| Query= MSMg01no193_j10.g1 MSMg01no193_j10.g1 CHROMAT_FILE:
MSMg01no193_j10.g1 PHD_FILE: MSMg01no193_j10.g1.phd.1 CHEM: term DYE:
big TIME: Tue May 17 20:12:06 2005
(202 letters)
>mm_chr16_53299723_53300324
Length = 602
Score = 344 bits (178), Expect = 2e-99
Identities = 181/182 (99%)
Strand = Plus / Plus
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Sbjct: 201 tgtgcagatatgaaaagaaaatttaataaaacaactgggatgaaactgcagtatgataga 260
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Sbjct: 261 gttatgaaatttacacttatgtttcaattaccaaaaacaatatgtctgcttttaggagat 320
Query: 121 gaaaatagtattaattccaaaatattatatatatatatatatatatatatatatatatat 180
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Sbjct: 321 gaaaatagtattaactccaaaatattatatatatatatatatatatatatatatatatat 380
Query: 181 at 182
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Sbjct: 381 at 382
Score = 74.2 bits (38), Expect = 5e-18
Identities = 41/42 (97%), Gaps = 1/42 (2%)
Strand = Plus / Minus
Query: 142 atat-tatatatatatatatatatatatatatatatatatat 182
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Sbjct: 388 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 347
Score = 74.2 bits (38), Expect = 5e-18
Identities = 41/42 (97%), Gaps = 1/42 (2%)
Strand = Plus / Minus
Query: 142 atat-tatatatatatatatatatatatatatatatatatat 182
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 394 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 353
Score = 72.3 bits (37), Expect = 2e-17
Identities = 40/41 (97%), Gaps = 1/41 (2%)
Strand = Plus / Minus
Query: 142 atat-tatatatatatatatatatatatatatatatatata 181
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 386 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 346
Score = 64.5 bits (33), Expect = 4e-15
Identities = 39/41 (95%), Gaps = 2/41 (4%)
Strand = Plus / Minus
Query: 142 atat-tatatatatatatatatatatatatatatat-atat 180
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 382 atatatatatatatatatatatatatatatatatataatat 342
Score = 64.5 bits (33), Expect = 4e-15
Identities = 33/33 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 149 atatatatatatatatatatatatatatatata 181
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Sbjct: 476 atatatatatatatatatatatatatatatata 444
Score = 64.5 bits (33), Expect = 4e-15
Identities = 33/33 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 147 atatatatatatatatatatatatatatatata 179
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 476 atatatatatatatatatatatatatatatata 444
Score = 62.6 bits (32), Expect = 2e-14
Identities = 32/32 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 146 tatatatatatatatatatatatatatatata 177
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Sbjct: 475 tatatatatatatatatatatatatatatata 444
Score = 62.6 bits (32), Expect = 2e-14
Identities = 32/32 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 151 atatatatatatatatatatatatatatatat 182
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 476 atatatatatatatatatatatatatatatat 445
Score = 60.7 bits (31), Expect = 6e-14
Identities = 40/45 (88%), Gaps = 5/45 (11%)
Strand = Plus / Minus
Query: 142 atat-tatatatatatatatatatatatatata----tatatata 181
|||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 476 atatatatatatatatatatatatatatatatacacatatatata 432
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.34 0.600 1.10
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 2, Extension: 1
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Number of successful extensions: 46
Number of sequences better than 10.0: 1
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Effective search space: 115236
Effective search space used: 115236
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X3: 517 (999.5 bits)
S1: 7 (14.4 bits)
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