BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-305H19.T7 (MSMg01no305_h19.b1) | MSMg01-305H19.TJ (MSMg01no305_h19.g1) |
ACC | AG430442 | AG430443 |
length | 1,311 | 1,303 |
length of high quality (start - end) | 429 (29 - 457) | 381 (71 - 451) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_h19.b1 PHD_FILE: MSMg01no305_h19.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:45:29 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_h19.g1 PHD_FILE: MSMg01no305_h19.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:45:29 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NNGGGATCAGTGGCGCTATAGACTACTATAGGGAGAGGATCCGCGGAATT
CATCTGTGATCTCTTTACTTCCCTGAATATCCTGCCACTCTACCCTATCA
CCAAAAAGAATAGTTGATGATCTTGTCCTTTGTAAATTGTTCTGGCTATC
CTCTAATGGACAGTTGTCTGATTACACTAAAGAGCTAGTCAAAGAGTTGA
GAGAATACTGGGGTTGCTATATTCATCCCAATGAAAAAGGTGTCCAGGGT
AGGAAAAGATGGCCCATGTGCAGAATGATCCCTGGGAGCATACAGAAGAA
ATCACATTTTCCCATACCAGATGTCAAACCTCTCACAACTATGCAAGGCC
ACAGTGACAGAGGCCAAAAGAAAAGTCTTAAAGGGATGGACAAGGGATAT
TATATGCTTCTGAAAGAAACTTGCTTATTTTTACAAAGGCACACACCACC
TTTCATTTTTTTACCCCCCCCGGATCTGCCTCATTCTAACACTCTAAAAG
AAGAATACACCTTTTTATTTTTCTGAACTCCACTAAGTATCCTTTCATGT
TGATTTTCTTTCTTCCTTTCTTTCCCCCAAATTATCTCATTATCTCATTC
TGTCTTGGTCAGAAATGTCAGACAACACAATGAAGTATGAAACTAGACCT
ATGAAATTAATTATTTTCTCTCATCTTCCTCTTGTAGTCCCTTTCCTTCT
CTGATGTAGATGAAGGGAATATATTTTGCTGGCTGCTCTAATTCTTCTCA
ATAAGATTGTGTTACTCTTTCTAACACTCTACTAGAAAAATACACCTTTT
TATTTTTCTGAACTCCACTAAGTATCCTTTCATGTTGATTTTCTTTCTTC
CTTTCTTTCCCCCAAATTATCTCATTATCTCATTCTGTCTTGGTCAGAAA
TGTCAGACAACACAATGAAGTATGAAACTAGACCTATGAAATTAATTATT
TTCTCTCATCTTCCTCTTGGAGTCCCTTTCCTTCTCTGATGTAGATGAAG
GNAAAATATTTTGCTGGCTGCTCCAATTCTTCTTCAAAAGATTGGGTTTC
CCCTTACAACCCAAAATGGTTGGAACCATTTTGCCCGCTTCTTGGAAAAA
TTGTCTGTGCAAAACAAATCCAGGAATTGTTGGGCCCGCTTGGAGAATTT
CTTGTTTTCGTAACCAGTGATGGAATAAAGAGATAATTTTAAATCACGGG
AGGGGGGTATATTAATCTTGAAGGGGCTTATACCTCGGGATCTTTATGAG
AAACACCACCCCGAATCCTGTTTAAATAAAAAATATTTTTTTTCTTCCTG
GGGTCGTGTTT
| NNGGGCGTGAAGTGAGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTCTTCAGAGACTTGAAGTTCTTTTCATA
TAGACCTTTCACCTGCTTGGTTAGAGTCACACCAAGTTACACAATATTAT
TTGTGGCTATGGTGAAGGTTGGCATCTCCCTAATTTCTTTCTCAACCTAG
TTATTCCTTGAGTAGAGGAAAGCCAGTGATTTGGTTGAGTTAGTTTTATA
TCTAGCCACTTTTCTGACATTGTTTATCAGCTTTAGGAGTTCTCTGGGGA
AATTTTTGGAGCCACTTATGTATACAATCATATCATCGGCAAGTAGTGAT
ATTTTGACTTCTTCCTTTTCAATTTGTATCAGTTTGACTTCCTTTTGATG
TTTAATTGCCCTAGCAAGATCTAAAATTACTATGCTGAATAGATAGGGAT
TTTTTTTTCCCCCCCCCCTAGNCTTTGATTTTACTGAAAAAAAAAAGAGT
TCTCTCCATACAGTTTGATGTTTGATCCTGGCTTGCTGTATACTACTTTT
ACGATGTTTAGGTATGAATGGGCCTTGAATTCCTGATATTTCCAAGACTT
TTGAAGGGATGCTGAATTTTGTCAAATGCTTTTTTAGCATGTAATGAATG
ATCACGTAGTTTTTTTTTCTTTGCATTTGTTTATGTAGTGTATTACATTG
ATTGATTTCTGTATATTGAACCATCCCTGCATCCCTTGGATGAAGCCTAC
TTGATCATGATGGACGATCATTTTGATGTGTTCTTGGATACAGTTTGCAA
GAATTTTTTTTATATTATTATTAGGNATTTTCCTCATTTACATTTCCAAT
GCTACCCCAAAAGTCCCCCATACCCTCCCCACGACTTCCCTACCCACCCA
CTCCCACGGTTTGGGCATGGCGTTCCCCTGTACTGGGGCATATAAAGTTA
GTTTGCAAAAATTTTATTGACTATTTTTGCATTGATATTCCTAAAGAAAA
TTGGTCCGAAATTCTCTTTCTTTGGTGGGTCTTTGGGGGGCTTAGGGATA
AAAGAAATTGGGGTCTCATAAAAGGAATTGGGGAGGGAACTTTTTCGTTT
CAAATTGTGGGAAAATTTGAGAGAAATTTTTTTAAAGGGTCCAAAAACTC
TGCCAAAAACATATTAGAATGGGGGTTTTTTTTTTTTATTGTGGGAGAAA
AAATAAAGCGCTCTTCTTTTTAAAAATAGCACGGGTTAAAAGTAATATAA
ACCCTCCTCTCTCTCTCTCTTGGTGGTCAAAATGAAATTCCTCTCTTATT
ATT
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 8 6 6 7 7 8 8 13 14 14 10 10 8 8 8 12 10 11 9 12 12 16 16 24 24 42 33 33 37 33 36 42 42 42 42 51 48 68 68 51 51 51 47 51
50 50 50 43 50 50 50 50 50 68 68 68 68 51 51 51 51 50 50 68 68 68 68 68 68 50 50 50 51 50 50 68 68 68 68 50 50 51 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 51 51 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57
68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 68 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 27 32
21 15 14 14 21 28 29 43 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 53 53 59 59 59 59 59 59
29 29 12 10 10 10 15 19 10 8 8 8 8 8 9 10 12 14 23 15 10 10 10 12 25 30 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 47 34 30 21 15 12 12 9 9 9 9 9 10
15 13 13 15 18 24 28 32 41 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 59 59 59 59 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 47 47 34 41 34 59 31 59 32 32 31 32 37 37 41 41 41 50 50 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 48 48 48 48 48 48 43 43 43 43 48 48 47 48 48 46
46 37 37 25 25 12 18 18 31 31 36 47 47 47 47 43 41 37 37 41 43 41 37 37 41 43 47 39 39 41 41 30 32 18 18 18 27 27 37 41 39 37 37 35 31 35 43 44 37 37
37 32 31 34 39 43 41 39 39 28 22 20 25 24 28 25 30 30 32 28 31 35 35 37 37 34 37 37 34 36 41 34 34 28 29 22 27 25 29 29 40 40 44 39 37 37 41 37 37 41
41 41 41 44 44 36 36 31 29 29 30 22 22 22 22 24 22 31 41 43 41 39 39 35 32 36 39 39 39 39 37 37 37 37 33 33 28 34 34 24 24 20 22 27 28 15 11 10 12 11
16 27 37 33 28 34 23 28 22 31 33 36 35 39 35 35 34 31 28 30 17 22 21 14 14 14 14 19 30 25 25 31 30 35 44 44 44 44 32 32 37 31 19 14 17 14 14 19 14 20
18 16 16 28 28 28 28 27 27 27 22 20 20 19 25 18 17 11 9 9 8 8 9 16 24 26 27 23 15 15 14 13 9 9 10 10 14 17 12 12 9 12 9 10 10 17 13 17 11 11
3 0 3 15 16 15 14 14 13 23 19 20 22 22 13 11 9 8 8 8 9 9 9 10 10 14 11 10 11 8 8 8 8 9 8 9 9 12 9 9 9 13 10 12 13 9 9 9 10 10
11 11 11 11 12 12 10 10 10 9 9 9 9 8 8 9 8 8 8 9 9 11 13 11 10 10 11 12 12 18 19 8 8 8 8 8 9 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8
9 9 11 11 6 6 6 6 6 6 8 7 8 8 6 8 8 8 8 8 9 8 18 10 9 8 8 8 8 8 8 10 12 11 9 9 10 10 10 8 8 9 8 6 6 6 8 8 8 9
9 9 9 9 13 9 11 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 7 8 7 7 7 9 10 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 9 9 9 9 9 6 6 8 9 9 9 9 9 12 11
10 10 17 11 11 9 10 8 7 8 8 10 10 12 12 11 11 10 10 8 8 8 8 8 10 12 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 6 7 6 6 6 6 8 8 8 7 7 7 7
8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 7 12 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 10 22 19 17 10 9 9 9 8 8 8 9 15 8 6 6 6 7 8 6 6 6
11 18 9 9 9 9 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 9 10 17 12 8 9 8 15 11 19 19 21 8 9 10 21 21 33 36 36 36 47 36 36 50 50 37 37 37
37 42 42 42 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 46 46 46 54 57 59 57 68 68 50 48 48 39 39 39 57 57 68 50 51 50 50 48 57 39 39 42 46 47 57 57 57 57 57 57
57 47 47 47 57 57 57 57 57 54 51 51 50 50 50 50 50 50 50 51 50 50 50 50 50 50 50 50 50 68 68 59 59 57 57 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 50 50 68 68 68
57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57
57 57 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 52 52 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59
59 59 68 68 68 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 48 48 57 57 57 57 57 59 68 59 59 59 59 59 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 48 50 50 53 50 50 59 59 59 59 41 47 24 26 13 14
13 14 13 21 21 34 41 59 59 59 59 59 48 59 59 57 50 50 50 50 50 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 53 50 50 50 50 47 33 22 8 8 7
7 8 15 18 22 20 18 22 22 22 25 25 29 29 24 13 13 11 11 11 3 0 3 29 27 39 34 34 28 23 19 10 8 8 8 8 11 10 10 11 14 17 13 8 8 8 8 8 8 9
13 26 34 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 59 68 59 59 57 59 59 59 59 68 68 68 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59
59 54 54 54 59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 59 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 59
57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 57 57 57 57 57 68 68
57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 54 54 59 59 54 59 59 59 57 57 54 54 54 54 54 54 48 43 43 30 30 30 42 42 48 57 59 57 57 48 57 57
57 48 48 48 48 48 48 48 47 47 46 59 46 40 39 39 39 39 39 34 34 34 39 41 59 59 47 47 40 59 47 41 47 47 59 37 37 25 32 34 41 41 37 37 41 32 34 40 41 41
41 46 46 46 46 46 46 41 41 41 41 37 37 41 41 41 41 41 41 39 39 39 37 37 39 37 37 30 32 30 28 24 34 25 31 22 23 22 23 23 32 32 39 36 31 41 41 39 39 36
32 25 25 25 25 31 37 37 37 25 25 19 19 20 32 32 39 37 37 35 28 28 23 19 3 0 3 19 19 37 32 32 31 35 28 32 37 25 25 21 16 16 23 21 24 31 27 27 22 22
22 32 24 19 15 14 12 11 18 24 22 20 30 30 32 27 37 26 26 24 22 22 22 22 25 27 22 23 16 16 11 16 16 9 9 8 8 8 8 13 17 20 24 17 16 18 17 16 20 22
22 16 13 10 12 10 9 9 10 17 8 16 11 8 11 8 10 10 10 13 15 19 9 10 9 9 9 10 14 10 10 10 13 10 8 8 8 9 13 11 13 13 10 8 8 8 12 8 8 8
10 8 10 17 18 17 12 8 8 8 8 8 8 9 9 12 15 13 13 10 10 10 12 17 20 23 20 18 28 19 17 9 9 10 9 9 9 10 11 10 10 10 10 10 10 10 16 15 16 20
8 7 6 6 6 6 8 11 16 22 12 15 10 10 10 10 12 12 11 11 8 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 12 15 17 14 14 13 8 10 8 8 8 11 11 9 8 8 8 8 8
8 15 9 9 9 9 10 10 14 15 15 12 8 8 6 6 6 6 9 9 10 17 10 10 10 10 11 11 11 12 17 17 16 11 12 12 12 9 9 18 12 13 8 8 7 7 11 9 9 10
10 15 12 12 12 12 11 11 11 11 11 10 21 17 11 12 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 15 15 20 24 17 16 15 11 10 10 9 9 9 9 13 15 18 17 10 8 10 8 8
8 10 9 12 12 14 12 8 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 10 10 14 13 19 21 17 10 14 9 8 8 8 8 17 9 6 8 6 9 9 9 9 10 10 10 9 7 7 7 8 8
13 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 11 11 8 8 8 11 13 8 6 6 8 10 10 13 10 8 8 8 8 6 6 6 6 8 10 9 10 8 8 6 6 8 6 6 8 8 10 10
8 8 8 8 8 8 6 9 11 6 8 8 8 9 9 9 8 8 6 6 8 6 6 6 8 8 8 8 12 22 18 8 8 6 6 8 8 12 11 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8
8 10 8 |