BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-023P19
Chromosome17 (Build37)
Map Location 60,193,903 - 60,297,320
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100043537, LOC100043542
Downstream geneLOC100043549
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-023P19.bB6Ng01-023P19.g
ACCDH855756DH855757
length1,116994
definitionDH855756|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-023P19, 5' end.DH855757|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-023P19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(60,193,903 - 60,195,017)(60,296,328 - 60,297,320)
sequence
gaattcacaaatataatccccacacagaacaaaagtagcctctcaaacat
ctgcagagatctatactcataagctccgtgagctttgtttggggttttat
actttgattatgagttatattttttgcagttatcctccacaatgaaatac
aaaacctatcaagagataaaactaaatgtaattagctttatatcctttga
aaacccgcatgccccttcatttattctgcccttccttggcacccagtgct
atgtgtttttctctcctttcctaattttacactgtacatacatgtacagt
tgtttgcatatgtctgtacatatgtcatatgctagaataaataacatgaa
aaaaaacatgcaatttttctttgtgggaataggtgacccaataaaaactt
aatatttctttcaaaatctgttaagtctaccaaaacatttacttctcatc
tttttgatcccagatacagagatcagagatcagagtttgattgcaaagac
acaaatgttttttaggaatatagccataatgacaaagctcatagtttttg
aagctggtcctgtatccttcagcaggcctcagatctaacattttccatga
ccgccacgtttacttccctgtttgcttctgtccccttgggccctacccac
atatttccagactttatttactctgctaccttcttctctcataatcatct
ggtatttttagcttatttttatatctgttctgtttattatttattgtatt
ccctgtgattctctatgctctattgtggcagagatgtttctgggttttat
tcacttgtgagctccaagtgtacaattgagttaatttaatattaaataat
gaatattgaatatacacgacttcatacatacataaattaaacaatctctc
aattcacttatatctttgtgttagttgcatgtctttgagcctcagttcta
ttttaaaagctcaagattgagcatatgttaattttgaaacattgtatttt
aagatgaggtgcttaagttcttcagctgctccccaaacttgtggttaatg
atgggtctggaaactccagcatccccactatatgggattcagacagagat
tgcttgacggatttga
gaattccacacccctaagcccctcaccccataaaaacccctagctttcga
gcctcgtggccgatatcccttatctcctgtgtgggatacatgtcggtctg
agctccgtcattaaactacctcttgtatttacatcaagacggtctattcg
tgattttttgggtgcatgccgaatcgggaattgagtgggggtttccccac
taggttctatcagtactatcattgagctgtatcttattcttattttgtaa
gtcaagtagctataagggagattttaaaaacaaatttacacaaaatttct
gtaggcaagtagaaggactaaaggagctgaagcagttttcaaccccattg
aaagaacaacaatatcaaccaaccagacaccccagagctccctggaacta
aaccaccaaccatggtaggaggaacccatggctccagctgcatatataac
agaggaatgccttatctggcatcaaagggaggggagaccctgggacctgt
ggaggctcagtgccccagcttaggggaatgctagtgtgctgaggcaggaa
tgggtggtgggtagaagcagggagtagggagagagactaggcggcttatg
gaagggaaactgggaagggggataacttttaaaatgtaattaagtaaaat
aagcaataaaaataatcttaagtaatttataaattttatgtcttaatcct
tgtaatactgttactggcatacccataacctttgtatcactaaataagaa
ttagaaatgtaaagccactttgtaaagtatatcttttataatgcccagct
ggaatttgaactttggtactgtaacttaagattaaagcctgtttaaacat
aggcacctgaaagattacttcaatgaacttcacttaggaacagtatttgt
ggcaacattaatagaacggcactgtgatcaggaaggaagaaggttgatgc
cccacttagtgtattaatttaacgatctggctcttgaagtttgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr17_60193903_60195017
seq2: B6Ng01-023P19.b_47_1162

seq1  GAATTCACAAATATAATCCCCACACAGAACAAAAGTAGCCTCTCAAACAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACAAATATAATCCCCACACAGAACAAAAGTAGCCTCTCAAACAT  50

seq1  CTGCAGAGATCTATACTCATAAGCTCCGTGAGCTTTGTTTGGGGTTTTAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCAGAGATCTATACTCATAAGCTCCGTGAGCTTTGTTTGGGGTTTTAT  100

seq1  ACTTTGATTATGAGTTATATTTTTTGCAGTTATCCTCCACAATGAAATAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTGATTATGAGTTATATTTTTTGCAGTTATCCTCCACAATGAAATAC  150

seq1  AAAACCTATCAAGAGATAAAACTAAATGTAATTAGCTTTATATCCTTTGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACCTATCAAGAGATAAAACTAAATGTAATTAGCTTTATATCCTTTGA  200

seq1  AAACCCGCATGCCCCTTCATTTATTCTGCCCTTCCTTGGCACCCAGTGCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCCGCATGCCCCTTCATTTATTCTGCCCTTCCTTGGCACCCAGTGCT  250

seq1  ATGTGTTTTTCTCTCCTTTCCTAATTTTACACTGTACATACATGTACAGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGTTTTTCTCTCCTTTCCTAATTTTACACTGTACATACATGTACAGT  300

seq1  TGTTTGCATATGTCTGTACATATGTCATATGCTAGAATAAATAACATGAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTGCATATGTCTGTACATATGTCATATGCTAGAATAAATAACATGAA  350

seq1  AAAAAACATGCAATTTTTCTTTGTGGGAATAGGTGACCCAATAAAAACTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAACATGCAATTTTTCTTTGTGGGAATAGGTGACCCAATAAAAACTT  400

seq1  AATATTTCTTTCAAAATCTGTTAAGTCTACCAAAACATTTACTTCTCATC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATTTCTTTCAAAATCTGTTAAGTCTACCAAAACATTTACTTCTCATC  450

seq1  TTTTTGATCCCAGATACAGAGATCAGAGATCAGAGTTTGATTGCAAAGAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTGATCCCAGATACAGAGATCAGAGATCAGAGTTTGATTGCAAAGAC  500

seq1  ACAAATGTTTTTTAGGAATATAGCCATAATGACAAAGCTCATAGTTTTTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAATGTTTTTTAGGAATATAGCCATAATGACAAAGCTCATAGTTTTTG  550

seq1  AAGCTGGTCCTGTATCCTTCAGCAGGCCTCAGATCTAACATTTTCCATGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTGGTCCTGTATCCTTCAGCAGGCCTCAGATCTAACATTTTCCATGA  600

seq1  CCGCCACGTTTACTTCCCTGTTTGCTTCTGTCCCCTTGGGCCCTACCCAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGCCACGTTTACTTCCCTGTTTGCTTCTGTCCCCTTGGGCCCTACCCAC  650

seq1  ATATTTCCAGACTTTATTTACTCTGCTACCTTCTTCTCTCATAATCATCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTTCCAGACTTTATTTACTCTGCTACCTTCTTCTCTCATAATCATCT  700

seq1  GGTATTTTTAGCTTA-TTTTATATCTGTTCTGTTTATTATTTATTGTATT  749
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTATTTTTAGCTTATTTTTATATCTGTTCTGTTTATTATTTATTGTATT  750

seq1  CCCTGTGATTCTCTATGCTCTATTGTGGCAGAGATGTTTCTGGGTTTTAT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGTGATTCTCTATGCTCTATTGTGGCAGAGATGTTTCTGGGTTTTAT  800

seq1  TCACTTGTGAGCTCCAAGTGTACAATTGAGTTAAATATAATATTAAATAA  849
      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||
seq2  TCACTTGTGAGCTCCAAGTGTACAATTGAGTT-AATTTAATATTAAATAA  849

seq1  TGAATATTGAATATACACGACTTCATACATACATAAATTAAACAATCTCT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATATTGAATATACACGACTTCATACATACATAAATTAAACAATCTCT  899

seq1  CAATTCACTTATATCTTTGTGTTAGTTGCATGTCTTTGAGCCTCAGTTCT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTCACTTATATCTTTGTGTTAGTTGCATGTCTTTGAGCCTCAGTTCT  949

seq1  ATTTTAAAAGCTCAAGAATGAGCATAATGTT-ATTTTGAAACATTGTATT  998
      ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||
seq2  ATTTTAAAAGCTCAAGATTGAGCAT-ATGTTAATTTTGAAACATTGTATT  998

seq1  TT-AGATGAGGTGC-TAAGTTCTTCAGGCTGCT-CTCAAACTTGT-GTTA  1044
      || ||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||
seq2  TTAAGATGAGGTGCTTAAGTTCTTCA-GCTGCTCCCCAAACTTGTGGTTA  1047

seq1  ATGATGGTCCTGAAATCT-CAGCATCCTCAACTATTAGGGACTCAAGACA  1093
      |||||||  ||| || || |||||||| | |||||  |||| || |||||
seq2  ATGATGGGTCTGGAAACTCCAGCATCC-CCACTATATGGGATTC-AGACA  1095

seq1  GAGATTGCTATGACTGATTTGA  1115
      ||||||||| |||| |||||||
seq2  GAGATTGCT-TGACGGATTTGA  1116

seq1: chr17_60296328_60297320
seq2: B6Ng01-023P19.g_68_1061 (reverse)

seq1  CCAAACTTC-AGAGGCAGTTCGTTAAA-TAATACACTAAGTTGTGCATCA  48
      ||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||
seq2  CCAAACTTCAAGAGCCAGATCGTTAAATTAATACACTAAGTGGGGCATCA  50

seq1  ACCCTTCTTCCTTCCTGATCACAGTGCCGTTCTATTAATGTTGCCACAAA  98
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  A-CCTTCTTCCTTCCTGATCACAGTGCCGTTCTATTAATGTTGCCAC-AA  98

seq1  ATACTGTTCCTAGGTGAAGTTCATTGAAGTAATCCTTCAGGTGCCTATGT  148
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  ATACTGTTCCTAAGTGAAGTTCATTGAAGTAATCTTTCAGGTGCCTATGT  148

seq1  TTAAACAGGCTTTAATCTTAAGTTACAGTACCAAAGTTCAAATTCCAGCT  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAACAGGCTTTAATCTTAAGTTACAGTACCAAAGTTCAAATTCCAGCT  198

seq1  GGGCATTATAAAAGATATTACTTTACAAAGTGGC-TTACATTTCTAATTC  247
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  GGGCATTATAAAAGATA-TACTTTACAAAGTGGCTTTACATTTCTAATTC  247

seq1  TTA-TTAGTGATACAAAGGTTATGGGTATGCCAGTAACAGTATTACAAGG  296
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTAGTGATACAAAGGTTATGGGTATGCCAGTAACAGTATTACAAGG  297

seq1  ATTAAGACATAAAATTTATAAATTACTTAAGATTATTTTTATTGCTTATT  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAGACATAAAATTTATAAATTACTTAAGATTATTTTTATTGCTTATT  347

seq1  TTACTTAATTACATTTTAAAAGTTATCCCCCTTCCCAGTTTCCCTTCCAT  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTTAATTACATTTTAAAAGTTATCCCCCTTCCCAGTTTCCCTTCCAT  397

seq1  AAGCCGCCTAGTCTCTCTCCCTACTCCCTGCTTCTACCCACCACCCATTC  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCGCCTAGTCTCTCTCCCTACTCCCTGCTTCTACCCACCACCCATTC  447

seq1  CTGCCTCAGCACACTAGCATTCCCCTAAGCTGGGGCACTGAGCCTCCACA  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCTCAGCACACTAGCATTCCCCTAAGCTGGGGCACTGAGCCTCCACA  497

seq1  GGTCCCAGGGTCTCCCCTCCCTTTGATGCCAGATAAGGCATTCCTCTGTT  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCCCAGGGTCTCCCCTCCCTTTGATGCCAGATAAGGCATTCCTCTGTT  547

seq1  ATATATGCAGCTGGAGCCATGGGTTCCTCCTACCATGGTTGGTGGTTTAG  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATGCAGCTGGAGCCATGGGTTCCTCCTACCATGGTTGGTGGTTTAG  597

seq1  TTCCAGGGAGCTCTGGGGTGTCTGGTTGGTTGATATTGTTGTTCTTTCAA  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGGGAGCTCTGGGGTGTCTGGTTGGTTGATATTGTTGTTCTTTCAA  647

seq1  TGGGGTTGAAAACTGCTTCAGCTCCTTTAGTCCTTCTACTTGCCTACAGA  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGTTGAAAACTGCTTCAGCTCCTTTAGTCCTTCTACTTGCCTACAGA  697

seq1  AATTTTGTGTAAATTTGTTTTTAAAATCTCCCTTATAGCTACTTGACTTA  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTTGTGTAAATTTGTTTTTAAAATCTCCCTTATAGCTACTTGACTTA  747

seq1  CAAAATAAGAATAAGATACAGCTCAATGATAGTACTGATAGAACCTAGTG  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAATAAGAATAAGATACAGCTCAATGATAGTACTGATAGAACCTAGTG  797

seq1  GGGAAACCCCCACTCAATTCCCGATTCGGCATGCACCCAAAAAATCACGA  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAAACCCCCACTCAATTCCCGATTCGGCATGCACCCAAAAAATCACGA  847

seq1  ATAGACCGTCTTGATGTAAATACAAGAGGTAGTTTAATGACGGAGCTCAG  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGACCGTCTTGATGTAAATACAAGAGGTAGTTTAATGACGGAGCTCAG  897

seq1  ACCGACATGTATCCCACACAGGAGATAAGGGATATCGGCCACGAGGCTCG  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCGACATGTATCCCACACAGGAGATAAGGGATATCGGCCACGAGGCTCG  947

seq1  AAAGCTAGGGGTTTTTATGGGGTGAGGGGCTTAGGGGTGTGGAATTC  993
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCTAGGGGTTTTTATGGGGTGAGGGGCTTAGGGGTGTGGAATTC  994