seq1: chr17_83497781_83498966
seq2: B6Ng01-240N06.b_50_1258
seq1 GAATTCCAGTGTGATGTTTTTGATATGTTCCCAAAGATCCAGGATATTTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAATTCCAGTGTGATGTTTTTGATATGTTCCCAAAGATCCAGGATATTTG 50
seq1 GTGAGATAGAAGGTTAAAATGGGGATCTTATTTGCTGAAAAACACCAAAG 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTGAGATAGAAGGTTAAAATGGGGATCTTATTTGCTGAAAAACACCAAAG 100
seq1 GAACGATATTGCGTCAATCAAGGATGGAATACAGAGCACCTGAGAGCAGG 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAACGATATTGCGTCAATCAAGGATGGAATACAGAGCACCTGAGAGCAGG 150
seq1 TGGGGTACTTCTGGGGAGCGGAAGGAAAGGATGCAGCTGTTGGCATTTTG 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGGGGTACTTCTGGGGAGCGGAAGGAAAGGATGCAGCTGTTGGCATTTTG 200
seq1 TACAACGAGCTGTTCCTGAATCCCATTGCCCTGCCTGCAGTCAAACTGAG 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TACAACGAGCTGTTCCTGAATCCCATTGCCCTGCCTGCAGTCAAACTGAG 250
seq1 TGCTACCATGTGGGACACTAGAAACATTTGCAACCTGCTTTGCCCGGTGC 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGCTACCATGTGGGACACTAGAAACATTTGCAACCTGCTTTGCCCGGTGC 300
seq1 CTAGGATCACCGTCCAGAAGCAGTGCTGGCTTGACTCATAGACCCAGTCA 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTAGGATCACCGTCCAGAAGCAGTGCTGGCTTGACTCATAGACCCAGTCA 350
seq1 GAGAACAGCTACCACCCAAAGAGAAATACCATAGCCTAGGCTTTCCCCAC 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAGAACAGCTACCACCCAAAGAGAAATACCATAGCCTAGGCTTTCCCCAC 400
seq1 ATGCAATTCTTTCCAGAAAGGAACTCTGCCAAGAGGCAAGAGCTACCGAG 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATGCAATTCTTTCCAGAAAGGAACTCTGCCAAGAGGCAAGAGCTACCGAG 450
seq1 AAGAGGGAGGGGAGATGGCATATTGGAGCCATGTGGGGAAAGTTGATTTT 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AAGAGGGAGGGGAGATGGCATATTGGAGCCATGTGGGGAAAGTTGATTTT 500
seq1 TTGGCAGTGCCCACACTCAAAGACAGCAGAGGGATCGTACTCAGCAAAGG 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTGGCAGTGCCCACACTCAAAGACAGCAGAGGGATCGTACTCAGCAAAGG 550
seq1 ATCCCCTTACTCCCGTCCCCAGCATCTAGGGAGAGCACGTTTGTCTGTCT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATCCCCTTACTCCCGTCCCCAGCATCTAGGGAGAGCACGTTTGTCTGTCT 600
seq1 CTTCTAAGACTCATGCAAGTTCATGAAAGTCTCCCTATGAGGGCCGACAT 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTTCTAAGACTCATGCAAGTTCATGAAAGTCTCCCTATGAGGGCCGACAT 650
seq1 GCAGCCGGTCTCTACCCAGCCCTCCCCAAAACCTTTGAGCATTCCTATTC 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCAGCCGGTCTCTACCCAGCCCTCCCCAAAACCTTTGAGCATTCCTATTC 700
seq1 CCCACACACCCCAAATTAGCCCGAGTGTCAATCCAAAAGGCAAGGCAAGG 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCCACACACCCCAAATTAGCCCGAGTGTCAATCCAAAAGGCAAGGCAAGG 750
seq1 AAATGCAAACCAGGGAGCCAGCAGCCCTGGGCTCTGAGTTCCCTCCTCCC 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AAATGCAAACCAGGGAGCCAGCAGCCCTGGGCTCTGAGTTCCCTCCTCCC 800
seq1 TCAGAGCTCAACTCAACGCAGACTTGCCTCT-CCTCGGTTGGAGCCTGAG 849
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2 TCAGAGCTCAACTCAACGCAGACTTGCCTCTCCCTCGGTTGGAGCCTGAG 850
seq1 GCAGGC-TCA-TTTCCCCTTAGGTTGTCACAGACCAATTTTCTAAACTGC 897
|||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCAGGCTTCATTTTCCCCTTAGGTTGTCACAGACCAATTTTCTAAACTGC 900
seq1 ATG-AAAACAGAAAACAAACAGAAAAGTAAATCCACC-AAAGCCTGGATC 945
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2 ATGAAAAACAGAAAACAAACAGAAAAGTAAATCCACCAAAAGCCTGGATC 950
seq1 TCGTGAA-CAGCTTGGCAGGCCAGAGCAA-CGTGCTAAC-AATTTCATG- 991
||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||
seq2 TCGTGAATCAGCTTGGCAGGCCAGAGCAATCGTGCTAACTATTTTCATGC 1000
seq1 CTGTTTTAAGACTTTCTAACT-AAGCAACAAGTACCAACAACCAG-ATGT 1039
||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||
seq2 CTGGTTTAAGACTTTCTAACTCTAGCAACAAGTATCAAC-ACCAGTTTGT 1049
seq1 GCCCTG-ATTTAAAAAAAAAAAA--GAAGAATGAACATCGGCT--TCTAG 1084
|||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||
seq2 GCCCTGAATTTAAAAAAAAAAAAAGGAAG-ATGGACATCGGCTTCTCTAG 1098
seq1 GGACAG-AGATTTGT-AAAACAGGAAAGCAC-TCATCAAGAAGC-AAAAC 1130
| || | |||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||
seq2 GAACCGAAGATTTGTAAAAACAGGAAGTCACTTCATCAAGGAGCTAAAAC 1148
seq1 CACCAAGC--ATCCTGGCCTGGGGCATG--CATCCTCTCCGGCTAAACAT 1176
| ||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||
seq2 TATCAAGCCATTCTTGGCCTTGGGCATGGCAATCCTCTCCGGCT-AACAT 1197
seq1 GG--CCAACCGA 1186
|| | ||||||
seq2 GGGCCAAACCGA 1209
| seq1: chr17_83645951_83646014
seq2: B6Ng01-240N06.g_73_136 (reverse)
seq1 CCCCCCACCCCCACCCAGAGTCTCTTCTCACCCTCTTCCTCCCCAAAGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCCCCCACCCCCACCCAGAGTCTCTTCTCACCCTCTTCCTCCCCAAAGTC 50
seq1 CTTGGACTTCCTGT 64
||||||||||||||
seq2 CTTGGACTTCCTGT 64
|