BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-018L14
Chromosome17 (Build37)
Map Location 73,946,715 - 74,087,131
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGalnt14
Upstream geneAlk, Ypel5, Lbh, Lycat, LOC668709, Capn13, LOC100043666
Downstream geneEhd3, LOC240160, Xdh, Srd5a2, Memo1, EG668716, 2810410M20Rik, LOC668773, LOC668775, Spast, Slc30a6, Nlrc4, LOC100043883, LOC624159, Yipf4, Birc6
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-018L14.bB6Ng01-018L14.g
ACCDH852045DH852046
length984943
definitionDH852045|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-018L14, 5' end.DH852046|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-018L14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(74,086,140 - 74,087,131)(73,946,715 - 73,947,658)
sequence
gaattcagccttagagtaggatttcagaatcttcatattctcgagttcct
tacctgagatgtttttcctccacttcatatctggatttttaccctactca
tcaaaaaggactctatagcacagaggttttcaacctatggatcgagatgc
ctttctgggtcaaatgacctttctctcataaggatcacatatacctcata
tcaggcatttacattatgtttcataacagtagaaagaaaccacagtttat
gaagtagcaataaaataattttatggttgaggaggtcaccacaacatgag
aaactctgttaaagggttgcagcgttaggaagatggagaaccagtgccat
agtagatatctagtcatttctttgagcgtctcttctcttctctttgcaac
tttatatgacttaaaataattccatgcatgtttggagagatgaagcacac
tgggtttccacaaacacctccatctttaccaagaaggaactgaggtagag
cagagaagcagctagggtttatctgagccttggaagtgccatagtgatac
ggaaacttcacagttccaggctcagccggccacgatacccagaaatgaca
ggttctggtaaactccatccgtgctggttgggttttgtcaactcgataca
aagctagacatgactagaaaggaagagtctcggttgagggattacccaca
ccatattggcctgtgagcagacctgtggggcattttcttgattaagtgac
caacatatttgggaccaggtcactgtggatggaaccgttcttgcaagggt
gggccagaactgtgtaagatagaaagatagctgagcaaagcaggagaagc
aatccaaaagcaagagttccttcacggtctctcctacagtttctgcctcc
aggttcagccttgagctctgccatgatgcactatagctgtaagccaaaca
aataacctattactcatctaattgtttgacacgg
gaattcatttcctcatggagaccaaggccagccatccagcactttccaga
cttggtgatacaatttccataaaaagaaaggggtgtgtgtgaaagtaaga
aacccttgggaagcaagtggccagagtccgatacaagaagtgctagcttt
gaagggcaagaagtgcaactatgtcttaacttcttactgaggagcccaga
gtgcagcccacctccttttaaggtacttggcaagtgacgtttgcaacaga
aagctttgaagatggatggagagaagtgagtttggaaattagtacaggct
cctgagggtgcaagaatgggattacagtcacggtgacatgaagaaagcac
agctcattcattcattcattcattcattcattcattcaatgcctttgctc
aactctcactgtggtcttgggcttgttggtggtagatagacccttgtgac
ctcttgtctcacccagcccttcaggatatacagggatgttcagtgactgg
ttatacagtgtggggataagcaagataccccagtctccctcaatggtagt
gattgaagctggggtgttggtccagcatcctctggttctatgcttactgc
tgtattggggtatcatttcatatgacccttatatatgagaagaatctggc
aaggtaaagaagattaagtgtctccccaaggccataagctggcacaaggc
agtcaggcttcaaaggcagggatcccaagccaacatcccatgcttcatgg
ctcacagatggtggcagaaacctgagggtggaaatctccttaaagaggca
gaggtgcctccatgtagctcttcccctgaaactctacccagcaggaaatg
gcaggaccttaaatgagaacctaactctggctgagtgttaagctccctcg
gtgcctgtgtctgcctttcccaaacgatcacgatatgggaatt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr17_74086140_74087131
seq2: B6Ng01-018L14.b_42_1025 (reverse)

seq1  CCGTGGTCAAACAATTAGATGAAGTAATAGGTTTATTTGGTTTGGCTTAC  50
      |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||
seq2  CCGT-GTCAAACAATTAGATG-AGTAATAGG-TTATTT-GTTTGGCTTAC  46

seq1  AGGCTATAGTGCATCATGGCAGGAGCTCAAGGCTGGAACCTGGAGGCAGA  100
      | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||
seq2  A-GCTATAGTGCATCATGGCA-GAGCTCAAGGCT-GAACCTGGAGGCAGA  93

seq1  AACTGTAGGAGAGACCGTGAAGGAACTCTTGCTTTTTGGATTGCTTCTCC  150
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  AACTGTAGGAGAGACCGTGAAGGAACTCTTGC-TTTTGGATTGCTTCTCC  142

seq1  TGGCTTGCTCAGCTATCTTTCTATCTTACACAGTTCTGGCCCACCCTTGC  200
      ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTTGCTCAGCTATCTTTCTATCTTACACAGTTCTGGCCCACCCTTGC  192

seq1  AAGAACGGTTCCATCCACAGTGACCTGGTCCCAAATATGTTGGTCACTTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAACGGTTCCATCCACAGTGACCTGGTCCCAAATATGTTGGTCACTTA  242

seq1  ATCAAGAAAATGCCCCACAGGTCTGCTCACAGGCCAATATGGTGTGGGTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAGAAAATGCCCCACAGGTCTGCTCACAGGCCAATATGGTGTGGGTA  292

seq1  ATCCCTCAACCGAGACTCTTCCTTTCTAGTCATGTCTAGCTTTGTATCGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCTCAACCGAGACTCTTCCTTTCTAGTCATGTCTAGCTTTGTATCGA  342

seq1  GTTGACAAAACCCAACCAGCACGGATGGAGTTTACCAGAACCTGTCATTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGACAAAACCCAACCAGCACGGATGGAGTTTACCAGAACCTGTCATTT  392

seq1  CTGGGTATCGTGGCCGGCTGAGCCTGGAACTGTGAAGTTTCCGTATCACT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGTATCGTGGCCGGCTGAGCCTGGAACTGTGAAGTTTCCGTATCACT  442

seq1  ATGGCACTTCCAAGGCTCAGATAAACCCTAGCTGCTTCTCTGCTCTACCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCACTTCCAAGGCTCAGATAAACCCTAGCTGCTTCTCTGCTCTACCT  492

seq1  CAGTTCCTTCTTGGTAAAGATGGAGGTGTTTGTGGAAACCCAGTGTGCTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTCCTTCTTGGTAAAGATGGAGGTGTTTGTGGAAACCCAGTGTGCTT  542

seq1  CATCTCTCCAAACATGCATGGAATTATTTTAAGTCATATAAAGTTGCAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTCTCCAAACATGCATGGAATTATTTTAAGTCATATAAAGTTGCAAA  592

seq1  GAGAAGAGAAGAGACGCTCAAAGAAATGACTAGATATCTACTATGGCACT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAGAGAAGAGACGCTCAAAGAAATGACTAGATATCTACTATGGCACT  642

seq1  GGTTCTCCATCTTCCTAACGCTGCAACCCTTTAACAGAGTTTCTCATGTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCTCCATCTTCCTAACGCTGCAACCCTTTAACAGAGTTTCTCATGTT  692

seq1  GTGGTGACCTCCTCAACCATAAAATTATTTTATTGCTACTTCATAAACTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTGACCTCCTCAACCATAAAATTATTTTATTGCTACTTCATAAACTG  742

seq1  TGGTTTCTTTCTACTGTTATGAAACATAATGTAAATGCCTGATATGAGGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTTCTTTCTACTGTTATGAAACATAATGTAAATGCCTGATATGAGGT  792

seq1  ATATGTGATCCTTATGAGAGAAAGGTCATTTGACCCAGAAAGGCATCTCG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGTGATCCTTATGAGAGAAAGGTCATTTGACCCAGAAAGGCATCTCG  842

seq1  ATCCATAGGTTGAAAACCTCTGTGCTATAGAGTCCTTTTTGATGAGTAGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCATAGGTTGAAAACCTCTGTGCTATAGAGTCCTTTTTGATGAGTAGG  892

seq1  GTAAAAATCCAGATATGAAGTGGAGGAAAAACATCTCAGGTAAGGAACTC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAAAATCCAGATATGAAGTGGAGGAAAAACATCTCAGGTAAGGAACTC  942

seq1  GAGAATATGAAGATTCTGAAATCCTACTCTAAGGCTGAATTC  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAATATGAAGATTCTGAAATCCTACTCTAAGGCTGAATTC  984

seq1: chr17_73946715_73947658
seq2: B6Ng01-018L14.g_69_1011

seq1  GAATTCATTTCCTCATGGAGACCAAGGCCAGCCATCCAGCACTTTCCAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTTCCTCATGGAGACCAAGGCCAGCCATCCAGCACTTTCCAGA  50

seq1  CTTGGTGATACAATTTCCATAAAAAGAAAGGGGTGTGTGTGAAAGTAAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGTGATACAATTTCCATAAAAAGAAAGGGGTGTGTGTGAAAGTAAGA  100

seq1  AACCCTTGGGAAGCAAGTGGCCAGAGTCCGATACAAGAAGTGCTAGCTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCTTGGGAAGCAAGTGGCCAGAGTCCGATACAAGAAGTGCTAGCTTT  150

seq1  GAAGGGCAAGAAGTGCAACTATGTCTTAACTTCTTACTGAGGAGCCCAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGGCAAGAAGTGCAACTATGTCTTAACTTCTTACTGAGGAGCCCAGA  200

seq1  GTGCAGCCCACCTCCTTTTAAGGTACTTGGCAAGTGACGTTTGCAACAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCAGCCCACCTCCTTTTAAGGTACTTGGCAAGTGACGTTTGCAACAGA  250

seq1  AAGCTTTGAAGATGGATGGAGAGAAGTGAGTTTGGAAATTAGTACAGGCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTTTGAAGATGGATGGAGAGAAGTGAGTTTGGAAATTAGTACAGGCT  300

seq1  CCTGAGGGTGCAAGAATGGGATTACAGTCACGGTGACATGAAGAAAGCAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAGGGTGCAAGAATGGGATTACAGTCACGGTGACATGAAGAAAGCAC  350

seq1  AGCTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCAATGCCTTTGCTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCAATGCCTTTGCTC  400

seq1  AACTCTCACTGTGGTCTTGGGCTTGTTGGTGGTAGATAGACCCTTGTGAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCTCACTGTGGTCTTGGGCTTGTTGGTGGTAGATAGACCCTTGTGAC  450

seq1  CTCTTGTCTCACCCAGCCCTTCAGGATATACAGGGATGTTCAGTGACTGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTGTCTCACCCAGCCCTTCAGGATATACAGGGATGTTCAGTGACTGG  500

seq1  TTATACAGTGTGGGGATAAGCAAGATACCCCAGTCTCCCTCAATGGTAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATACAGTGTGGGGATAAGCAAGATACCCCAGTCTCCCTCAATGGTAGT  550

seq1  GATTGAAGCTGGGGTGTTGGTCCAGCATCCTCTGGTTCTATGCTTACTGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTGAAGCTGGGGTGTTGGTCCAGCATCCTCTGGTTCTATGCTTACTGC  600

seq1  TGTATTGGGGTATCATTTCATATGACCCTTATATATGAGAAGAATCTGGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATTGGGGTATCATTTCATATGACCCTTATATATGAGAAGAATCTGGC  650

seq1  AAGGTAAAGAAGATTAAGTGTCTCCCCAAGGCCATAAGCTGGTACAAGGC  700
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  AAGGTAAAGAAGATTAAGTGTCTCCCCAAGGCCATAAGCTGGCACAAGGC  700

seq1  AGTCAGGCTTCAAAGGCAGGGATCCCAAGCCAACATCCCATGCTTCATGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCAGGCTTCAAAGGCAGGGATCCCAAGCCAACATCCCATGCTTCATGG  750

seq1  CTCACAGATGGTGGCAGAAACCTGAGGGTGGAAATCTCCTCAAAGAGGCA  800
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  CTCACAGATGGTGGCAGAAACCTGAGGGTGGAAATCTCCTTAAAGAGGCA  800

seq1  GAGGTGCCTCCATGTAGCTCTTCCCCTGAAACTCTACCCAGCAGGAAATG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTGCCTCCATGTAGCTCTTCCCCTGAAACTCTACCCAGCAGGAAATG  850

seq1  GCAGGACCTTAAATGAGAACCTAACTCTGGCTGAGTGTTAAGCTCCCTCG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGACCTTAAATGAGAACCTAACTCTGGCTGAGTGTTAAGCTCCCTCG  900

seq1  GTGCCTGTGTTCTGCCTTTCACAGAAGATCACGTATTGGGAATT  944
      ||||||||| |||||||||| || | |||||||   ||||||||
seq2  GTGCCTGTG-TCTGCCTTTCCCAAACGATCACGATATGGGAATT  943