BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-104O12
Chromosome17 (Build37)
Map Location 79,170,637 - 79,265,943
singlet/doubletdoublet
Overlap geneHeatr5b, 2310002B06Rik, EG625054, Eif2ak2
Upstream geneLOC668795, LOC383275, Crim1, Fez2, LOC100043888, Hdac1-ps, Vit, Strn
Downstream gene2410078J06Rik, Cebpz, 2410091C18Rik, Prkcn, LOC675425, Qpct, LOC668812, LOC383277, Cdc42ep3, LOC639964, AW061290, Cyp1b1, EG668821, Arl6ip2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-104O12.bB6Ng01-104O12.g
ACCDH913074DH913075
length1,1211,192
definitionDH913074|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-104O12, 5' end.DH913075|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-104O12, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(79,264,815 - 79,265,943)(79,170,637 - 79,171,842)
sequence
gaattctctgtttaatatgggaggtcaagttgaaaaaggaagagggagat
gtttttttgtgactcaggagttctggcagacattattaaaaacaataagg
gaagaatcattttcatcatacatgaaacactgaacctcagggtaacagca
atatcaatcttatctaggtttaacagcgattttgaagacatagaagaaat
tggcttaggtggatttggtcaagttttcaaagcgaaacacagaattgatg
gaaagagatacgctattaagcgcgttaaatataacacggagtgagtacct
gtcttgctctttgaacagtgtgttgaactcccagctctcgcctttatgtg
cctatccttctttgcctgctaatttctttctggtcctccttgattttttt
ttcctgactacaagagtttgacttatcctgaaatgaccttaccttactaa
cattggttatttatttcagtttaaaatatgactgtatcattttgagatag
tgctgaaacctcaagctgttgacttaacttggtctaaggaggtttcctca
attttctccattttgaggctccctcctctctgatgtttcaaacttgtatc
acattgacctaaaaagagccacaggctaatttcaggaaaaccgcacggtg
tcttagctcttgagccctgttgctgtaaagctttcattgtacagagtctt
ggcttctttgcataaactaagcccctcgatttatgtttgtcacacagtga
agtttctaagttaggctctgcttgctgcttgggttgactacccttgctgc
ccaaatgggacttgtttgtgaacttcaaagattttaacacatcttctcaa
cagagtatcaaccatgatgtagctattgaaaactgttacagacagtcaaa
ggagatgcaaacgatgcatacctttggatagctaccattaagcctctgtc
ttcttcttatacattgagaatgagacagctgtggtttgggatatggcttt
actattcattcagttttcttccctttggaggttcttgctccaagctaaaa
aaaactggcatgggactcaggactacagagaagaggagctgcgtgctgca
tccattacgtaaggggttctg
gaattctttcagggaacttcaggaggtgagaaaagacagcccaaatggga
aactacaaagagcatgaggatgatgtgagggctcaggaggggataactga
cagcagagagctagctttgaactgcctgctgctttcaagtgcctgcctgc
tatctactctttcctccaagtttccactcaaacatgacttgctccaaaat
ttgcagcccgggcctccagactagcttagtgccctgccctgcttcaaagc
tctaggtttcccctgtggtagctctctttcctttcggtcacatcttctag
ttctgagtttgtcttgctaagtaaatagagcacatctgccttgttctaaa
acttgcctaagtaagtaatatccaatgtcacacagttcacataaacctaa
agatttggaagcgttggcaaacaaactctctaagtgaaaaagcagaggta
aaacttagtccagcatgtcagacctaggacatgctggagtaagtctgagt
ggacagactaggacatgctggagtaagtctgagtggacagactaggacat
gctggagtaagtctgagtgggcagactaggacatgctggagtaagtctga
gaggacagactaggacatgctggagtaagtctgagaggacagactagggt
atgctggagtaagtctgagaggacagactaggacatgctggagtaagtct
gagtggacggacctaggatatgctagcacctgagaaagtgataaaagaaa
tgaagtgaagtggtgtaacaatttcccagtcagcaggaaaaactaagcct
gaggtacaaatagctaaacaataatacatattacccccaactacaaaaga
actccaaatgaatgcacactactaattctgttatgtggcattctgaccta
ctttttttttttaaagattcattcatttgtcatatgtagtacactgtaac
tgttttcacacactccagagagggagtcagatcttgttaagatgtttgtg
agctaccatgtggtgctgggatttgaactctggaccttcagaagaagagt
cgggtgctcttaccactgagcatctcacagcccctgactaatttttaggc
atttatttatccaggttaggtgtcaggcacaatgctttgacactttatcc
gccatggcttcacaaagatccttctacttttaggaaactgag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr17_79264815_79265943
seq2: B6Ng01-104O12.b_46_1166 (reverse)

seq1  CAGAACACCTTACGTAATGGGATGCAAGCACGCAGGCTCCTC-TCTCTGT  49
      |||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||
seq2  CAGAACCCCTTACGTAAT-GGATGC-AGCACGCA-GCTCCTCTTCTCTGT  47

seq1  AGTCCTTGTGGTTCCCATGCCAAGTTTTTTTTTAGCTTGGAGCCAGAA-C  98
      |||||   ||  ||||||||||   |||||||||||||||||| |||| |
seq2  AGTCC---TGAGTCCCATGCCA--GTTTTTTTTAGCTTGGAGCAAGAACC  92

seq1  TCAAAAGGGAAGAAAACTGAATGAATAGTAAAGCCATATCCCAAACCACA  148
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAAGGGAAGAAAACTGAATGAATAGTAAAGCCATATCCCAAACCACA  142

seq1  GCTGTTCTCATTCTCAATGTATAAGAAGAAGACAGAGGCTTAAATGGTAG  198
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  GCTG-TCTCATTCTCAATGTATAAGAAGAAGACAGAGGCTT-AATGGTAG  190

seq1  CTATCCAAAGGTATGCATCGTTTGCATCTCCTTTTGACTGTCTGTAACAG  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  CTATCCAAAGGTATGCATCGTTTGCATCTCC-TTTGACTGTCTGTAACAG  239

seq1  TTTTCAATAGCTACATCATGGTTGATACTCTGTTGAGAAGATGTGTTAAA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCAATAGCTACATCATGGTTGATACTCTGTTGAGAAGATGTGTTAAA  289

seq1  ATCTTTGAAGTTCACAAACAAGTCCCATTTGGGCAGCAAGGGTAGTCAAC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTTGAAGTTCACAAACAAGTCCCATTTGGGCAGCAAGGGTAGTCAAC  339

seq1  CCAAGCAGCAAGCAGAGCCTAACTTAGAAACTTCACTGTGTGACAAACAT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGCAGCAAGCAGAGCCTAACTTAGAAACTTCACTGTGTGACAAACAT  389

seq1  AAATCGAGGGGCTTAGTTTATGCAAAGAAGCCAAGACTCTGTACAATGAA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCGAGGGGCTTAGTTTATGCAAAGAAGCCAAGACTCTGTACAATGAA  439

seq1  AGCTTTACAGCAACAGGGCTCAAGAGCTAAGACACCGTGCGGTTTTCCTG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTTACAGCAACAGGGCTCAAGAGCTAAGACACCGTGCGGTTTTCCTG  489

seq1  AAATTAGCCTGTGGCTCTTTTTAGGTCAATGTGATACAAGTTTGAAACAT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTAGCCTGTGGCTCTTTTTAGGTCAATGTGATACAAGTTTGAAACAT  539

seq1  CAGAGAGGAGGGAGCCTCAAAATGGAGAAAATTGAGGAAACCTCCTTAGA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGAGGAGGGAGCCTCAAAATGGAGAAAATTGAGGAAACCTCCTTAGA  589

seq1  CCAAGTTAAGTCAACAGCTTGAGGTTTCAGCACTATCTCAAAATGATACA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGTTAAGTCAACAGCTTGAGGTTTCAGCACTATCTCAAAATGATACA  639

seq1  GTCATATTTTAAACTGAAATAAATAACCAATGTTAGTAAGGTAAGGTCAT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATATTTTAAACTGAAATAAATAACCAATGTTAGTAAGGTAAGGTCAT  689

seq1  TTCAGGATAAGTCAAACTCTTGTAGTCAGGAAAAAAAAATCAAGGAGGAC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGGATAAGTCAAACTCTTGTAGTCAGGAAAAAAAAATCAAGGAGGAC  739

seq1  CAGAAAGAAATTAGCAGGCAAAGAAGGATAGGCACATAAAGGCGAGAGCT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAAGAAATTAGCAGGCAAAGAAGGATAGGCACATAAAGGCGAGAGCT  789

seq1  GGGAGTTCAACACACTGTTCAAAGAGCAAGACAGGTACTCACTCCGTGTT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGTTCAACACACTGTTCAAAGAGCAAGACAGGTACTCACTCCGTGTT  839

seq1  ATATTTAACGCGCTTAATAGCGTATCTCTTTCCATCAATTCTGTGTTTCG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTTAACGCGCTTAATAGCGTATCTCTTTCCATCAATTCTGTGTTTCG  889

seq1  CTTTGAAAACTTGACCAAATCCACCTAAGCCAATTTCTTCTATGTCTTCA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGAAAACTTGACCAAATCCACCTAAGCCAATTTCTTCTATGTCTTCA  939

seq1  AAATCGCTGTTAAACCTAGATAAGATTGATATTGCTGTTACCCTGAGGTT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCGCTGTTAAACCTAGATAAGATTGATATTGCTGTTACCCTGAGGTT  989

seq1  CAGTGTTTCATGTATGATGAAAATGATTCTTCCCTTATTGTTTTTAATAA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGTTTCATGTATGATGAAAATGATTCTTCCCTTATTGTTTTTAATAA  1039

seq1  TGTCTGCCAGAACTCCTGAGTCACAAAAAAACATCTCCCTCTTCCTTTTT  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTGCCAGAACTCCTGAGTCACAAAAAAACATCTCCCTCTTCCTTTTT  1089

seq1  C-TCTTGACCTCCCATATTAAACAGAGAATTC  1129
      |  |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTTGACCTCCCATATTAAACAGAGAATTC  1121

seq1: chr17_79170637_79171842
seq2: B6Ng01-104O12.g_69_1260

seq1  GAATTCTTTCAGGGAACTTCAGGAGGTGAGAAAAGACAGCCCAAATGGGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTCAGGGAACTTCAGGAGGTGAGAAAAGACAGCCCAAATGGGA  50

seq1  AACTACAAAGAGCATGAGGATGATGTGAGGGCTCAGGAGGGGATAACTGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTACAAAGAGCATGAGGATGATGTGAGGGCTCAGGAGGGGATAACTGA  100

seq1  CAGCAGAGAGCTAGCTTTGAACTGCCTGCTGCTTTCAAGTGCCTGCCTGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAGAGAGCTAGCTTTGAACTGCCTGCTGCTTTCAAGTGCCTGCCTGC  150

seq1  TATCTACTCTTTCCTCCAAGTTTCCACTCAAACATGACTTGCTCCAAAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTACTCTTTCCTCCAAGTTTCCACTCAAACATGACTTGCTCCAAAAT  200

seq1  TTGCAGCCCGGGCCTCCAGACTAGCTTAGTGCCCTGCCCTGCTTCAAAGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCAGCCCGGGCCTCCAGACTAGCTTAGTGCCCTGCCCTGCTTCAAAGC  250

seq1  TCTAGGTTTCCCCTGTGGTAGCTCTCTTTCCTTTCGGTCACATCTTCTAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGGTTTCCCCTGTGGTAGCTCTCTTTCCTTTCGGTCACATCTTCTAG  300

seq1  TTCTGAGTTTGTCTTGCTAAGTAAATAGAGCACATCTGCCTTGTTCTAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGAGTTTGTCTTGCTAAGTAAATAGAGCACATCTGCCTTGTTCTAAA  350

seq1  ACTTGCCTAAGTAAGTAATATCCAATGTCACACAGTTCACATAAACCTAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGCCTAAGTAAGTAATATCCAATGTCACACAGTTCACATAAACCTAA  400

seq1  AGATTTGGAAGCGTTGGCAAACAAACTCTCTAAGTGAAAAAGCAGAGGTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTTGGAAGCGTTGGCAAACAAACTCTCTAAGTGAAAAAGCAGAGGTA  450

seq1  AAACTTAGTCCAGCATGTCAGACCTAGGACATGCTGGAGTAAGTCTGAGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTTAGTCCAGCATGTCAGACCTAGGACATGCTGGAGTAAGTCTGAGT  500

seq1  GGACAGACTAGGACATGCTGGAGTAAGTCTGAGTGGACAGACTAGGACAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACAGACTAGGACATGCTGGAGTAAGTCTGAGTGGACAGACTAGGACAT  550

seq1  GCTGGAGTAAGTCTGAGTGGGCAGACTAGGACATGCTGGAGTAAGTCTGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGAGTAAGTCTGAGTGGGCAGACTAGGACATGCTGGAGTAAGTCTGA  600

seq1  GAGGACAGACTAGGACATGCTGGAGTAAGTCTGAGAGGACAGACTAGGGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGACAGACTAGGACATGCTGGAGTAAGTCTGAGAGGACAGACTAGGGT  650

seq1  ATGCTGGAGTAAGTCTGAGAGGACAGACTAGGACATGCTGGAGTAAGTCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTGGAGTAAGTCTGAGAGGACAGACTAGGACATGCTGGAGTAAGTCT  700

seq1  GAGTGGACGGACCTAGGATATGCTAGCACCTGAGAAAGTGATAAAAGAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGGACGGACCTAGGATATGCTAGCACCTGAGAAAGTGATAAAAGAAA  750

seq1  TGAAGTGAAGTGGTGTAACAA-TTCCCAGTCAGCAGGAAAAACTAAGCCT  799
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGTGAAGTGGTGTAACAATTTCCCAGTCAGCAGGAAAAACTAAGCCT  800

seq1  GAGGTACAAATAGCTAAACAATAATACATATTACCCCCAACTACAAAAGA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTACAAATAGCTAAACAATAATACATATTACCCCCAACTACAAAAGA  850

seq1  ACTCCAAATGAATGCACACTACTAATTCTGTTATGTGGCATTCTGACCTA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCAAATGAATGCACACTACTAATTCTGTTATGTGGCATTCTGACCTA  900

seq1  CTTTTTTTTTTTTAAAGATTCATTCATTTGTCATATGTAAGTACACTGTA  949
      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  C-TTTTTTTTTTTAAAGATTCATTCATTTGTCATATGT-AGTACACTGTA  948

seq1  ACTGTTTTCACACACTCCAGAAGAGGGAGTCAGATCTTGTTAAAGATGGT  999
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |
seq2  ACTGTTTTCACACACTCCAG-AGAGGGAGTCAGATCTTGTT-AAGATGTT  996

seq1  TGTGAGCTACCATGTGGTTGCTGGGATTTGAACTCTGGACCTTCAGAAGA  1049
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGCTACCATGTGG-TGCTGGGATTTGAACTCTGGACCTTCAGAAGA  1045

seq1  GTAGTCGGGTGCTCTTACCCACTGAGCCATCTCACCAGCCCCTGACCTAA  1099
        ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||
seq2  AGAGTCGGGTGCTCTTA-CCACTGAG-CATCTCA-CAGCCCCTGA-CTAA  1091

seq1  TTTTTAAGGCATTTATTTATCAAAGTTAGGTGTCAGGCACAATGGTTTG-  1148
      ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| 
seq2  TTTTT-AGGCATTTATTTATCCAGGTTAGGTGTCAGGCACAATGCTTTGA  1140

seq1  CACTGTTATACCGCATGGCTTACAAAAGATCTTTCTACTTTTTTATGATA  1198
      |||| |||| |  ||||||||   ||||||| ||||||||||     |  
seq2  CACT-TTATCCGCCATGGCTTCACAAAGATCCTTCTACTTTT-----AGG  1184

seq1  AAACTGAG  1206
      ||||||||
seq2  AAACTGAG  1192