BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-305L13.T7 (MSMg01no305_l13.b1) | MSMg01-305L13.TJ (MSMg01no305_l13.g1) |
ACC | AG430597 | AG430598 |
length | 1,317 | 1,312 |
length of high quality (start - end) | 267 (505 - 771) | 327 (75 - 401) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_l13.b1 PHD_FILE: MSMg01no305_l13.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:46:01 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_l13.g1 PHD_FILE: MSMg01no305_l13.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:46:01 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NNGGCGTCATTGGCGCTATAGACTCCTATGGGAGAGGATCCGCGGAATTC
CCAGGCCCTTACATGTCTGACAAGTTGTTCTGAGAACCAGTTGAAATGGT
ATATGTGACATCACTCAAAATCTCAGTGCATATCATTGAACATAAGGAAT
AGCTGAGAAGATTTGAGGTTATTTAGCCAGAAAATGAGAACAATCAAATG
AACAGACTCAATGTCATCAAATACTTCAAGACTGAACCACAGAAATGGTT
CTGGATAATCAGCACAAATGTTTGTGCACACACACACACACACACACAGA
CACACACACATACACACACAGAGAGAGCAGGAGAGCAAGAGAGAGGGGAG
AGAGAGAGAGAGAGCTGCATACATGACCAGCAGCTGTTATGAATGACAAT
TTTTTTAACTTCAGTCTCACTAAAAAATATTTCTAGTAAACCTTTTGGAA
GCTTTTTTTTTCCCCCCCCCCAAACATCCAGGCATGACTTAAAAGAAAAA
GGGCGGGTGAGGCTAAGGAGAAAGTTCATGTATTAAGTTGGCAACTGAGC
CATGGGAGCTACACAGTATCTTCCAAAGTAAAAAAATCTGGTATATGAAA
CATGTAGAGTATTTATATTTTCAATTCTTTCTCCTTAAATATTGAAAGTA
CCTTGAGTCTGTTTTCACAGCACTACGAGTTCTTCTCACAAGGGCAACAA
CCTGAACCTTTCATCGCCTCTGCTTCAGGGAGAAAGTAACAAAGCAGACG
AAACAGCAGTGAGCATGGCAAATTAATCAATCTGAGTGAACAGCCATGCT
GCAGGAAGAGGTACGAAAGACACAGAGAGGATCAGCACTATGCCTACACA
AAATAAATCCTGCACACAATAAAGAAACATGTCATGTGATTTGTGTTTAA
CCAAATTCACAGGATCTATGATGCTAGGGTCTTCATATTGAGCTCTGAGT
CTGTAAACTTACCCAATTAAAAATGATTATCAGGGTAACTTATTGCATCC
TTGAAAAACTGTGGAACACTTATGGTAGTAAACTCCTGTAAGCCTAGTTG
ACCCCCCCACCATGCCTTTGGATTTTTTCCCGACAGGTTCCAAAAATGGT
TTAAATTGCCCCCCGGGAATGCCCCAAAATTTTCTCTGACTCTCAAATTT
TTTTCTTCAAAACACCTGGTGGGGGGTGAAAGGGGTATAATAAAAAAGGC
TTTCTAAATATTGTACCCCCACCTGTCTTTAGAACAGAATAATTAACCTT
TTTTCCTCCACCGGGCTCCTAACTAAGGAGAATTTTGTAAACCGTGGGTT
CTCAAAGAACATAGTAA
| NNNGGATTTCACGTGAGGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCATCCTTAACCAAGAAGTTATTTGTC
ATTGATACTTACTTGATATCAATGTTTAGTATTTATCAATGGAGTGTCAC
TGGGTGTATCAACCACACTTTGGGGAAGACCTCATGTCTAGGAGTACAAA
ATGCAATCTATGCTTTTTGTGGGCTTTTTGTTTTGTTTACTTGTTGTTGT
TTGTCTTATTGTACTGGAGGAATGAACGTCAATTAGAGAATGCCTCCATA
AGAAGGGCTGTAGACAAGTCTGTAGGGCATTCTCTTTTTTTTTTTTTTTT
CATTTTTTATTAGGTATTTAACTCATTTACATTTCCAATGCTATACCAAA
ATTTTTCTTTATCCACCCACCCCCACTCCCCTGCCCACCCATTCCCCCTT
TTTGTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCGGGGGNATATAAATTTTGAAAGAAAA
AGGGGGCTCTCTTTCCAGTGATGGCCGACTAGGCCATCTTTTGATATATA
TGCAGCTAGAGTCAAGAGCTCCGGGGTACTGGTTAGCTCATAATGTTGTT
CCACCTATAGGGTTGCAAATCCCTTTAGCTCCTTGGCTACTTTCTCTAGC
TCCTCCATTGGGAGCCCTATGATCCATCCATTAGCTGACTGTGAGCATCC
ACTTCTGTGTTTGCTGGGCCCCGGCATAGTCTCACAAGAGACAGTTACAT
CTGCGTCCTTTCAATAAAATCTTGCTAGTGTATGCAATGGTGTCAGCGTT
TGGATGCTGATTATGGGGTGGATCCCTGAATATGGCACTCTCTAAATGGT
CCATCCTTTCATCTCATTCTCAATCTCCGTCTTTGGTACTCTTTCAATGG
GGGTTTTGTTCCAAATCTAAGGAGGGGCTAAATGCCCACTTTCAGTTCTT
CTTCTTCTTGAGTTTCATGTGTTTACCAAATAAATTTTAATCTTGGCGAT
CCTAGATTTGGGCCTTAATTCCCCCTTATCATGGAAATACTTTGTGGGAT
TTTCTTTGGGAAGGGATTACCTCCCCCTAATTGTGCCCTCCAGGTCACTT
TTTTTGATAGATAATTCAGGTGATTTCTTAATAATTTATTTGAGAAGGTC
TAACCATTTATGGTAGGATCATCCTGACTAGGTCTATTTTGTATTTTAAA
AATATCGAATAGACTTATGTATATGTCGATTATTACTTCTTAATCTCTTT
TTTATTTTCCCAGTACTCCACTATTATATTCTTTATTTTTCTATTAATAT
TTCTATAAATTA
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 10 9 8 8 8 8 8 11 12 13 10 8 8 8 8 8 12 9 8 8 10 8 8 8 22 19 19 24 19 22 28 33 33 33 33 37 39 39 32 28 28 25 22 13
15 12 17 17 22 30 34 33 43 39 39 42 34 34 37 34 34 37 43 39 39 32 36 36 36 36 36 43 43 50 53 50 48 43 42 42 32 21 13 16 16 16 22 23 31 36 39 37 37 37
44 44 48 42 37 30 30 37 37 42 47 50 48 48 43 39 37 37 44 48 35 57 39 37 35 42 42 47 46 57 57 57 50 50 57 47 57 57 50 50 50 57 57 52 52 52 52 57 57 57
50 41 41 43 43 32 33 29 41 41 41 43 59 59 57 57 52 52 52 57 57 57 43 43 32 32 38 32 21 14 14 14 21 32 38 43 35 35 35 44 44 52 52 57 57 57 52 57 57 57
57 59 59 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 59 59 57 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 57 59 68 59 59 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 54 52 52 52 52 52 52 59 59 57 57 57 52 52 52 52 52 57 59 57
52 52 52 52 57 57 59 57 57 57 50 50 37 37 44 43 32 32 32 44 44 57 57 42 47 42 42 42 35 36 37 44 44 54 57 54 54 54 54 47 47 47 57 57 57 57 54 47 42 42
37 39 39 46 46 48 48 48 48 54 54 48 68 54 54 48 59 48 48 48 57 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 59 59 57 57 53 48 50 48 47 59 59 31 24 12 11 11
11 14 13 11 11 11 11 22 25 37 59 47 47 48 48 48 53 57 57 57 57 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 48 48 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 41 32 32
23 25 22 21 15 15 15 15 15 26 31 32 31 31 36 27 21 11 11 9 11 9 9 11 29 33 59 59 59 59 41 28 15 12 11 13 10 10 10 16 22 23 23 9 9 9 9 8 8 8
8 8 10 12 14 25 29 34 41 42 50 50 50 59 59 48 48 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 50 53 44 43 36
43 43 43 43 48 48 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 54 57 57
59 57 57 43 50 43 48 50 44 44 37 50 50 57 59 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 57 57 59 59 59 57 57 48
48 48 54 54 54 54 54 54 54 57 59 59 59 59 59 54 54 59 59 59 59 59 59 43 40 30 30 37 28 28 20 28 28 39 34 46 47 47 59 46 46 41 39 39 39 36 31 35 37 59
47 44 44 39 37 37 39 39 39 34 34 25 25 28 32 32 32 32 39 39 39 41 41 41 39 39 39 37 37 37 39 39 32 27 17 19 16 18 18 18 18 18 34 28 37 28 28 28 14 9
9 9 9 18 21 39 43 41 37 37 37 37 37 37 39 39 36 37 32 19 12 8 8 8 8 11 20 18 22 24 25 30 30 29 24 30 30 34 30 25 27 25 21 19 17 20 13 24 24 32
27 41 41 12 9 8 8 8 8 11 12 19 19 25 25 28 30 25 28 28 18 18 18 18 16 22 18 20 15 16 25 22 18 24 28 22 13 14 24 30 34 41 36 37 28 28 14 13 10 13
13 22 16 12 12 13 14 14 25 28 32 32 28 14 14 14 14 19 18 30 27 26 9 13 8 8 8 8 11 16 12 14 15 21 16 10 10 9 13 7 8 8 8 9 11 21 22 21 28 21
18 10 9 9 18 15 17 22 31 37 28 28 21 20 22 24 28 28 19 29 15 18 18 12 12 10 9 8 8 10 10 18 17 12 12 12 28 21 31 35 31 24 22 12 15 10 14 9 13 12
16 18 14 28 15 19 8 8 8 10 15 15 11 10 10 8 8 10 22 25 26 26 20 22 21 20 18 18 15 10 8 6 6 6 8 11 12 8 8 10 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8
11 11 15 11 13 15 9 9 10 9 9 9 9 9 12 15 11 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 7 7 7 8 8 9 13 9 9 11 16 12 10 9 9 10 11 11 11 13
10 10 10 17 16 11 12 10 6 6 6 6 6 6 9 9 10 10 9 9 9 9 10 13 11 11 9 12 11 12 11 10 6 6 6 6 7 13 14 14 14 14 19 19 26 24 18 12 10 9
9 9 6 8 6 6 8 8 10 15 17 21 25 22 12 10 12 8 8 8 8 11 21 24 31 35 15 14 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 11 13 9 10 15 15 18
28 23 13 6 6 6 7 8 8 8 13 8 8 8 8 8 10 12 10 8 8 10 10 10 10 9 9 8 8 8 8 10 18 18 16 13 9 6 6 7 6 7 7 19 19 12 12 8 8 8
8 8 8 11 9 10 10 10 10 6 15 6 6 8 8 11 15 12 9 9 6 8 6 6 8 8 11 12 12 8 8 6 6 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 10 11 8 8 10 9
9 14 16 10 8 8 8 10 10 8 8 8 8 10 15 12 12 8 10 10 10 8 8 8 8 8 13 8 8 6 6 8 8 8 10 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 9 8 10
8 8 8 6 6 6 6 8 8 11 11 10 10 10 9 9 9 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 7 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 13 6 6 6 6 9 9 14 7 8 8 6 8 10 11 19 23 19 17 10 10 10 22 17 19 10 16 19 37 33 36 36
36 36 36 35 35 34 36 37 57 48 57 57 57 57 57 57 57 44 35 28 27 27 37 37 31 36 32 42 42 43 50 47 54 57 57 50 47 47 48 57 40 30 27 21 19 13 18 13 21 24
32 37 43 43 40 41 57 57 57 57 57 37 37 37 42 42 47 50 57 47 50 50 54 57 50 50 38 30 24 24 24 38 43 57 52 52 46 52 52 52 52 57 57 57 52 52 52 47 47 41
50 43 35 35 35 50 50 54 57 57 57 43 43 52 59 57 57 52 57 57 57 52 57 57 43 43 29 29 28 44 44 43 38 19 16 19 19 20 38 38 52 52 57 52 43 43 35 35 35 42
47 59 59 57 57 68 68 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 52 52 52 57 59 57 52 52 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 43 52 52 52 59 57 59 59 57 57 57 59 57 57 57 52 57 52 59 41 59 57 54 54 59 59 59 59 54 41 41
20 20 20 38 41 59 59 54 54 50 59 37 37 37 50 50 54 57 57 48 57 44 59 43 43 43 57 57 57 57 57 57 57 57 59 54 54 54 59 59 59 59 59 59 59 59 59 47 32 32
30 39 44 57 44 44 30 30 30 24 24 15 30 18 26 23 41 41 43 43 47 43 43 43 43 43 43 40 37 30 30 30 37 37 39 37 37 23 28 23 34 34 48 48 46 46 47 37 28 21
11 10 10 11 13 10 12 12 18 18 24 24 34 37 46 48 48 48 48 59 57 48 47 43 40 40 40 47 34 32 20 20 15 34 28 39 39 47 30 30 17 17 17 30 30 48 59 59 59 59
27 25 11 11 11 23 24 30 23 22 15 15 10 11 11 18 21 32 27 15 9 9 9 9 9 11 29 27 3 0 3 20 23 20 12 9 9 9 12 18 12 13 12 12 7 7 7 9 9 10
14 13 15 8 8 8 8 10 14 32 37 46 59 59 59 59 59 35 28 28 32 32 30 35 32 20 21 18 15 15 14 28 28 42 39 43 43 48 59 59 47 43 43 43 37 37 30 30 30 36
32 37 36 41 26 26 30 30 37 37 43 43 37 42 28 28 25 32 23 28 41 44 34 42 42 32 24 21 24 25 32 42 25 32 23 28 23 36 36 35 33 33 28 28 31 42 42 43 43 43
43 43 37 37 39 39 43 43 39 43 37 37 35 39 29 33 25 25 25 40 40 43 43 43 30 28 14 14 14 24 34 47 37 30 22 24 24 24 19 19 28 43 30 30 30 30 30 32 23 23
23 32 32 32 28 34 34 28 32 19 18 19 19 26 29 34 32 35 35 35 35 35 33 33 39 35 32 37 28 28 19 27 12 12 12 16 23 23 24 21 25 31 31 23 27 14 18 18 16 16
14 11 13 10 10 10 13 13 20 24 21 24 14 14 13 17 17 19 30 37 34 34 22 16 11 11 13 10 10 10 13 15 19 10 8 8 8 8 8 8 11 16 18 11 11 11 24 21 35 35
37 34 23 23 18 18 12 15 18 32 32 15 14 8 8 8 8 10 15 16 22 19 15 8 8 8 10 8 8 8 8 8 15 10 17 14 15 14 14 12 14 22 12 8 8 8 10 17 20 19
17 8 8 8 12 10 15 14 14 14 24 19 19 24 22 24 30 24 19 12 13 11 15 13 22 9 9 9 8 8 8 9 9 9 12 20 12 12 12 12 18 13 11 8 8 8 8 8 8 12
8 8 10 12 12 9 15 15 15 15 20 11 12 10 10 10 12 16 9 10 10 8 7 7 8 8 9 10 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 9 17 21 9 9 9 10 11 15
12 15 19 18 19 20 15 18 13 10 19 16 16 16 16 19 19 22 25 22 10 10 12 10 10 10 9 9 9 8 8 10 12 10 10 10 10 11 11 9 9 13 14 11 6 8 6 6 6 6
8 8 10 8 12 12 14 16 14 12 9 9 9 12 9 8 8 8 8 8 8 11 10 10 11 9 9 9 9 9 11 10 8 8 8 8 8 8 11 11 11 11 9 12 10 10 6 6 6 6
8 12 11 10 8 8 8 10 13 20 22 13 12 10 11 11 11 12 15 14 12 10 10 8 8 8 8 9 9 11 11 11 11 12 9 9 8 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 9 13 21
18 17 17 17 17 16 12 10 10 10 9 9 11 8 8 8 8 8 8 10 10 11 13 13 12 9 9 9 9 9 11 11 11 10 11 11 10 13 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10
10 10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 12 8 7 6 8 8 11 11 8 8 6 6 8 12 8 8 8 6 6 8 7 6 10 9 11 16 12 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6
6 8 8 10 8 8 8 18 10 10 8 8 8 8 12 12 11 8 8 6 6 8 6 9 9 9 9 10 10 8 9 9 9 9 8 10 10 11 9 8 10 8 10 14 19 19 21 13 13 8
9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 12 10 10 8 8 8 8 8 8 11
12 15 14 9 9 9 9 12 11 10 10 9 13 9 10 9 13 12 10 13 11 11 11 8 10 6 7 10 8 10 9 9 9 8 8 6 8 10 10 8 8 8 8 9 9 8 8 6 6 8
8 9 9 8 8 8 8 8 12 8 8 8 |