BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-122O24.T7 (MSMg01no122_o24.b1) | MSMg01-122O24.TJ (MSMg01no122_o24.g1) |
ACC | AG332670 | AG332671 |
length | 1,288 | 1,070 |
length of high quality (start - end) | 38 (26 - 63) | 704 (83 - 786) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no122_o24.b1 PHD_FILE: MSMg01no122_o24.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:31:58 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no122_o24.g1 PHD_FILE: MSMg01no122_o24.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:31:58 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | plural |
---|
sequence | TACTATGGGCGCTATAGACTCACTAAGGGAGAGGATCCGCGGAATTCCAG
GGCAAAAAGGGCTAAAGGGTGGGTAGGGCTTTGGGGTGTGGGTGTGGGCC
CTTAAAAAACCCCCCTNNNNNNCCCCCAATTTCTTTTTTTCTTATNTCTA
TTAAATATTTACTATATCTTAAAATCTTTAATATTTCATATTTTCATTCT
TATATTATATTAAAAATTTCACTCACTCTCCAATAATATTTAATACATAT
TTTAACAACATAAACATCATATAATTCTAATCTTTTCATATACATACATA
CTTTAATTTTCAAACTCCAATACAATTTTCAAATAATAACCATCATAAAC
ATTTTCAACTTCACTTTTAATTTATTAATTTACTATTACTTATTCCCTAT
TATATTTTTTTTTTTCAATTTTTATTTATTTCATACTATAATTTTTCTTA
TAAACAACCATATTTTTTTCTTCCCCCCCCCAAACTACCATTCTCTCTCC
TTCAAAAAAAAAAAAAACTTTTTCTCATTATTTTTATTTTTCAATATTCA
ATTTTACACATACACTATCTTTTCTAAATTCCATTATCACTTCTTTATAT
TTATATACTTCTTTATAACTTTTTTATTTTCTACTATTTTCCTTTTTATA
ATTATTCAACTTCATATATACTCTCTCTATCATTTATATTTTATATTTAT
TTACTTTAATATCTATTCATTATTTTTTTTAATCTATCATCATTATATAT
TAATCTACAATCATTATCTTTTATCATTCTCAATAAATCATAATCTAATA
TAATTTATATATATTCTCTAAATTCCATTTTCATACATTTCTAACTTAAA
TTTCTATCTCTATCTAAATTATAATATCCATAATTATTCATTAACATCTA
TCTATTTCTTTATATTTCATCTATAAATTAATTAATCACTATATATTATA
CATCACTAATTAACTTATATATTATATTCAATAATTTCTTAACTATCCCT
ATTAATTTACTTTTATACTCCAATATATTAATACTATATATATATTTACT
CTATTTTTTTTAATATACATATTCATTTACTATCTTTTCAATTAATATTA
ACTATTCATCATCTTCCTCTAAATTATCATTCCTCTNCACTCTACTCATA
TCTATCTAATTACATCTATATTCATTTATCATTCACATCTTTATTCCCTA
TTATCACACCAAACCCTACTCCCATATCCAAAACATATTCCTTCATATTA
TATCAATCTATACTACTCTTAATTAATCAAATTACATC
| CCTTCTNTTNNTATTCATGTGATGCTGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTAAAGCCATGTTGTGGTTCTTCC
TGCTAACATGCACCTTTATTGAGTTACTCATGCTCCTGCATGTAACCCCT
CACTAACGATCCTGTAAGAAACCCCAATTAACTCGTTGAGTTGATTAACT
TATTTGCCTGAACTTCTTTCTTTTGCTGATCCCAAATTAGGCTGAATAGA
CTTTCCTTCATGCCTTCCCAGAAGTGGGAGGGGGGAGGGGAAACACAGGA
AATTAGGGTTTACCCTGGCAATATATTTTCTTATTTTCTAGACGAAACTT
ACACTATATATCTATTGTATGTTGTGGAGCAATTTCATCAAATTGAAACA
TTTCCTCTCAACCTTCGTCCTTTAAATTAGACATTTTAATTGAATTTTTT
GATGTTTCTTGCAGTTATCATGTTTAAAATAACTAGAAAAAGTGTAGAAT
ATTTACCTATGTGGTCAATTTTGAAAAGTCACTATCACCAATTTTAGAAC
CATGGACAATTGTCAAATTACTACTTTGTAAAGAAATTGAAATTCTAATC
ATTAGTGTTTTAAACTAGAAATTGCCATTTCTCATAACTTCAAGATTATG
TCACAAATAGAAAAAGACATTAATTGGTTCATACGTGAGACTAATGAAGA
GGTAAAGTCAACACAGCCATGAAAAAAAGAAACATTTTATATAGCTTTTC
CCCTATGATGTTGGAATATTTTTTATTCATTTTATATCCTGATTGCAGAT
ATCTTTCCCTCATCTTTCACCAGAACTTCCTTTACATAACTCCCCAGCAC
CACACACACACACACACTATGCCTGCCCCTTCTCTTGAGGAGAAGGGGAA
AGTCCCCCCTTTGGCCCGAACCTTGCCCAAGCTTTACTTCTCCCAAATAA
GGCCCAAACAAGGGCAGCCCCAACCCAGTGTTGAATGAAAATCTCAAAAA
GTTAACCCCAAACACAGTTTTAGAAGAACAGCCCCCCCCACTTCCCAATT
TTGAAAGAACCCAAGTTTTC
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 6 13 13 13 11 14 19 11 10 8 8 8 8 8 8 14 22 19 12 8 10 8 22 26 53 47 50 50 47 47 47 47 47 57 43 57 57 43 43 43 53 36 36 35 35 35
19 21 9 9 13 21 34 33 25 9 9 9 9 8 8 11 10 10 9 12 16 16 23 31 37 44 53 57 57 53 53 53 53 50 38 36 36 36 36 33 33 33 37 37 34 27 22 13 8 7
8 9 12 12 10 12 10 8 8 8 9 12 10 10 10 3 0 0 0 0 0 0 3 13 13 7 6 6 8 8 8 9 9 9 9 10 9 8 10 10 11 12 11 11 3 0 3 8 8 8
8 8 11 11 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 10 9 9 9 10 9 9 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 8 9 8 8 8 8 8 8 8
6 6 8 8 12 11 11 11 11 11 11 9 9 9 9 9 9 9 8 8 6 6 8 6 10 10 9 9 9 9 10 9 9 8 8 10 8 8 8 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8
8 10 8 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 11 9 9 8 8 8 8 8 6 6 8 10 6 6 8 8 9 9 10 10 10 9 9 10 8 8 8 6 8 8 11 12 12 9 8 8 8
8 8 9 9 9 9 12 10 8 8 7 7 8 8 8 8 8 6 9 10 8 8 9 8 8 12 11 11 11 11 10 8 8 6 6 8 8 9 11 11 11 10 13 11 11 11 11 11 10 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 7 9 11 10 10 10 10 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 9 11
8 8 8 8 8 6 8 15 19 30 28 17 10 8 8 8 8 8 10 11 11 11 12 15 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 9 8 8 6 6 10 8 10
14 12 16 12 10 9 6 6 8 8 10 10 10 11 11 20 15 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 15 16 16 10 8 8 8 8 8 9 10 10 8 8 6 8 8 8 12 8 8 8
8 8 8 11 11 11 10 15 20 11 10 10 8 8 8 8 8 8 11 11 11 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 8 8 6 6 8 8 8 7 7 8 6 6 8 8 9 10 10
10 12 11 8 6 6 8 8 10 9 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 11 8 10 10 10 10 11 11 11 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 11 11 10 9 9 9 10 8 9 9
9 8 8 9 9 9 9 9 9 8 8 9 9 9 9 9 10 11 11 11 11 12 12 11 11 16 11 8 8 6 6 8 8 8 10 13 10 11 11 11 10 10 11 13 8 8 8 8 8 8
8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 8
8 13 10 8 6 6 8 10 8 8 8 8 10 10 9 8 8 6 6 8 8 10 9 9 9 10 10 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 10 10 9 11 9
10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 8 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 6 7 8 8 11 11 11 16 12 10 8 8 8 8 8 8 10
8 9 9 9 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 9 9 6 8 8 8 8 8 10 9 9 9 9 9 9 9 9 12 12 12 12
12 10 8 8 6 6 8 8 11 11 11 11 13 13 11 9 9 9 10 8 8 8 8 8 11 11 10 10 10 10 10 10 10 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10 9 9 10
8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 6 6 8 8 8 7 6 8 8 8 8 8
8 8 10 6 6 6 6 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 6 6 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10
10 8 10 10 10 10 8 8 6 6 8 8 10 10 10 16 8 8 6 6 8 8 9 9 11 11 9 9 9 8 8 6 7 10 12 10 10 10 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 10 10 10 9 9 9 12 11 11 11 12 15 11 11 12 15 16 15 12 11 11 11 11 9 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 11 12 8 8
6 7 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 8 7 6 8 6 6 8 6 8 12 11 10 8 6 6 6 6 8 6 6 3 0 3 8 8 8 8 8 9 10 9 9 10 10 8
8 7 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 9 9 9 7 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 9 9 15 10 10 9 9 8 8 8 8 12 12 12 8 9 8 8 8
8 11 10 10 8 8 6 6 6 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 15 11 12 11 12 11 11 11 11 11 8 10 6 6 8 7 6 8 8 10 8 8 8 8 10 8 10
9 8 8 6 6 10 8 8 8 8 9 10 8 8 6 6 8 8 13 15 10 9 9 10 8 8 6 6 8 8 11 12 10 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 8 8 8 8 7 3 0 3 3 0 0 3 8 8 6 7 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 8 17 11 12 13 7 7 9 8 12 12 19 17 17 9 10 10 19 21 33 30 30
30 30 35 35 35 37 36 36 42 36 36 36 36 33 33 50 50 47 43 30 23 10 9 9 9 9 12 10 10 12 10 14 22 24 24 28 35 35 35 36 53 50 43 43 43 47 47 47 47 47
47 42 42 42 42 42 47 50 48 48 21 21 10 12 10 21 25 39 39 33 36 30 36 37 41 41 42 48 51 50 50 50 51 51 51 50 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68
68 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 43 43 59 59 68 68 68 68 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59
59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 62 62
62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 68 68
68 68 62 62 68 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 52 52 52 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68
68 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 44 44 52 52 45 45 45 52
62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 59 59 39 39 47 59 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62
62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 57 68 59 59 52 52 52 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 57
57 43 59 59 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 59 57 57 44 44 43 43 54 57 52 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 59 48 57 57 57 57 57 57 68 68 59
59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 59 59 57 57 54 54 54 57 57 68 68 59 59 57 57 54 54 54 57 57 57 59 57 57 68 54 50 48 48 48 50 48 57 48 48 57 43 43 32 35
39 42 59 43 43 48 43 43 43 43 48 48 43 43 39 32 30 30 30 28 33 33 33 33 40 37 43 43 39 31 31 37 37 37 41 47 50 50 50 50 59 59 41 41 41 39 34 43 37 28
28 30 32 33 41 33 33 33 33 33 30 37 28 28 30 24 21 24 22 23 28 32 28 28 32 31 31 24 25 24 34 34 26 26 11 13 12 16 16 21 21 11 11 11 21 21 28 28 16 19
10 10 9 22 27 33 33 33 47 47 36 36 36 35 18 19 18 17 9 10 10 10 12 13 16 20 22 22 22 31 37 37 29 16 12 12 12 12 14 16 26 23 28 28 21 19 19 24 23 24
21 28 31 28 21 18 12 12 14 19 23 36 37 27 18 13 13 11 17 18 19 20 20 17 9 8 8 8 8 8 8 10 12 10 9 9 10 9 9 9 10 11 10 18 18 19 15 15 9 11
8 8 8 8 11 16 15 14 19 22 14 14 11 15 22 23 14 12 9 9 8 8 8 8 11 18 10 13 11 10 9 12 12 10 8 8 8 8 8 8 11 11 19 15 15 10 10 9 9 10
10 10 12 8 8 8 9 10 12 17 17 10 10 10 10 8 8 8 8 10 8 10 10 10 14 14 12 9 9 9 9 9 10 9 12 12 12 11 16 10 10 8 8 7 9 9 16 23 23 12
11 11 11 12 10 10 8 8 8 9 8 8 10 10 8 8 6 7 8 7 9 8 8 8 9 9 9 8 8 8 8 10 9 16 21 34 18 16 11 10 10 10 12 12 12 10 8 8 8 8
11 8 8 8 8 8 8 8 8 11 14 13 11 11 11 13 22 16 11 11 |