BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-102M02
Chromosome17 (Build37)
Map Location 75,845,506 - 76,036,012
singlet/doubletdoublet
Overlap geneRasgrp3, 2810405J04Rik
Upstream geneNlrc4, LOC624159, Yipf4, Birc6, Ttc27, LOC100043672, Ltbp1, EG621988
Downstream geneLOC668787, LOC100043885, LOC100043886
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-102M02.bB6Ng01-102M02.g
ACCDH911557DH911558
length910717
definitionDH911557|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-102M02, 5' end.DH911558|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-102M02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(76,035,080 - 76,036,012)(75,845,506 - 75,846,221)
sequence
gaattctacgttgtccttcttctgtctctatctcccacctgggattacac
atgtccaccaccgcgctcataggtgcatctgagggagctcatagggagaa
agaaggaaagatctttcacatgccatgcagcagcgctaacccaggatttt
cagaatggtcattgaatcccaggaaataattctgaaaaaaattgtaactg
aaaggaagcccatcacagtttggtctttttgttgttgttttggtgttgtt
gttgttgttgtggtgctgctgctgctgctgctgctgctgttgttgttgtt
gttgttgttgttgttgttgttgttgttgctgctgctgctgtgatcaaatg
ctgcccaaaataatcttgggaaagaaacaggtttatttgtcttactggtt
ataggcatcactgagagaggtcagcacaggaacgtggaagaagaaagcat
agaggaccactgttttcttacttcccctagctggagctgttacctttgat
acttatataacacaggatcacattcctaaggacagcaccctcatagtgtg
ctgtttcaccctacatcaatcagtaaccacaaattatttccaaacatagc
cacaggccaaccctatggaggcaactaaggtcccctgtccctaggtctgt
caagctgacagtcaaactcgacatcattaagtccatagcattcacataga
aaaatgctctcttcagaccattcatgcagatcctctcaattaaaagtcac
ctcaaaaaaatgattcttcagcaacatgttcttccacctcacgcatatca
gtatcttgtatacttctacccgttctcatatactaatatatggagattac
tccatatagcttcatggaatatctgctacttactactcagtataatgtat
cttgcacatt
gaattcaaagaaatctacctacctctgtcttctgagtgctgggattaaag
gtgggaaccaccaaatttggttaatttaactttttaaaatgtatttatgt
atggacagggtctttctgggtaccccaggctggcctccaatttcaaagtg
tagcccaagctaacttcaaacttttaatcctcctgccaatgtttcccaag
tactgggattacaggtctacctcatgatacccaacccttgcccataacag
atttgtttgattgtttgtttgtttcctgctgtatggttggaatagctact
tgacaaggattcaatcttttttaaatttgttaaagcttgttttgtgacct
accagaaggcctatcctggagtctgttctgcacatgctttacttaaaagg
atgcaatatatcatgttgttgggtggaatcttctctgtgttaaacctact
caacgtatagtgcgttgttcaactctattatttccactttggtttatttc
tactgtctaatgaagtctaaattccctgtgattatattgtctatttctac
cttaagttttgatcaaatttctgtttcaataataatctcttttgtctttc
cttccttccttccttccttccatccttccttccttccttcctccttcctc
cctccctccctccctttccttccttttcctttcctttcctttcctttcct
ttcctttcctttccatt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr17_76035080_76036012
seq2: B6Ng01-102M02.b_44_953 (reverse)

seq1  AATGTGCAAGGATTAACATTTTATACTTGAAGTTATGTAGAGTAA--AGC  48
      ||||||||| |||  |||  |||||||   |||       |||||  |||
seq2  AATGTGCAA-GAT--ACA--TTATACT--GAGT-------AGTAAGTAGC  36

seq1  AGATATTTTCCATGAGGCTATATGGAGTATATCTCCATATATTTAGTATA  98
      |||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
seq2  AGATA--TTCCATGAAGCTATATGGAGTA-ATCTCCATATA-TTAGTATA  82

seq1  TGAGAAAAGGGGTTAGAAGTATACAAGATACTGATATGCGTGAGGTGGAA  148
      ||||||    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAA---CGGGTAGAAGTATACAAGATACTGATATGCGTGAGGTGGAA  129

seq1  GAACATGTTTGCTGAAGAATCATTTTTTTTGAGGTGACTTTTAATTTGAG  198
      ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||
seq2  GAACATG-TTGCTGAAGAATCA-TTTTTTTGAGGTGACTTTTAA-TTGAG  176

seq1  AGGATCTGCATGAATGGTCTGAAGAGAGCATTTTTCTATGTGAATGCTAT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATCTGCATGAATGGTCTGAAGAGAGCATTTTTCTATGTGAATGCTAT  226

seq1  GGACTTAATGATGTCGAGTTTGACTGTCAGCTTGACAGACCTAGGGACAG  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTTAATGATGTCGAGTTTGACTGTCAGCTTGACAGACCTAGGGACAG  276

seq1  GGGACCTTAGTTGCCTCCATAGGGTTGGCCTGTGGCTATGTTTGGAAAAT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  GGGACCTTAGTTGCCTCCATAGGGTTGGCCTGTGGCTATGTTTGG-AAAT  325

seq1  AATTTGTGGTTACTGATTGATGTAGGGTGAAACAGCACACTATGAGGGTG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTGTGGTTACTGATTGATGTAGGGTGAAACAGCACACTATGAGGGTG  375

seq1  CTGTCCTTAGGAATGTGATCCTGTGTTATATAAGTATCAAAGGTAACAGC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCCTTAGGAATGTGATCCTGTGTTATATAAGTATCAAAGGTAACAGC  425

seq1  TCCAGCTAGGGGAAGTAAGAAAACAGTGGTCCTCTATGCTTTCTTCTTCC  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGCTAGGGGAAGTAAGAAAACAGTGGTCCTCTATGCTTTCTTCTTCC  475

seq1  ACGTTCCTGTGCTGACCTCTCTCAGTGATGCCTATAACCAGTAAGACAAA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTTCCTGTGCTGACCTCTCTCAGTGATGCCTATAACCAGTAAGACAAA  525

seq1  TAAACCTGTTTCTTTCCCAAGATTATTTTGGGCAGCATTTGATCACAGCA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACCTGTTTCTTTCCCAAGATTATTTTGGGCAGCATTTGATCACAGCA  575

seq1  GCAGCAGCAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAGC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCAGCAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAGC  625

seq1  AGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCACCACAACAACAACAACAACACCAAAACA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCACCACAACAACAACAACAACACCAAAACA  675

seq1  ACAACAAAAAGACCAAACTGTGATGGGCTTCCTTTCAGTTACAATTTTTT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACAAAAAGACCAAACTGTGATGGGCTTCCTTTCAGTTACAATTTTTT  725

seq1  TCAGAATTATTTCCTGGGATTCAATGACCATTCTGAAAATCCTGGGTTAG  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAATTATTTCCTGGGATTCAATGACCATTCTGAAAATCCTGGGTTAG  775

seq1  CGCTGCTGCATGGCATGTGAAAGATCTTTCCTTCTTTCTCCCTATGAGCT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCTGCTGCATGGCATGTGAAAGATCTTTCCTTCTTTCTCCCTATGAGCT  825

seq1  CCCTCAGATGCACCTATGAGCGCGGTGGTGGACATGTGTAATCCCAGGTG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCAGATGCACCTATGAGCGCGGTGGTGGACATGTGTAATCCCAGGTG  875

seq1  GGAGATAGAGACAGAAGAAGGACAACGTAGAATTC  933
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGATAGAGACAGAAGAAGGACAACGTAGAATTC  910

seq1: chr17_75845506_75846221
seq2: B6Ng01-102M02.g_68_784

seq1  GAATTCAAAGAAATCTACCTACCTCTGTCTTCTGAGTGCTGGGATTAAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAAGAAATCTACCTACCTCTGTCTTCTGAGTGCTGGGATTAAAG  50

seq1  GTGGGAACCACCAAATTTGGTTAATTTAACTTTTTAAAATGTATTTATGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGAACCACCAAATTTGGTTAATTTAACTTTTTAAAATGTATTTATGT  100

seq1  ATGGACAGGGTCTTTCTGGGTACCCCAGGCTGGCCTCCAATTTCAAAGTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGACAGGGTCTTTCTGGGTACCCCAGGCTGGCCTCCAATTTCAAAGTG  150

seq1  TAGCCCAAGCTAACTTCAAACTTTTAATCCTCCTGCCAATGTTTCCCAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCCAAGCTAACTTCAAACTTTTAATCCTCCTGCCAATGTTTCCCAAG  200

seq1  TACTGGGATTACAGGTCTACCTCATGATACCCAACCCTTGCCCATAACAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGGGATTACAGGTCTACCTCATGATACCCAACCCTTGCCCATAACAG  250

seq1  ATTTGTTTGATTGTTTGTTTGTTTCCTGCTGTATGGTTGGAATAGCTACT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGTTTGATTGTTTGTTTGTTTCCTGCTGTATGGTTGGAATAGCTACT  300

seq1  TGACAAGGATTCAATCTTTTTTAAATTTGTTAAAGCTTGTTTTGTGACCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAAGGATTCAATCTTTTTTAAATTTGTTAAAGCTTGTTTTGTGACCT  350

seq1  ACCAGAAGGCCTATCCTGGAGTCTGTTCTGCACATGCTTTACTTAAAAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGAAGGCCTATCCTGGAGTCTGTTCTGCACATGCTTTACTTAAAAGG  400

seq1  ATGCAATATATCATGTTGTTGGGTGGAATCTTCTCTGTGTTAAACCTACT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAATATATCATGTTGTTGGGTGGAATCTTCTCTGTGTTAAACCTACT  450

seq1  CAACGTATAGTGCGTTGTTCAACTCTATTATTTCCACTTTGGTTTATTTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACGTATAGTGCGTTGTTCAACTCTATTATTTCCACTTTGGTTTATTTC  500

seq1  TACTGTCTAATGAAGTCTAAATTCCCTGTGATTATATTGTCTATTTCTAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGTCTAATGAAGTCTAAATTCCCTGTGATTATATTGTCTATTTCTAC  550

seq1  CTTAAGTTTTGATCAAATTTCTGTTTCAATAATAATCTCTTTTGTCTTTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAAGTTTTGATCAAATTTCTGTTTCAATAATAATCTCTTTTGTCTTTC  600

seq1  CTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTCCTTCCTC  650
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCATCCTTCCTTCCTTCCTTCCTCCTTCCTC  650

seq1  CCTCCCTCCCTCCCTTTCCTTCC-TTTCCTTTCCTTTCCTTTCCTTTCCT  699
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCCTCCCTCCCTTTCCTTCCTTTTCCTTTCCTTTCCTTTCCTTTCCT  700

seq1  TTCCTTTCCTTTCCTTT  716
      |||||||||||||| ||
seq2  TTCCTTTCCTTTCCATT  717