BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-174K06
Chromosome17 (Build37)
Map Location 62,627,742 - 62,826,945
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100043560
Downstream geneEfna5, Fbxl17
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-174K06.bB6Ng01-174K06.g
ACCGA002668GA002669
length985281
definitionB6Ng01-174K06.b B6Ng01-174K06.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(62,627,742 - 62,628,723)(62,826,665 - 62,826,945)
sequence
gaattcaaatttgattttttttttccattcagtgttcctttttaatttgc
cagtcacattttctttcattgcttctgccctactcgattttgccatttaa
tttttttgagaattgaagtgtgcttaccttgacgttctgtaacgtttgat
ttttccctgcctctaaccagtcctccattttttttaagattctctatatg
agtcttctatttggcttcagaacatgtacacattttaaagtaaaataagc
taaaaaggactgttaattctgtacccttccatttcttctttccctcagtc
tttctcctctccacccacccacgcagactcttactatctttagcattaaa
ccactgtcatgtcaagaggcaaggttttctttggggagccttccagtgag
atcctagtgtgaactaataataagattatgttaagaagatcttctcgttg
tccacacagacacgatctgtgtcccaagctggaaacagtaagattcacag
tggacatgtaaaaagagaaacgagaatgcaagttgtttgaatttttgatg
tatggttataattcccttagttgtttgaatctttgatgtatgcctataat
tccctttactccagaagaatgtgattggggacattggcagtgatcccata
cggaacatgtggtctagtggacctgatattttcctctttcatcttaaact
caatatctacatatgagcaaggccttaggagtcctggacaaattctcctg
tgggtcatattaaaagtgtcagtgggtttgtacagcatgagtgtctcttt
ggtgtagagactcccaaagcttgtttcttcttagaaatacagggacaaat
atggagcaaagactgaaggaatggccaaccaataactggcccaacttgaa
acccaacctatgggcaagtaccagtccctgaacattattaacggtacttt
gtttatgccttgcagacaggagccctagcacaact
ataatgtatacacttaatgaaagaagagacatacaacctgtgcaaggggt
gcttatatcatggtatcagttaaagaatagccctgtgaacatcatgtata
tacacatattaccaatgactgtgtcttaagagtgatgaatgttagtaaaa
tcataggacaaggcaatctgaagcttgggacaattaatggaacatataag
ttgtatgtaaaattttgaatattatgaaagagtgtcatgtcagaaaggag
tttgtgtgtatgtgtatgtgtggggtgggaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr17_62627742_62628723
seq2: B6Ng01-174K06.b_43_1027

seq1  GAATTCAAATTTGATTTTTTTTTTCCATTCAGTGTTCCTTTTTAATTTGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAATTTGATTTTTTTTTTCCATTCAGTGTTCCTTTTTAATTTGC  50

seq1  CAGTCACATTTTCTTTCATTGCTTCTGCCCTACTCGATTTTGCCATTTAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCACATTTTCTTTCATTGCTTCTGCCCTACTCGATTTTGCCATTTAA  100

seq1  TTTTTTTGAGAATTGAAGTGTGCTTACCTTGACGTTCTGTAACGTTTGAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTGAGAATTGAAGTGTGCTTACCTTGACGTTCTGTAACGTTTGAT  150

seq1  TTTTCCCTGCCTCTAACCAGTCCTCCATTTTTTTTAAGATTCTCTATATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCCCTGCCTCTAACCAGTCCTCCATTTTTTTTAAGATTCTCTATATG  200

seq1  AGTCTTCTATTTGGCTTCAGAACATGTACACATTTTAAAGTAAAATAAGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTTCTATTTGGCTTCAGAACATGTACACATTTTAAAGTAAAATAAGC  250

seq1  TAAAAAGGACTGTTAATTCTGTACCCTTCCATTTCTTCTTTCCCTCAGTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAAGGACTGTTAATTCTGTACCCTTCCATTTCTTCTTTCCCTCAGTC  300

seq1  TTTCTCCTCTCCACCCACCCACGCAGACTCTTACTATCTTTAGCATTAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTCCTCTCCACCCACCCACGCAGACTCTTACTATCTTTAGCATTAAA  350

seq1  CCACTGTCATGTCAAGAGGCAAGGTTTTCTTTGGGGAGCCTTCCAGTGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTGTCATGTCAAGAGGCAAGGTTTTCTTTGGGGAGCCTTCCAGTGAG  400

seq1  ATCCTAGTGTGAACTAATAATAAGATTATGTTAAGAAGATCTTCTCGTTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTAGTGTGAACTAATAATAAGATTATGTTAAGAAGATCTTCTCGTTG  450

seq1  TCCACACAGACACGATCTGTGTCCCAAGCTGGAAACAGTAAGATTCACAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACACAGACACGATCTGTGTCCCAAGCTGGAAACAGTAAGATTCACAG  500

seq1  TGGACATGTAAAAAGAGAAACGAGAATGCAAGTTGTTTGAATTTTTGATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACATGTAAAAAGAGAAACGAGAATGCAAGTTGTTTGAATTTTTGATG  550

seq1  TATGGTTATAATTCCCTTAGTTGTTTGAATCTTTGATGTATGCCTATAAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGTTATAATTCCCTTAGTTGTTTGAATCTTTGATGTATGCCTATAAT  600

seq1  TCCCTTTACTCCAGAAGAATGTGATTGGGGACATTGGCAGTGATCCCATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTTTACTCCAGAAGAATGTGATTGGGGACATTGGCAGTGATCCCATA  650

seq1  CGGAACATGTGGTCTAGTGGACCTGATATTTTCCTCTTTCATCTTAAACT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGAACATGTGGTCTAGTGGACCTGATATTTTCCTCTTTCATCTTAAACT  700

seq1  CAATATCTACATATGAGCAAGGCCTTAGGAGTCCTGGACAAATTCTCCTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATATCTACATATGAGCAAGGCCTTAGGAGTCCTGGACAAATTCTCCTG  750

seq1  TGGGTCATATTAAAAGTGTCAGTGGGTTTGTACAGCATGAGTGTCTCTTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTCATATTAAAAGTGTCAGTGGGTTTGTACAGCATGAGTGTCTCTTT  800

seq1  GGTGTAGAGACTCCCAAAGCTTGTTTCTTCTTAGAAATACAGGGACAAAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTAGAGACTCCCAAAGCTTGTTTCTTCTTAGAAATACAGGGACAAAT  850

seq1  ATGGAGCAAAGACTGAAGGAATGGCCAACCAATAACTGGCCCAACTTGAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAGCAAAGACTGAAGGAATGGCCAACCAATAACTGGCCCAACTTGAA  900

seq1  ACCCAACCTATGGGCAAGTACCAGTCCCTG-ACATTATTAACGGTACTTT  949
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  ACCCAACCTATGGGCAAGTACCAGTCCCTGAACATTATTAACGGTACTTT  950

seq1  G-TTATG-CTTGCAGACAGGAGCCCTAGCACAACT  982
      | ||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTATGCCTTGCAGACAGGAGCCCTAGCACAACT  985

seq1: chr17_62826665_62826945
seq2: B6Ng01-174K06.g_76_356 (reverse)

seq1  TTCCCACCCCACACATACACATACACACAAACTCCTTTCTGACATGACAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCACCCCACACATACACATACACACAAACTCCTTTCTGACATGACAC  50

seq1  TCTTTCATAATATTCAAAATTTTACATACAACTTATATGTTCCATTAATT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTCATAATATTCAAAATTTTACATACAACTTATATGTTCCATTAATT  100

seq1  GTCCCAAGCTTCAGATTGCCTTGTCCTATGATTTTACTAACATTCATCAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCAAGCTTCAGATTGCCTTGTCCTATGATTTTACTAACATTCATCAC  150

seq1  TCTTAAGACACAGTCATTGGTAATATGTGTATATACATGATGTTCACAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAAGACACAGTCATTGGTAATATGTGTATATACATGATGTTCACAGG  200

seq1  GCTATTCTTTAACTGATACCATGATATAAGCACCCCTTGCACAGGTTGTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATTCTTTAACTGATACCATGATATAAGCACCCCTTGCACAGGTTGTA  250

seq1  TGTCTCTTCTTTCATTAAGTGTATACATTAT  281
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTCTTCTTTCATTAAGTGTATACATTAT  281