BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-011K10
Chromosome17 (Build37)
Map Location 59,261,467 - 59,395,931
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneCntnap5c, LOC620408, EG545216, LOC668648, 2610034M16Rik, Nudt12, 4930505H01Rik
Downstream geneLOC100043537, LOC100043542
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-011K10.bB6Ng01-011K10.g
ACCDH846974DH846975
length9931,086
definitionDH846974|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-011K10, 5' end.DH846975|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-011K10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(59,394,965 - 59,395,931)(59,261,467 - 59,262,537)
sequence
gaattcactatgtataccaagctgctcttgaacttccaaccttctccaat
aatcattctgcttcttgctccctgctgagattatttgcaggagccaccat
gcttagatcttagcatctatccttactgtagatgtttagtagcacagctt
ccagaattggatcaccaaatggagcatcaagtgttacttgttcatctatt
tccggtgcctccaactagagttcatgtctggggaacagtcagtgaaggaa
ggaagcaggaaaggaagaggaagtgaggaacatacatagatggacccgtt
atggaagtaaaattgacttgactatcaggttcttttcagtagccacataa
aaattaccattttgtccaattttattttgcaaacacacatttaattctgc
cagaggttaatatccaacattggtaaagtattgtggtggtcacccttctt
tgaatctttgcagcatggtcaagctatttccatagaacggagatagaatg
gaaaacaagcttagtggatgagatggagccagattgctagtatgttaagg
ttcctgcttagctatagaattgagtaggttgctgaatttatctccacctt
agtttgctcatctataacacggtaataatagttttccctcatgattttga
gaatttgaggactcaatgtctatataacatgaagtgcttaagcctttaag
aagtcctcaatgccaggctcctatctgtaagcataccatagcatcagtaa
cattgtcaggccttagtgctcacccatgaaatggatctcatgttggtcct
gtcattagaccatctttccttcagtctcttctctatttttatttctgcaa
ttctttagacaggaagagatctgggtcagaaaatttgacggtaggttagt
tatcctgtccctctgcttgaggctctgtctatctactggaggtagacttt
tcagttcctctctcaatgcttgggaatttggctcaggtcatcc
gaattcagtctattgagggaattgttgactgttgtttgtaaaataaaatg
cctcagtgtgctcaaagcctcccagagatggccatatatggctattatca
tgtttctggcttcttagtttcctaatttccatttcatttttttcttgcat
agtatctcagacttcttctttaatgaatacaagtgagaaaattttccaaa
cttgatagtaatacatactaaaaagaaaaaagaaacgtgtaggaaattac
tatctcacatttgtgttgaaagcaaagttgcaattaaattttgttctaca
tattgccttgcttattctggaatcttgatatttatatagtaggtcatgca
atagtaatatgattatgaaagttactaatgcacaagcatgttctaataag
gtgtaattattagctatggtacttttcattattccatttaattacaaaca
cttgagtcatatttctatgtataatgtactgcatatgtgtttctgtacat
tagttcatttaattgtcacacttttcttaagaagaaatctttctttatct
gacagttcaagaaattgaggcacaatgaatttgtatccattattcaaagt
tatagaactaataatatacatggaaaaggaatgtgaattgaggctgtctg
atttgaaaaatagcctagtctgtataccaaatggaccctatagctaatga
tagtactatcataaaaggctgcagaagacctaagcttgcagcatgccact
agaattaggtagaaaatgacatgatttcaaagcatcagtttctttggtat
ggtggaatatatccttgcgagtattttcaagatattattaggttaaaatt
aacttgaagttcttgcatatgctaattaacctcgcccctgtttagcttaa
ggctggaactttacagatggtattgtaccttcataaccttgaccatttta
ttagggcttgaaaaagtgcctgttccacttccttggaaagaaaaagcgta
aatgtacctctccagttagaagtacagttaaaaagaatccacggctctgt
ctgctaagtgtttgagtggtccttaatggcatagta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr17_59394965_59395931
seq2: B6Ng01-011K10.b_43_1006 (reverse)

seq1  GAGAGAAGGAACTTGAAAAGTCTACCTCCAGTAGATAGACAGAGCCTCAA  50
      ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAG-AGGAAC-TGAAAAGTCTACCTCCAGTAGATAGACAGAGCCTCAA  48

seq1  GCAGAGGGACAGGATAACTAACCTACCGTCAAATTTTCTGACCCAGATCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAGGGACAGGATAACTAACCTACCGTCAAATTTTCTGACCCAGATCT  98

seq1  CTTCCTGTCTAAAAGAATTGCAGAAATAAAAATAGAGAAGAGACTGAAGG  150
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTGTCT-AAAGAATTGCAGAAATAAAAATAGAGAAGAGACTGAAGG  147

seq1  AAAGATGGTCTAATGACAGGACCAACATGAGATCCATTTCATGGGTGAGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGATGGTCTAATGACAGGACCAACATGAGATCCATTTCATGGGTGAGC  197

seq1  ACTAAGGCCTGACAATGTTACTGATGCTATGGTATGCTTACAGATAGGAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAAGGCCTGACAATGTTACTGATGCTATGGTATGCTTACAGATAGGAG  247

seq1  CCTGGCATTGAGGACTTCTTAAAGGCTTAAGCACTTCATGTTATATAGAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGCATTGAGGACTTCTTAAAGGCTTAAGCACTTCATGTTATATAGAC  297

seq1  ATTGAGTCCTCAAATTCTCAAAATCATGAGGGAAAACTATTATTACCGTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGAGTCCTCAAATTCTCAAAATCATGAGGGAAAACTATTATTACCGTG  347

seq1  TTATAGATGAGCAAACTAAGGTGGAGATAAATTCAGCAACCTACTCAATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAGATGAGCAAACTAAGGTGGAGATAAATTCAGCAACCTACTCAATT  397

seq1  CTATAGCTAAGCAGGAACCTTAACATACTAGCAATCTGGCTCCATCTCAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATAGCTAAGCAGGAACCTTAACATACTAGCAATCTGGCTCCATCTCAT  447

seq1  CCACTAAGCTTGTTTTCCATTCTATCTCCGTTCTATGGAAATAGCTTGAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTAAGCTTGTTTTCCATTCTATCTCCGTTCTATGGAAATAGCTTGAC  497

seq1  CATGCTGCAAAGATTCAAAGAAGGGTGACCACCACAATACTTTACCAATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCTGCAAAGATTCAAAGAAGGGTGACCACCACAATACTTTACCAATG  547

seq1  TTGGATATTAACCTCTGGCAGAATTAAATGTGTGTTTGCAAAATAAAATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGATATTAACCTCTGGCAGAATTAAATGTGTGTTTGCAAAATAAAATT  597

seq1  GGACAAAATGGTAATTTTTATGTGGCTACTGAAAAGAACCTGATAGTCAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACAAAATGGTAATTTTTATGTGGCTACTGAAAAGAACCTGATAGTCAA  647

seq1  GTCAATTTTACTTCCATAACGGGTCCATCTATGTATGTTCCTCACTTCCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAATTTTACTTCCATAACGGGTCCATCTATGTATGTTCCTCACTTCCT  697

seq1  CTTCCTTTCCTGCTTCCTTCCTTCACTGACTGTTCCCCAGACATGAACTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTTTCCTGCTTCCTTCCTTCACTGACTGTTCCCCAGACATGAACTC  747

seq1  TAGTTGGAGGCACCGGAAATAGATGAACAAGTAACACTTGATGCTCCATT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTGGAGGCACCGGAAATAGATGAACAAGTAACACTTGATGCTCCATT  797

seq1  TGGTGATCCAATTCTGGAAGCTGTGCTACTAAACATCTACAGTAAGGATA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGATCCAATTCTGGAAGCTGTGCTACTAAACATCTACAGTAAGGATA  847

seq1  GATGCTAAGATCTAAGCATGGTGGCTCCTGCAAATAATCTCAGCAGGGAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCTAAGATCTAAGCATGGTGGCTCCTGCAAATAATCTCAGCAGGGAG  897

seq1  CAAGAAGCAGAATGATTATTGGAGAAGGTTGGAAGTTCAAGAGCAGCTTG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGAAGCAGAATGATTATTGGAGAAGGTTGGAAGTTCAAGAGCAGCTTG  947

seq1  GTATACATAGTGAATTC  967
      |||||||||||||||||
seq2  GTATACATAGTGAATTC  964

seq1: chr17_59261467_59262537
seq2: B6Ng01-011K10.g_67_1152

seq1  GAATTCAGTCTATTGAGGGAATTGTTGACTGTTGTTTGTAAAATAAAATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTCTATTGAGGGAATTGTTGACTGTTGTTTGTAAAATAAAATG  50

seq1  CCTCAGTGTGCTCAAAGCCTCCCAGAGATGGCCATATATGGCTATTATCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCAGTGTGCTCAAAGCCTCCCAGAGATGGCCATATATGGCTATTATCA  100

seq1  TGTTTCTGGCTTCTTAGTTTCCTAATTTCCATTTCATTTTTTTCTTGCAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTCTGGCTTCTTAGTTTCCTAATTTCCATTTCATTTTTTTCTTGCAT  150

seq1  AGTATCTCAGACTTCTTCTTTAATGAATACAAGTGAGAAAATTTTCCAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATCTCAGACTTCTTCTTTAATGAATACAAGTGAGAAAATTTTCCAAA  200

seq1  CTTGATAGTAATACATACTAAAAAGAAAAAAGAAACGTGTAGGAAATTAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGATAGTAATACATACTAAAAAGAAAAAAGAAACGTGTAGGAAATTAC  250

seq1  TATCTCACATTTGTGTTGAAAGCAAAGTTGCAATTAAATTTTGTTCTACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTCACATTTGTGTTGAAAGCAAAGTTGCAATTAAATTTTGTTCTACA  300

seq1  TATTGCCTTGCTTATTCTGGAATCTTGATATTTATATAGTAGGTCATGCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGCCTTGCTTATTCTGGAATCTTGATATTTATATAGTAGGTCATGCA  350

seq1  ATAGTAATATGATTATGAAAGTTACTAATGCACAAGCATGTTCTAATAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTAATATGATTATGAAAGTTACTAATGCACAAGCATGTTCTAATAAG  400

seq1  GTGTAATTATTAGCTATGGTACTTTTCATTATTCCATTTAATTACAAACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTAATTATTAGCTATGGTACTTTTCATTATTCCATTTAATTACAAACA  450

seq1  CTTGAGTCATATTTCTATGTATAATGTACTGCATATGTGTTTCTGTACAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGAGTCATATTTCTATGTATAATGTACTGCATATGTGTTTCTGTACAT  500

seq1  TAGTTCATTTAATTGTCACACTTTTCTTAAGAAGAAATCTTTCTTTATCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTCATTTAATTGTCACACTTTTCTTAAGAAGAAATCTTTCTTTATCT  550

seq1  GACAGTTCAAGAAATTGAGGCACAATGAATTTGTATCCATTATTCAAAGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGTTCAAGAAATTGAGGCACAATGAATTTGTATCCATTATTCAAAGT  600

seq1  TATAGAACTAATAATATACATGGAAAAGGAATGTGAATTGAGGCTGTCTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGAACTAATAATATACATGGAAAAGGAATGTGAATTGAGGCTGTCTG  650

seq1  ATTTGAAAAATAGCCTAGTCTGTATACCAAATGGACCCTATAGCTAATGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGAAAAATAGCCTAGTCTGTATACCAAATGGACCCTATAGCTAATGA  700

seq1  TAGTACTATCATAAAAGGCTGCAGAAGACCTAAGCTTGCAGCATGCCACT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTACTATCATAAAAGGCTGCAGAAGACCTAAGCTTGCAGCATGCCACT  750

seq1  AGAATTAGGTAGAAAATGACATGATTTCAAAGCATCAGTTTCTTTGGTAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATTAGGTAGAAAATGACATGATTTCAAAGCATCAGTTTCTTTGGTAT  800

seq1  GGTGGAATATATCCTTGCGAGTATTTTCAAGATATTTATTAGGTTAAAAT  850
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  GGTGGAATATATCCTTGCGAGTATTTTCAAGATA-TTATTAGGTTAAAAT  849

seq1  TAACTTGAAGTTCTTGCATATGCTAAT---ACACTGCCCTGTTTACCTTT  897
      |||||||||||||||||||||||||||    | |  ||||||||| ||| 
seq2  TAACTTGAAGTTCTTGCATATGCTAATTAACCTCGCCCCTGTTTAGCTTA  899

seq1  AGGCT-GAACTTTACAGATGGTATTGTACCTTCATAACCTTGAC--ATTT  944
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||
seq2  AGGCTGGAACTTTACAGATGGTATTGTACCTTCATAACCTTGACCATTTT  949

seq1  ATTAGGGCTTG-AAAAGTG-CTGTT-CAC-TCCTT-GAAAG-AAGAGCGT  988
      ||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||| ||||| || |||||
seq2  ATTAGGGCTTGAAAAAGTGCCTGTTCCACTTCCTTGGAAAGAAAAAGCGT  999

seq1  AAATGTA-CTC-CCAGTTAG-AGTACAGTAAAAAAGAAT-CACGGCTCTG  1034
      ||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||
seq2  AAATGTACCTCTCCAGTTAGAAGTACAGTTAAAAAGAATCCACGGCTCTG  1049

seq1  TCTGCTAAGTGTTTGAGTGGTTCTTTATGGCATAGTA  1071
      ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||
seq2  TCTGCTAAGTGTTTGAGTGGTCCTTAATGGCATAGTA  1086