BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-138J14
Chromosome17 (Build37)
Map Location 75,468,923 - 75,646,375
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLtbp1, EG621988
Upstream geneMemo1, EG668716, 2810410M20Rik, LOC668773, LOC668775, Spast, Slc30a6, Nlrc4, LOC100043883, LOC624159, Yipf4, Birc6, Ttc27, LOC100043672
Downstream geneRasgrp3, 2810405J04Rik, LOC668787, LOC100043885
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-138J14.bB6Ng01-138J14.g
ACCDH937812DH937813
length4411,087
definitionDH937812|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-138J14, 5' end.DH937813|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-138J14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(75,645,929 - 75,646,375)(75,468,923 - 75,470,024)
sequence
ataatagcatctttctacatggtcatgaacttaaaaggtaaaaaaaaaaa
atctatgtacagtgctgagtattatgcctgagacatttaattgctaagga
gactatcgctactatcactgtcatttatcattattatcatcgtcatcatc
atcatcatctgaaagttccttgttccagatgcctcaggtcagatgtaaat
catcagactatccagggagtggggtgcatgaagctgcttagttaaagtgt
ccacttaaaagtaggtggagcaatattatgaactaaccagtacccggagc
tcttgtctctagctgcatatgtatcaaaagatggcctagtcggccatcac
tggaaagagaggcccattggacacacaaactttatatgccccagtacagg
ggaacgccagggccaaaaagggggagggggtgggtagggga
gaattctgctttggagatcaggacttagattacagtgtgttgttatgact
tttgtctagccttattactcatgtaaactgtggagcaagtttcaagaaat
gtgagtcaacgtgactattaccagctaccttttgactctgaccctcagac
caccggtggtttgtttgcaaaaaaacatttgccagataaagctaaaggtg
taatgtctacgtccatccttctttagaggagatgcggtaatttagaggag
aatgccatgagggagaagagatagcttcagttccacctgggatttggttt
ctgcgaaagcagagtcgtcagggaagcagctctggactctgtagctgctg
gatcccaattataactgcttcctgatcgggtgtgggcttgggaggtgaga
tggcttgtgtcagaactgttgcctcctgatcgggtgtgggcttgggaggt
gagatggcttgtgtattctggaatgaaatataaatgaccatgacctgtga
acatagatttagatcattccaaatgtcctgttcaaccgggaaccttttat
tgactttttatagtaacaaaatcaagaaggttatatattaagatgtttta
aagtacaggggtggaaacatcagataggcgatcatagcaaagcaggtgaa
atctctgctatagccttggatgctgtctatcagtgatgttcttagctatt
ggatcagtgaaagcctgtcatatgtggctaatgagttatctaatcattac
atacaatattagacaataaatagctgttaagaagttgaaatggcctgtgg
acctgcaacattccaacttcttatatcatggaaattctaattaataaacc
tttgtaagtacaacttctctcagaaactttccttgatatgggcaagggga
gagacagcctaggatgctgtcaattgtgatatttgcatcttaaagctttt
gtactgagctgggcggggtacaaattcccagcactcaggagcagagcagt
gtatttctgagttcgagggcagctggtctacgagttggtccatgtcagca
aggcctatacagagaccttgttctcgaactaaaccaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr17_75645929_75646375
seq2: B6Ng01-138J14.b_43_489 (reverse)

seq1  TCCCCTACCCACCCCCTCCCCCTTTTTGGCCCTGGCGTTCCCCTGTACTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCTACCCACCCCCTCCCCCTTTTTGGCCCTGGCGTTCCCCTGTACTG  50

seq1  GGGCATATAAAGTTTGTGTGTCCAATGGGCCTCTCTTTCCAGTGATGGCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCATATAAAGTTTGTGTGTCCAATGGGCCTCTCTTTCCAGTGATGGCC  100

seq1  GACTAGGCCATCTTTTGATACATATGCAGCTAGAGACAAGAGCTCCGGGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTAGGCCATCTTTTGATACATATGCAGCTAGAGACAAGAGCTCCGGGT  150

seq1  ACTGGTTAGTTCATAATATTGCTCCACCTACTTTTAAGTGGACACTTTAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGTTAGTTCATAATATTGCTCCACCTACTTTTAAGTGGACACTTTAA  200

seq1  CTAAGCAGCTTCATGCACCCCACTCCCTGGATAGTCTGATGATTTACATC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGCAGCTTCATGCACCCCACTCCCTGGATAGTCTGATGATTTACATC  250

seq1  TGACCTGAGGCATCTGGAACAAGGAACTTTCAGATGATGATGATGATGAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACCTGAGGCATCTGGAACAAGGAACTTTCAGATGATGATGATGATGAC  300

seq1  GATGATAATAATGATAAATGACAGTGATAGTAGCGATAGTCTCCTTAGCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGATAATAATGATAAATGACAGTGATAGTAGCGATAGTCTCCTTAGCA  350

seq1  ATTAAATGTCTCAGGCATAATACTCAGCACTGTACATAGATTTTTTTTTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAATGTCTCAGGCATAATACTCAGCACTGTACATAGATTTTTTTTTT  400

seq1  TTACCTTTTAAGTTCATGACCATGTAGAAAGATGCTATTATGAATTC  447
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACCTTTTAAGTTCATGACCATGTAGAAAGATGCTATTATGAATTC  447

seq1: chr17_75468923_75470024
seq2: B6Ng01-138J14.g_65_1151

seq1  GAATTCTGCTTTGGAGATCAGGACTTAGATTACAGTGTGTTGTTATGACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGCTTTGGAGATCAGGACTTAGATTACAGTGTGTTGTTATGACT  50

seq1  TTTGTCTAGCCTTATTACTCATGTAAACTGTGGAGCAAGTTTCAAGAAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTCTAGCCTTATTACTCATGTAAACTGTGGAGCAAGTTTCAAGAAAT  100

seq1  GTGAGTCAACGTGACTATTACCAGCTACCTTTTGACTCTGACCCTCAGAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGTCAACGTGACTATTACCAGCTACCTTTTGACTCTGACCCTCAGAC  150

seq1  CACCGGTGGTTTGTTTGCAAAAAAACATTTGCCAGATAAAGCTAAAGGTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCGGTGGTTTGTTTGCAAAAAAACATTTGCCAGATAAAGCTAAAGGTG  200

seq1  TAATGTCTACGTCCATCCTTCTTTAGAGGAGATGCGGTAATTTAGAGGAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGTCTACGTCCATCCTTCTTTAGAGGAGATGCGGTAATTTAGAGGAG  250

seq1  AATGCCATGAGGGAGAAGAGATAGCTTCAGTTCCACCTGGGATTTGGTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCCATGAGGGAGAAGAGATAGCTTCAGTTCCACCTGGGATTTGGTTT  300

seq1  CTGCGAAAGCAGAGTCGTCAGGGAAGCAGCTCTGGACTCTGTAGCTGCTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCGAAAGCAGAGTCGTCAGGGAAGCAGCTCTGGACTCTGTAGCTGCTG  350

seq1  GATCCCAATTATAACTGCTTCCTGATCGGGTGTGGGCTTGGGAGGTGAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCCCAATTATAACTGCTTCCTGATCGGGTGTGGGCTTGGGAGGTGAGA  400

seq1  TGGCTTGTGTCAGAACTGTTGCCTCCTGATCGGGTGTGGGCTTGGGAGGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTTGTGTCAGAACTGTTGCCTCCTGATCGGGTGTGGGCTTGGGAGGT  450

seq1  GAGATGGCTTGTGTATTCTGGAATGAAATATAAATGACCATGACCTGTGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATGGCTTGTGTATTCTGGAATGAAATATAAATGACCATGACCTGTGA  500

seq1  ACATAGATTTAGATCATTCCAAATGTCCTGTTCAACCGGGAACCTTTTAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAGATTTAGATCATTCCAAATGTCCTGTTCAACCGGGAACCTTTTAT  550

seq1  TGACTTTTTATAGTAACAAAATCAAGAAGGTTATATATTAAGATGTTTTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTTTTTATAGTAACAAAATCAAGAAGGTTATATATTAAGATGTTTTA  600

seq1  AAGTACAGGGGTGGAAACATCAGATAGGCGATCATAGCAAAGCAGGTGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTACAGGGGTGGAAACATCAGATAGGCGATCATAGCAAAGCAGGTGAA  650

seq1  ATCTCTGCTATAGCCTTGGATGCTGTCTATCAGTGATGTTCTTAGCTATT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCTGCTATAGCCTTGGATGCTGTCTATCAGTGATGTTCTTAGCTATT  700

seq1  GGATCAGTGAAAGCCTGTCATATGTGGCTAATGAGTTATCTAATCATTAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATCAGTGAAAGCCTGTCATATGTGGCTAATGAGTTATCTAATCATTAC  750

seq1  ATACAATATTAGACAATAAATAGCTGTTAAGAAGTTGAAATGGCCTGTGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACAATATTAGACAATAAATAGCTGTTAAGAAGTTGAAATGGCCTGTGG  800

seq1  ACCTGCAACATTCCAACTTCTTATATCATGGAAATTCTAATTAATAAACC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGCAACATTCCAACTTCTTATATCATGGAAATTCTAATTAATAAACC  850

seq1  TTTGTAAGTACAACTTCTCTCAGAAACTTTCCTTGATATGGGCAAGGGGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TTTGTAAGTACAACTTCTCTCAGAAACTTTCCTTGATATGGGCAAGGGG-  899

seq1  AGAGACAGCCTAGGATGCTGTCAATTGTGATATTTGCATCTTAAAGCTTT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACAGCCTAGGATGCTGTCAATTGTGATATTTGCATCTTAAAGCTTT  949

seq1  TGTACCTGAGCTGGGCGTGGTACAAAATCCCAGCACTCAGGAGGCAGAGG  1000
      |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |
seq2  TGTA-CTGAGCTGGGCGGGGTACAAATTCCCAGCACTCAGGA-GCAGA-G  996

seq1  CAGGTGTATTTCTGAGTTCGAGGGCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCA  1050
      || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  | ||||
seq2  CA-GTGTATTTCTGAGTTCGAGGGCAG-CTGGTCTAC-GAGT-TGGTCCA  1042

seq1  TGTCAGCCAGGGCTATACAGAGAAACCCTG-TCTCGAAAAAACTAAAAAC  1099
      ||||||| ||| ||||||||||  ||| || |||||    ||||  ||||
seq2  TGTCAGCAAGGCCTATACAGAG--ACCTTGTTCTCG----AACT--AAAC  1084

seq1  CAA  1102
      |||
seq2  CAA  1087