BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-531I04.T7 (MSMg01no531_i04.b1) | MSMg01-531I04.TJ (MSMg01no531_i04.g1) |
ACC | AG599893 | AG599894 |
length | 736 | 751 |
length of high quality (start - end) | 542 (54 - 595) | 654 (83 - 736) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no531_i04.b1 PHD_FILE: MSMg01no531_i04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 21:08:09 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no531_i04.g1 PHD_FILE: MSMg01no531_i04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 21:08:09 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CCCATTACTTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXCGCGGAATTCTCACCTGTACGCAATACTGAATGGCAGAGAAGCACCT
GAAAAAATGTTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATCAAAACAA
CCCTGAGATTCCACCTCATACCAGTCAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCA
GGTGACAGCAGATGCTGGCATGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCA
TTGTTGGTGGGATTGCAGGCTTGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGC
GGTTCCTCAGAAAATTGGACATAGTACTACTGGAGGATCCAGCAATACCG
CTCCTGGGCATATATCCAGAAGATGCCCCAACTGGTAAGAAGGACACATG
CTCCACTATCTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTGGAAAG
AACCCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATGTGGTAAATC
TACACAATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAATT
CCTAGCCAAATGGATGGACCTGGAGGGCATCATCCTGAGTGAGGTAACAC
ATTCACAAAGGAATTCTCACAATATGTACTCACTGATAAGTGGATATTAG
CCCCAAACCTAGGATTCCCAAGATATAAGATACAACTTGCTAAACACATG
ATACTCAAGAAGAATGAAGACTGAAGTTGTGGACTC
| CCTTTTTCAATGCTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCCTTTCCCTGCCTAGCT
GTTCTTCCTTGATCTGGGGTCCTTTTTAAGAAAACAACAGGGAAAAAATA
GGAAGAAACCTACAGTGGGGCAGCCTGAAGCTGCAACACAAATAATGATT
ATTCCTGTCAAGGTTTAACTGTGGTTGCTAAGTTACTGGTCTTCTCTGCA
AAACCTTGAAGTATGGGACACATTAGGAGCTCGTTAGGTCCCAGTGACTT
GCGGTAAATGTACAATTTGTCTCTGTGCTAAACACACTTCAAAAATAACA
ATAATAAAAAAGAATCCCACATGGCTTAAAAATCTGTGACCTTTCTGTTG
TTACCCTTCTCCTCCCCTTTACACCTCTTCTCCTACTTGCATGTTATTAT
GGAAACTGCTATTGGAAAAGTTAAAGAATTGTGCCAAGGAACTTGATATA
TTAGACTACAGCATTTGGCATTTAATGAAGGTTTTCACAAAGAGCACCAC
AGGAAGGGTCAAGGAAATCTAAAGGGAGTTTCTATAATAATTGTTTACAG
TGCACACAGCAGGGCTATCAGCTCAATCTCTGAGAGCACCTGTAGTGTGT
GTGCCTGGCTGCAAAACATTGCAGAAGCAGGACGCATTTGACTCTTTCAT
CCATTTTCTATTTGCACTAATAATATCACTGTCAAATTCACAGATCCTGG
A
|
quality values | Open.Hide. 7 7 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 11 14 14 19 28 30 33 32 24 22 22 25 29 28 22 25 27 37 37 39 46 25 24 28 28 15 15 13 10 10 10 9 10 13 16 22 23 24
31 31 31 31 48 48 57 35 35 28 28 30 29 33 33 33 22 25 9 10 8 6 6 6 7 10 13 34 30 33 46 40 48 48 48 48 48 57 48 53 53 53 44 48 43 43 43 43 47 48
57 57 57 68 68 68 68 68 48 48 47 42 42 50 50 50 48 48 57 59 54 54 53 48 47 47 42 42 35 42 48 57 50 50 50 57 57 54 54 57 57 57 48 48 57 57 57 57 57 57
57 57 57 42 48 48 48 41 50 50 50 57 57 57 57 57 48 48 57 57 57 57 54 57 57 68 68 68 68 68 57 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 43 43 35
59 44 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 62 62 62
62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68
68 68 68 68 62 62 62 62 45 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 52 43 43 43 43 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57
57 57 57 52 52 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 59 59 59 57 57 68 68 68 57 57 50 43 43 43 43 43 43 57 57 59 59 68 59 68 59 59 59 57
57 54 57 52 52 43 43 43 43 43 43 46 43 42 36 33 29 35 43 43 42 35 35 42 44 57 57 57 57 48 42 37 32 33 33 35 42 43 44 46 44 43 32 30 14 14 18 24 40 39
39 39 30 41 30 32 32 43 42 47 39 39 30 32 36 43 43 37 37 28 33 33 30 37 42 59 59 59 43 43 43 43 43 43 43 43 37 43 43 43 48 48 48 48 48 48 48 48 40 40
39 34 32 23 22 18 22 28 33 37 37 39 39 39 40 43 43 36 36 36 39 37 37 32 23 29 25 24 24 33 33 34 37 32 32 28 31 31 33 28 28 29 26 19 18 16 19 19 25 28
22 22 15 11 11 11 13 15 24 28 25 30 32 25 25 11 12 12 21 16 19 19 21 21 26 23 23 32 28 37 32 32 26 19 13 16 13 16 10 13 10 12 10 13 22 23 23 26 10 12
13 12 18 19 22 22 28 21 20 16 10 10 15 19 17 22 25 22 17 12 12 15 14 16 13 12 10 13 9 9 10 12 12 9 9 9 16 20 16 14 11 11 11 16 17 23 23 25 17 18
9 9 9 10 13 12 9 9 9 9 16 12 17 19 24 28 28 28 24 23 17 17 10 10 10 10 19 23 18 14 14 12 11 8 8 8 | Open.Hide.10 10 10 10 21 12 9 10 10 10 12 9 9 9 9 18 9 9 9 21 17 25 25 26 30 37 37 37 37 37 37 37 37 37 37 37 30 23 8 6 6 6 6 8 12 15 22 26 33 33
39 37 47 53 38 38 50 42 42 53 57 59 59 59 57 43 43 29 21 29 23 30 29 37 37 43 42 42 42 42 50 50 57 54 57 57 59 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68
57 59 57 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 59 59 54 54 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 54 54 50 50 52 50 50 57 57 57 57 68 68 50 50 50
50 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68
57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 68 68 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 52 52 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 43 62 52 62 45 62 62 68 62 62 54 54 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62
62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 68 59 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 59 59 57 57 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 54 54 57 57 68 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 68 68 68
68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 68 68 57 57 57 57 59 59 57 68 57 57 54 54 59 59 59 48 48 48 57 50 68 68 50 57 57 59 59 59 59 68 68
68 57 57 57 57 57 59 59 48 48 48 59 59 59 59 59 48 48 48 48 48 50 50 50 47 47 59 59 41 37 37 41 41 41 59 41 41 41 48 48 48 59 48 57 48 47 47 41 39 39
43 43 48 43 42 39 35 35 35 41 39 47 59 59 57 48 46 43 43 43 43 43 43 43 46 46 46 43 46 46 43 43 48 48 43 43 48 48 47 50 43 43 36 36 36 39 39 48 48 48
48 48 48 47 39 39 36 36 34 34 37 29 29 29 39 43 47 47 43 36 36 33 33 33 33 37 37 35 35 35 30 30 14 14 14 28 28 35 32 31 43 41 41 41 46 47 47 47 43 43
43 48 37 37 28 28 28 36 34 39 41 41 41 31 31 36 37 37 34 31 21 21 26 24 26 17 17 20 24 19 29 34 28 32 37 37 37 37 34 34 30 30 30 33 19 24 25 22 28 28
32 25 30 26 29 30 30 32 32 32 37 37 37 30 30 30 30 32 29 26 32 36 37 37 34 34 28 28 23 32 24 28 28 20 22 18 18 18 17 17 23 22 26 20 20 18 18 23 18 19
19 |