BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-076J24
Chromosome17 (Build37)
Map Location 94,811,721 - 94,996,242
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream genenone
Downstream geneLOC668885, LOC668886, Mettl4, 2700099C18Rik, LOC100043754, LOC668888, LOC100038868
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-076J24.bB6Ng01-076J24.g
ACCDH892839DH892840
length1,1211,015
definitionDH892839|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-076J24, 5' end.DH892840|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-076J24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(94,995,129 - 94,996,242)(94,811,721 - 94,812,736)
sequence
gaattcatggtaaaaaagagaaaaatgtacagaacaaactgtgcttaatt
attaagcaatgtaatgtgttcctcagttgacagcagatgtggatgatggc
ataataaacttggtaattatttgccaatgctgaatgtaaaaaccagagtc
ctaatcaaactttaactagccactaaatatataacagcccagaaaacata
caggaagtataaagacttctatatccagtctaagtggtatcatgatctgt
tagatactggagaagctttgaactaagcccatgttggtgataagataggc
ttagagaccagggagtattgaataggattccaagcttagatcaaaagctt
gataattgcctctagaagttgtattcatttaaagcacttttgataacaag
gtaaacatgccactttaagtagttaacagagtaaaccaagtatagtgtgt
atgggattatctctaagtttacaccccttaagaggaaatgtttaggacag
gaaatgtctgtggccttgtagactgtttatagctagagccttagtaccat
gggaactctccatggcaaggggacaaaatggaccttctttgtgttctttg
caccttagaatgtagcagagatttctgcataaggagttcatgtagagttg
tttaggctagctagatacaaactgttccaacagttagggaacaaaggagc
ctgcattttagaatgaagcaaggattcactgtctatcaataggtgaagga
gctttgacaggttctatttccaagacaatcatggtgtgagacagtacagc
acacctggtgcctctcaggaagatggtgccacacagaccttagctgacac
tgtgctattagtcacatcggtggcatatgtttgccagtgtattcagatga
cttgaatgtcaattctagaacctcattgcttattatttgcttttatatga
tgctcttgggcctgtgaatgtgggcttgagtcattctcaatgggtacctt
gggcctactcatggctcttgactgaaagaaccaccctgagagtttctaaa
tataatggtgggctaaggtgaacaatgagtgtttctttgatatttcttga
agatttctgaaatttatttga
gaattctgacctctgttttcttacctgttatttgtttttctaccttcttg
agaatttgtaagtcctgtgaaggagagaaaatttaaagagattgtggaat
aaagtcaggtcatgctcaactttatctcttcttcatttgtcaaagaaata
ttggagcccctgaagatcagctggcccttcactttacatcctctctcttg
gtgacaacattcagtgttttaggttgaatggaactcctccaggccctggc
aggaaagggatttgaaaacccttcctctacaaacctctagaaatattgaa
cagtgtatgcaaaaatcattttcagtgtatgttcaaagagacaaaggatg
tcaaatattgggaggaaaataggcctccaaatgccaaaaaataagccaat
gatcattaaaaagtatcaaaaaatccctggcaagatgcctaagaagaaat
tttcagatgtatagtgataatttggcaaaataatgaaatgaggctgatgt
atatacacacaaaggaaatcaatgacacatcccactgaagactgatgggt
taagctgacaagttagaacaaacgcaacaatccaagcacctgagtaatca
gcttcatatgcatataatcccacatcaaaaagtcaaataatacattttaa
gtaaacaactaaatgtctataaagcttgactctatttgcatcaaactaac
tttccatgtgtatagaaagacctatagacacaaaccaaatcatggcacca
cagaacatgaaaatggactacaattttaaaaagtaggcaagataccagct
tgatagacatgtggctacaatgtaaaatataaaagatatgtgatgtagcc
aggaagtggtggcacacacccttaattccagcatttgggtggcaaaggcc
ggtcaatttctgagttcgagccagcctggtctacagagtgagttccagga
cagccagggctacacacagaaaccttgtctcaaagatgagtgagagagag
agagagagagtgaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr17_94995129_94996242
seq2: B6Ng01-076J24.b_48_1168 (reverse)

seq1  TCCAATAAATGTCAG-AATCTTC-AGAAATATCAA--GAACACTCAATGT  46
      || ||||||| |||| ||||||| |||||||||||   |||||||| |||
seq2  TCAAATAAATTTCAGAAATCTTCAAGAAATATCAAAGAAACACTCATTGT  50

seq1  CTACC-TAGCCCACATAATTA-ATTTAGAAACTCTCAGGGTGGTTCTTTC  94
        ||| ||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCTTAGCCCAC--CATTATATTTAGAAACTCTCAGGGTGGTTCTTTC  98

seq1  AGTCAAGAGCCATGAGTAGG-CCAAGGTACCCATTGAGAATGACTCAAG-  142
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  AGTCAAGAGCCATGAGTAGGCCCAAGGTACCCATTGAGAATGACTCAAGC  148

seq1  CCACATTCACAGG-CCAAGAGCATCATATAAAAGCAAATAATAAGCAATG  191
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACATTCACAGGCCCAAGAGCATCATATAAAAGCAAATAATAAGCAATG  198

seq1  AGGTTCTAGAATTGACATTCAAGTCATCTGAATACACTGGCAAACATATG  241
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTCTAGAATTGACATTCAAGTCATCTGAATACACTGGCAAACATATG  248

seq1  CCACCGATGTGACTAATAGCACAGTGTCAGCTAAGGTCTGTGTGGCACCA  291
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCGATGTGACTAATAGCACAGTGTCAGCTAAGGTCTGTGTGGCACCA  298

seq1  TCTTCCTGAGAGGCACCAGGTGTGCTGTACTGTCTCACACCATGATTGTC  341
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCCTGAGAGGCACCAGGTGTGCTGTACTGTCTCACACCATGATTGTC  348

seq1  TTGGAAATAGAACCTGTCAAAGCTCCTTCACCTATTGATAGACAGTGAAT  391
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGAAATAGAACCTGTCAAAGCTCCTTCACCTATTGATAGACAGTGAAT  398

seq1  CCTTGCTTCATTCTAAAATGCAGGCTCCTTTGTTCCCTAACTGTTGGAAC  441
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGCTTCATTCTAAAATGCAGGCTCCTTTGTTCCCTAACTGTTGGAAC  448

seq1  AGTTTGTATCTAGCTAGCCTAAACAACTCTACATGAACTCCTTATGCAGA  491
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTGTATCTAGCTAGCCTAAACAACTCTACATGAACTCCTTATGCAGA  498

seq1  AATCTCTGCTACATTCTAAGGTGCAAAGAACACAAAGAAGGTCCATTTTG  541
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTCTGCTACATTCTAAGGTGCAAAGAACACAAAGAAGGTCCATTTTG  548

seq1  TCCCCTTGCCATGGAGAGTTCCCATGGTACTAAGGCTCTAGCTATAAACA  591
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCTTGCCATGGAGAGTTCCCATGGTACTAAGGCTCTAGCTATAAACA  598

seq1  GTCTACAAGGCCACAGACATTTCCTGTCCTAAACATTTCCTCTTAAGGGG  641
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTACAAGGCCACAGACATTTCCTGTCCTAAACATTTCCTCTTAAGGGG  648

seq1  TGTAAACTTAGAGATAATCCCATACACACTATACTTGGTTTACTCTGTTA  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAACTTAGAGATAATCCCATACACACTATACTTGGTTTACTCTGTTA  698

seq1  ACTACTTAAAGTGGCATGTTTACCTTGTTATCAAAAGTGCTTTAAATGAA  741
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACTTAAAGTGGCATGTTTACCTTGTTATCAAAAGTGCTTTAAATGAA  748

seq1  TACAACTTCTAGAGGCAATTATCAAGCTTTTGATCTAAGCTTGGAATCCT  791
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAACTTCTAGAGGCAATTATCAAGCTTTTGATCTAAGCTTGGAATCCT  798

seq1  ATTCAATACTCCCTGGTCTCTAAGCCTATCTTATCACCAACATGGGCTTA  841
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAATACTCCCTGGTCTCTAAGCCTATCTTATCACCAACATGGGCTTA  848

seq1  GTTCAAAGCTTCTCCAGTATCTAACAGATCATGATACCACTTAGACTGGA  891
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCAAAGCTTCTCCAGTATCTAACAGATCATGATACCACTTAGACTGGA  898

seq1  TATAGAAGTCTTTATACTTCCTGTATGTTTTCTGGGCTGTTATATATTTA  941
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGAAGTCTTTATACTTCCTGTATGTTTTCTGGGCTGTTATATATTTA  948

seq1  GTGGCTAGTTAAAGTTTGATTAGGACTCTGGTTTTTACATTCAGCATTGG  991
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCTAGTTAAAGTTTGATTAGGACTCTGGTTTTTACATTCAGCATTGG  998

seq1  CAAATAATTACCAAGTTTATTATGCCATCATCCACATCTGCTGTCAACTG  1041
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATAATTACCAAGTTTATTATGCCATCATCCACATCTGCTGTCAACTG  1048

seq1  AGGAACACATTACATTGCTTAATAATTAAGCACAGTTTGTTCTGTACATT  1091
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAACACATTACATTGCTTAATAATTAAGCACAGTTTGTTCTGTACATT  1098

seq1  TTTCTCTTTTTTACCATGAATTC  1114
      |||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTCTTTTTTACCATGAATTC  1121

seq1: chr17_94811721_94812736
seq2: B6Ng01-076J24.g_69_1083

seq1  GAATTCTGACCTCTGTTTTCTTACCTGTTATTTGTTTTTCTACCTTCTTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGACCTCTGTTTTCTTACCTGTTATTTGTTTTTCTACCTTCTTG  50

seq1  AGAATTTGTAAGTCCTGTGAAGGAGAGAAAATTTAAAGAGATTGTGGAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATTTGTAAGTCCTGTGAAGGAGAGAAAATTTAAAGAGATTGTGGAAT  100

seq1  AAAGTCAGGTCATGCTCAACTTTATCTCTTCTTCATTTGTCAAAGAAATA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTCAGGTCATGCTCAACTTTATCTCTTCTTCATTTGTCAAAGAAATA  150

seq1  TTGGAGCCCCTGAAGATCAGCTGGCCCTTCACTTTACATCCTCTCTCTTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGAGCCCCTGAAGATCAGCTGGCCCTTCACTTTACATCCTCTCTCTTG  200

seq1  GTGACAACATTCAGTGTTTTAGGTTGAATGGAACTCCTCCAGGCCCTGGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACAACATTCAGTGTTTTAGGTTGAATGGAACTCCTCCAGGCCCTGGC  250

seq1  AGGAAAGGGATTTGAAAACCCTTCCTCTACAAACCTCTAGAAATATTGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAAGGGATTTGAAAACCCTTCCTCTACAAACCTCTAGAAATATTGAA  300

seq1  CAGTGTATGCAAAAATCATTTTCAGTGTATGTTCAAAGAGACAAAGGATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGTATGCAAAAATCATTTTCAGTGTATGTTCAAAGAGACAAAGGATG  350

seq1  TCAAATATTGGGAGGAAAATAGGCCTCCAAATGCCAAAAAATAAGCCAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAATATTGGGAGGAAAATAGGCCTCCAAATGCCAAAAAATAAGCCAAT  400

seq1  GATCATTAAAAAGTATCAAAAAATCCCTGGCAAGATGCCTAAGAAGAAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCATTAAAAAGTATCAAAAAATCCCTGGCAAGATGCCTAAGAAGAAAT  450

seq1  TTTCAGATGTATAGTGATAATTTGGCAAAATAATGAAATGAGGCTGATGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAGATGTATAGTGATAATTTGGCAAAATAATGAAATGAGGCTGATGT  500

seq1  ATATACACACAAAGGAAATCAATGACACATCCCACTGAAGACTGATGGGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATACACACAAAGGAAATCAATGACACATCCCACTGAAGACTGATGGGT  550

seq1  TAAGCTGACAAGTTAGAACAAACGCAACAATCCAAGCACCTGAGTAATCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGCTGACAAGTTAGAACAAACGCAACAATCCAAGCACCTGAGTAATCA  600

seq1  GCTTCATATGCATATAATCCCACATCAAAAAGTCAAATAATACATTTTAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCATATGCATATAATCCCACATCAAAAAGTCAAATAATACATTTTAA  650

seq1  GTAAACAACTAAATGTCTATAAAGCTTGACTCTATTTGCATCAAACTAAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAACAACTAAATGTCTATAAAGCTTGACTCTATTTGCATCAAACTAAC  700

seq1  TTTCCATGTGTATAGAAAGACCTATAGACACAAACCAAATCATGGCACCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCATGTGTATAGAAAGACCTATAGACACAAACCAAATCATGGCACCA  750

seq1  CAGAACATGAAAATGGACTACAA-TTTAAAAAGTAGGCAAGATACCAGCT  799
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAACATGAAAATGGACTACAATTTTAAAAAGTAGGCAAGATACCAGCT  800

seq1  TGATAGACATGTGGCTACAATGTAAAATATAAAAGATATGTGATGTAGCC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAGACATGTGGCTACAATGTAAAATATAAAAGATATGTGATGTAGCC  850

seq1  AGGAAGTGGTGGCACACACCTTTAATTCCAGCATTTGGGTGGCAAAGGCC  899
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGTGGTGGCACACACCCTTAATTCCAGCATTTGGGTGGCAAAGGCC  900

seq1  GGTCAATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCAGG  949
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCAATTTCTGAGTTCGA-GCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCAGG  949

seq1  ACAGCCAGGGCTACACACAGAAACCTTGTCTCAAAAGATGAGTGAGAGAG  999
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  ACAGCCAGGGCTACACACAGAAACCTTGTCTC-AAAGATGAGTGAGAGAG  998

seq1  AGAGAGAGAGAGAGAGA  1016
      |||||||||||| ||||
seq2  AGAGAGAGAGAGTGAGA  1015