACTGGAGAGAGGAAATTTCCTCTTTCTACTTGA  700

seq1  TTGATGCTGGGAGCATACAGCCCTGGAGTTGTCAGAAAACCCCGTATGGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATGCTGGGAGCATACAGCCCTGGAGTTGTCAGAAAACCCCGTATGGA  750

seq1  GTGAGAGAATAAACCCACATGGGAGGTTTAACCAGTCAGAAAAAGAGAAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  GTGAGAGAATAAACCCACATGGGAGGTTTAACCAGTCAGAAAAAGAGAA-  799

seq1  GCCAGCACTAAGTCTCTGCTCCAGGGTTATATGTGCCTGAGAGCAGTACT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGCACTAAGTCTCTGCTCCAGGGTTATATGTGCCTGAGAGCAGTACT  849

seq1  ACATGTGGCCCTTGCACTGAGCTAACCAACTTGTTAACATGTTAGCATGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGTGGCCCTTGCACTGAGCTAACCAACTTGTTAACATGTTAGCATGA  899

seq1  GCTAACATGTCTTGCATGAAACATGTCTTTGAGCTTCTCATTTCCATATT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAACATGTCTTGCATGAAACATGTCTTTGAGCTTCTCATTTCCATATT  949

seq1  TAAAAAAATAGTATAAAAGTATATTAACACATTTGACCAGGGAGGAGACC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TAAAAAAATAGTATAAAAGTATATTAACACATTTGACCAGGGA-GAGACC  998

seq1  TGGAGAACTAGCAAGAGAAGTCATTTTGAGCTTACGCAACCCTTGTGCA-  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TGGAGAACTAGCAAGAGAAGTCATTTTGAGCTTACGCAACCCTTGTGCAC  1048

seq1  CGCTGCCATGGCTGTTATGAGTGTTTAACTTTCGCTTTCGACTGAAGCAA  1099
      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
seq2  CGCTGCCATGGCTGTTATGAGTG-TTAACTTTCGCTTTCGACTGAAGC-A  1096

seq1  CCATTTCCGTGTCTTCTGCAGAACTAACTTTGTGGACT-GTGGGGCACTG  1148
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||
seq2  CCATTTCCGTGTCTTCTGCAGAACTAAC-TTGTGGACTGGTGGGGTCCTG  1145

seq1  GG-CTATACACAGACAGTCTGGTCTCCAGTTGAGCTGAGGTCTGATCCCT  1197
      || ||||||||||||||||||  |  ||||  | |||||||| |||||||
seq2  GGCCTATACACAGACAGTCTG--CCTCAGTGAACCTGAGGTC-GATCCCT  1192

seq1  GG  1199
      ||
seq2  GG  1194

seq1: chr16_29656326_29657155
seq2: B6Ng01-326G19.g_65_894 (reverse)

seq1  CCACCTCTCCCTCTCCCTCCCTGACCCCTCTCTCCCTTTTTTTGTTCTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCTCTCCCTCTCCCTCCCTGACCCCTCTCTCCCTTTTTTTGTTCTCT  50

seq1  CTCTCTTTCCTCCTCTTCCTTCTCCACGGTACTGGAGATGGAAGACCAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTTTCCTCCTCTTCCTTCTCCACGGTACTGGAGATGGAAGACCAAA  100

seq1  CACTCTAACACTGAGCCCCACCCAGCCCAAAGTGCAGGGCTCACTGGTCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCTAACACTGAGCCCCACCCAGCCCAAAGTGCAGGGCTCACTGGTCT  150

seq1  CTATTGGCTAAGAACATGTTTGTCTTGTGGGTGTAAATTGACAGTGTCCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTGGCTAAGAACATGTTTGTCTTGTGGGTGTAAATTGACAGTGTCCA  200

seq1  CACAGACAGTAATGAACTTGCCACCAGACTACTGGAATGCCTAATACGTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGACAGTAATGAACTTGCCACCAGACTACTGGAATGCCTAATACGTA  250

seq1  TGATTTTTTTTCCCTGTTATTTATAGATAGCAAAAGTCAGAAGTCACCAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTTTTTTTCCCTGTTATTTATAGATAGCAAAAGTCAGAAGTCACCAT  300

seq1  ATTAATGCTTCAGCAACATGCACACGCCCAGGGACAATGGTGGCCTTGCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAATGCTTCAGCAACATGCACACGCCCAGGGACAATGGTGGCCTTGCC  350

seq1  ACCTCACTGAACAACACAAGAGTAGGAGGTGCCAGAAGTGTGTTAGGAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCACTGAACAACACAAGAGTAGGAGGTGCCAGAAGTGTGTTAGGAAA  400

seq1  AAGGCCTGTCAAAGGTCAAACTAGGCTCAGCACTGCAAAGGGTAGTACTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCCTGTCAAAGGTCAAACTAGGCTCAGCACTGCAAAGGGTAGTACTA  450

seq1  CAAACTAGCCGTGAGCAATGTGAGATCCGTCTAGAACCCCTCTGAAGCAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACTAGCCGTGAGCAATGTGAGATCCGTCTAGAACCCCTCTGAAGCAT  500

seq1  CTCATGGTCGGCATCGGATCAAAGGCTTGTGCCTGTGACACTTGGTTGAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATGGTCGGCATCGGATCAAAGGCTTGTGCCTGTGACACTTGGTTGAG  550

seq1  AATACTCAAATCCAGAGCAACGGGTCCAATATGTGTTGGGTTTTGTAGCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACTCAAATCCAGAGCAACGGGTCCAATATGTGTTGGGTTTTGTAGCT  600

seq1  TTATCGCTAGCAGAACTGTTCCCATTTTATGGATGTACAGCAATTTGTGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCGCTAGCAGAACTGTTCCCATTTTATGGATGTACAGCAATTTGTGA  650

seq1  CGTTGACAAAATAAGACTTAAGGAAGCCAGTCCGATTAACAAACCACTTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTTGACAAAATAAGACTTAAGGAAGCCAGTCCGATTAACAAACCACTTT  700

seq1  CCAGAGTAGCTCCTCTACAAAGTTCTCGGAGGAAGGAAAGTGATGGCGTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAGTAGCTCCTCTACAAAGTTCTCGGAGGAAGGAAAGTGATGGCGTG  750

seq1  TGAGGTATTGGGAGCTCGGTACACGATACACAGAAATGGCGAGATGAGCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGTATTGGGAGCTCGGTACACGATACACAGAAATGGCGAGATGAGCT  800

seq1  CGTCGTTTGAACAGATGGCTCAGAGAATTC  830
      ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTCGTTTGAACAGATGGCTCAGAGAATTC  830