BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-252F22
Chromosome17 (Build37)
Map Location 12,450,451 - 12,497,701
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMap3k4
Upstream genePark2, Agpat4, Tdgf1-ps2
Downstream gene4732491K20Rik, LOC625753, Plg, Slc22a3, LOC100041192, Slc22a2, Slc22a1, Igf2r, Air, EG635617, Mas1, Mrgprh, Pnldc1, Mrpl18, Tcp1, Acat3, Acat2, Wtap, Sod2, Gpr31c, Tcp10c, Ttll2, Unc93a, Smok2a, Smok2b
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-252F22.bB6Ng01-252F22.g
ACCGA059382GA059383
length1,1271,123
definitionB6Ng01-252F22.b B6Ng01-252F22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(12,496,558 - 12,497,701)(12,450,451 - 12,451,583)
sequence
gaattcatgaaaagtagcattgaactctcccagttattttaaaagaaggc
agcagaccaagtctctggttttccaggagccttctgggaaatctcaaggc
cagttttagattctgcaattgtcagctctgaatacagtgggatcaaggtg
ggtaagaactgtagttggctgtgtacttaaccaaagtacaacagagtttt
aaaaaagtaaatataagcaagtgacatataaaggaactaaagagacgtgt
tctcaggtagtcaaggatataagttggtgtgtaagccacaggtggcacac
gggacctttgctgtgcagataggtagcatggaaggtagggtgaccctgcc
agcctccatggggagcagaccggcaatccaggaagcctttgacatggtag
cacagccagattttagtttgcatgtatgtaatttgattctaaaacaataa
agagaaattaggagaattgactttgactatgagaagtaaaaccccttctc
cgtgaactttctttgtacatcactaacggattcacagacatgtcatataa
aagaggcttctacagctcagttatgtttaataatgaatgttttcatactt
taccttgctctagttatatccagtgggaagtcataagttagcgcagttta
gtaccagtgagagatggctcagtggtcagagcattggctgctcttaggct
gacaggttagagagctcggaacctgcgtacatttcccaatccatacacag
cggcttacaaccattcatagctccagtttcaggccctctgttgtcctctt
ctggccttcgagggcacacagtgcatggatacagttgtaggttatctaag
atatagtcaatccagtattataatagagcttcttatcagatagtgcttca
acttgattaacatgaaatttatattctgtgttagcttgttcagttagtaa
atttgcagaagttcagaaggatgcgtgagagcaaaagctcttacagagtt
aattggtaagtcaagagaaatgttttcactagcaattataaaagttgttt
gttcccagagatttgctggagattgtgactgaattcttatgttttctgaa
ggtcaagccctaatcctgaattgaact
gaattcagcagatgaggcaaggctcgtgtatttaccctaatgttcagcag
aagggatatgccaagtgtcaacgacagaaacgtgccaaatggcattaaaa
ggcagcttaagctgctacagggacttgaagaacaaaactgagcactaaaa
agatactccaggaaacatggagcacagtgttgttacagccatgttcagct
aatatccactgttttaatcatgttaaagtctgtttgcctgtgaagaagtt
ctcacataaagaccattgacaatccccgtccgtcaccatccagaggtaag
aaatggcagaaagctgttgtgacgccaaccttagctcgtcggcagcaccg
ttgtcgtcggcgctggtccacagctcagcacagctctcctgcaggccgga
ttccagaaagctccctgtggatttcagcagcatccctgcgatgtcactgg
ggacaaacagcaaagcagaaggagaatcagctattgctgcaacagacaca
atggactaaggagaaaacacagaactcttagacgacagcctagcccacct
ttgttctaatacacagcactgactataaacctggtggtaaattgtgtgta
ggagccactgattatacaaaggtctcgcttaaatgttcaagatggcataa
aatgcctgcaacaagccaaatgacacgatggaaaagcagcagaaactgaa
gcagagctgtttccaaactttctctccaggttatctcttacagctggtga
agaccaactctccctaccggaactttctcaatgatcagaccgcttacaca
ctagtgttaatgaacacttaagcatgcagaacagggtgaatcatggtggc
aacccttcacgagcactactgacctccatgatgttcaaggaaaggcagtg
atgacctggtgagagagcgggtgagtacacgcccgtcatcagatgggaaa
agaaaacagggcaaggctgacagcagatgagaagagccaaccctctgcag
cgagtctctcctggacagaaagcttcttcgacacatcctaggcagagctg
atgtagcaggattatccaacgggagggggaggggagtctagaacgacaga
ctatgaaggtgtgaaccgtgcca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr17_12496558_12497701
seq2: B6Ng01-252F22.b_43_1169 (reverse)

seq1  AGTTCAATATCAGGGGAATAAGGGCCTGACTTTCAGAAACACTAAGAATT  50
      |||||||| |||||   || ||||| |||| ||||||||   ||||||||
seq2  AGTTCAAT-TCAGG---ATTAGGGCTTGACCTTCAGAAAACATAAGAATT  46

seq1  CAAGTTCACAATCCTCAGGCAAATCTCTGGGAAACAAAACAAACTTTTAT  100
      ||   ||||||| |||  ||||||||||||| ||||||   |||||||||
seq2  CA--GTCACAAT-CTCCAGCAAATCTCTGGG-AACAAA--CAACTTTTAT  90

seq1  AATTGGCTTAGTGAAAACATTTCTCCTTGACTTTACCAATTAAACTCTGT  150
      |||||   |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||
seq2  AATTG--CTAGTGAAAACATTTCT-CTTGAC-TTACCAATT-AACTCTGT  135

seq1  -AGAGCTTTTTGCTCTTCACGCATCCTTCCTGAACTTCTGCAATTTTACT  199
       ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||
seq2  AAGAGC-TTTTGCTC-TCACGCATCCTT-CTGAACTTCTGCAAATTTACT  182

seq1  AACTGAACAAGCTAACACAGAATATAAA-TTCATGTTTAATCAAGTTGAA  248
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||
seq2  AACTGAACAAGCTAACACAGAATATAAATTTCATG-TTAATCAAGTTGAA  231

seq1  GCACTATCTGATAAGAAGCTCTATTATAATACTGGATTGACTATATCTTA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTATCTGATAAGAAGCTCTATTATAATACTGGATTGACTATATCTTA  281

seq1  GATAACCTACAACTGTATCCATGCACTGTGTGCCCTCGAAGGCCAGAAGA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAACCTACAACTGTATCCATGCACTGTGTGCCCTCGAAGGCCAGAAGA  331

seq1  GGACAACAGAGGGCCTGAAACTGGAGCTATGAATGGTTGTAAGCCGCTGT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACAACAGAGGGCCTGAAACTGGAGCTATGAATGGTTGTAAGCCGCTGT  381

seq1  GTATGGATTGGGAAATGTACGCAGGTTCCGAGCTCTCTAACCTGTCAGCC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGGATTGGGAAATGTACGCAGGTTCCGAGCTCTCTAACCTGTCAGCC  431

seq1  TAAGAGCAGCCAATGCTCTGACCACTGAGCCATCTCTCACTGGTACTAAA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAGCAGCCAATGCTCTGACCACTGAGCCATCTCTCACTGGTACTAAA  481

seq1  CTGCGCTAACTTATGACTTCCCACTGGATATAACTAGAGCAAGGTAAAGT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCGCTAACTTATGACTTCCCACTGGATATAACTAGAGCAAGGTAAAGT  531

seq1  ATGAAAACATTCATTATTAAACATAACTGAGCTGTAGAAGCCTCTTTTAT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAAACATTCATTATTAAACATAACTGAGCTGTAGAAGCCTCTTTTAT  581

seq1  ATGACATGTCTGTGAATCCGTTAGTGATGTACAAAGAAAGTTCACGGAGA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACATGTCTGTGAATCCGTTAGTGATGTACAAAGAAAGTTCACGGAGA  631

seq1  AGGGGTTTTACTTCTCATAGTCAAAGTCAATTCTCCTAATTTCTCTTTAT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGTTTTACTTCTCATAGTCAAAGTCAATTCTCCTAATTTCTCTTTAT  681

seq1  TGTTTTAGAATCAAATTACATACATGCAAACTAAAATCTGGCTGTGCTAC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTTAGAATCAAATTACATACATGCAAACTAAAATCTGGCTGTGCTAC  731

seq1  CATGTCAAAGGCTTCCTGGATTGCCGGTCTGCTCCCCATGGAGGCTGGCA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTCAAAGGCTTCCTGGATTGCCGGTCTGCTCCCCATGGAGGCTGGCA  781

seq1  GGGTCACCCTACCTTCCATGCTACCTATCTGCACAGCAAAGGTCCCGTGT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCACCCTACCTTCCATGCTACCTATCTGCACAGCAAAGGTCCCGTGT  831

seq1  GCCACCTGTGGCTTACACACCAACTTATATCCTTGACTACCTGAGAACAC  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACCTGTGGCTTACACACCAACTTATATCCTTGACTACCTGAGAACAC  881

seq1  GTCTCTTTAGTTCCTTTATATGTCACTTGCTTATATTTACTTTTTTAAAA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCTTTAGTTCCTTTATATGTCACTTGCTTATATTTACTTTTTTAAAA  931

seq1  CTCTGTTGTACTTTGGTTAAGTACACAGCCAACTACAGTTCTTACCCACC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGTTGTACTTTGGTTAAGTACACAGCCAACTACAGTTCTTACCCACC  981

seq1  TTGATCCCACTGTATTCAGAGCTGACAATTGCAGAATCTAAAACTGGCCT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATCCCACTGTATTCAGAGCTGACAATTGCAGAATCTAAAACTGGCCT  1031

seq1  TGAGATTTCCCAGAAGGCTCCTGGAAAACCAGAGACTTGGTCTGCTGCCT  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGATTTCCCAGAAGGCTCCTGGAAAACCAGAGACTTGGTCTGCTGCCT  1081

seq1  TCTTTTAAAATAACTGGGAGAGTTCAATGCTACTTTTCATGAATTC  1144
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTTAAAATAACTGGGAGAGTTCAATGCTACTTTTCATGAATTC  1127

seq1: chr17_12450451_12451583
seq2: B6Ng01-252F22.g_68_1190

seq1  GAATTCAGCAGATGAGGCAAGGCTCGTGTATTTACCCTAATGTTCAGCAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGCAGATGAGGCAAGGCTCGTGTATTTACCCTAATGTTCAGCAG  50

seq1  AAGGGATATGCCAAGTGTCAACGACAGAAACGTGCCAAATGGCATTAAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGATATGCCAAGTGTCAACGACAGAAACGTGCCAAATGGCATTAAAA  100

seq1  GGCAGCTTAAGCTGCTACAGGGACTTGAAGAACAAAACTGAGCACTAAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGCTTAAGCTGCTACAGGGACTTGAAGAACAAAACTGAGCACTAAAA  150

seq1  AGATACTCCAGGAAACATGGAGCACAGTGTTGTTACAGCCATGTTCAGCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATACTCCAGGAAACATGGAGCACAGTGTTGTTACAGCCATGTTCAGCT  200

seq1  AATATCCACTGTTTTAATCATGTTAAAGTCTGTTTGCCTGTGAAGAAGTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATCCACTGTTTTAATCATGTTAAAGTCTGTTTGCCTGTGAAGAAGTT  250

seq1  CTCACATAAAGACCATTGACAATCCCCGTCCGTCACCATCCAGAGGTAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACATAAAGACCATTGACAATCCCCGTCCGTCACCATCCAGAGGTAAG  300

seq1  AAATGGCAGAAAGCTGTTGTGACGCCAACCTTAGCTCGTCGGCAGCACCG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGGCAGAAAGCTGTTGTGACGCCAACCTTAGCTCGTCGGCAGCACCG  350

seq1  TTGTCGTCGGCGCTGGTCCACAGCTCAGCACAGCTCTCCTGCAGGCCGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCGTCGGCGCTGGTCCACAGCTCAGCACAGCTCTCCTGCAGGCCGGA  400

seq1  TTCCAGAAAGCTCCCTGTGGATTTCAGCAGCATCCCTGCGATGTCACTGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGAAAGCTCCCTGTGGATTTCAGCAGCATCCCTGCGATGTCACTGG  450

seq1  GGACAAACAGCAAAGCAGAAGGAGAATCAGCTATTGCTGCAACAGACACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACAAACAGCAAAGCAGAAGGAGAATCAGCTATTGCTGCAACAGACACA  500

seq1  ATGGACTAAGGAGAAAACACAGAACTCTTAGACGACAGCCTAGCCCACCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGACTAAGGAGAAAACACAGAACTCTTAGACGACAGCCTAGCCCACCT  550

seq1  TTGTTCTAATACACAGCACTGACTATAAACCTGGTGGTAAATTGTGTGTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTCTAATACACAGCACTGACTATAAACCTGGTGGTAAATTGTGTGTA  600

seq1  GGAGCCACTGATTATACAAAGGTCTCGCTTAAATGTTCAAGATGGCATAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCCACTGATTATACAAAGGTCTCGCTTAAATGTTCAAGATGGCATAA  650

seq1  AATGCCTGCAACAAGCCAAATGACACGATGGAAAAGCAGCAGAAACTGAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCCTGCAACAAGCCAAATGACACGATGGAAAAGCAGCAGAAACTGAA  700

seq1  GCAGAGCTGTTTCCAAACTTTCTCTCCAGGTTATCTCTTACAGCTGGTGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAGCTGTTTCCAAACTTTCTCTCCAGGTTATCTCTTACAGCTGGTGA  750

seq1  AGACCAACTCTCCCTACCGGAACTTTCTCAATGATCAGACCGCTTACACA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCAACTCTCCCTACCGGAACTTTCTCAATGATCAGACCGCTTACACA  800

seq1  CTAGTGTTAATGAACACTTAAGCATGCAGAACAGGGTGAATCATGGTGGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGTGTTAATGAACACTTAAGCATGCAGAACAGGGTGAATCATGGTGGC  850

seq1  AACCCTTCACGAGCACTACTGACCTCCATGATGTTCAAGGAAAGGCAGTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCTTCACGAGCACTACTGACCTCCATGATGTTCAAGGAAAGGCAGTG  900

seq1  ATGACCTGGTGAGAGAGCGGGTGAGTACACGCCCGTCATCAGATGGGAAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACCTGGTGAGAGAGCGGGTGAGTACACGCCCGTCATCAGATGGGAAA  950

seq1  --GAAACAGGGCAGGGCTGACAGCAGATGAGAAGAG-CAAACCTCTGCAG  997
         |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||
seq2  AGAAAACAGGGCAAGGCTGACAGCAGATGAGAAGAGCCAACCCTCTGCAG  1000

seq1  CGAGGTCTCTCCTGGACAGAAAGCTCCTCCCACCACACCCCCAAGCAGAG  1047
      ||| ||||||||||||||||||||| || | | ||||  || | ||||| 
seq2  CGA-GTCTCTCCTGGACAGAAAGCTTCTTCGA-CACA-TCCTAGGCAGA-  1046

seq1  GCTGAGTGTTAGCAGGATTATCCAAAGGGGAGGGGAGGGGAGTCTAGGAA  1097
      ||||| || |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||
seq2  GCTGA-TG-TAGCAGGATTATCCAACGGGAGGGGGAGGGGAGTCTA-GAA  1093

seq1  CGACAAGGAACTTAGTGAAGGTGTGAAACCGTGCCA  1133
      |||||    |||   |||||||||| ||||||||||
seq2  CGACA---GACT--ATGAAGGTGTG-AACCGTGCCA  1123