| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-123A15.T7 (MSMg01no123_a15.b1) | MSMg01-123A15.TJ (MSMg01no123_a15.g1) |
|---|
| ACC | AG332747 | AG332748 |
|---|
| length | 1,277 | 1,294 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 279 (133 - 411) | 590 (122 - 711) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no123_a15.b1 PHD_FILE: MSMg01no123_a15.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:32:12 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no123_a15.g1 PHD_FILE: MSMg01no123_a15.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:32:12 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | GAGAACATNNNNGGGCACTGGGCGCTATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XCGCGGAATTCCCCCATCAGGAGAAGACCCTTTTATGTTAGAGGTCCTGC
ACTCTCCACAGAAGATTCCCCCCTTCAACTCCATTTTTGATTATTAAATC
TAAGTCCATTAAGTAACTTCTGTCTAACCCTCTGTATATTTTCACTAGTT
TCTAAATGATTTATAATGCATGACATAATTTAAGGTCATACCAAAAACGT
ACTTATAATGATTTTCATGGGTTGTAATGACAGGAAAAATAGCCTGTACA
TGATCAGCAAAAATGCAATTTTTTTTTTTACAAATTATTATCAATTCATG
AATAGTTTCATCTGTAGGAGCAGAATGCACAGACACAGAGGCAGGGTTCA
CAGCAAAGAAGGATTGTTGCCTTGCTCGGAGCTCTGCTAAGATGTCCTTG
GATAGCTATCTCCCTTTTAATATCCCCCACAAAAGACCTCAGAAAGTAAA
CAGACTCACAAGCCCGGGAGCCTCTGAAACGTAGAAGATTCATATTTAAC
CAATGTTGCCGGTGAAGATGCTGTCTACCTTCAAGGCTGCTGCATGCTCT
TCAGGGAGCTCCAGAAACACGTGTACAAGAGCCATTGCTGTGCAGGGTGG
CTCCTTAGCAATGCAGCTGACTTGGAGTCACCTGTGATCCTGTAAGTACA
TACCACCTCACATAACCACAACAAACTCACTTGATTCACCAAGCTAGACA
AGGGGAAACTGGCTGCTTCAGTCTGTTGTCCATGTCCTCTCTGGGATAAA
TGTACCTTGTTCATTGACCTCTCTAGAAGAATCCTACCACAGATACTCCA
TATCAAAAGCTTTATCCAAGTCAAGTGTATTCCCCATGAATATCTCAACC
ATGTATATATGAATCTAATTGCGTATATGTGTATTATGGCGTTATGTTTC
CCTTTTAATTTTATTTCTTATTTCTTTTTCCTCTTTTTCATTTATCTTAT
ATTTTTTTTTTTTTGCCCTTATATTTTTATTTTTTTTTCACTTTCTGTTT
TTCCTTCTTTTTTTCGTCTTTTTCTCTTTTCTTTTTGTTATCTTTCTTTC
TTTCTTTTTCTTTTTACTTTTTTTTCCTTTTCTTCTCTTAATCATTCTTT
ACCTTTTTCTCCTTCTCTTCTGAACTTATCAATTCCTTTTTTCTCTCTGC
ATACTCGCTCTCTACTAAGTATCACACTATCTTCCTCCTTTAATCATTTC
TATTATTGTATNCTTATCTTCTCTTTT
| NNTTTCTCAGTGGAGCCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTCAAGGTTCATTCTGGCTTGATTTTTTTCC
CTTGTTCTCTGACTCAGCTATATGAGATCTTTAGCAGTAGGAACTTACAG
TTAAGTTCTAGAAGGCAATTAATAGCATGGACAATAGGCTGTAATGTTTG
GGAATCTAGAGACTACACTGTCCAAAAACTCAAAAAAGGGATTACATATT
CCTGTTATTGGACTTTTTATTTTCTTGCTTGTTATGTATAGTAGGTTTTA
TTTCTTTTTCTATTTGTTTATATATGTGTGCATATATGCGTTTATATGAG
TCATATGCATTTAAGTGCCAGAGAGGTCACAAGAAGTTGTTGGACCCTCT
GTTACTGGAGTTATGGGTGATTGTGGTCTTCCTGATGGTGCTGGGAATGG
AACTCAGGTCCTACACAGGACCAGCATGCACTTTGATGCGCTGATCCATT
TCTCCAGTCCTGTTGGATGTAGTTCTAAGTTTAACTTATACGTTTTAGGC
CCTACTCCTCATAGGCAGAGTGTGAGCTGTCAGAATATCTGATTCAGAGT
TCTGTGCATTTATCAAACAAAAGTGAAAATTTCTTTTGAAGGTTACTTAA
TTTTCTCTTTCTCCTCCGGCTCCTCCTCTTCTTTCCCATTAAAGAAATGC
TATTTGTTTAGAACTCTTTTAAAATTCTGTACTTCTATTGGGTGGATTAC
TTTGAACTCCGTACTTCCCATTTTGAACGGAAGCTGAGCACCCCGTAATC
CACTCCCTCCACCGCCTTCTCTCACAGTGTCCCCCCCACCTCTTCTTCTC
TCTCTTCTTCTCTCTTCTCCTTTCTCTCTCTCCCCCCTTTCTCTTCTTCC
TCTTTCTCTCTTCTTCTCTTACCTCTTTCCCTTCTTCTCCCCTTTTCCCC
CTCCCTTTTTTCTTCTTTTCCTCTCCTTCCTTTTCTTCTTTTTTTTCTTT
TCTCATTCCTTTCTTTCCTCCCTCCCTTCTCTTTCCCTACACCCTCTCTC
TGTCTTGCCTCCCATCTCTTCTCTTCTCTCTCTTTCTCTTTCTTCCTTCA
TCTGCTTCTCCTTTCCCTCTCCTCTCTGTCCTCTTCTCACCGATCATTCT
TCTTCTCGTCCTTTCTGTTCTCCCTCTTTTCTCCCACATCTCCTGCTCTC
CTCCATCTATCCTATCTCTCCTCCTTCATACTTACATCTACTCCCTCTCC
TCTCTCTTTCTTACACTCCTAATCCTTTCTTCCTCTCGTCTTCT
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 6 9 10 3 0 0 0 0 3 9 9 9 9 7 7 8 8 8 11 10 8 8 8 8 8 8 13 15 18 20 18 17 17 18 18 21 24 35 35 28 30 33 36 36 37 48
48 48 42 42 43 43 50 47 42 53 53 50 57 53 50 50 47 53 33 31 31 30 28 25 21 12 9 9 9 10 17 10 13 11 10 10 10 14 16 10 13 13 27 30 47 39 39 39 44 44
53 57 57 57 53 53 50 57 36 36 33 33 39 37 37 37 25 25 15 12 6 6 6 6 6 8 13 11 11 13 21 18 20 22 30 33 44 48 59 47 53 53 53 53 53 53 53 43 47 47
47 47 47 43 43 43 39 39 39 43 43 48 68 68 68 68 68 68 57 54 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 57 50 47 47 47 50 50 57
57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 68 68 68 68 68 57 59 57 57 54 57 54 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 59 57 57 59 59 57 57 54 57 57 52 52 52 57 57 57
57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 68 59 59 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57
59 59 59 59 59 57 57 54 54 54 57 59 59 59 57 57 59 54 57 59 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 43 43 42 44 44 54 59 59 54 54 54 59
59 59 57 48 48 48 59 59 48 48 48 59 59 57 54 48 48 48 48 43 46 43 48 48 59 59 48 48 43 43 43 37 37 35 39 39 43 43 48 48 48 48 46 46 43 43 39 39 39 43
43 43 39 39 35 35 34 30 18 12 10 8 8 10 8 8 11 13 10 19 24 32 59 59 48 47 39 37 30 30 30 30 39 59 57 57 57 40 40 25 25 25 40 40 43 48 57 57 57 48
48 50 53 37 37 37 37 37 34 40 32 23 15 11 11 12 15 12 11 12 11 15 10 9 9 11 11 10 10 9 12 12 25 25 30 30 30 33 28 19 13 13 15 25 15 20 28 31 20 20
26 15 15 12 12 12 15 13 13 18 25 20 20 23 30 30 34 39 39 39 37 48 48 48 48 43 43 43 43 43 28 28 14 12 23 15 15 20 34 32 43 43 43 59 59 59 57 54 48 54
54 48 48 48 48 48 54 48 43 43 43 43 43 39 44 37 39 35 42 42 47 43 44 44 48 47 47 48 48 42 44 35 37 42 42 47 42 42 42 42 43 44 43 46 44 39 39 35 42 42
40 32 32 32 28 23 25 28 28 35 40 37 37 37 37 37 37 28 28 28 28 32 37 36 36 23 23 23 23 28 23 23 32 37 44 48 43 43 43 40 34 19 19 18 24 24 32 39 39 35
35 39 40 43 34 25 21 11 11 18 23 32 34 28 23 23 23 28 34 37 37 25 29 12 12 12 18 18 24 24 28 34 32 23 18 23 24 19 22 22 31 33 33 24 25 26 12 13 13 34
28 28 26 25 25 19 22 18 12 12 13 24 29 36 19 19 17 26 24 30 14 13 13 24 24 30 28 22 22 28 32 29 32 35 23 25 12 12 12 15 12 19 12 13 13 15 10 11 13 18
17 19 17 11 11 11 18 11 13 13 24 28 39 39 30 25 21 13 13 11 16 11 13 13 12 10 10 8 11 19 11 13 12 8 8 8 8 8 15 10 16 16 12 10 10 10 16 11 19 23
21 19 14 14 11 11 10 19 12 12 11 11 11 15 10 10 9 8 8 6 6 6 6 8 8 12 11 10 10 8 10 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 9 12 8 8 8 11 8 8 8
6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 15 21 13 13 9 10 10 12 10 10 10 12 12 10 10 10 11 11 9 9 10 10 8 8 8 8 10 10 9 9 9 9 9 9 10 10 10 10 12 11
10 8 8 8 8 8 6 9 10 11 10 9 9 11 8 8 9 8 8 10 8 8 8 8 10 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 8 8 9 9 10 10 10 9 9 9
9 12 10 8 10 8 8 8 8 8 10 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 10 10 16 10 8 10 11 11 8 8 8 8 8 8 15 8 8 9 9 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8
6 10 10 13 12 15 14 15 15 15 22 17 15 9 6 8 8 8 8 8 8 8 6 8 12 12 12 7 7 6 10 8 10 10 10 10 9 7 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 10 8
8 6 6 8 8 8 6 9 11 11 13 13 8 6 6 6 6 7 10 8 8 8 8 10 8 9 11 10 10 9 9 10 8 13 9 9 9 9 10 10 9 9 10 10 6 6 8 6 8 10
8 8 9 11 11 10 18 12 8 8 8 12 8 13 9 9 9 10 14 12 15 10 8 8 6 6 8 10 12 10 10 16 14 10 8 7 6 8 6 6 8 8 7 7 9 10 10 10 9 8
8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 8 8 8 7 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 9 9 8 8 8 6 6 6 6 9 12 9 9 9
8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 8 6 10 11 12 11 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8
6 7 8 10 10 10 8 8 10 13 3 0 3 6 6 6 6 6 10 12 14 12 11 12 10 10 9 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 9 9 6 6 6 7 6 8 10 9 9 6 6 8 7 11 13 13 8 8 8 3 0 3 17 19 22 8 9 10 23 21 29 22 28 33 38 36 36 50 50 37 37 37
36 36 36 36 57 53 47 44 44 37 37 37 37 23 23 11 12 12 12 12 11 12 12 12 18 9 9 9 9 10 10 22 31 28 50 50 31 36 36 36 36 38 59 59 59 53 53 53 33 33
33 33 33 33 21 21 9 9 9 9 9 9 12 15 20 20 16 10 12 12 10 12 19 30 41 57 57 57 57 47 47 47 43 48 37 42 37 43 43 43 48 57 48 43 43 43 42 33 30 30
30 30 42 42 48 54 54 48 48 48 57 57 68 68 57 57 54 41 41 48 41 42 42 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 50 44
37 35 35 43 44 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 52 50 50 47 52 52 57 57 57 57 57 52 52 52 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 57
68 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 52 34 34 19 19 27 43 44 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 43 39 39 44 44 62 62 62 62 62 62 52
52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 62 28 30 14
12 11 13 11 12 18 28 28 52 52 52 57 57 59 59 57 57 52 57 57 52 52 52 43 57 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 59 59 44 43 33 33 43 43 43 43
38 29 29 32 23 17 23 23 27 27 28 24 24 11 16 18 43 43 52 52 52 52 43 52 52 57 57 57 52 43 43 50 50 52 57 50 50 46 37 43 43 44 50 48 57 57 54 54 57 57
46 54 46 47 42 42 42 33 33 42 44 42 48 48 48 48 44 57 42 42 35 35 32 32 31 28 28 36 36 43 26 27 13 15 15 34 32 57 54 54 54 54 54 57 57 47 39 32 32 39
39 48 57 57 57 43 43 32 32 23 28 28 32 32 28 28 28 33 32 32 23 23 23 32 32 20 20 31 28 23 12 11 11 12 20 24 37 37 36 37 37 43 39 28 26 14 18 18 34 34
43 47 47 43 39 39 35 35 35 30 28 19 16 12 12 21 19 25 25 30 30 32 32 32 39 30 30 30 32 28 36 30 39 37 39 39 46 43 48 43 41 34 42 34 34 36 34 42 36 39
39 27 27 20 23 23 37 37 46 48 48 48 46 48 33 33 33 33 25 25 28 34 34 35 31 36 37 39 41 41 37 31 31 31 29 29 28 32 28 34 23 22 22 32 34 28 28 20 28 23
37 37 43 39 39 22 22 19 23 16 13 10 19 15 23 17 12 12 9 11 11 13 15 15 15 24 24 21 19 11 11 11 18 18 20 29 19 19 19 12 15 14 14 13 10 12 15 12 15 16
29 34 32 23 20 16 13 13 8 8 8 8 10 19 15 15 13 11 11 10 10 9 9 10 13 13 10 10 11 10 10 9 9 9 12 13 10 11 10 16 12 14 12 9 10 10 8 8 10 8
8 8 8 11 16 11 12 10 13 10 11 11 11 11 11 18 19 12 8 8 6 6 8 8 8 10 16 18 11 11 10 12 15 10 12 9 10 9 9 9 9 8 10 19 20 21 21 22 22 22
33 33 33 15 15 8 8 12 8 17 8 9 8 8 8 8 8 11 15 9 8 8 8 15 12 12 11 11 10 19 19 10 10 8 10 9 9 13 15 11 9 9 9 12 12 8 8 8 8 9
9 10 10 13 13 10 10 9 9 12 16 24 24 23 21 13 13 10 8 8 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 12 12 10
9 9 9 8 8 10 9 10 9 11 12 11 13 11 11 10 8 8 8 8 10 6 7 10 8 8 8 6 6 8 8 8 10 10 11 10 10 9 8 8 8 8 8 8 10 11 11 11 12 12
9 9 8 8 8 8 8 8 9 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 11 8 8 8 8 13 10 10 8 8 6 6 8 8 10 12 12 10 11 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 11
10 10 11 8 8 8 8 10 10 10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 10 8 8 10 10 10 15 13 11 8 8 6 6 8 8 9 9 9 15 11 11 11 9 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 9 12 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 12 11 11 10 10 8 8 8 7 9 9 9 9 8 13 10
10 9 7 10 8 8 8 8 8 8 11 8 8 6 7 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 7 6 8 6 6 6 6 8 12 17 11 11 9 8 8 8 8 8 8
7 6 8 8 8 6 7 8 9 7 8 8 9 9 11 10 10 9 10 12 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 10 19 15 8 6
6 15 8 8 8 8 8 6 8 7 7 6 6 8 8 8 11 12 12 9 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 6 6 8 6 6 6 8 10 11 10 8 6 |
|---|
