BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-478F08.T7 (MSMg01no478_f08.b1) | MSMg01-478F08.TJ (MSMg01no478_f08.g1) |
ACC | AG559474 | AG559475 |
length | 742 | 743 |
length of high quality (start - end) | 403 (317 - 719) | 610 (65 - 674) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no478_f08.b1 PHD_FILE: MSMg01no478_f08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:58:02 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no478_f08.g1 PHD_FILE: MSMg01no478_f08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:58:02 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | GCGGCCGCTAAACGACTCACTTTTCAGAGAGGAGCCGCGGAATTCTTTTT
TCCGGACACTTTGATTTTCCTTTAAAGATTTTTTTTTTTTGGACATTTGT
GTGTGTGAACAACTGTGAACATCAGAGGACAGCTTACAGGAGTTATTATC
ACCACGTGGGTTCTGGGAATTAAACTTAGGTTGTCAAGCATGGCAGCAAG
TGCCCTTGCTCGCTGAGCCATCTCGCTAGCCTAAGAATACGGCATTTTAT
AAGTACCCTGTCATTTTGAGATGGTTTCATGGAATCCATGTAGACCAAGA
GCCAAATGTTTTTTGAGGACAACCTTGAACTCCTAGTCCTTCTGTTCACC
CCCAGTGGTTGGGATTACAGGTCTGGGTACCACTATTCTGGCTTAGGGGA
TGCTGGGGATGAAAGTCAGGGCATCTGGCATGATGGGTGGGCATCCTGAC
AAATGGGCTACATTGCTAACTCTAAATTCATAATCTGTTGTATTAAATAT
TTCATAAATAAATCCCAACAGCAGGTTCGGTACTCGCCTCAGTGCTTTAT
GTTCCTGAATGAAAGACACACACTCAGCCTTTATATTTGAAATACGCCTT
AAGCAGCTCGATAGCTGGGCCACTGCCTAACCTCCATGCAGTGAATCCCG
AGTTATTACTTACTAATTCTATGTCCTTTCTAGGCTGCTCTGGATCCAGC
AGCAACCAGGCCTCGCTCTCCCAGCTCCTTCACATGGCAGCC
| GGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXCAGGACAGCCAGGGCTATACAGAGAAACCCTGTCTA
GGAAAAAAAAAAAAAAAGACAACAACGAAAAACAGGTTTGGCTGGAAAAG
ACCCATATTTCCTTCCCTACCCATAGCAAGAGAAGTTTCCAGGAGATGAG
GCAACTTTTGGTAATAAATAGAACAAAAAGACTCATATTTTTCAGGACAC
AGAGCCTAGGAGATACTGTGTGACTACTGCCTGACTCAAGATGCTAGTAG
CTCAGCAGAGGAGTGAATATATAAAAAGATATGTTCCCCAAATCTTCGGG
AGAGAGATGACTTGAGACCGTGACATTCATTTGGAAAATAGTTTCTTACC
TCAACTTGTACTGATTAGACACTGACTAAGCCTTGAATTTGGGCTCTACT
CTCCCCTGATCCATGGAACCTGTTCTAGAGGATGCACTTGCTCTGCCACA
GAAGTGCAACATAGTTTTTATATTCTTCCCTACACATTATGTTGTACTTT
TTGAATATATATTGTTTCGAGTTTTAACGGGTAAATAGCCTTGCCTTAGT
TTAATATTTCACAATAATTGCTACCTGCAATGTAGTGGCTTTTTGTTTTT
TAATCCTTTGAGTGAATCCCAGCAGTCTGTTATCTCATATATAGTCTTTC
TAATCCTTTCCCTGGACAGGAGTAAAGGAGAAAGTTCAACCTA
|
quality values | Open.Hide.15 15 27 27 30 22 15 13 13 9 9 19 29 29 59 28 28 17 14 9 9 7 6 6 6 6 6 8 11 11 6 6 7 6 6 8 17 29 36 33 33 33 33 33 33 59 34 25 9 8
8 8 6 6 10 11 11 12 12 12 12 16 18 21 23 30 37 59 59 59 57 57 57 48 48 47 47 47 50 50 53 59 59 59 59 68 68 68 59 59 59 47 41 41 41 43 50 57 68 68
68 48 48 43 43 43 46 36 36 20 20 20 36 44 57 57 57 57 57 57 57 42 42 35 44 44 48 48 57 57 57 57 57 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 47
44 46 52 52 52 52 59 59 68 59 59 54 57 57 57 54 50 50 50 50 50 51 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59 57 52 52 52 57 57 59 57 57 57 59 59 59 57 57 59 59 57
57 57 52 52 57 57 57 54 59 52 52 48 57 57 57 57 57 43 50 50 48 50 50 48 48 59 59 59 59 48 48 47 59 59 57 32 34 24 24 12 13 15 19 28 44 44 68 68 68 68
68 68 59 59 59 57 48 48 48 48 48 48 48 59 59 68 68 68 57 57 54 57 57 57 59 44 43 43 43 48 48 57 57 57 48 48 48 47 59 43 59 39 37 32 37 37 43 59 59 59
59 34 28 21 12 10 7 8 8 8 8 11 11 11 11 11 16 23 34 37 37 39 48 48 48 48 57 57 57 57 48 48 39 47 59 59 48 48 47 47 48 46 46 47 43 43 39 39 35 39
39 39 34 36 42 43 48 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 54 48 57 57 48 48 57 59 59 57 57 47 57 47 54 54 57 59 59 48 47 44 59 59 59 59 59 59 68 59 57 57 57
57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 59 59 43 43 38 59 59 57 47 50 43 43 43 59 59 68 59 59 59 57 57 57 59 59 68 59 59 57 50 59 42 47 47 48 44 44 48
48 57 57 57 48 59 59 59 59 59 57 57 57 59 57 57 57 59 59 59 48 48 48 57 57 57 57 48 48 48 57 57 59 48 43 46 46 46 48 59 59 54 57 57 57 57 57 59 59 59
57 48 48 48 57 57 59 59 59 59 59 59 43 43 43 40 40 39 39 41 37 37 37 36 29 34 32 34 34 34 41 32 32 32 30 30 39 39 39 39 35 39 39 48 57 57 59 59 59 48
47 47 46 41 41 43 41 37 37 41 41 40 59 40 39 39 43 43 46 46 46 43 43 34 31 23 23 23 34 34 47 59 47 47 47 59 59 59 44 37 37 41 34 34 31 31 26 31 39 39
34 37 41 41 41 34 34 32 32 39 47 47 46 47 47 59 43 41 36 34 31 36 37 40 39 31 31 37 37 37 29 31 35 37 31 32 32 34 34 39 39 39 37 28 28 32 24 26 24 30
32 30 25 32 32 37 37 37 37 37 46 37 37 37 37 32 29 31 37 37 37 39 37 36 31 32 34 39 37 32 32 33 28 31 36 37 32 32 28 32 32 32 30 35 30 22 19 20 24 30
34 41 41 34 34 20 20 16 16 16 21 21 34 30 21 30 13 24 19 22 18 18 23 22 26 14 20 16 16 11 11 11 19 19 28 21 13 13 14 23 18 18 | Open.Hide.18 18 18 23 26 31 39 39 39 41 40 40 40 46 46 47 59 29 27 9 9 9 9 6 6 8 8 8 8 13 10 10 11 11 12 25 28 37 37 37 44 39 37 42 39 25 18 9 6 6
6 6 6 6 17 22 35 36 30 30 31 31 33 33 33 33 36 36 53 53 53 53 47 57 57 50 50 50 50 50 48 57 48 42 42 48 48 68 54 54 54 54 54 57 57 57 54 54 57 57
57 57 57 54 54 57 57 59 59 59 59 59 59 59 68 68 59 57 57 54 47 47 47 47 47 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68
68 59 59 52 52 57 59 59 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 62 68 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 43 43 39 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 43 43 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 52 62 44 39 27 23 28 27 31 31 39 44 59 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 52 52 62 62 62 52 62 62 43 43 43 43 43 45 62 62
68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 52 52 62 62 62 62 62
62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 45 57 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 52 52 52 57 57 57
57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 37 43 43 57 57 54 57 57 52 52 52 57 52 52 57 59 52 52 52 52 44 50 50 54 54 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 48 48 48 48 59 57 57 57 57 43 43 43 46 47 59 48 48 43 39 39 39 39 48 59 59 68 59
59 57 48 59 43 43 43 48 48 54 48 37 37 23 23 23 37 37 46 46 46 48 48 57 57 57 57 48 48 48 48 46 36 41 34 41 39 35 31 32 39 41 41 36 36 37 34 34 41 29
29 30 31 37 37 41 40 37 37 32 32 28 37 28 39 39 43 37 43 43 39 40 40 41 41 47 37 37 31 22 30 14 13 13 24 24 24 29 34 41 43 43 34 32 18 18 18 34 34 43
41 34 31 35 31 31 37 37 43 25 24 12 12 12 21 18 32 25 25 28 25 25 23 23 20 23 15 23 11 12 12 25 25 31 31 28 23 23 18 19 13 12 12 12 12 19 21 21 28 30
28 25 22 30 24 29 29 10 9 8 8 8 11 12 20 24 22 22 19 21 21 14 14 17 27 22 24 24 20 19 18 21 20 12 12 11 15 12 14 14 17 18 16 |