| Query= MSMg01no405_l04.g1 MSMg01no405_l04.g1 CHROMAT_FILE:
MSMg01no405_l04.g1 PHD_FILE: MSMg01no405_l04.g1.phd.1 CHEM: term DYE:
big TIME: Wed May 18 18:20:45 2005
(445 letters)
>mm_chr16_81775405_81776249
Length = 845
Score = 806 bits (417), Expect = 0.0
Identities = 442/457 (96%), Gaps = 14/457 (3%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 tttaaaagaaataataaaaggaaatgttttattttggtaaatgtttagtctaaataattg 62
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 203 tttaaaagaaataataaaaggaaatgttttattttggtaaatgtttagtctaaataattg 262
Query: 63 tttgcttctctttattttataagaaatactacaacaattctgctctatacctgcaaagga 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 263 tttgcttctctttattttataagaaatactacaacaattctgctctatacctgcaaagga 322
Query: 123 gaagtgagtaagtctaacaaccagttgaaaatttagtattaaggaatttttagcacaaga 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 323 gaagtgagtaagtctaacaaccagttgaaaatttagtattaaggaatttttagcacaaga 382
Query: 183 atattttttatatctggaatctctaagagtctcttaatgtcaatcagacatatatatgtg 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 383 atattttttatatctggaatctctaagagtctcttaatgtcaatcagacatatatatgtg 442
Query: 243 tgattgtacacatttttatgtggtacatttactagaaatttaataaaacaaatgaatata 302
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 443 tgattgtacacatttttatgtggtatatttactagaaatttaataaaacaaatgaatata 502
Query: 303 tatataatatttgttaaaatacataataaaaaacttgttaactctgaactattgataatg 362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 503 tatataatatttgttaaaatacataataaaaaacttgttaactctgaactattgataatg 562
Query: 363 ctttaaataaaaattatttactgatacaacaagtgattatatatatatat-------at- 414
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 563 ctttaaataaaaattatttactgatacaacaagtgattatatatatatatggtggctatt 622
Query: 415 --atatat-at---atatatatatatatatatatata 445
|||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 623 ttatatattattttatatatatatatatatatatata 659
Score = 89.7 bits (46), Expect = 4e-22
Identities = 46/46 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 400 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 445
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 681 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 636
Score = 89.7 bits (46), Expect = 4e-22
Identities = 46/46 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 400 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 445
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 683 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 638
Score = 89.7 bits (46), Expect = 4e-22
Identities = 46/46 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 400 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 445
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 685 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 640
Score = 89.7 bits (46), Expect = 4e-22
Identities = 46/46 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 400 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 445
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 687 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 642
Score = 89.7 bits (46), Expect = 4e-22
Identities = 46/46 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 400 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 445
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 689 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 644
Score = 89.7 bits (46), Expect = 4e-22
Identities = 46/46 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 400 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 445
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 691 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 646
Score = 89.7 bits (46), Expect = 4e-22
Identities = 46/46 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 400 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 445
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 693 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 648
Score = 89.7 bits (46), Expect = 4e-22
Identities = 46/46 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 400 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 445
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 695 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 650
Score = 87.7 bits (45), Expect = 1e-21
Identities = 45/45 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 401 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 445
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 696 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 652
Score = 66.5 bits (34), Expect = 4e-15
Identities = 43/46 (93%), Gaps = 2/46 (4%)
Strand = Plus / Minus
Query: 400 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 445
|||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||
Sbjct: 667 tatatatatatatatatatatatatatatataaa-ata-atatata 624
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.34 0.600 1.10
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 2, Extension: 1
Number of Sequences: 1
Number of Hits to DB: 112
Number of extensions: 54
Number of successful extensions: 53
Number of sequences better than 10.0: 1
Number of HSP's gapped: 40
Number of HSP's successfully gapped: 14
Length of query: 445
Length of database: 845
Length adjustment: 10
Effective length of query: 435
Effective length of database: 835
Effective search space: 363225
Effective search space used: 363225
X1: 8 (15.9 bits)
X2: 517 (999.5 bits)
X3: 517 (999.5 bits)
S1: 8 (16.4 bits)
S2: 8 (16.2 bits)
|