BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-130A07
Chromosome17 (Build37)
Map Location 44,409,972 - 44,515,182
singlet/doubletdoublet
Overlap geneClic5
Upstream geneGpr110, Gpr116, Mep1a, LOC100043332, Pla2g7, Tdrd6, Slc25a27, Cyp39a1, Dscr1l1, Enpp5, Enpp4
Downstream geneRunx2, Supt3h, 4930564C03Rik, EG210562, EG668314
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-130A07.bB6Ng01-130A07.g
ACCDH931441DH931442
length1,159902
definitionDH931441|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-130A07, 5' end.DH931442|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-130A07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(44,514,016 - 44,515,182)(44,409,972 - 44,410,877)
sequence
gaattcaagcacaaaatcccaagatgggtggttcccgaggaacagcgcag
agaacaggttgttttctgacctccatgtgcacgcatacacacttgcacat
gcatgcatttatatacacacaggaaaaccctgacatacacacacacacac
acacacacacacacacacacacactgagagagagagagagagagagagag
agagagagagagagagagatgttaacacgagataaaaatcttgactccag
gaggaattatcctgcagagtttctcatttcttctgtacctcagtgtacaa
gcaaccagatagaagaaaatggctttactagattgtgggtcaatagtgtt
gtgaggaggtgccaaccctggcatttttagcaactctgatttgcataccc
tgtcccacaattgtctagcctactcttgagctaggatggacccatgtgtg
gcttttgatttgccaaggtatctttattttcaccttgaggcatagtttgc
agcattggattcctaactcataagcagatgctccaaagttctgtttttag
gcgcattcaagaggtccagagagagatggagcacggagagctacactctc
ctccttgtgcatcctctctgggaaaggcactgcttcacatccatcaggaa
ctggctaggcttacctggcttgattttgtggaatgtaccatagatctttc
ctatctgaaactctaaatggcatacacataaactcacatgacagtcatcc
tttcatatatttatatttcctttcaaaagctttactcttgagatggctca
gtgggtcaaggcattttccgcccagcttgatgacctgagttagattcctg
gaagtcgcatgatggaaggagagaacagactatggaatgttgccctctga
ctccatatacgtgagcaccaaggcgtatgtacgcaaacacaaaactaaca
aatataaataagatatatatcttttttcactttgcttgcttgcttgtttg
ccacttggtggagggtccaacttttgttcacgcaccccctatcctttata
aacgaaattttcaggttggtccataaggattgatcttggaagatcatttg
tctgttttttaggaatccggccaggctggcgcatggtcaggtggggagag
tacctgcgg
gaattccagagatttgttaacatggagccctgcaggtgtgggtccagcag
agatgaaacccggcctgctgaggtgagatggatagttggctgtatgggga
gctgatgtttgcagccgagtccctgctgtgtcctgttctttctgggctgg
cacattgtagttgtaggtgtgtgggcaaaataacagacatgcttcgatgg
ctgctatagagataaactacagactaactggaaagggtatatgcctcctg
ccctgacatttagccttgctgcaaggtaatagtaacttttcttcagagcc
agacaaactttcctggtgaggcacaagtagagtgttcacaaccccaatgt
cacaaaaacaaacagacagacagacagacagacaacaaattggggataga
tgtggagatgagcataggttttgagtcattttctagcaatggagagattc
tatggaggagaggggggggaatcacagattgctttctacacaagaacatg
tggccatccgtaaaacctgagaccagagactggagtagttgaggttcatc
tgccctttctcaaagggaagagagatggtaatgcaacaattttgaaggta
cctcaatcactattagagggagaatgggcataaggacagagaacccctgt
aagatgataactttttttgagtttgcattaatatcaaacacccaatgaaa
ccctgggcaggtgtgtgtaggggccagtttccctttccgccacagacaat
gacattttcagtgctatagaggcaattctgtctatctgaattggcacaga
gaagcaggacaaagtcagaggaacttgaaaccgaggcagtttcttgggtc
tctcagatgtcagagcaccagggtatccttctgtgagtgtgggcagtaga
ag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr17_44514016_44515182
seq2: B6Ng01-130A07.b_47_1205 (reverse)

seq1  CCGCAGGTAACTCTCCCCACTCGACCATTGCGCCAGCCTGGGCCGCGTAT  50
      |||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||    || ||
seq2  CCGCAGGT-ACTCTCCCCACCTGACCA-TGCGCCAGCCTGG---CCGGAT  45

seq1  TCCTAATAAACAGTACAAATGACTCTCCAAGATCAATCCCTAATGGGCCA  100
      |||||| |||||| ||||||||   |||||||||||| ||| |||| |||
seq2  TCCTAAAAAACAG-ACAAATGATCTTCCAAGATCAAT-CCTTATGGACCA  93

seq1  CTCTTGAAAATTTCGTTTATAAAGGATA-GCGGTGCGTGAACAATAGTTG  149
        | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||
seq2  -ACCTGAAAATTTCGTTTATAAAGGATAGGGGGTGCGTGAACAAAAGTTG  142

seq1  GACACT-CACCAAGTGGCAAACAAGCAAGCAAGCAAAGTGAGAAAAGATA  198
      ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  GACCCTCCACCAAGTGGCAAACAAGCAAGCAAGCAAAGTGAAAAAAGATA  192

seq1  TTATATCTTATTTATATTTGTTAGTTTTGTGTTTGCGTACATACGCCTTG  248
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  -TATATCTTATTTATATTTGTTAGTTTTGTGTTTGCGTACATACGCCTTG  241

seq1  GTGCTCACGTATATGGAAGTCAGAGGGCAACATTCCATAGTCTGTTCTCT  298
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTCACGTATATGG-AGTCAGAGGGCAACATTCCATAGTCTGTTCTCT  290

seq1  CCTTCCATCATGCGACTTCCAGGAATCTAACTCAGGTCATCAAGCTGGGC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCCATCATGCGACTTCCAGGAATCTAACTCAGGTCATCAAGCTGGGC  340

seq1  GGAAAATGCCTTGACCCACTGAGCCATCTCAAGAGTAAAGCTTTTGAAAG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAATGCCTTGACCCACTGAGCCATCTCAAGAGTAAAGCTTTTGAAAG  390

seq1  GAAATATAAATATATGAAAGGATGACTGTCATGTGAGTTTATGTGTATGC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATATAAATATATGAAAGGATGACTGTCATGTGAGTTTATGTGTATGC  440

seq1  CATTTAGAGTTTCAGATAGGAAAGATCTATGGTACATTCCACAAAATCAA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTAGAGTTTCAGATAGGAAAGATCTATGGTACATTCCACAAAATCAA  490

seq1  GCCAGGTAAGCCTAGCCAGTTCCTGATGGATGTGAAGCAGTGCCTTTCCC  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGGTAAGCCTAGCCAGTTCCTGATGGATGTGAAGCAGTGCCTTTCCC  540

seq1  AGAGAGGATGCACAAGGAGGAGAGTGTAGCTCTCCGTGCTCCATCTCTCT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGGATGCACAAGGAGGAGAGTGTAGCTCTCCGTGCTCCATCTCTCT  590

seq1  CTGGACCTCTTGAATGCGCCTAAAAACAGAACTTTGGAGCATCTGCTTAT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGACCTCTTGAATGCGCCTAAAAACAGAACTTTGGAGCATCTGCTTAT  640

seq1  GAGTTAGGAATCCAATGCTGCAAACTATGCCTCAAGGTGAAAATAAAGAT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTAGGAATCCAATGCTGCAAACTATGCCTCAAGGTGAAAATAAAGAT  690

seq1  ACCTTGGCAAATCAAAAGCCACACATGGGTCCATCCTAGCTCAAGAGTAG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTGGCAAATCAAAAGCCACACATGGGTCCATCCTAGCTCAAGAGTAG  740

seq1  GCTAGACAATTGTGGGACAGGGTATGCAAATCAGAGTTGCTAAAAATGCC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGACAATTGTGGGACAGGGTATGCAAATCAGAGTTGCTAAAAATGCC  790

seq1  AGGGTTGGCACCTCCTCACAACACTATTGACCCACAATCTAGTAAAGCCA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTTGGCACCTCCTCACAACACTATTGACCCACAATCTAGTAAAGCCA  840

seq1  TTTTCTTCTATCTGGTTGCTTGTACACTGAGGTACAGAAGAAATGAGAAA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTTCTATCTGGTTGCTTGTACACTGAGGTACAGAAGAAATGAGAAA  890

seq1  CTCTGCAGGATAATTCCTCCTGGAGTCAAGATTTTTATCTCGTGTTAACA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGCAGGATAATTCCTCCTGGAGTCAAGATTTTTATCTCGTGTTAACA  940

seq1  TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAGTGTG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAGTGTG  990

seq1  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTCAGGGTTTTCCTG  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTCAGGGTTTTCCTG  1040

seq1  TGTGTATATAAATGCATGCATGTGCAAGTGTGTATGCGTGCACATGGAGG  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTATATAAATGCATGCATGTGCAAGTGTGTATGCGTGCACATGGAGG  1090

seq1  TCAGAAAACAACCTGTTCTCTGCGCTGTTCCTCGGGAACCACCCATCTTG  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAAAACAACCTGTTCTCTGCGCTGTTCCTCGGGAACCACCCATCTTG  1140

seq1  GGATTTTGTGCTTGAATTC  1167
      |||||||||||||||||||
seq2  GGATTTTGTGCTTGAATTC  1159

seq1: chr17_44409972_44410877
seq2: B6Ng01-130A07.g_69_970

seq1  GAATTCCAGAGATTTGTTAACATGGAGCCCTGCAGGTGTGGGTCCAGCAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGAGATTTGTTAACATGGAGCCCTGCAGGTGTGGGTCCAGCAG  50

seq1  AGATGAAACCCGGCCTGCTGAGGTGAGATGGATAGTTGGCTGTATGGGGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGAAACCCGGCCTGCTGAGGTGAGATGGATAGTTGGCTGTATGGGGA  100

seq1  GCTGATGTTTGCAGCCGAGTCCCTGCTGTGTCCTGTTCTTTCTGGGCTGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGATGTTTGCAGCCGAGTCCCTGCTGTGTCCTGTTCTTTCTGGGCTGG  150

seq1  CACATTGTAGTTGTAGGTGTGTGGGCAAAATAACAGACATGCTTCGATGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATTGTAGTTGTAGGTGTGTGGGCAAAATAACAGACATGCTTCGATGG  200

seq1  CTGCTATAGAGATAAACTACAGACTAACTGGAAAGGGTATATGCCTCCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTATAGAGATAAACTACAGACTAACTGGAAAGGGTATATGCCTCCTG  250

seq1  CCCTGACATTTAGCCTTGCTGCAAGGTAATAGTAACTTTTCTTCAGAGCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGACATTTAGCCTTGCTGCAAGGTAATAGTAACTTTTCTTCAGAGCC  300

seq1  AGACAAACTTTCCTGGTGAGGCACAAGTAGAGTGTTCACAACCCCAATGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAAACTTTCCTGGTGAGGCACAAGTAGAGTGTTCACAACCCCAATGT  350

seq1  CACAAAAACAAACAGACAGACAGACAGACAGACAACAAATTGGGGATAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAAAACAAACAGACAGACAGACAGACAGACAACAAATTGGGGATAGA  400

seq1  TGTGGAGATGAGCATAGGTTTTGAGTCATTTTCTAGCAATGGAGAGATTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGAGATGAGCATAGGTTTTGAGTCATTTTCTAGCAATGGAGAGATTC  450

seq1  TATGGAGGAGAGGGGGGGGAATCACAGATTGCTTTCTACACAAGAACATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGAGGAGAGGGGGGGGAATCACAGATTGCTTTCTACACAAGAACATG  500

seq1  TGGCCATCCGTAAAACCTGAGACCAGAGACTGGAGTAGTTGAGGTTCATC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCATCCGTAAAACCTGAGACCAGAGACTGGAGTAGTTGAGGTTCATC  550

seq1  TGCCCTTTCTCAAAGGGAAGAGAGATGGTAATGCAACAATTTTGAAGGTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCTTTCTCAAAGGGAAGAGAGATGGTAATGCAACAATTTTGAAGGTA  600

seq1  CCTCAATCACTATTAGAGGGAGAATGGGCATAAGGACAGAGAACCCCTGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCAATCACTATTAGAGGGAGAATGGGCATAAGGACAGAGAACCCCTGT  650

seq1  AAGATGATAAC-TTTTTTGAGTTTGCATTAATATCAAACACCCAATGAAA  699
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATGATAACTTTTTTTGAGTTTGCATTAATATCAAACACCCAATGAAA  700

seq1  CCCTGGGCAGGTGTGTGTAGGGGCCAGTTTCCCTTTCCGCCACAGACAAT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGGGCAGGTGTGTGTAGGGGCCAGTTTCCCTTTCCGCCACAGACAAT  750

seq1  GACATTTTCAGGTGCTATAGGAGGCAATTCTTGTCTATCTGAATTGGCAC  799
      |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  GACATTTTCA-GTGCTATA-GAGGCAATTC-TGTCTATCTGAATTGGCAC  797

seq1  AGAGAAGCAGGACAAAGTCAGAGGAACTTTGAAACCGAGGCAGTTTCTTG  849
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAAGCAGGACAAAGTCAGAGGAAC-TTGAAACCGAGGCAGTTTCTTG  846

seq1  GGTCTCTCCAGATGTCAGAGCACCAGGGTATCCTTCTGTGAGTGTGGGCA  899
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTCT-CAGATGTCAGAGCACCAGGGTATCCTTCTGTGAGTGTGGGCA  895

seq1  GTAGAAG  906
      |||||||
seq2  GTAGAAG  902